TAGLN2基因单核苷酸多态性与广西扶绥县肝癌高发家系遗传易感性的关系

目的探讨TAGLN2基因rs2252815和rs2789422位点单核苷酸多态性与广西扶绥县原发性肝细胞癌(以下简称"肝癌")高发家系遗传易感性的关系。方法选取广西扶绥县20个肝癌高发家系成员共79例,将其中肝癌患者20例设为肝癌高发家系肝癌组,将无肝癌的直系亲属成员59例设为肝癌高发家系非肝癌组;将10个正常对照家系的成员40例设为正常家系对照组。采用飞行时间质谱技术检测TAGLN2基因rs2252815和rs2789422位点的基因型和等位基因频率;采用非条件Logistic回归分析三组人群等位基因及基因型分布频率的差异。结果 TAGLN2基因rs2252815位点存在CC、CT和TT三种基因型,其中CC基因型19例、CT基因型47例、TT基因型51例(2例未检测出相应基因型); rs2789422位点存在CC、CT和TT三种基因型,其中CC基因型72例、CT基因型43例、TT基因型3例(1例未检测出相应基因型)。肝癌高发家系肝癌组与肝癌高发家系非肝癌组或正常家系对照组进行比较,TAGLN2基因rs2252815和rs2789422位点CC、CT、TT基因型及等位基因C、T分布频率比较差异均无统计学意义(P 0. 05)。结论 TAGLN2基因rs2252815和rs2789422位点单核苷酸多态性与广西扶绥县肝癌家系遗传易感性之间无明显相关性。     

广东汉族人群PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点单核苷酸多态性与2型糖尿病遗传易感性的关联研究

目的探讨T2DM遗传易感性与广东汉族人群PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点单核苷酸多态性(SNP)的关联。方法采用病例对照设计,运用SNPscanTM分型技术检测T2DM组和正常对照组(NC)PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点的基因型,比较两组基因型及等位基因频率分布。结果 NC、T2DM组rs6821591位点T、C等位基因频率分别为67.31%、32.69%/67.57%、32.43%,rs2970847为23.91%、76.09%/23.95%、76.05%,两组双位点等位基因频率分布及TT/CT/CC基因型频率分布比较,差异无统计学意义(P0.05)。调整协变量前后,两组rs6821591和rs2970847位点的隐性、显性、共显性及超显性遗传模型比较,差异无统计学意义(P0.05)。结论T2DM遗传易感性可能与广东汉族人群PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点SNP无明显关联。     

ABCB1基因单核苷酸多态性rs1045642与脑梗死患者氯吡格雷反应的相关性研究

目的探讨ABCB1基因单核苷酸多态性rs1045642与脑梗死患者氯吡格雷反应的相关性。方法选择2013年1~12月在长江航运总医院神经内科住院的脑梗死患者100例,采用光学比浊法测定残余血小板聚集率(residual platelet agglutination,RPA),根据RPA结果分为氯吡格雷抵抗(clopidogrel resistance,CR)组42例(RPA≥70%)和非CR组58例。采用直接测序法测定ABCB1基因rs1045642单核苷酸多态位点在CR组和非CR组的基因型及等位基因分布频率。结果非CR组吸烟比例明显高于CR组,差异有统计学意义(P=0.009)。CR组CC、CT、TT基因型频率分别为21.4%、45.2%、33.3%,非CR组CC、CT、TT基因型频率分别为36.2%、44.8%、19.0%,差异无统计学意义(P0.05);CR组C、T等位基因分布频率分别为44.0%、56.0%,非CR组C、T等位基因分布频率分别为58.6%、41.4%,差异无统计学意义(P0.05)。结论脑梗死患者中发生CR与其ABCB1基因单核苷酸多态性rs1045642等位基因多态性的发生无相关关系。     

p53基因多态性与鼻咽癌遗传易感性的关系

目的研究广西南宁鼻咽癌患者p53基因遗传多态性与鼻咽癌发生的关系。方法采用病例-对照研究方法,以200例鼻咽癌患者、200例对照人群为研究对象。选取p53基因SNP rs117562731位点作为遗传标记,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和测序方法检测rs117562731位点基因型频率和等位基因频率,比较两组不同基因型与鼻咽癌易感性的关系。结果通过对rs117562731位点多态基因型检测分型发现,在鼻咽癌组和对照组CC、CT、TT基因型频率分别为80.0%、17.0%、3.0%和93.0%、5.5%、1.5%。rs117562731位点等位基因及基因型频率在鼻咽癌组与对照组间分布有显著性差异(P0.05)。结论 p53基因SNP rs117562731位点多态性与鼻咽癌之间存在显著的相关性。     

氯离子通道-6基因位点rs3737964单核苷酸多态性与冠心病的关系

目的:探讨氯离子通道-6基因位点rs3737964单核苷酸多态性与冠心病发生的关系。方法:本研究收集冠心病患者1 193例(冠心病组)和非冠心病1 200例(对照组)。采用修订后的Inter-hearnt调查表进行流行病学调查,应用实时荧光定量多聚酶链反应技术之TaqMan探针法检测所有研究对象氯离子通道-6基因rs3737964位点多态性。结果:研究对象中氯离子通道-6基因多态性位点rs3737964的T和C等位基因的频率分别是10.4%和89.6%,各基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P=0.178)。rs3737964位点基因型TT频率分布在冠心病组(2.3%)明显高于对照组(1.0%),与基因型为CC者相比,基因型为TT者其患冠心病的危险性增加(OR=2.318,95%CI=1.168~4.063,P=0.016 3),调整混杂因素后差异仍有统计学意义(OR=2.925,95%CI=1.287~6.65,P=0.010 4)。分层分析结果显示:rs3737964位点的TT基因型在60岁以上人群中患冠心病的危险性明显增加(调整混杂因素后OR=3.597,95%CI=1.191~10.858,P=0.023 2)。在男性人群中TT型基因型患冠心病的危险性明显增加(OR=3.669,95%CI=1.401~9.608,P=0.008 1)。在吸烟的人群中TT基因型者患冠心病的危险性明显增加,调整混杂因素后差异仍有统计学意义(OR=3.187,95%CI=1.038~9.787,P=0.042 9)。结论:氯离子通道-6基因位点rs3737964多态性可能是罹患冠心病的遗传易感性基因之一,60岁、吸烟及男性人群中TT基因型者更易患冠心病。     

LOX-1 3′-UTR+1073多态性与冠心病的相关性

目的探讨血凝素样氧化低密度脂蛋白受体（LOX）-1基因中3′-UTR+1073位点（C/T）基因型多态性与冠心病的遗传易感性的关系。方法采用PCR和限制性片段长度多态性（RFLP）分析方法对LOX-1 3′-UTR+1073位点C/T基因型多态性进行检测,观察其在101例冠心病患者（其中61例心肌梗死患者）和54例对照中的频率分布。并与冠心病危险因素和临床情况相结合进行综合分析。结果①LOX-1 3′-UTR+1073基因CC、CT与TT基因型及C、T等位基因在冠心病组和对照组中分布频率无显著差异;在心肌梗死组和对照组中分布频率无显著差异;②在具有相同危险因素（高血压、糖尿病、吸烟）的人群中,3′-UTR+1073基因CC、CT与TT基因型在患冠心病和不患冠心病者分布频率无显著意义。结论LOX-1 3′-UTR+1073基因的基因型多态性与冠心病可能无关,不能作为冠心病的遗传易感标志。     

Pitx3基因多态性与帕金森病易感性的相关性研究

目的探讨Pitx3基因多态性与帕金森病(PD)易感性的关系。方法选择江苏地区汉族的215例PD患者作为PD组,同期选择健康体检者250例作为对照组,利用多重连接酶链反应方法,检测2组Pitx3 2个单核苷酸多态性(SNP)位点rs2281983和rs3758549基因分布,分析各基因型、等位基因频率、单倍型与PD易感性的关系。结果 PD组与对照组Pitx3基因SNP位点rs2281983的CC、CT和TT基因型(6.5%vs 7.2%,42.3%vs 41.2%,51.2%vs 51.6%,χ2=0.274,P=0.717)和等位基因频率(χ2=0.159,P=0.423)分布比较,差异无统计学意义。PD组与对照组rs3758549的CC、CT和TT基因型(57.8%vs 66.4%,34.4%vs 29.2%,7.9%vs 4.4%,χ2=9.144,P=0.023)和等位基因频率(χ2=10.138,P=0.011)分布比较,差异有统计学意义。2组Pitx3基因C-C、C-T单倍型分布比较,差异无统计学意义(P>0.05);与对照组比较,PD组T-T单倍型增加PD易感性(OR=1.299,95%CI:1.003¹.863,P=0.048)。结论江苏地区汉族人群中,Pitx3基因的rs3758549位点基因型分布和等位基因频率与PD易感性之间有显著关联性,Pitx3基因的单倍型TT可能与PD易感性相关。     

我国西部汉族人IL-10基因多态性与肺结核易感性的相关性研究

目的探讨白介素-10(IL-10)基因单核苷酸多态性与肺结核易感性的相关性,为肺结核的早期预警提供新的候选分子标志物。方法检测147例肺结核患者(病例组)及206例健康个体(对照组)中IL-10基因-819(CT)、-1 082(AG)多态位点基因型,进行关联分析。结果样本均衡性检验显示病例组与对照组个体之间在性别(P=0.575)、年龄(P=0.840)分布无统计学差异;基因分型检出率为99.7%;哈德温伯格平衡检测显示对照组个体符合遗传学规律(P值分别为0.137与0.311);-819位点CC、CT、TT基因型分布在病例组与对照组间无统计学差异(P=0.901);-1 082多态位点AA、AG、GG基因型在病例组中的分布频率分别为48.6%、43.2%和8.2%,而在对照组中分别为60.5%、36.1%和3.4%,二者之间存在统计学差异(P=0.032),G为风险等位基因(OR=1.55,95%CI 1.10~2.19)。结论 IL-10基因-1 802(AG)位点单核苷酸多态性与我国西部汉族人群肺结核易感性显著相关,可作为该地区肺结核早期预警筛查的候选分子标志物。     

DNMT3B启动子区SNP(-579G/T)与佳木斯肺癌发病风险的相关性

目的探讨DNMT3B基因启动子-579G/T单核苷酸多态性与佳木斯地区人群肺癌易感性的相关性。方法选取98例肺癌患者及105例健康人的外周血,提取全基因组DNA,运用PCR-RFLP结合DNA测序技术检测DNMT3B基因启动子-579G/T单核苷酸多态性在各组中基因型的分布。结果正常对照组DNMT3B-579G/T基因型GG/GT/TT的频率分别为0/24%/76%,病例组基因型GG/GT/TT分别为0/21%/79%。携带有SNP(-579G/T)G→T转换的个体患肺癌的易感性病例组与对照组相比,未见显著性差异(P=0.991 3,OR=1.003 6,95%CI:0.521 6¹.931 0)。结论 DNMT3B基因启动子区-579G/T多态性位点不能作为佳木斯地区人群肺癌易感性的一个独立风险因素。     

TM及TFPI的基因多态性与肺血栓栓塞症的相关性研究

目的：了解中国北方地区汉族人群血栓调节蛋白(TM)G-127A 及组织因子途径抑制物(TFPI)T-287C的基因多态性分布频率,探讨二者与肺血栓栓塞症(PTE)的发病关系。方法应用PCR-限制性片段长度多态性分析方法,对中国北方地区汉族人群80例确诊为PTE的患者和来自同一地方、性别、年龄相匹配的80名健康体检者的TM基因G-127A及TFPI基因T-287C 2个位点的多态性进行分析。结果中国北方地区汉族人群的 TM G-127A 位点及 TFPI T-287C 位点的基因型及等位基因频率分布符合 Hardy-Weinberg遗传平衡定律。PTE患者及健康对照者TM G-127A位点仅有1种基因型,为 GG基因型。PTE患者TFPI T-287C位点具有3种基因型,分别为 TT、TC、CC,其中TC基因型最多见,CC基因型最少见;健康对照者TFPI有3种基因型,分别为 TT、TC、CC,其中TT基因型最多见,CC基因型最少见。TFPI T-287C基因型TT、TC、CC在PTE组中的频率分别为35.0%、43.8%、21.3%,在健康对照组中的频率分别为55.0%、37.5%、7.5%。PTE 突变基因型(CC+TC)频率为65.1%(OR =2.270,95%CI ：1.201~4.290),突变等位基因(C)频率为43.1%(OR =2.130,95%CI ：1.330~3.412),均显著高于健康对照组(分别为45.0%、26.3%, P值均<0.05)。结论中国北方地区汉族人群中TM基因G-127A位点的突变较少见,可能不是PTE的危险因素;TFPI T-287C存在基因多态性,TFPI T-287C基因多态性可能与中国北方地区汉族人群发生PTE相关。     

磷脂酶A2受体基因多态性与脑卒中人群脂代谢的相关性研究

目的 探讨磷脂酶A2受体基因多态性与脑卒中人群脂代谢的关系.方法 以rs2203053和rs4665135位点为遗传标记,应用多聚酶链-限制性片段长度多态性检测756例脑卒中患者的基因型.结果 Rs2203053位点突变基因型CC+CT的总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇水平明显高于野生基因型TT(分别为P=0.042和P=0.011),而甘油三酯和高密度脂蛋白胆固醇水平无明显差异(P＞0.05).Rs4665135位点突变基因型CC+CT与野生基因型TT的血脂水平无明显差异.结论 磷脂酶A2受体基因rs2203053位点多态性与脑卒中人群总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇的代谢相关.     

褪黑色素受体1B基因多态性与妊娠期糖尿病的相关性研究

目的探讨我国褪黑色素受体1B(MTNR1B)基因SNP位点rs10830963和rs1387153的多态性与妊娠期糖尿病(GDM)遗传易感性的关系。方法采用病例对照研究,分别选取GDM患者(GDM组)184例和对照(NC)组235名,利用PCR-RFLP的方法测定2个SNP位点多态性分布,并进行统计学分析。结果 GDM组FPG高于NC组(P=0.039),但孕前BMI比较差异无统计学意义。SNP位点rs10830963基因型(GG,GC,CC)频率、等位基因频率与NC组比较,差异均无统计学意义(P=0.637,P=0.422)。而SNP位点rs1387153基因型(TT,CT,CC)与NC组比较,差异有统计学意义(P=0.012),且风险基因型TT的频率高于NC组(TTvs TC+CC,P=0.01)。GDM组T等位基因高于NC组(OR:1.517,95%CI:1.147~2.006,P=0.003),且该SNP位点的TT基因型的GDM患者FPG高于其他两个基因型的患者。结论 MTNR1B基因SNP位点rs10830963与GDM无相关性,而SNP位点rs1387153与GDM的易感性相关。     

葡萄糖激酶基因多态性与妊娠期糖尿病遗传易感性的关系

目的 探讨葡萄糖激酶(GCK)基因-259位点单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病(GDM)发病的关系.方法 应用PCR-RFLP技术对80例GDM孕妇(GDM组)和80例正常孕妇(对照组)的GCK基因-259位点(A→T)进行单核苷酸多态性分析.结果 两组GCK基因-259位点各基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡检验,具有群体代表性;GDM组GCK基因-259位点T等位基因频率高于对照组 (P＜0.05),A等位基因频率、A/A基因型频率无统计学差异(P＞0.05),T/T基因型频率与GDM组呈正相关(OR值为3.235,P=0.031),结论 GCK基因-259位点单核苷酸多态性可能在GDM遗传易感性中起重要作用;T等位基因可能与GDM发生有关.     

CDKAL1基因多态性与妊娠期糖尿病及其临床特点的相关性研究

目的 探讨我国南方人群中CDKAL1基因两个SNP位点rs7754840和rs10448033的多态性与GDM易感性的关系. 方法 采用病例对照研究,分别选取GDM患者(GDM组)153例和正常糖耐量的孕妇(GNGT组)180名.采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性分析法(PCR-RFLP)测定两个SNP位点多态性分布,并进行统计学分析. 结果 GDM组孕前BMI、FPG、TG均高于GNGT组,TC、HDL-C及LDL-C均低于GNGT组(P＜0.05).SNP位点rs7754840基因型(CC,GC,GG)频率和等位基因频率与GNGT组比较,差异均无统计学意义(P=0.937、0.933);而SNP位点rs10440833基因型(AA,AT,TT)与GNGT组比较,差异有统计学意义(P=0.024),且风险基因型TT的频率高于GNGT组(TTvs TC+CC,P=0.032);GDM组A等位基因频率高于GNGT组[OR(95％CI):1.519(1.114～2.071),P=0.008];AA基因型患者的FPG高于其他基因型(P=0.011),TG高于TT基因型(P=0.007),HDL C低于TT基因型(P=0.001). 结论 CDKAL1基因SNP位点rs7754840与GDM无相关性;SNP位点rs10440833与GDM的易感性相关,且该位点多态性可能与血糖、TG及LDL-C的水平有关.     

SP-D基因rs721917多态性与COPD的相关性研究

目的探讨肺泡表面活性蛋白D(SP-D)基因多态性与慢性阻塞性肺疾病易感性的关系。方法收集117例COPD患者(COPD组)和117名健康者(对照组)的外周血,提取全血细胞DNA,采用基因测序技术检测两组SP-D基因单核苷酸多态性位点(rs721917)的基因型分布频率。结果 COPD组中rs721917的CC、TC、TT频率分别为28.2%、56.4%、15.4%,与对照组41.0%、51.3%、7.70%相比(P=0.048);COPD组中T等位基因频率(43.6%)高于对照组(33.3%),T等位基因是COPD的易感基(OR=1.545,95%CI 1.062~2.249,P0.05)。结论 SP-D(rs721917)位点基因多态性与COPD的易感性相关,T等位基因可能是COPD的易感基因。     

hTERT基因多态性与胃癌易感性的研究

人端粒酶逆转录酶(hTERT)作为端粒酶的关键酶参与了包括胃癌在内的多种肿瘤的发生和发展,有研究发现该基因的多个单核苷酸多态性(SNP)位点与多种恶性肿瘤具有不同程度的相关性。目的:探讨hTERT基因rs2853676和rs2853677位点SNP与胃癌遗传易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测297例胃癌、105例萎缩性胃炎和402例对照组患者rs2853676和rs2853677位点的基因多态性,采用病理学检查和~(13)C-尿素呼气试验检测幽门螺杆菌(Hp)感染。结果:胃癌组rs2853676位点AA基因型频率显著高于对照组(15.2%对6.5%,P=0.01),AA基因型携带者患胃癌的风险增加2.47倍(95%CI:1.46~4.16)。三组rs2853677位点CC、TC、TT基因型频率差异无统计学意义。与对照组相比,萎缩性胃炎组和胃癌组Hp感染率显著升高(64.8%、56.9%对40.3%,P均0.01),OR值分别为2.73(95%CI:1.74~4.26)、1.96(95%CI:1.44~2.67)。Logistic回归分析发现,Hp感染与基因突变无明显交互作用。结论:hTERT基因rs2853676基因多态性与胃癌遗传易感性有关,其增加胃癌的风险与Hp感染可能无关。     

p21和p27基因多态性与妇科肿瘤的相关性研究

目的探讨p21和p27基因多态性与妇科肿瘤遗传易感性的关系。方法采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性方法,分析100例妇科肿瘤患者和95例健康对照者的p21基因3′非翻译区（3′UTR）和p27基因第109密码子多态性位点的基因型。结果妇科肿瘤患者p21基因突变型TT频率为26.00%,对照者为16.84%,两者相比,P〈0.01;年龄〈46岁组肿瘤患者的p21基因突变型（CT＋TT）频率为86.84%,≥46岁组为59.52%,两组相比,P〈0.01;中低分化组妇科肿瘤患者的突变型CT和TT基因型频率为76.47%,高分化组为46.67%,两组相比,P〈0.05;妇科肿瘤患者与对照者的p27基因型总体分布及V和G等位基因频率相比,P均〈0.01。结论p21基因3′UTR多态性和p27基因V109G多态性与妇科肿瘤的遗传易感性有关。     

中国藏族PSCA基因rs2294008多态性与胃癌遗传易感性的关系

目的:研究前列腺干细胞抗原基因(prostatestem cell antigen gene,PSCA)rs2294008位点多态性与中国藏族胃癌患者遗传易感性的关系.方法:收集185例藏族胃癌患者与200例健康人群的外周血样本,提取基因组DNA,采用dHPLC方法进行PSCA基因rs2294008位点分型.结果:PSCA基因rs2294008位点3种基因型C C、C T、T T在胃癌病例组中频率分别为:40.00%、48.65%和11.35%,而在对照组中分别为54.00%、39.50%和6.50%.与CC型比较,携带CT,TT型基因型者胃癌发生的危险性增加,OR值分别为1.66(95%CI 1.09-2.54)和2.36(95%CI 1.11-5.00).结论:PSCA基因rs2294008位点CT,TT基因型增加中国藏族人群的胃癌易感性.     

花生四烯酸5-脂氧合酶激活蛋白基因多态性与急性冠状动脉综合征的易感性

目的探讨花生四烯酸5脂氧合酶激活蛋白(ALOX5AP)基因SG1 3S114T/A多态性与急性冠状动脉综合征(ACS)的易感性。方法选择住院的胸痛患者714例,将确诊为ACS的患者377例作为ACS组,非ACS患者337例作为对照组,采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性方法检测ALOX5AP基因SG13S114T/A多态性,并进行logistic回归分析。结果 ACS组患者AA、AT和TT基因型频率分别为1 3.79%、50.93%和35.28%,对照组患者分别为12.76%、38.58%和48.66%,2组AT和TT基因型频率差异有统计学意义(P=0.041,0.020);ACS组男性AT基因型频率高于对照组(P=0.040),女性TT基因型频率低于对照组(P=0.013)。SG13S114T/A位点AT和TT基因型以及T等位基因是所有ACS(P=0.004、0.001和0.013)和男性ACS(P=0.014、0.005和0.020)发病的危险因素。结论 ALOX5AP基因SG1 3S114T/A多态性AT和TT基因型以及T等位基因可能与老年人,特别是老年男性ACS的易感性相关。     

亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T、β-纤维蛋白原基因G448A多态性与缺血性卒中遗传易感性的关系

目的 探讨亚甲基四氧叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MqHFR)基因C677T、β-纤维蛋白原(β-fibrinogen,β-Fg)基因C0448A多态性与缺血性卒中遗传易感性的关系.方法 采用寡核苷酸芯片技术对88例缺血性卒中患者及与其配对的88名对照者进行单核苷酸多态性位点检测和分析.结果 缺血性卒中患者组MqHFR基因T纯合基因型、杂合基因型和T等位基因频率分别为17.0%、50.0%和42.05%.对照组为11.4%、36.4%和29.55%,两组间MTHFR基因C677T基因型频率(P=0.034)和等位基因频率(P=0.014)分布有显著差异,β-Fg基因杂合基因型和A等位基因频率分别为27.3%和15.91%,对照组为25.0%和14.77%.多元logistic回归分析显示,M31-IFR基因C677T CT基因型与缺血性卒中发病有关(优势比为2.181,95%CI 1.138～4.181;P<0.05);β-Fg基因G448A与缺血性卒中无显著相关性,其与MTHFR基因C677T位点无协同作用.结论 MTHFR基因C677T位点突变可能足缺血性卒中发病的遗传因素之一.