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1.
陆小宇  罗慧  何鸳  胡鑫洁  周瑞  朱虹丽  李楠  陈梅 《陕西中医》2021,(12):1808-1813
目的:基于网络药理学研究凤香洗液中“丁香-苦参”配伍治疗子宫内膜癌(EC)的作用机制。方法:使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对丁香-苦参的活性成分进行检索和筛选,通过Gene Cards数据库、OMIM数据库筛选EC相关靶点,构建活性成分-靶点网络图。将筛选到的靶点利用String数据库构建蛋白互作(PPI)网络,并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,最后构建活性成分-靶点-信号通路网络图。结果:共筛选到31个潜在活性分子,690个中药成分靶点,1627个EC相关靶点,药物-疾病的共同靶点146个,共同靶点以多种方式参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、凋亡过程的负调控等595个生物过程,并参与癌症通路、PI3K/Akt信号通路、乙肝通路、癌症蛋白聚糖信号通路等115条信号通路。结论:丁香-苦参通过作用于PTGS2、Akt1、PTGS1、RELA、PRSS1、MAPK1等靶点调控癌症、PI3K/Akt、乙肝、癌症蛋白聚糖等信号通路,从而发挥干预EC的作用。  相似文献   

2.
目的:通过网络药理学方法筛选鼻渊通窍颗粒化学成分,构建成分-疾病靶点网络,研究其治疗过敏性鼻炎的潜在分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和DrugBank数据库,筛选鼻渊通窍颗粒所含的化学成分,并获取其作用靶点;应用GeneCards数据库,以“Allergic Rhinitis”为关键词检索过敏性鼻炎疾病靶点;获得药物和疾病的共同靶点并导入STRING数据库得到蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系,通过Cytoscape 3.7.2构建PPI网络。使用clusterProfiler进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。以药物网络分子中结合位点较多的槲皮素、芹菜素、山柰酚通过AutoDock软件同PTGS1、PTGS2,以及与过敏性鼻炎密切相关的血清因子IgE抗体进行分子对接。结果:网络药理学研究发现鼻渊通窍颗粒治疗过敏性鼻炎可能的活性成分为槲皮素、芹菜素、山柰酚、熊果酸、迷迭香酸,通过调节PTGS2、PTGS1、CHRM2、ADRB2、NOS2等靶点,调控MAPK、HIF-1、核因子κB、cAMP等信号通路,发挥其抑制炎症的作用。分子对接结果显示,关键成分对PTGS1、PTGS2和IgE抗体具有良好的亲和性。结论:本研究基于网络药理学理论和分子对接技术揭示了鼻渊通窍颗粒以多成分、多靶点、系统调节过敏性鼻炎,为临床药物治疗提供依据。  相似文献   

3.
目的采用网络药理学方法探讨黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的作用机制。方法使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄芪-山药药对活性成分,通过Uniprot数据库获得活性成分可能作用靶点,利用CTD数据库获得2型糖尿病作用靶点,通过基因注释工具Matescape分析黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的分子机制。结果筛选出黄芪-山药药对活性成分26个,预测获得与2型糖尿病相关靶点223个,蛋白相互作用网络筛选出关键靶点41个。黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的关键靶点MAPK1、PTGS2、NCOA2、PTGS1主要与细胞增殖、分化、凋亡、炎症等生物学过程有关,可以作用于糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路、内分泌耐药性、IL-17信号通路、雌激素信号通路中的关键靶点。结论黄芪-山药药对通过细胞增殖、分化、凋亡、炎症机制对2型糖尿病起到直接或间接治疗作用。  相似文献   

4.
龚普阳  潘烨华  郭瑜婕  哈立洋  李晓朋  顾健 《中草药》2021,52(11):3296-3305
目的探究竹叶椒Zanthoxylum armatum挥发油抗炎、镇痛的活性成分及作用机制。方法采用气相色谱-质谱联用(GC-MS)定性表征竹叶花椒挥发油成分,并借助中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)、Pub Chem、Swiss Target Prediction和Uniprot数据库收集活性成分对应靶点。通过GisGeNET及OMIM数据库筛选炎性反应和疼痛的相关靶点,采用Cytoscape软件构建"成分-靶点-疾病"网络。借助STRING及BioGPS数据库构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络并分析靶点组织分布,运用DAVID数据库对靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)功能及京都基因及基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。采用分子对接法验证竹叶花椒挥发油主要活性成分与核心靶点的相互作用。结果从竹叶椒挥发油中鉴定成分44个,预测得到其潜在抗炎、镇痛靶点78个,关键靶点涉及前列腺素内过氧化物合成酶2(prostaglandin-endoperoxidesynthase2,PTGS2)、毒蕈碱型乙酰胆碱受体亚型3(muscarinic acetylcholine receptor M3,CHRM3)、过氧化物酶体增殖物激活受体α(peroxisome proliferator activated receptorα,PPARA)、大麻素受体2(cannabinoid receptor 2,CNR2)等。GO分析结果表明筛选得到的靶点主要涉及RNA聚合酶II启动子转录的正调控、质膜及酶结合等生物学过程。KEGG通路富集分析得到60条信号通路,涉及神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触及胰岛素抵抗等相关通路。分子对接结果显示竹叶椒挥发油中芝麻素、胆甾烯基豆蔻酸酯和(-)-β-花柏烯等活性成分与核心靶点具有较好的亲和能力。结论竹叶椒挥发油中多种活性成分能够作用于PTGS2、CHRM3、PPARA等靶点,并通过多通路发挥抗炎、镇痛作用。  相似文献   

5.
目的探讨防风-秦艽治疗腰椎间盘突出症(LDH)的药理学机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选出防风-秦艽的活性成分和作用靶点,并通过Uniprot数据库将获得的靶蛋白名称转换成Gene Symbol;从GeneCards和OMIM数据库对LDH的靶点进行检索及筛选;通过R软件筛选得到药物-疾病共同靶点并进行Venn图的绘制。使用Cytoscape 3.7.0软件,构建药物与疾病有效成分-靶点网络图;使用String数据库构建作用靶标的蛋白互作网络并用R3.6.3软件进行相应分析;使用"clusterProfiler"R包对药物核心靶标进行GO功能分析以及KEGG通路富集分析,通过R软件对结果进行可视化。结果筛选得到药对活性成分20个,药物疾病共有靶点19个;通过药物-疾病成分靶点网络图得到常用中药成分为wogonin、beta-sitosterol、5-O-Methylvisamminol,关键靶点为PTGS2、NOS2、AR、ESR1。共有靶点PPI网络得到度值≥16的节点,为IL-6、AKT1、CASP3、CXCL8及PTGS2 5个潜在靶点;GO分析共得到富集条目811条,其中生物过程771条、分子功能33条及细胞组成7条(P0.05);KEGG富集得到IL-17信号通路、TNF通路、AGE-RAGE信号通路等39条通路(P0.05)。结论防风-秦艽可能通过多成分-多靶点-多通路的途径,发挥抗炎、抗氧化应激、抗细胞凋亡和调节机体免疫等作用,从而达到治疗LDH的目的。  相似文献   

6.
目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在活性成分和作用机制。方法:利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因;GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因;绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点;STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图,通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分;DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果:经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点,两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分,KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示,PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论:黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄...  相似文献   

7.
目的通过网络药理学方法联合GEO 数据库预测黄芪治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的核心 活性成分及靶点,并通过分子对接初步验证。方法利用中药系统药理分析平台(TCMSP)提取黄芪的活性成分 及对应靶点,借助Uniprot 数据库对靶点进行规范化,通过GEO 数据库提取溃疡性结肠炎的差异表达基因,并 利用R 语言筛选药物与疾病的交集基因,分别通过DAVID 数据库、STRING 数据库对交集基因进行富集分析 和蛋白互作分析;通过Cytoscape 软件构建黄芪“活性成分-药物靶点”网络、黄芪治疗溃疡性结肠炎“活性 成分-疾病靶点”网络及蛋白互作网络筛选出核心成分及靶点,借助Auto dock Vina 软件进行分子对接验证, PyMol 软件绘制对接结果图。结果共获得黄芪16 个活性成分,对应189 个作用靶点;GEO 数据库提取获得 溃疡性结肠炎差异表达基因1 355 个;药物与疾病交集基因44 个;富集分析显示多与炎症相关;筛选得到核 心活性成分异鼠李素(Isorhamnetin)和毛蕊异黄酮(Calycosin),核心靶点前列腺素G/H 合成酶2(PTGS2);分子 对接结果表明其核心活性成分与核心靶点之间均有较强的结合活性。结论黄芪中的异鼠李素、毛蕊异黄酮等 主要活性成分可能通过参与炎症相关信号通路及生物功能作用于PTGS2 等疾病靶点,从而发挥治疗溃疡性结 肠炎的效用。  相似文献   

8.
周曙光  韦洁  廖欣  庞力峰  杨希霖 《中成药》2020,(4):1062-1065
目的基于网络药理学探讨莪术抗血栓作用机制。方法利用TCMSP数据库获取莪术活性成分,从TCMSP和BATMAN-TCM数据库获取莪术活性成分靶点,利用Drug Bank等数据库收集血栓疾病基因,利用String工具构建蛋白互作网络,并运用Cytoscape软件构建莪术活性成分-靶点-疾病网络,借助DAVID工具进行关键靶点KEGG通路富集分析,使用Cytoscape Clue Go插件进行生物学功能分析。结果经条件筛选,莪术活性成分共29个,抗血栓靶点20个,包括F2、F10、PTGS1等。莪术抗血栓机制可能涉及凝血信号通路、血小板激活通路。结论莪术可能通过多成分、多靶点等相互作用方式,干预多条信号通路,进而调控血栓形成和发展。  相似文献   

9.
目的基于网络药理学探讨山药活性成分抗老年痴呆症的潜在作用机制。方法通过中药系统药理学技 术平台(TCMSP)收集并筛选山药的活性成分及其对应靶标蛋白。利用Uniprot 数据库获取山药活性成分对应的 靶标基因,并与通过GeneCards 数据库所获得的老年痴呆症疾病基因做映射,获得山药调节老年痴呆症的潜在 作用靶点。利用Cytoscape 3.7.2 软件构建山药的活性成分-作用靶点网络。通过String 平台构建作用靶点之间 的互作关系,并导入Cytoscape 3.7.2 软件构建靶蛋白互作关系网络(PPI)。通过Metascape 分析平台,对山药治 疗老年痴呆症的作用靶点进行GO 分析和KEGG 通路富集分析。结果从山药中筛选出12 个有效活性成分, 包括薯蓣皂苷元、海风藤酮、豆甾醇、荜拔明宁碱等;74 个作用靶点,与老年痴呆症有关的作用靶点48 个, 关键靶点6 个,包括AKT1、VEGFA、PTGS2、NOS3、TP53、ESR1;涉及6 条主要信号通路,包括神经活性 配体-受体相互作用、癌症途径、血清素能突触、长寿调节途径、雌激素信号途径、可卡因成瘾。这些作用通 路可能是山药活性成分防治老年痴呆症的活性依据。结论初步探讨了山药活性成分治疗老年痴呆症的作用机 制,为山药抗老年痴呆症活性成分的开发和应用提供了思路并指明了方向,为后续深入研究提供了理论基础及 参考依据。  相似文献   

10.
目的:运用网络药理学的技术分析香砂六君子汤治疗慢性萎缩性胃炎的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)搜索香砂六君子汤的药物成分及靶点,绘制中药-化合物-靶点网络;通过GeneCards、OMIM数据库筛选疾病相关基因,绘制韦恩图,获取共同基因并绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进行网络拓扑分析获取核心基因;对核心基因进行进一步的基因本体(GO)功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:经过筛选得到香砂六君子汤中药活性成分137个,潜在作用靶点162个,慢性萎缩性胃炎疾病702个相关靶点,药物-疾病共同靶点51个,经过网络拓扑分析得到PTGS2、TNF、VEGFA、IL1B、CAT等18个核心靶点,通过GO、KEGG主要富集于对活性氧的反应、细胞对氧化应激的反应等生物过程和肿瘤坏死因子、IL-17、Toll样受体、C型凝集素受体信号通路等通路上。结论:香砂六君子汤可以通过多成分-多靶点-多通路的机制,抑制“炎-癌”转化治疗慢性萎缩性胃炎。  相似文献   

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