RAPD法对50株幽门螺杆菌的分子流行病学

目的：从基因水平研究幽门螺杆菌与疾病的关系。方法：用随机扩增的多态性DNA（RAPD）法对50株来自不同病人的幽门螺杆菌进行基因分型，并在此基础上探讨不同基因型别的幽门螺杆菌与疾病之间的关系。结果：50株幽门螺杆菌均呈现不同的基因图谱，经聚类分析可分为3个基因型别，此3个基因型别在不同疾病中的发生率不同，经统计学分析，差异有显性（P＝0．03）。结论：不同基因型 别的幽门螺杆菌与不同的疾病结局有关。     

潮汕地区幽门螺杆菌DNA指纹图谱46例分析

目的通过检测潮汕地区消化性溃疡及胃炎患者幽门螺杆菌的感染情况,对病人胃内分离的Hp进行DNA指纹图谱分析,探讨本地区Hp基因型与疾病的相互关系。方法收集我院消化内科内镜检查显示胃黏膜尿素酶试验阳性患者46例(消化性溃疡30例,单纯性胃炎16例),取胃窦黏膜组织进行Hp培养、总DNA的提纯和纯化、随机扩增多态性DNA指纹法(RAPD)分析,采用聚类分析作基因分型,同时采用免疫印迹法测定血清空泡毒素VacA抗体。结果46例临床分离菌株指纹各不相同,分为3个基因型别(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型),Ⅰ型以胃炎多见,Ⅲ型以溃疡多见,有显著性差异(p<0·05);血清VacA抗体阳性率在各疾病组和基因型组间无显著性差别(p>0·05)。结论提示不同基因型别的Hp与不同的疾病类别有关,RAPD是有效的基因分型方法。     

用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测幽门螺杆菌的分子流行病学研究

本研究应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性(PCR RFLP)法对来自不同临床标本的幽门螺杆菌 (Hp)进行分析 ,通过聚类分析进行基因分型 ,并在此基础上探讨不同基因型别的Hp与不同疾病的关系。1.材料与方法 :(1)菌株来源与培养 :5 0株Hp菌株分离自消化道疾病行胃镜检查的患者标本 (男 30例 ,女 2 0例 ) ;2 5株来自消化道溃疡患者 ,2 5株来自其他胃病患者 ,Hp菌株用布氏肉汤培养基、在 37℃恒温、微需氧条件下培养 3～ 4天 ,观察细菌形态 ,进行菌株鉴定 ,然后传代 ,- 80℃保存。(2 )DNA制备 :收集纯培养 3～ 4天的Hp于 5 0 0 μlTE(pH…     

上海市浦东地区淋病奈瑟菌分型与耐药性的相关分析

目的了解上海市浦东地区淋病病原体奈瑟双球菌的不同基因分型及各基因型与耐药性之间的对应关系。方法运用随机扩增多态性DNA(RAPD)指纹图谱对78株分离自不同患者淋球菌菌株进行区分，从分子水平对淋球菌进行基因分型，并在此基础上探讨不同的基因分型与耐药性之间的关系。结果78株淋球菌分离株RAPD图谱上相似，但各菌株基因图谱之间有明显不同DNA多态性，可将菌株区分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三种基因分型，对此三种基因分型与A、B、C、D四种不同的耐药类型进行对应分析，发现耐药类型与基因型别之间存在对应关系。结论通过研究发现浦东地区淋球菌流行株有着不同的耐药特点及基因型别，耐药性与不同的基因分型之间存在着一定相关性。     

重庆市老年中心铜绿假单胞菌流行病学分型研究

目的对重庆市老年中心引起医院感染的铜绿假单胞菌(PAE)进行流行病学分型研究,了解其流行与耐药,以便更好地控制其引起的医院感染.方法采用随机扩增多态性DNA(RAPD)基因分型方法对重庆市老年中心分离的24株PAE进行RAPD基因分型.结果24株PAE共得RAPD 14型,分型率100%;同一病区不同患者分离出的PAE未检出相同基因型的PAE,3个不同病区间未检出相同RAPD型别的PAE;7例感染个体连续收集的PAE有5例RAPD指纹图谱完全一致,2例出现跳跃性指纹图谱,且与其他分型指纹图谱不相同.结论RAPD能满足对PAE进行分子流行病学分型;通过分型可判断内原性、外源性或突变PAE引起的感染.     

志贺菌痢暴发菌株的分子流行病学分析

目的 探讨4种基因分型方法在一起F2a志贺菌痢暴发的流行病学研究中的意义。方法 对43株从患粪便和食物中分离菌株进行质粒图谱分析、质粒DNA酶切图谱分析、随机PCR分析、setl／set2毒力基因PCR分析。结果 随机PCR将43株F2a志贺菌分为2个不同的谱型，质粒图谱、setl／set2毒力基因PCR分为3个不同的谱型。而质粒：DNA酶切图谱分为4个不同的谱型。其中基因型完全相同的菌株35株，为引起本次菌痢暴发的流行株。7株基因型不同的菌株是本次暴发期间同时存在的散发病例。从食物中分离的菌株基因型与流行株相同，证明此次暴发是通过污染的食物而引起传播的。食堂炊事员粪便中虽然分离出了F2a志贺菌，但基因型与流行株不同，不是本次暴发的传染源。结论 DNA水平上的分型方法能更为准确、深入地揭示菌痢暴发过程中各分离株之间的流行病学联系。     

幽门螺杆菌感染胃癌发生风险与TP53基因多态性分析

目的探讨胃癌患者肿瘤抑制因子P53(TP53)基因多态性与幽门螺杆菌(Hp)感染胃癌发生风险的相关性及其对mRNA表达的影响。方法选择2018年3月-2020年3月海南医学院第二附属医院行胃癌根治术Hp阳性患者136例作为研究组,选择同期医院进行治疗的Hp阳性慢性胃溃疡患者80例作为对照组。抽取所有患者空腹外周静脉血,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对TP53基因第72密码子多态性进行检测;采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)法对cDNA中TP53基因mRNA水平进行检测;比较两组患者TP53基因多态性分布情况,分析TP53不同基因型与胃癌患者TP53mRNA水平和临床资料的关系。结果哈迪-温伯格平衡(HWE)检验结果显示,研究组和对照组患者TP53基因多态性分布具有群体代表性;两组患者TP53基因Arg/Arg、Arg/Pro基因型频率差异无统计学意义,研究组TP53基因Pro/Pro基因型频率高于对照组,差异具有统计学意义(P0.05);单因素方差分析结果发现,胃癌Hp阳性患者TP53基因不同基因型之间TP53 mRNA水平差异具有统计学意义(P0.05),但患者年龄比较差异无统计学意义,秩和检验结果发现,胃癌Hp阳性患者TP53基因不同基因型之间性别差异无统计学意义,TNM分期、分化程度差异具有统计学意义(P0.05)。结论 TP53基因Pro/Pro基因型可增加幽门螺杆菌感染者胃癌发生的风险,且与病理分级有关,在临床中可进行推广应用。     

副溶血性弧菌食源性疾病分离株的RAPD分子分型研究

目的：探讨副溶血性弧菌食源性疾病分离株的基因多态性。方法：采用随机扩增多态性分析(RAPD)对副溶血性弧菌食源性疾病分离株进行分子分型，结合SPSS软件构建以上菌株的带型关系系统树状图，对菌株进行基因多态性分析。结果：所采用引物能从副溶血性弧菌扩增出特异性的DNA条带，分型效果较好，所有46株副溶血性弧菌中大部分的RAPD结果经聚类分析可分为3个主要聚类群，较好地反应了不同血清型和不同来源菌株的亲缘关系。结论：可应用RAPD方法进行食源性疾病的流行病学调查和溯源。     

基于MOVICS集成聚类的低级别胶质瘤多组学数据整合分子分型

  目的  探讨癌症分型中的多组学整合与可视化(multi-omics integration and visualization in cancer subtyping, MOVICS)集成聚类方法在低级别胶质瘤(lower-grade gliomas, LGG)多组学数据整合分型中的应用，识别LGG高危患者，筛选出潜在的生物标志物和重要通路。  方法  采用MOVICS方法集成LGG多组学数据的10种整合方法的分型结果，得到LGG的稳健分子分型，进一步采用Cox回归研究不同分型患者的死亡风险；针对不同分型，筛选差异表达的mRNA(DEmRNAs)，miRNA(DEmiRNAs)以及差异甲基化基因(differential methylation genes, DMGs)，对三者进行联合分析得到重合基因，利用GO和KEGG分析得到重合基因富集通路，进一步分析核心基因的表达水平对生存率的影响，最后对不同分型患者进行通路活性分析。  结果  LGG患者分为三型，其中，分型3患者的死亡风险是分型1的2.794倍；筛选出1 569个DEmRNAs，140个DEmiRNAs以及337个DMGs，119个重合基因富集到有统计学差异的26条GO生物功能项和7条KEGG通路；生存分析表明DNAJB14和MTUS1可能与患者生存结局相关。通路活性分析结果显示Androgen、EGFR、Trail和VEGF通路的活性在不同分型间差异有统计学意义。  结论  MOVICS聚类集成方法能够有效地对LGG患者进行分型，识别预后高风险患者，筛选出潜在生物标志物以及重要通路，为LGG患者个体化治疗策略的制定提供理论依据。     

对应分析在分子流行病学基因分型中的应用

目的为了进一步了解分子流行病学基因分型及不同的生物表型之间的关系.方法运用对应分析方法对微生物4种不同的耐药生物表型及3种不同的基因分型进行分析.结果通过对应分析得到R型及Q型因子的载荷矩阵,并在二维图形中显示出表型与基因分型之间的相互关系,发现了不同的基因分型有相对应的表型.结论对应分析是主成分分析和因子分析的进一步扩展,可以在低维度空间直观体现行变量与列变量的关系,能够在分子流行病学基因分型研究中运用.     

Molecular Bias

Bias is ubiquitous in research. The advent of the molecular era provides a unique opportunity to study the consequences of bias with large-scale empirical evidence accumulated in the massive data produced by the current discovery-oriented scientific effort, rather than just with theoretical speculations and constructs. Here I discuss some empirical evidence about manifestations of bias in molecular epidemiology. Bias may manifest as either heterogeneity or as deviation from the true estimates. The failure to translate molecular knowledge and the failure to replicate information are some typical hallmarks of bias at action. The acquired knowledge about the behaviour and manifestations of bias in molecular fields can be transferred back also to more traditional fields of epidemiology and medical research. Getting rid of false claims of the past is at least as important as producing new scientific discoveries. In many fields, the observed effects sizes that circulate as established knowledge are practically estimating only the net bias that has operated in the field all along. Issues of plausibility (in particular biological plausibility), replication, and credibility that form the theoretical basis of epidemiology and etiological inference can now be approached with large-scale empirical data.     

Molecular medicine

The enormous advances in the biological sciences are making a dramatic impact upon clinical medicine. The emerging specialty of molecular medicine applies these theoretical and technological advances to understanding the causes, expression and rational treatment of human disease.     

走近分子成像

从工程的角度介绍分子成像的概念，说明研究分子成像的重要性，简述了实现分子成像的要点。文章着重分析了传统医学成像模式在分子成像中的作用与地位，也讨论了传统医学成像模式如何适应分子成像的需求、谋求新的技术发展的有关问题。     

Molecular Gastronomy in Spain

Beyond the overwhelming international success of Ferrán Adria, Spain has been one of the countries with a more active implication in molecular gastronomy as a scientific discipline but also in the use of ingredients, technologies, and equipment from the scientific and technological universe in the culinary area. Nowadays, this is a well-established discipline in Spain, with a number of research groups covering related topics, several companies commercializing appliances and additives worldwide, and renowned international chefs and many restaurants and companies committed to the collaboration with scientists for facing the future of Spanish gastronomy.     

分子营养学在营养科学研究中的应用

随着分子生物学和基因工程技术的飞速发展，营养学研究已经进入了一个新的时代——“分子营养学”时代。各种分子生物学技术广泛地应用在营养学研究中，从而产生了分子营养学。分子营养学的研究将为进一步阐明各种膳食营养素在人体生命活动中的作用机制奠定基础，进而有助于制定更加合理化、个性化的膳食营养指导和标准。     

Molecular biology of rickettsiae

Our understanding of the biology of the rickettsiae, organisms that are the archetype of the obligate intracytoplasmic bacterial parasites, remains muddy and fragmentary. For example although we all appreciate that the rickettsiae can exploit their unique environment, the host cell cytoplasm, but are unable to grow axenically, the basis of this fact is still one of microbiology's central mysteries. It is unfortunate, but true, that because of the inherent difficulty of working within this system, progress on the answers to such questions will be slow and laborious. However, with the application of molecular biological methods, that is, the powerful modern approaches of genetics and biochemistry, the rickettsiology community has the realistic prospect that this field is far from being at a stand-still and that significant increases in our comprehension of the fundamental problems of rickettsial biology are occurring and will continue to occur at ever accelerating rates. Some examples, both in terms of scientific conclusions and technical approaches, of the progress made in recent years and expectations for the near future will be presented.Presented at the 4th International Symposium on Rickettsiae and Rickettsial Diseases, Pietany, C.S.F.R., 1–6 October, 1990.     

Molecular epidemiology ofSalmonella enteritidis

Sixteen strains ofSalmonella enteritidis isolated in 1991 from 13 unrelated poultry-associated sources, 7 strains from 2 community outbreaks, and 18 human sporadic isolates were investigated by phage typing, analysis of rRNA gene restriction patterns (ribotyping) and plasmid profiles. Four different phage types and 10SphI patterns were found, whereas plasmids were identical in all but 4 isolates. Only one ribotype (RT A) occurred among both human and avian strains. This particular ribotype was also responsible for the two outbreaks investigated, suggesting that such strains may be of special significance for the increase ofS. enteritidis infections.