布鲁氏菌基因组学研究进展

布鲁氏菌是一类革兰氏阴性、胞内寄生菌,缺乏经典的毒力因子,致病性不仅依靠侵袭力和内毒素,还有赖于较强的环境适应能力。目前,布鲁氏菌入侵机体和在胞内持续存在的机制尚未明确。布鲁氏菌基因组学研究不仅可全面了解布鲁氏菌的基因组成、分子进化、毒力因子以及致病机制等特点,还可以对一些致病相关基因和重要的蛋白进行预测。该研究为开发研究疫苗和新型抗生素提供分子基础,从而为构建新的有效的布病治疗和防控策略提供理论依据。本文就布鲁氏菌的基因组组成、特征,全基因组测序分析、比较基因组研究进展予以概述。     

比较基因组学在筛选抗结核药物靶标中的应用

近年来结核病发病率与死亡率明显回升，成为影响人群健康的主要传染病之一。其中耐多药结核病的威胁日益严重，是结核病临床治疗的棘手问题。因此研发新型抗结核药物迫在眉睫。大量已完成测序的模式生物基因组以及人类基因组信息，为生物医药研究提供了丰富的生物学信息。比较基因组学（comparative genomics）即在基因组物理图测序和注释基础上，对已知基因和基因组进行比较，     

国外缩小膜壳绦虫研究进展

缩小膜壳绦虫属人共患寄生虫,国内研究甚少。国外的实验研究涉及缩小膜壳绦虫的动物模型,在终宿主体内的行为和代谢,绦虫的表面抗原及粪抗原,缩小膜壳绦虫被排出的机制以及苯并咪唑类药物的驱虫机制,本从以上几方面加以综述。     

布鲁氏菌基因组学研究进展北大核心CSCD

布鲁氏菌是一类革兰氏阴性、胞内寄生菌,缺乏经典的毒力因子,致病性不仅依靠侵袭力和内毒素,还有赖于较强的环境适应能力。目前,布鲁氏菌入侵机体和在胞内持续存在的机制尚未明确。布鲁氏菌基因组学研究不仅可全面了解布鲁氏菌的基因组成、分子进化、毒力因子以及致病机制等特点,还可以对一些致病相关基因和重要的蛋白进行预测。该研究为开发研究疫苗和新型抗生素提供分子基础,从而为构建新的有效的布病治疗和防控策略提供理论依据。本文就布鲁氏菌的基因组组成、特征,全基因组测序分析、比较基因组研究进展予以概述。     

多房棘球绦虫疫苗研究进展

泡型包虫病 (Alveolar echinococcosis,AE)是由多房棘球绦虫 (Echinococcus multilocularis,Em)的续绦期幼虫寄生在人体肝脏引起的一种严重危害人体健康的人畜共患寄生虫病(Zoonosis)。健康教育是预防 AE的根本措施 ,早期或病灶较为局限的病例首选外科手术 ,但术后复发率较高 ,同时对人体损伤较大 ,不宜手术的病例可采用大剂量、长疗程的阿苯哒唑、甲苯咪唑、丙硫咪唑、苯硫氨酯或吡喹酮等药物进行化疗 ,临床发现这些药物存在一定的毒副作用 ,部分患者不能耐受 ,同时某些化疗患者可产生耐药性 ,这就需要研究更有效的防治措施。人们发现…     

重要绦虫功能基因组学研究进展

绦虫病是一类严重危害人类健康以及畜牧业生产的寄生虫病,其防治措施目前尚不完善。近年来,分子生物学技术发展迅速,已成为遏制绦虫病的有效手段。因此,研究绦虫基因的功能对于防治绦虫病意义重大。本文介绍了功能基因组学研究常用的几种技术,并对近年来一些重要绦虫的功能基因组学研究进展作一综述。     

布鲁氏菌比较基因组学研究进展

依据宿主偏好性的不同,布鲁氏菌分为6个经典种。根据生物学特性又将其分为19个亚型。包括：B.melitensis（羊种,主要感染绵羊和山羊种,     

COPD基因和基因组学研究进展

慢性阻塞性肺病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是一种以气流受限为特征的慢性气道疾病,气流受限不完全可逆,呈进行性发展,包括肺气肿、慢性支气管炎和末梢气道疾病.COPD位居常见病死亡原因第四位,WHO报导2030年COPD将成为世界第三大致死疾病[1].COPD发病机制复杂,与多个基因变异及环境因素相互作用有关[2].吸烟是COPD的主要环境危险因素,然而重度吸烟者仅10％ ～ 20％发病,且少数终生不吸烟者患COPD[3],故COPD具有内在遗传易感性.     

Application of industrial scale genomics to discovery of therapeutic targets in heart failure.

In recent years intense activity in both academic and industrial sectors has provided a wealth of information on the human genome with an associated impressive increase in the number of novel gene sequences deposited in sequence data repositories and patent applications. This genomic industrial revolution has transformed the way in which drug target discovery is now approached. In this article we discuss how various differential gene expression (DGE) technologies are being utilized for cardiovascular disease (CVD) drug target discovery. Other approaches such as sequencing cDNA from cardiovascular derived tissues and cells coupled with bioinformatic sequence analysis are used with the aim of identifying novel gene sequences that may be exploited towards target discovery. Additional leverage from gene sequence information is obtained through identification of polymorphisms that may confer disease susceptibility and/or affect drug responsiveness. Pharmacogenomic studies are described wherein gene expression-based techniques are used to evaluate drug response and/or efficacy. Industrial-scale genomics supports and addresses not only novel target gene discovery but also the burgeoning issues in pharmaceutical and clinical cardiovascular medicine relative to polymorphic gene responses.     

棘球绦虫和其它寄生性绦虫乙酰胆碱酯酶和烟碱型乙酰胆碱受体作为潜在药物靶点的研究进展

棘球蚴病是由棘球绦虫的幼虫(棘球蚴)引起的慢性寄生虫病,主要发生于牧区人群,是一种严重危害人类健康的人兽共患寄生虫病,本病治疗主要依赖于阿苯达唑(Albendazole, ABZ)。由于ABZ较低的肠道吸收率及肝脏对药物的转化作用,使得该药的生物利用度较低。以往的研究表明乙酰胆碱酯酶(AChE)和烟碱型乙酰胆碱受体(nAChRs)在寄生虫的神经系统和离子通道中起着重要的作用,这两者都是目前新一代驱虫药物的靶点。为提高对棘球蚴胆碱能系统功能的认识,本文回顾了以往关于棘球蚴和其他寄生虫AChE和nAChR的研究,并讨论了它们作为棘球蚴病疫苗开发和药物设计的合适靶点的潜力。     

医学蠕虫水通道蛋白研究进展

水通道蛋白是广泛存在于医学蠕虫中的一类可特异性介导水和其他溶质分子跨膜转运的膜内在蛋白,其在促进水跨膜转运、渗透调节、营养物质吸收、有毒代谢产物排出以及抗寄生虫药物转运过程中发挥重要作用,有望成为抗寄生虫疫苗候选分子和药物靶点。本文综述了医学蠕虫水通道蛋白的结构特征并探讨其作为抗蠕虫疫苗候选分子和药物靶点的可行性,为新型抗寄生虫疫苗或药物研发提供参考。     

蓝氏贾第鞭毛虫细胞骨架蛋白的分子生物学研究进展

蓝氏贾第鞭毛虫作为真核生物的模型,越来越受到广大生物学学者的重视,贾第虫借助细胞骨架蛋白附着于宿主肠上皮细胞,导致贾第虫病。将蓝氏贾第鞭毛虫细胞骨架蛋白成分作为新药物开发靶点的研究与日俱增。本文综述了蓝氏贾第鞭毛虫细胞骨架蛋白的分子生物学研究方法及最新进展,为新药物的开发及贾第虫骨架蛋白的进一步研究提供有价值的资料。     

比较基因组学在蓝氏贾第鞭毛虫进化研究中的应用新进展

蓝氏贾第鞭毛虫(简称贾第虫)作为一种古老的真核生物,在生物进化过程中的地位举足轻重。比较基因组学能够在基因组水平上深入认识贾第虫的进化关系,进一步明确贾第虫在生物进化中的地位。本文对比较基因组学的主要研究方法进行综述,同时介绍比较基因组学在贾第虫生物进化研究中的应用,对贾第虫比较基因组学的发展进行展望。     

A web-based research tool for functional genomics of the microcirculation: the leukocyte adhesion cascade

OBJECTIVE: Currently, microvascular data are almost exclusively deposited in scholarly journals. With the increasing availability of molecular data and the construction of genomic databases, a need arises to organize physiological data in a more accessible format. The microcirculation is a functional system that spans all organ systems and shares certain characteristics of organization with metabolic pathways, which have successfully been organized around genomic information for several prokaryotes. Here, we present a web-based research and teaching tool (http:@hsc.Virginia.EDU/medicine/basic-sci/biomed/l ey/) that covers a small aspect of microcirculatory physiology, the leukocyte adhesion cascade. METHODS: Currently, the site is organized in a flat-text mode with hypertext links to GenBank, Medline, and online journals where available. RESULTS: The web-based research and education tool is useful for graduate student education, and as a research resource for genetic researchers interested in gene function and for physiologists and biomedical engineers interested in the molecular basis of the leukocyte adhesion cascade. Our effort is intended to be a beginning toward a distributed database for the microcirculation (microcirculation physiome. see http://www.bme.jhu.edu/news/microphys). CONCLUSIONS: We invite all microvascular researchers to provide annotations and comments to make the research and teaching tool more useful to the scientific community.     

重要人兽共患寄生虫功能基因组学研究进展

随着分子生物学技术的迅速发展,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学,对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析。为促进我国寄生虫功能基因组学的研究,本文介绍几种重要的功能基因组学研究技术方法,并对近几年来一些重要寄生虫功能基因组学的最新研究进展作一综述。     

缺血性卒中的基因组学研究进展

缺血性卒中是导致成年人残疾和死亡的主要疾病之一.年龄、性别、吸烟、高血压和糖尿病等是缺血性卒中的危险因素,但它们仅能部分解释卒中发病的原因.孪生子、家系以及单基因遗传性卒中研究显示,缺血性卒中具有明显的遗传倾向性.近年来,基因组学在缺血性卒中研究中取得了明显进展,并显示许多新的单核苷酸多态性或基因与缺血性卒中及其危险因素有关.然而,这些遗传基因对缺血性卒中的贡献仍然太小,需要重复性研究进一步证实.     

Integrating tumor genomics into studies of the microbiome in colorectal cancer

ABSTRACT

Although the gut microbiome has been linked to colorectal cancer (CRC) development, associations of microbial taxa with CRC status are often inconsistent across studies. We have recently shown that tumor genomics, a factor that is rarely incorporated in analyses of the CRC microbiome, has a strong effect on the composition of the microbiota. Here, we discuss these results in the wider context of studies characterizing interaction between host genetics and the microbiome, and describe the implications of our findings for understanding the role of the microbiome in CRC.