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1.
目的对不同老年人群粪便中艰难梭菌进行分离培养、鉴定以及分子型别特征研究,分析其规律特征,为积极有效地预防与控制老年人群艰难梭菌感染提供数据支持。方法收集2010年1月~2016年12月不同老年人群的粪便样本,厌氧培养艰难梭菌,并使用多位点序列分型(MLST)、毒素基因A、B和二元毒素检测、核糖体分型的方法,对老年人群分离的艰难梭菌进行研究分析。结果 116名老年人的粪便样品中分离出艰难梭菌;MLST分型得到32个型别,其中ST3、ST2、ST35、ST11为主要型别,新发现型别ST332及ST473;老年人群中艰难梭菌以产A毒素、B毒素并二元毒素阴性的菌株为主;经核糖体分型鉴定其中1株为RT027型(ST1型),发现6株RT078型(ST11型),RT001型最为常见。结论老年住院患者是艰难梭菌感染的高危人群,老年人群分离的艰难梭菌多为产毒株,ST37型非主要型别,与以往报道略有不同,并发现引起暴发流行的高毒株,应注重加强老年人群的艰难梭菌检测和预防措施。  相似文献   

2.
目的 通过对住院腹泻患者粪便中艰难梭菌的分离培养和毒力基因检测及分型,了解郴州市住院腹泻患者艰难梭菌感染状况。方法 收集2020年10-12月湘南学院附属医院、郴州市第一人民医院和郴州市第三人民医院住院腹泻患者粪便标本306例,厌氧培养法分离艰难梭菌菌株,采用荧光聚合酶链反应(RT-PCR)检测A、B毒素基因tcdA、tcdB及二元毒素基因cdtA、cdtB,并对分离的艰难梭菌菌株进行多位点序列分型(MLST)。结果 郴州市住院腹泻患者产毒艰难梭菌核酸阳性率为8.17%(25/306),>60岁患者感染风险更高(χ2=5.499,P=0.019); 306份标本中分离出17株艰难梭菌,粪便标本荧光PCR检测有25份阳性,二者比较有统计学差异(P=0.008),毒力基因检测均为tcdA2=5.499,P=0.019); 306份标本中分离出17株艰难梭菌,粪便标本荧光PCR检测有25份阳性,二者比较有统计学差异(P=0.008),毒力基因检测均为tcdA+tcdB+tcdB+,未检出二元毒素;选取7株艰难梭菌进行MLST分型,分出5个ST型,ST54型(3株)、ST129型(1株)、ST98型(1株)、ST53(1株)和ST631(1株)。结论 郴州市住院腹泻患者艰难梭菌感染率较低,感染毒素类型为tcdA+,未检出二元毒素;选取7株艰难梭菌进行MLST分型,分出5个ST型,ST54型(3株)、ST129型(1株)、ST98型(1株)、ST53(1株)和ST631(1株)。结论 郴州市住院腹泻患者艰难梭菌感染率较低,感染毒素类型为tcdA+tcdB+tcdB+,呈多种ST流行。  相似文献   

3.
目的探讨杭州地区医院获得性腹泻患者艰难梭菌的克隆分布及药敏表型特征。方法对2013年1月-2016年12月间浙江大学医学院附属第一医院及邵逸夫医院医院获得性腹泻患者的粪便标本进行艰难梭菌(Clostridium difficile,CD)培养初筛,初筛阳性菌株通过PCR扩增及测序分析16-23SrRNA基因及毒素基因(tcdA及tcdB基因),以明确CD菌种以及是否为产毒菌株;以MLST技术对产毒CD菌株进行同源性分析;并对CD菌株进行药敏敏感性试验。结果共培养CD菌株61株,其中54株为产毒菌株,tcdA及tcdB基因阳性菌株数分别为1株(A+B-)和53株(A-B+),未发现毒素基因双阳性菌株;产毒菌株来源于11个不同ST型别,其中7个ST型别为已知的;各ST型别间亲缘关系较远,ST54型别是最主要流行克隆型别占38.9%(21/54),其次是ST2、ST35和ST37,各占比13.0%(7/54);万古霉素及甲硝唑为敏感性最高的药物,未发现耐药菌株,其次是左氧氟沙星、四环素和环丙沙星,耐药率分别为16.6%、31.4%和38.8%,克林霉素及夫西地酸耐药率最高均为96.3%。结论毒素表型A-B+的ST54型艰难梭菌为本地区主要流行克隆,万古霉素和甲硝唑是有效的治疗CDI的抗菌药物。  相似文献   

4.
目的对2018-2020年昆明地区腹泻患者中艰难梭菌感染特征进行分析, 为后续监测和防治提供数据支持。方法收集2018-2020年云南省4家哨点医院腹泻患者粪便标本共388份, 使用实时荧光定量PCR方法进行艰难梭菌粪便毒素基因检测, 对结果阳性的粪便标本进行菌株的分离, 用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定菌株。提取分离菌株的基因组DNA进行多位点序列分型(MLST)。分析毒素阳性和菌株分离阳性与患者的临床特征以及艰难梭菌阳性与其他病原共感染的情况。结果 388份粪便标本中, 艰难梭菌内参tpi基因阳性标本47份, 总阳性率为12.11%。其中, 非产毒艰难梭菌4份(8.51%), 产毒艰难梭菌43份(91.49%)。47份阳性标本分离得到18株艰难梭菌, 阳性标本的分离率为38.30%。其中tcdA、tcdB、tcdC、tcdR和tcdE基因均为阳性的菌株14株。18株艰难梭菌的二元毒素均为阴性。所有分离菌株的MLST结果共形成10种序列型(ST), 其中ST37型5株(27.78%);ST129、ST3、ST54和ST2型各2株;ST35、ST532、ST48、ST27和ST3...  相似文献   

5.
目的了解中国部分地区艰难梭菌聚合酶链反应(PCR) 核糖体型别分布及其A、B毒素基因多态性,为建立适宜中国的艰难梭菌分子检测和分子分型技术提供基础数据,同时在基因水平上为艰难梭菌感染导致的复杂临床表现提供依据。方法对中国3个城市(北京、广州、济南)分离的64株艰难梭菌临床株进行PCR 核糖体分型,并对不同型别的26株代表菌株的A、B毒素基因进行扩增测序。结果64株艰难梭菌中,毒素基因型以A+B+型(45株,70.31%)为主,A-B+型19株(29.69%)。共存在9种PCR 核糖体型别,以017型(21株,32.81%)为主要型别,其次为001型(13株,20.31%)、012型(11株,17.19%)。A-B+菌株中,14株(73.68%)是017型,1株是001型。A、B毒素基因呈现一定的多态性,其中有7种A毒素序列型别(TSTA),6种B毒素序列型别(TSTB),8种A、B毒素序列型别组合(TSTG)。结论我国部分地区的艰难梭菌可能以PCR 核糖体017型为主,A、B毒素基因在菌株间存在多态性,且核糖体型别与毒素基因多态性间存在相对应的关联。应进一步扩大菌株数量和范围,探寻适合我国的分子检测和分子分型方法,从而帮助医院更好地预防和控制艰难梭菌感染。  相似文献   

6.
目的研究2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的型别,了解本地菌株分子流行病学特征。方法对66株肠道沙门菌临床分离株进行血清分型和多位点序列分型(MLST)。对其中主要血清型:鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果分布于21个血清型的66株沙门菌分成26个ST型别。发现一株纽波特沙门菌为新型ST1690。菌株血清型与MLST型别数据库中所对应的血清型符合率为100.00%。9株甲型副伤寒沙门菌的PFGE带型完全一致(P7型),与先前杭州流行菌株有差异(P1-P6型)。6株肠炎沙门菌分成4个PFGE型,型间最小相似性为92.70%。13株鼠伤寒沙门菌分为11个PFGE型,型间最小相似性为71.70%。7株萨雷甲尼沙门菌分成4个PFGE型别,型间最小相似性为91.00%。结论近年杭州腹泻病人中流行的肠道沙门菌菌株主要血清型为鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎等。甲型副伤寒沙门菌菌株在杭州出现了新PFGE型别。MLST数据可以对沙门菌血清学鉴定提供一定的帮助。  相似文献   

7.
目的:建立艰难梭菌分离培养与鉴定的表型诊断技术,并对分离获得的艰难梭菌进行分子学特征研究。方法采集杭州某医院ICU住院患者肛拭标本,接种厌氧血琼脂平皿,置厌氧培养箱,可疑菌株采用厌氧菌鉴定试剂条鉴定;用VIDAS荧光酶联免疫技术检测A/B毒素;用PCR技术检测艰难梭菌毒素基因和核糖体分型。结果28例 ICU 患者检出艰难梭菌9株,检出率为32.14%。9株艰难梭菌中, A/B 毒素表型阳性7株(77.78%),毒素基因检测均阳性。9株艰难梭菌可分为3种核糖型,其中R3型为优势株,占77.78%。结论杭州市ICU患者检出艰难梭菌的比例较高,均携带A/B毒素基因,且存在优势型别。  相似文献   

8.
目的探讨多位点基因序列分型方法在沙门菌分型鉴定研究中的应用,初步掌握广州地区沙门菌多位点基因序列分型数据。方法选取沙门菌7对保守管家基因aroC、dnaN、hemD、hisD、purE、sucA、thrA作为研究靶标,对其进行扩增、测序及序列分析。结果 41株沙门菌分离株有8个血清群和14个ST型,食品来源沙门菌菌株的血清群有7个,ST型为10个,患者来源菌株血清群为5个,ST型为10个,实验中还发现2个新的ST型。结论沙门菌血清学分群结果与MLST分型结果的对应关系密切,很多ST型菌株的血清群固定,相同血清群菌株也有较固定的ST型,因而,可运用多位点基因序列分型方法对沙门菌进行分型鉴定。  相似文献   

9.
多位点序列分型技术在沙门菌鉴定中的应用研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:探讨多位点序列分型技术(Multilocus sequence typing,MLST)在沙门菌鉴定中的应用。方法:对1株分离自腹泻病人的沙门菌疑似菌株用肠杆菌科鉴定试条API 20E进行生化鉴定并进行血清学鉴定,应用MLST分型方法对该菌株分子分型。结果:API 20E鉴定为沙门菌属,Vi因子血清不凝集,O因子血清A-F O多价不凝集。该菌的MLST型别为ST64型,提示为鸭沙门菌。结论:MLST分子分型技术有助于沙门菌的鉴别。  相似文献   

10.
目的了解医务人员中艰难梭菌携带及分子流行特征,为防控提供依据。方法收集嘉兴市第二医院2016年部分医务人员和来院健康体检成人粪便,经厌氧培养获得艰难梭菌,并结合毒素基因检测和多位点序列分型进行综合分析。结果医务人员组183份粪便标本中共分离到13株艰难梭菌,阳性率为7.10%,而健康体检成人组310份标本分离到8株,阳性率为2.58%,两者差异有统计学意义(χ~2=5.773,P=0.016);艰难梭菌阳性的医务人员,均未有腹泻症状,考虑定植,并相对散发;医务人员组tcdA~+tcdB~+菌株9株,tcdA~-tcdB~+菌株1株,tcdA~-tcdB~-菌株3株,产毒率为76.92%;多位点序列分型中,医务人员组CD发现多种ST型,但没有发现明显的优势型别。结论医务人员粪便艰难梭菌的定植相对散发,但较高的粪便阳性率和菌株产毒率亟需引起重视并加强院感防控,预防暴发流行。  相似文献   

11.
目的 研究金黄色葡萄球菌临床血流感染分离株的分子流行病学特征.方法 收集2006年1月至2008年12月解放军总医院分离的临床血流感染金黄色葡萄球菌菌株(共47株),标本来源均为患者静脉血.采用琼脂稀释法检测所有菌株对多种抗生素的耐药性,PCR方法 检测pvl毒素基因,DiversiLab~(TM)Rep-PCR分型系统分析菌株的同源性;对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行葡萄球菌染色体/mec(SCCmec)分型以及ST239型别的快速筛查;综合分型和药敏试验结果,挑选部分代表菌株进行多位点序列分型(MLST).结果 47株血流感染金黄色葡萄球菌中,pvl基因检出率为4.3%.MRSA占51.1%.MRSA均为SCCmec Ⅲ型菌株;Rep-PCR分为A~L共12个型,其中A型为最主要的型,共22株(46.8%),所有的MRSA均属于A、B两型.结论 47株临床血流感染金黄色葡萄球菌中的MRSA绝大部分为多重耐药克隆ST239-MRSA-SCCmecⅢ型.  相似文献   

12.
First results of multilocus sequence typing (MLST) for characterization of 29 invasive Streptococcus pyogenes strains isolated in the Czech Republic in the first half of 2003 are presented. None of 16 emm types detected among the study strains showed sequence type (ST) variability. The MLST results are indicative of differences between the strains causing serious diseases in the Czech Republic and those isolated in other countries. In seven strains, four new STs with known alleles in new combinations, ST134, ST308, ST336, ST340, and one new ST with three as yet undescribed alleles (gki 91, murI 65 and yqiL 60), ST341, were described. These newly described STs were submitted to the web-based reference MLST database for S. pyogenes.  相似文献   

13.
目的 了解河北省侵袭性肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae, Spn)19F型和19A型的耐药特征及多位点序列分型(multilocus sequence type, MLST)分布。 方法 19F型和19A型采用多重聚合酶链式反应(multiplex polymerase chain reaction,mPCR)进行筛选分析;采用微量营养肉汤稀释法对其进行11种常见药物的药物敏感性试验,测定其最低抑菌浓度值(minimum inhibitory concentration, MIC)并进行药物敏感性的判断;采用MLST技术对菌株进行序列分型分析。结果 15株19F型侵袭性Spn对利奈唑胺、万古霉素、左氧氟沙星呈现出完全敏感。9株19A型侵袭性Spn对氯霉素、利奈唑胺、万古霉素、头孢噻肟、左氧氟沙星呈现出完全敏感。15株19F型侵袭性Spn共检出4种序列分型(sequence type, ST),3株属于新的ST型,优势STs为ST-271(9株,60.00%);9株19A型侵袭性Spn共检出2种ST型,优势STs为ST-320(8株,88.89%)。结论 本地区19F型和19A型侵袭性Spn耐药现象较为严重,且存在多重耐药;19F型的基因型具有多变性和复杂性,而19A型的基因型则较为紧凑。  相似文献   

14.
 目的 研究耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌分子流行病学特征和碳青霉烯耐药机制,为临床经验性用药及医院感染防控提供依据。方法 对某院2019年4—9月分离的耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌进行菌种鉴定及药敏分析,mCIM联合eCIM试验筛选碳青霉烯酶,聚合酶链反应(PCR)方法检测碳青霉烯酶耐药基因,多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子流行病学特征分析。结果 8株耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌中5株来自于重症监护病房(ICU),对临床常用头孢类及加酶抑制剂药物均表现出高水平耐药的特性。所有菌株均携带金属β-内酰胺酶,7株为blaNDM-1,1株为blaIPM-4。MLST分子分型及PFGE同源性分析有6个ST序列类型,6个克隆群。ST596(3株)均为A群、ST121(1株)为C群、ST993(1株)为F群、ST91(1株)为E群、ST794(1株)为B群、ST88(1株)为D群。结论 该院耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌主要来源于ICU,产金属酶blaNDM-1β-内酰胺酶是其主要耐药机制。ST596 A群阴沟肠杆菌短时间内在ICU存在局部流行,应加强医院感染防控措施,遏制暴发流行。  相似文献   

15.
The multi-drug resistant (MDR) Acinetobacter baumannii as an important nosocomial pathogen has emerged a global health concern in recent years. In this study, we applied three easier, faster, and cost-effective methods including PCR-based open reading frames (ORFs) typing, sequence typing of blaOXA-51-like and RAPD-PCR method to rapid typing of A. baumannii strains. Taken together in the present study the results of ORFs typing, PCR-sequencing of blaOXA-51-like genes and MLST sequence typing revealed there was a high prevalence (62%, 35/57) of ST2 as international and successful clone which detected among clinical isolates of multi-drug resistant A. baumannii with ORF pattern B and blaOXA-66 gene. Only 7% (4/57) of MDR isolates belonged to ST1 with ORF pattern A and blaOXA-69 gene. Interestingly, we detected singleton ST513 (32%, 18/57) that encoded blaOXA-90 and showed the ORF pattern H as previously isolated in Middle East. Moreover, our data showed RAPD-PCR method can detect divergent strains of the STs. The Cl-1, Cl-2, Cl-3, Cl-4, Cl-10, Cl-11, Cl-12, Cl-13 and Cl-14 belonged to ST2. While the Cl-6, Cl-7, Cl-8 and Cl-9 belonged to ST513. Only Cl-5 belonged to ST1. It seems that the combination of these methods have more discriminatory than any method separately and could be effectively applied to rapid detection of the clonal complex (CC) of A. baumannii strains without performing of MLST or PFGE.  相似文献   

16.
Multilocus sequence typing (MLST) was used to examine the clonal relationship and genetic diversity of 71 Vibrio parahaemolyticus isolates from clinical and seafood-related sources in southeastern Chinese coast between 2002 and 2009. The tested isolates fell into 61 sequence types (STs). Of 17 clinical isolates, 7 belonged to ST3 of the pandemic clonal complex 3, with 3 strains isolated in 2002. Although there was no apparent clonal relationship found between clinical strains and those from seafood-related sources positive with pathogenic markers, there were clonal relationships between clinical strains from this study and those from environmental sources in other parts of China. Phylogenetic analysis showed that strains of 112 STs (61 STs from this study and 51 retrieved from PUBMLST database covering different continents) could be divided into four branches. The vast majority of our isolates and those from other countries were genetically diverse and clustered into two major branches of mixed distribution (of geographic origins and sample sources), whereas five STs representing six isolates split as two minor branches because of divergence of their recA genes, which had 80%-82% nucleotide identity to typical V. parahaemolyticus strains and 73.3%-76.9% identity to the CDS24 of a Vibrio sp. plasmid p23023, indicating that the recA gene might have recombined by lateral gene transfer. This was further supported by a high ratio of recombination to mutation (3.038) for recA. In conclusion, MLST with fully extractable database is a powerful system for analysis of clonal relationship for strains of a particular region in a national or global scale as well as between clinical and environmental or food-related strains.  相似文献   

17.
目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)进行多位点序列分型(multi—locus sequence typing,MLST)研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MI。ST分析对7个管家基因进行扩增并测序,确定菌株的序列型,对其相关性进行分析。结果两例病例分离株7个管家基因位点序列均不相同,第一例病例分离株的序列型为ST-7型,属高致病性ST-5complex/subgroupIII克隆系;第二例病例分离株的序列型为新发现的ST一9804型。结论广州两例B群流脑病例虽然发生时间相近,但分属不同的序列型,无同源性。MLST分型技术对研究不同流脑病例间的流行病学关系有重要意义。  相似文献   

18.
The objective of this study was to determine persistence of clonal strains from farm to retail by assessing the clonal relatedness of Campylobacter coli isolated on farm, peri-harvest, and at processing from 11 individually identified pigs. Phenotypic (antimicrobial susceptibility) and genotypic (pulsed field gel electrophoresis [PFGE] and multi-locus sequence typing [MLST]) characterization of isolates was conducted. There was high genetic diversity of Campylobacter isolates from on-farm fecal samples. Campylobacter isolates from farm, post-evisceration, hide, and carcass samples showed similar phenotypes and belonged to the same genotypic clusters based on PFGE and sequence types (STs) based on MLST. Five STs that have not been previously reported were identified (ST-4083, ST-4084, ST-4085, ST-4086, ST-4087). Despite high genotypic diversity of C. coli on farm, retail meat products were consistently contaminated with isolates of the same STs, particularly ST854 and ST1056, as isolates collected from previous stages confirming persistence of strains from pre- to post-harvest.  相似文献   

19.
目的 了解马鞍山地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(金葡菌)(MRSA)肠毒素、溶血素分布情况、菌株克隆群关系及其耐药性。方法 采用全自动酶联荧光免疫系统和PCR技术分别检测肠毒素和溶血素基因分布;选择金葡菌的7个管家基因作为目的基因,对34株MRSA和3株甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)进行多位点序列分型(MLST),然后与网上数据库比对,获得序列型(ST),根据eBURST的ST进行亲缘性分析;采用琼脂稀释法检测MRSA对12种抗生素的耐药情况。结果 210株金葡菌肠毒素阳性率为50.9%,溶血素基因携带率为97.1%,其中51株MRSA全部含有溶血素基因。34株MRSA有10个ST,以ST239为主(47.1%,16/34),其次为ST5(17.6%,6/34);3株MSSA的ST为ST188、ST1281和ST7。17株患者来源菌株分为6个ST,以ST239为主(35.3%,6/17),其次为ST5(29.4%,5/17);20株食品来源菌株有9个ST别,以ST239为主(45.0%,9/20),其次为ST7(15.0%,3/20)。ST585、ST630以及ST239的亲缘关系较近,其他ST之间亲缘关系较远。除万古霉素外,所有菌株对10种抗生素有不同程度的耐药。结论 金葡菌溶血素普遍存在;ST239为马鞍山地区MRSA的主要优势菌株,各ST间亲缘关系较远。  相似文献   

20.
目的分析白假丝酵母菌多位点序列分型(MLST)与标本来源、药物敏感性之间的关系,探讨菌株间的亲缘关系及其分子流行病学特征。方法收集2015年4—5月某院新生儿科病房分离的白假丝酵母菌,采用试剂盒对菌株进行体外药物敏感性测试,并采用MLST方法对菌株进行分型,分析菌株间的同源性及分子流行病学特征。结果共分离15株白假丝酵母菌,来自4例患儿和1名医务人员,15株白假丝酵母菌经MLST获得3个序列型(ST),其中13株为ST1997,另外2株分别为ST1359和ST1933。经eBURST软件对ST分型进行聚类分析,ST1997菌株属于Group 13,ST1359菌株属于Group 1,ST1933菌株属于Group 20。同一患者外周血和外周静脉导管分离的白假丝酵母菌属于同一克隆株。结论新生儿科病房存在白假丝酵母菌血流感染的暴发,应积极制定相应的预防控制措施,加强对新生儿科病房的医院感染管理。  相似文献   

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