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1.
目的:通过网络药理学的方法对黄芪桂枝五物汤治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的相关靶点进行预测与机制探讨。方法:利用中药网络药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选出黄芪桂枝五物汤中有效成分和相关靶标蛋白;运用网络可视化软件Cytoscape 3.5.1构建黄芪桂枝五物汤有效成分-靶标相互作用网络进行拓扑学分析;借助STRING在线数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析;从Uniprot数据库中获取靶标蛋白的基因名称后,借助David数据库进行KEGG通路功能富集分析,研究黄芪桂枝五物汤在治疗DPN上的作用机制及原理。结果:黄芪桂枝五物汤的核心化合物有槲皮素(quercetin),山柰酚(kaempferol),β-谷甾醇(beta-sitosterol),7-O-甲基异丙醇胺(7-O-methylisomucronulatol),异鼠李素(isorhamnetin)等,核心靶标有前列腺素G/H合酶2(prostaglandin G/H synthase2),热休克蛋白HSP90(heat shock protein HSP90),核受体共激活因子2(uclear receptor coactivator2)等;PPI网络图显示黄芪桂枝五物汤有效成分中关键蛋白主要有CJun氨基端激酶(JUN),肿瘤蛋白p53(TP53),FOS,丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),转录因子P65(RELA),白细胞介素-8(IL-8)等;KEGG结果表明黄芪桂枝五物汤主要作用与肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway),Toll样受体信号通路(Toll-like receptor signaling pathway)等信号通路有关。结论:黄芪桂枝五物汤主要通过多种途径,多种信号通路作用于多种靶点发挥其药物功效,利用网络药理学通过多种数据库与统计分析软件可以有效预测与分析药物的潜在作用与起效机制。  相似文献   

2.
范尧夫  许娟  孙洪平  曹琳 《中成药》2023,(10):3468-3475
目的 基于网络药理学和动物实验探讨葛根芩连汤治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。方法 利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)对葛根芩连汤有效成分进行筛选及靶点预测,GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库获得T2DM相关疾病靶标基因,Cytoscape技术整合药物与疾病的交集靶点基因,建立蛋白质相互作用(PPI)网络,R语言进行GO功能、KEGG通路富集分析。通过动物实验验证葛根芩连汤治疗T2DM的作用机制。结果 获得活性化合物140个,有效靶点212个。葛根芩连汤治疗T2DM涉及靶点204个,涉及炎症TNF信号通路等119条信号通路。与模型组比较,葛根芩连汤可降低T2DM小鼠体质量、空腹血糖、空腹胰岛素、HOMA-IR、TNF-α及IL-17水平(P<0.05),改善肝细胞形态,减少脂质空泡数目,减轻淋巴细胞浸润及脂质沉积,降低肝组织TNF-α、NF-κB蛋白表达(P<0.05)。结论 葛根芩连汤治疗T2DM具有多成分、多靶点特性,可能通过TNF-α信号通路抑制炎症反应来发挥降糖疗效。  相似文献   

3.
目的通过系统药理学方法探讨《金匮要略》中经典方剂苓桂术甘汤治疗慢性心衰的作用机制及原理。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选出苓桂术甘汤中茯苓、桂枝、白术、甘草的有效成分和相关靶标蛋白;使用网络可视化软件Cytoscape 3. 5. 1构建苓桂术甘汤有效成分-靶标相互作用网络进行拓扑学分析;利用STRING在线数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析;从Uniprot数据库中获取靶标蛋白的基因名称后,借助David数据库进行基因本体(GO)功能分析和KEGG通路功能富集分析,研究苓桂术甘汤治疗慢性心衰的作用机制及原理。结果结果表明苓桂术甘汤的核心化合物有槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、异鼠李素(isorhamnetin)等,核心靶标有前列腺素G/H合成酶2(Prostaglandin G/H synthase 2),雌激素受体(Estrogen receptor),钙调素(Calmodulin)、雄激素受体(Androgen receptor)等; PPI网络图显示苓桂术甘汤有效成分中关键蛋白主要有c-Jun氨基端激酶(JUN)、肿瘤蛋白p53(TP53)、Fos蛋白(FOS)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、转录因子p65(RELA)等。KEGG结果表明苓桂术甘汤主要作用与TNF信号通路(TNF signaling pathway)、癌症通路(Pathways in cancer)等信号通路有关。结论苓桂术甘汤主要通过多种途径,多种信号通路作用于多种靶点发挥其药物功效。利用系统药理学通过多种数据库与统计分析软件可以有效预测与分析药物的潜在作用与起效机制。  相似文献   

4.
目的运用网络药理学方法研究淫羊藿改善心肌重塑的有效成分和作用机制。方法利用中药系统药理学技术平台TCMSP数据库筛选出淫羊藿口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的主要活性成分及其靶点基因,通过GeneCards、OMIM等数据库获取心肌重塑靶点基因。将成分靶点与疾病靶点上传至String数据库,构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白互作网络,并根据其度值筛选出关键靶点。借助DAVID分析平台对关键靶标进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获取淫羊藿活性成分23个,与心肌重塑交集的关键靶标78个,包括白介素6(IL-6)、半胱氨酸蛋白酶(CASP)3、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)8等基因,主要富集在恶性肿瘤途径(Pathways in cancer)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway)、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、缺氧诱导因子1信号通路(HIF-1 signaling pathway)、促乳素信号通路(Prolactin signaling pathway)等。结论本研究结果初步验证和预测了淫羊藿改善心肌重塑的作用机制,为进一步深入揭示其分子机制提供了理论基础。  相似文献   

5.
目的:运用网络药理学分析方法探究葛根芩连汤(Gegen Qinliantang,GQT)治疗2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的潜在效应机制。方法:利用整合药理学平台(Computation Platform for Integrative Pharmacology of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)收集GQD中4味中药的化学成分及T2DM的相关靶点基因,并根据二维结构相似性特征筛选药物靶标;采用整合药理学平台在线Cytoscape技术构建核心靶标网络及"中药-成分-靶标-通路"多维网络;利用平台基因功能注释(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)对核心靶标进行基因功能和通路的注释分析。结果:共收集葛根芩连汤234种成分,核心靶标175个;其中筛选得到的68个活性成分与蛋白激酶C-δ(PRKCD),葡萄糖激酶(GCK),细胞色素C氧化酶亚基(COX7C/COX5A/COX5B),ATP合成酶F1亚基(ATP5F1A/ATP5F1C),胰岛素受体(INSR)等22个主要蛋白具有强相互作用,主要涉及在内分泌系统,细胞生长与死亡,Fox O转录因子(Fox O)信号通路,脂肪细胞因子信号通路,胰岛素信号通路等多条通路。结论:本研究初步揭示了葛根芩连汤治疗2型糖尿病的效应机制,其机制多与抗炎、抗氧化应激、抗胰岛β细胞损伤、改善糖脂代谢和并发症等相关。  相似文献   

6.
目的:通过系统生物学方法探讨针灸治疗中风的潜在作用机制。方法:系统检索PubMed、 Embase、Cochrane Library、中国生物医学文摘数据库(CBM)、中国期刊全文数据库(CNKI)、中文科技期刊数据库(VIP)和万方数据库(WanFang),收集关于针灸治疗中风机制的实验研究文献,从符合纳入标准的文献中筛选出与针灸治疗中风机制相关的靶标、基因和通路;利用STRING在线数据库对靶标进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析;从Uniprot数据库中获取靶标蛋白的基因名称后,借助DAVID数据库进基因本体(GO)功能分析和KEGG通路富集分析,研究针灸治疗中风的作用机制。结果:PPI网络图结果表明针灸治疗中风的核心靶标有IL8、TNF、IL6、IL1B、ICAM1、C3、POMC、PTGS2、CRP、NPY等;GO分析结果表明针灸治疗中风的作用主要通过干预炎症反应、白细胞介素-8生产的正调节、细胞凋亡的积极调节等发挥生物学功能;KEGG结果表明针灸治疗中风主要作用与TNF signaling pathway、NF-kappa B signaling pathway、MAPK signaling pathway、NOD-like receptor signaling pathway、Adipocytokine signaling pathway等信号通路有关。结论:由此可见,针灸主要通过抑制炎症反应、细胞凋亡和补体激活等多种途径、多种信号通路来发挥其治疗中风的作用。  相似文献   

7.
目的:以网络药理学为载体探索葛根芩连汤治疗腹泻的基因靶点及作用通路。方法:初步检索中药系统药理学数据库与分析平台,查找目标中药的有效成分和基因靶点,定义生物利用度≥30%,类药性≥0.18,确定药物的作用靶点; 然后查询OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库,挖掘腹泻疾病的潜在靶点。最后对两种基因取交集,构建中药—成分—靶基因—疾病的中药调控网络,对网络里面的基因构建蛋白互作网络,找到核心基因,进行基因本体和京都基因与基因组百科全书分析。结果: 最终确定葛根芩连汤中有效成分总共486个,去除重复后获得有效成分121个,基因靶点221个; 腹泻的疾病靶点5217个,二者共同靶点基因182个,PPI网络蛋白分析发现AKT1、CASP3、JUN、PTGS2、RELA、ESR1是葛根芩连汤治疗腹泻的核心靶点。基因本体分析确定了157个条目(P<0.05),其中生物过程主要通过DNA、RNA的转录,细胞因子的结合,蛋白酶的激活及细胞的代谢等过程发挥作用; 京都基因与基因组百科全书通路富集分析明确了167条信号通路,其中信号通路涉及炎症、细胞代谢、细胞衰老等方面,主要IL-17信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等。结论: 葛根芩连汤对腹泻的治疗主要通过抗炎、缓解肌肉痉挛等机制发挥作用; 其具体分子机制尚未得到验证,后期需要借助分子生物学研究,完善葛根芩连汤的作用机制,为临床用药提供新依据。  相似文献   

8.
[目的]通过系统药理学相关生物信息学分析方法探讨中药材骨碎补治疗骨质疏松的的生物学通路及靶标。[方法]通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库提取骨碎补的活性成分和有关的靶标蛋白。通过运用软件Cytoscape 3.5.1构筑骨碎补有效成分与靶标关系网络进行拓扑学分析。使用STRING数据库进行蛋白之间相互作用(PPI)网络的构筑与分析。借助David数据库进行KEGG通路功能富集分析。[结果]表明骨碎补的核心化合物有柚皮苷、圣草酚、山奈酚等,重要的靶标有前列腺素G/H合成酶2(Prostaglandin G/H synthase 2)、Heat shock protein HSP 90、Caspase-3等,骨碎补发挥生物学效应作用于骨质疏松症的关键蛋白主要有JUN、TP53、MAPK1、白介素-6(IL-6)、雌激素受体1(ESR1)等。KEGG结果表明骨碎补主要作用于TNF signaling pathway、T cell receptor signaling pathway、HIF-1 signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway、Estrogen signaling pathway等相关信号通路。[结论]骨碎补主要通过多种途径,多种信号通路作用于多种靶点发挥抗骨质疏松的生物学效用。  相似文献   

9.
目的:运用网络药理学的方法,探索芪术颗粒治疗糖尿病肾病的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP),中医百科全书数据库(ETCM),以口服生物利用度和类药性为限定条件筛选出芪术颗粒中各药的化学成分及其蛋白靶点,并通过UniProt数据库将蛋白靶点规范为相应的基因名称;通过在线《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM),疾病-基因数据库(DisGeNET),治疗靶标数据库(TTD),ETCM数据库检索糖尿病肾病的相关基因;两者取交集之后,通过蛋白质相互作用数据库(STRING)构建蛋白互作网络,使用Cytoscape分析网络的核心靶点,使用KOBAS 3.0数据库对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从芪术颗粒中共得到化学成分93个,涉及到254个靶点,与糖尿病肾病相关的基因607个,取交集后确定了76个芪术颗粒治疗糖尿病肾病的靶标,包括蛋白激酶B1(Akt1),血管内皮生长因子α(VEGFA),白细胞介素(IL)-6,肿瘤坏死因子(TNF),丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),基质金属蛋白酶(MMP)-9等核心靶点,经过GO分析和KEGG分析,芪术颗粒可以影响细胞对氮化合物的反应、调节活性氧代谢过程等生物过程,调控糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物(AGE)/晚期糖基化终产物受体(RAGE)信号通路,流体剪切应力和动脉粥样硬化,IL-17信号通路,缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路,TNF信号通路等通路。结论:芪术颗粒对糖尿病肾病的治疗作用可能是影响Akt1,VEGFA,IL-6,TNF,MAPK1,MMP-9等靶点,调控糖尿病并发症中的AGE/RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化,IL-17信号通路,HIF-1信号通路,TNF信号通路等通路发挥的,可以为进一步的基础实验研究提供理论参考。  相似文献   

10.
目的通过网络药理学方法研究葶苈大枣泻肺汤的活性成分、作用靶点及治疗心力衰竭可能的作用机制。方法采用TCMSP数据库及Swiss Target Prediction数据库获得葶苈大枣泻肺汤的活性成分及作用靶点,通过Uniprot数据库对靶点进行标准化,通过GeneCard、OMIM数据库获得心力衰竭的疾病靶点。将药物的作用靶点与疾病靶点进行交集,获得药物-疾病共同靶点。应用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络图(PPI),并应用R语言对核心靶点进行筛选。采用Cytoscape 3.7.2软件绘制出药物活性成分-心力衰竭靶点网络。最后运用R语言对共同靶点进行基因本体(GO)生物过程分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果本研究共预测到葶苈大枣泻肺汤共39个活性成分,122个与心力衰竭共同的靶点。PPI网络中核心靶点为信号传导及转录激活蛋白-3(STAT3)、蛋白激酶(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等。GO生物过程结果显示与细胞间信号传导、分子与蛋白结合过程及体内酶活性调节等相关。KEGG通路富集分析结果显示主要涉及AGE-RAGE信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、流体剪切应力与动脉粥样硬化(Fluid shear stress and atherosclerosis)及MAPK信号通路等方面。结论葶苈大枣泻肺汤治疗心力衰竭具有多成分、多靶点、多通路的特点。该研究为进一步探讨该药治疗心力衰竭的作用机制提供了参考。  相似文献   

11.
目的:基于网络药理学方法研究加味桃核承气汤干预2型糖尿病的潜在作用靶点。方法:基于TCMSP数据库及Uniprot数据库筛选出加味桃核承气汤有效成分及靶点基因。通过Gene Cards数据库及OMIM数据库筛选出2型糖尿病的疾病靶点基因,并用Cytoscape软件构建"活性成分-靶点"相互作用网络图。将有效成分靶标与疾病靶标上传到STRING数据库,构建蛋白互作网络图(PPI),并计算其特征值,使用R语言对得到的PPI进行核心基因的筛选。最后,运用R语言对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:预测得到加味桃核承气汤治疗2型糖尿病的有效成分155个及共作有效靶点106个。有效成分中度值较高的为槲皮素(quercetin),山柰酚(kaempferol)及异鼠李素(isorhamnetin),作用靶点中度值较高的为雌激素受体(ESR1),过氧化物酶体增殖剂激活受体γ(PPARG)与雄激素受体(AR)。PPI网络中核心基因为表皮生长因子受体(EGFR)及ESR1等; GO富集分析显示会影响基因的转录、核受体活性及激素的受体结合、神经递质等; KEGG通路富集分析显示流体剪切应力和动脉粥样硬化通路为显著性最高的通路,其次为晚期糖基化终末产物及其受体通路。结论:通过网络药理学的方法预测加味桃核承气汤防治2型糖尿病的关键作用靶点及相关通路,结果提示此方剂具有多靶点、多通路等复杂机制,不仅表明加味桃核承气汤具有降糖的作用,而且其还具有抗炎、改善胰岛素抵抗、调节脂代谢等生物学功能。  相似文献   

12.
目的 研究蒙药特格希德格奇(糖尿乐)治疗糖尿病的药效及作用机制。方法 采用高脂饲料结合腹腔注射四氧嘧啶法建立2型糖尿病模型,给予二甲双胍和不同剂量的蒙药特格希德格奇(糖尿乐)干预后,测定小鼠空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)、血清胰岛素(serum insulin,FINS)、总胆固醇(total cholesterol,TC)、甘油三酯(triglycerides,TG)、低密度脂蛋白(low-density lipoprotein,LDL-C)、高密度脂蛋白(high-density lipoprotein,HDL-C)水平,计算胰岛素抵抗指数(HOMA-IR);通过苏木精-伊红(HE)观察小鼠胰腺组织病理学变化。通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)、化学专业数据库并结合文献查找蒙药特格希德格奇(糖尿乐)药物的化学成分,使用Swiss Target Prediction平台预测靶点;在人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DisGeNET数据库和GeneCards数据库中搜索糖尿病相关靶点,利用STRING数据库和Cytoscape 软件构建蛋白相互作用网络图;使用Metascape数据库对靶点进行基因本体(GO)注释和KEGG富集分析并利用Autodock软件进行分子对接。结果 蒙药特格希德格奇(糖尿乐)能够显著降低小鼠血糖、血清胰岛素、胰岛素抵抗指数、血脂水平,降低因ALX造模带来的胰岛组织坏死的范围,改善2型糖尿病小鼠。通过网络药理学搜集得到22个蒙药特格希德格奇(糖尿乐)潜在化学成分,525个药物靶点,13403个疾病靶点。经交集获得潜在靶点472个,核心靶点21个。KEGG通路富集分析涉及的信号通路有cAMP信号通路(cAMP signaling pathway)、cGMP-PKG信号通路(cGMP-PKG signaling pathway)、Th17细胞分化、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、花生四烯酸代谢(Arachidonic acid metabolism)和脂肪细胞因子信号通路(Adipocytokine signaling pathway)等。分子对接结果显示,AKT1、EGFR、MAPK1、MAPK3、SRC与其相对应的活性成分均有较好的结合能力。结论 蒙药特格希德格奇(糖尿乐)确能够降低糖尿病药效其机制可能与调节cAMP信号通路、cGMP-PKG信号通路、Th17细胞分化、MAPK信号通路等通路的蛋白表达有关。  相似文献   

13.
目的:基于网络药理学探讨雷公藤与干燥综合征的关联关系及潜在作用机制。方法:通过检索TCMSP数据库,结合口服生物利用度和类药性分析,筛选出雷公藤中的主要活性成分及作用靶点;检索GEO数据库筛选干燥综合征的预测靶点,并将有效化合物和疾病靶点进行映射;采用Cytoscape软件构建雷公藤化合物-干燥综合征靶点相互作用网络;通过Bisogenet包进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建;再使用Bioconductor平台和R软件进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:筛选得到雷公藤有效成分共22个,作用靶点413个,从GEO数据库确定干燥综合征差异基因466个;有效化合物-干燥综合征网络总共包括28个节点和41条相互作用关系,关键活性化合物有山柰酚、川陈皮素、β-谷甾醇、雷公藤内酯醇、浙贝素等;通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络得到11个核心蛋白;GO富集分析主要涉及共获得生物过程(BP)295个,细胞组成(CC)3个,分子功能(MF)46个;相关条目主要涉及花生四烯酸代谢、类二十烷酸、脂肪酸、前列腺素等生物的合成与代谢过程、氧化应激以及多种酶的活性等;KEGG通路富集筛选得到19条信号通路,主要包括为花生四烯酸代谢、血清素能突触、TNF信号通路、多种细胞凋亡、VEGF信号通路、IL-17信号通路、核因子-κB信号通路等。结论:本研究应用网络药理学方法,对雷公藤治疗干燥综合征的活性成分、作用靶点和信号通路进行了探索性研究,发现雷公藤中的山柰酚、川陈皮素、β-谷甾醇等活性成分可参与调节花生四烯酸、类二十烷酸、脂肪酸、前列腺素等生物的合成与代谢过程、氧化应激以及多种酶的活性,并通过血清素能突触、TNF信号通路、多种细胞凋亡通路、VEGF信号通路、IL-17信号通路、核因子-κB信号通路等信号通路进行综合靶向调控,从而发挥治疗作用。  相似文献   

14.
目的 利用网络药理学及分子对接技术,研究茵陈蒿汤治疗妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)的物质基础及可能的作用机制。方法 使用TCMSP数据库挖掘茵陈蒿汤有效成分和作用靶点,利用GeneCard与OMIM数据库筛选疾病靶点。将药物与疾病靶点的交集导入String构建PPI网络,使用Cytoscape3.7.2软件筛选核心靶点,借助Metascape数据库对靶点进行基因本体论(GO)功能和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,从筛选靶点-成分网络图中根据degree值筛选出前5个关键成分,并将该网络中的基因靶点以degree值高低进行排序,选择前5个核心靶点,然后从RCSB PDB数据库和Pub Chem数据库获取靶点与成分的三维结构和化学结构,使用Pymol软件对蛋白质分子进行去水、去磷酸根等操作,最后使用AutoDockTools进行分子对接。结果 茵陈蒿汤中共筛选出21种有效活性成分,关键成分5个,分别为槲皮素、山奈酚、芦荟大黄素、谷甾醇、大黄酸;其治疗ICP的的核心靶点14个,分别为JUN、CASP3、TNF、TP53、MYC、EGFR、AKT1、VEGFA、MMP9、MAPK1、EGF、IL6、CXCL8、MAPK8,靶点主要涉及细胞氧化应激反应、细胞运动的正向调节、受体配体活性、细胞因子受体结合、蛋白激酶活性等生物学过程,通过乙型、丙型肝炎途径、癌症途径、MAPK、 IL-17、TNF信号通路等多途径发挥治疗ICP的作用。分子对接结果显示关键成分与对应靶点具有较好的结合活性。结论 茵陈蒿汤治疗ICP是通过槲皮素、山奈酚、芦荟大黄素、谷甾醇、大黄酸等多种成分作用于JUN、CASP3、TNF、TP53、MYC、EGFR、AKT1、VEGFA、MMP9、MAPK1、EGF、IL6、CXCL8、MAPK8等多种基因靶点,从而影响MAPK、 IL-17、肿瘤坏死因子、ErbB、 Toll样受体以及乙型丙型肝炎病毒等多种相关信号通路发挥功效,该研究为进一步深入研究其作用机制奠定了基础。  相似文献   

15.
目的 使用网络药理学方法来探究防衰益寿丸中君药抗衰老作用并验证。方法 采用中药系统药理学数据库和分析平台等数据库筛选防衰益寿丸君药的活性成分及活性成分作用靶点;在GeneCards、DigSee和OMIM疾病数据库中检索衰老相关靶点;借助Uniprot数据库查询其活性成分对应靶点基因名称;采用Cytoscape 3.7.2软件构建成分、疾病、两者交集靶点网络图;借助STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作网络;通过R 3.6.1软件对防衰益寿丸君药抗衰老靶基因进行GO和KEGG富集分析;将核心靶点与对应的化合物进行分子对接验证,并通过动物实验验证网络药理学预测结果。结果 研究共筛选出31个活性化合物,预测得到152个作用靶点,共收集2257个衰老靶点。通过靶点映射表明药物活性成分作用于AKT1、TNF、MAPK8、MPAK1、CASP3等97个共同表达靶基因,发现靶基因主要参与被动跨膜转运蛋白活性、铵离子结合、血红素结合、脂多糖的反应等生物过程。通过调节糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路等发挥抗衰老作用。分子对接验证结果表明核心靶点AKT1、MAPK1、TNF及HMOX-1靶点可与活性成分原阿片碱、花生四烯酸及山奈酚小分子化合物稳定结合。动物实验结果表明防衰益寿丸能够调控多条通路改善小鼠的学习记忆能力,改善大脑胆碱能神经通路功能,增加脑内乙酰胆碱的含量,改善老龄小鼠血脂水平。结论 研究初步探究并验证了防衰益寿丸君药抗衰老作用的核心活性成分(人参皂苷类成分、山奈酚、花生四烯酸、原阿片碱等)及关键靶基因(如AKT1、TNF、CASP3、MAPK1、HMOX1等),网络关系构建及通路富集(如糖尿病并发症AGE-RAGE通路、TNF信号通路、MAPK信号通路等),揭示了药物抗衰老的潜在通路和机制,体现了中药的多成分-多靶点-多途径的药理作用,为进一步深入阐释其抗衰老机制奠定了基础。  相似文献   

16.
目的 利用网络药理学研究黄芪治疗肌少-骨质疏松症的作用机制。方法 首先借助TCMSP分析平台、GeneCards数据库和OMIM数据库,分别筛选中药活性成分、中药靶标、肌少症疾病靶标和骨质疏松症疾病靶标,将肌少症疾病靶标和骨质疏松症疾病靶标取交集,得到肌少-骨质疏松症疾病靶标。将中药靶标与肌少-骨质疏松症疾病靶标取交集,得到中药-疾病靶标并构建中药-疾病-靶标调控网络。然后通过构建中药-疾病共同靶标的蛋白互作网络,筛选核心靶标基因。最后将中药-疾病共同靶标进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路。结果 筛选得到黄芪治疗肌少-骨质疏松症的20个活性成分和10个中药-疾病共同靶标,并推断其作用机制可能与催乳素信号通路、内分泌失调信号通路、雌激素信号通路、乳腺癌信号通路、类风湿性关节炎信号通路、Toll样受体信号通路、胰岛素抵抗信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等有关。结论 基于网络药理学探讨了黄芪治疗肌少-骨质疏松症的作用靶标及信号通路,为中药单体开发提供了理论依据。  相似文献   

17.
目的通过网络药理学方法预测四君子汤治疗结直肠癌潜在的作用靶点及信号通路。方法利用TCMSP获得四君子汤的化学成分及作用靶点,结合Swiss Target Prediction网站进行靶标垂钓;通过TTD、OMIM、Drugbank和GeneCards数据库收集结直肠癌相关靶点。运用Venn图取药物和疾病交集靶点,并在Unitprot数据库查询靶标蛋白基因名,通过STRING在线数据库对二者交集的靶点蛋白构建蛋白相互作用网络(PPI),采用Cytoscape 3.7.1软件进行可视化处理。使用David网站进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果获得四君子汤的有效成分134个,PPI包含125个靶点蛋白,关键蛋白包括TP53、AKT1、IL6等。经GO富集分析得到四君子汤治疗结直肠癌主要通过516个生物学过程,53个细胞组成和98个分子功能发挥作用。KEGG通路富集结果显示,四君子汤治疗结直肠癌的机制可能与PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路等相关。结论四君子汤主要通过调节TP53、AKT1、IL-6等关键蛋白,干预PI3K-Akt、TNF、FoxO等信号通路来治疗结直肠癌,体现了四君子汤治疗结直肠癌“中药多成分-多靶标-多通路”的特点。  相似文献   

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