农村婴幼儿病毒性腹泻流行病学调查

目的为预防控制婴幼儿病毒性腹泻的流行提供病原学和流行病学依据。方法以河北省卢龙县医院和妇幼保健院因腹泻住院治疗的患儿为监测对象，采用流行病学调查方法对腹泻病患儿进行检测调查。结果1236份粪便样本轮状病毒阳性率为46％；398份轮状病毒阴性样本中杯状病毒阳性率为31．6％；2种病毒腹泻感染率以12月龄的患儿所占比例最高．分别为39．3％和27．4％，其中轮状病毒9月龄患儿感染率为26．1％．6月龄为14．4％；而杯状病毒6，9，3月龄患儿感染率分别为25．6％，17．9％和16．2％。轮状病毒和杯状病毒感染发病月份基本一致，主要集中在当年12月至次年2月，分别占全年病例的86％和65％。轮状病毒毒株鉴定结果：G3型（45％）最常见，其次为G1型（35％），Q型（8％），G4型（3％），G9型（0．6％），混合感染（1％），未分型（8％）；杯状病毒经DNA测序均属于诺瓦克病毒（NLV）GⅡ遗传组。流行株为NLVGⅡ-4，GⅡ-7和GⅡ-3。结论婴幼儿病毒性腹泻的病原主要是轮状病毒，其次是杯状病毒。     

成都地区春季婴幼儿腹泻杯状病毒检测及基因序列分析

[目的]了解2010年春季成都地区婴幼儿腹泻中杯状病毒感染率、基因型和优势毒株。[方法]收集四川大学华西第二医院2010年春季(3～5月)腹泻婴幼儿的粪便标本,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测,阳性扩增片段通过T-A克隆测序,最后进行核苷酸序列的进化分析。[结果]诺如病毒NoV的检出率为12%(9/75),包括GⅠ组2例,GⅡ组7例,未检出札如病毒SaV。其中7株GⅡ组与标准毒株Lordsale相似性为93.0%～94.7%,最为接近,结合进化分析显示皆为GII-4基因型。[结论]杯状病毒是导致成都地区婴幼儿腹泻的重要病原之一,其主要流行型为NoVGⅡ-4型。     

广州市儿童秋冬季诺如病毒感染检测分析

目的 研究广东省广州市5岁以下儿童秋冬季急性病毒性腹泻诺如病毒的感染情况、基因型别和流行优势毒株.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测诺如病毒(NVs),部分阳性标本的PCR产物经纯化、测序,结合参考毒株相应的核苷酸序列进行进化分析.结果 NVs的检出率为23.88%(112/469).35株测序病毒之间的核苷酸序列同源性为70.4%～100%,均属于GH遗传组.广州市2003年秋冬季测序的11株NVs 5株为GⅡ-4;5株为GⅡ-3;另1株不能确定其型别;2004年测序的11株10株为GⅡ-4;1株为GⅡ-3;2005年所测序的13株均为GⅡ-4.结论 广州市婴幼儿秋冬季病毒性腹泻存在不同基因型NVs感染,以NV GⅡ组毒株为主,其中GⅡ-4型为流行优势株.     

2007年广西罗城县婴幼儿杯状病毒腹泻监测分析

目的了解广西罗城县2007年5岁以下腹泻住院儿童人类杯状病毒（human caliciviruses,HuCVs）分子流行病学特征。方法收集广西罗城县监测点5岁以下急性腹泻住院儿童患者粪便标本,用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）方法检测HuCVs,部分阳性标本进行序列测定和核苷酸序列比对、进化分析病毒型别,并收集相关流行病学资料。结果 HuCVs阳性检出率为9.23%（30/325）,受感染婴幼儿年龄集中在3～17月龄,感染高峰出现在8～10月。18株HuCVs经序列测定比对分析,全部属于GII-4型,17株为Europe-2006b株相似株。结论 GII-4型/2006b株是2007年广西罗城县HuCVs腹泻的优势流行株,应对广西HuCVs腹泻进行长期监测。     

天津市病毒性腹泻婴幼儿诺如病毒感染调查

为调查天津市秋冬季婴幼儿腹泻患儿中诺如病毒(Norovirus,No Vs)的感染情况,收集2009年10—12月天津市儿童医院住院部的319例疑似病毒性腹泻婴幼儿的粪便标本,采用逆转录聚合酶链反应法(RT-PCR)检测Nov的衣壳蛋白基因后,将部分阳性PCR产物测序,通过Genbank的Blast比对和系统发育树分析,推断各毒株型别。结果显示,在319件标本中,Nov的PCR阳性标本60件(GⅡ型59件,GⅠ型1例),检出率为18.81%。将24件PCR阳性产物测序和分析,1株为No V GⅠ型;23株为Nov GⅡ型,且GⅡ-4/2006b有15株,GⅡ-3有2株。感染Nov的患儿多为2岁以下且无性别差异。提示Nov是天津市秋冬季婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,且2009年仍以GⅡ-4/2006b型毒株流行为主。     

南宁市婴幼儿散发性腹泻中诺如病毒基因Ⅱ组4型变异株的流行特征

目的了解南宁市婴幼儿散发性腹泻病例中诺如病毒(Norovirus,NV)基因Ⅱ组(GenogroupⅡ,GⅡ)4型变异株的组成和流行特点。方法采集2010年1月~2011年12月南宁市某医院门诊354例婴幼儿腹泻病例的粪便标本,应用实时荧光逆转录-聚合酶链反应检测NV核酸及其基因组,阳性标本进行核苷酸序列测定和遗传进化分析。结果 354份标本中,NV核酸检测阳性101份,阳性率28.5%,全部属于GⅡ。对测序成功的84株NV的核苷酸序列进行分析,77.4%属于GⅡ.4型(65株),其余为GⅡ.2型(7株)、GⅡ.14型(4株)、GⅡ.7型(3株)、GⅡ.3型(2株)、GⅡ.6型(2株)和GⅡ.12型(1株)。65株GⅡ.4型中,60株(92.3%)为2006b变异株,5株(7.7%)为2010变异株。结论 GⅡ.4型是南宁市婴幼儿中NV所致散发性腹泻的最主要基因型,其中2006b变异株占优势。首次在本地区检测到2010变异株,且该毒株的流行呈上升趋势。有必要加强监测,以及时掌握GⅡ.4型变异株的流行变迁。     

2011年西宁地区儿童腹泻病毒流行病学调查

目的:对2011年西宁市腹泻病毒进行流行病学调查,对青海省腹泻病毒流行株和流行趋势进行统计分析,为腹泻病毒引起的腹泻提供实验室资料,更好地控制病毒性腹泻的流行。方法:用巢式PCR和多重PCR方法对西宁地区488例婴幼儿腹泻标本进行腹泻病毒检测。结果:西宁地区腹泻儿童中腹泻病毒的检出率分别为:轮状病毒A组阳性33例(6.76%),其中G9型15例、G3型13例、P6型1例、P8型2例、P9型2例;轮状病毒B/C组阳性3例(0.61%);杯状病毒阳性23例(4.71%),其中扎如病毒17例、诺如病毒GⅡ型6例;星状病毒阳性7例(1.43%)。结论:轮状病毒A组和杯状病毒是西宁地区婴幼儿腹泻的主要病原体之一。     

天津市婴幼儿病毒性腹泻诺如病毒检测

目的研究天津市秋冬季婴幼儿腹泻患儿中诺如病毒感染的流行情况及其基因型别。方法 2008年10-12月收集天津市儿童医院住院部310例疑似病毒性腹泻的婴幼儿粪便标本,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测粪便中诺如病毒核酸,并将部分阳性株的PCR产物进行测序,采用序列分析软件分析测序结果 ,推断其毒株型别。结果 310份腹泻标本中,诺如病毒RT-PCR阳性37份(GII型37份,GI型0例),检出率为11.94%;23份PCR产物送往测序,经Genebank Blast及系统进化树分析,所有诺如病毒均为诺如病毒基因组Ⅱ型,其中GII-4/2006b占95.65%(22/23),GII-3占4.35%(1/23);感染诺如病毒的患儿多为1岁以下,且11月份检出率最高。结论诺如病毒是天津市秋冬季婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,2008年诺如病毒以GII-4/2006b型毒株流行为主。     

2009-2010年湖南省哨点医院婴幼儿病毒性腹泻病原学研究

目的了解湖南省哨点医院2009-2010年常见腹泻病毒的病原学特征,为病毒性腹泻的综合防治提供科学依据。方法收集湖南省哨点医院2009-2010年5岁以下住院腹泻患儿的粪便标本,采用Dako公司酶免疫试剂盒检测轮状病毒,采用逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)进行分型鉴定;采用聚合酶链反应(PCR)检测腺病毒;逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测星状病毒和杯状病毒,对部分PCR阳性标本进行测序加以验证。结果检测2009-2010年湖南省哨点医院婴幼儿腹泻标本759份,其中轮状病毒占22.79%(173/759)、杯状病毒占9.22%(70/759)、腺病毒占4.61%(35/759)、星状病毒占0.79%(6/759)、混合感染占2.50%(19/759)。173份轮状病毒G血清型与P基因型以G1、G3、P[4]型为优势株。四种病毒主要是感染2岁以下婴幼儿,且有明显的季节特征。测序结果证实12份阳性标本的PCR产物均为其所对应的病毒。结论轮状病毒是2009-2010年湖南省婴幼儿病毒性腹泻的最主要病原,杯状病毒、腺病毒和星状病毒也是本省婴幼儿病毒性腹泻的重要病原。     

成都地区腹泻病例人杯状病毒感染状况研究

目的 了解成都地区2010年7～12月之间人杯状病毒感染性腹泻的情况.方法 采集成都市2家哨点医院2010年7～12月之间腹泻病人的大便标本501份,采用RT-PCR方法,对501份大便标本同时进行诺如病毒、札如病毒核酸检测.结果 501份标本中检出阳性122份,核酸阳性率为24.35％ (122/501),其中诺如病毒GⅠ型1份,占阳性标本的0.82％ (1/122);诺如病毒GⅡ型100份,占阳性标本的81.97％ (100/122);札如病毒18份,占阳性标本的14.75％(18/122);诺如病毒GⅡ型和札如病毒共同感染3份,占阳性标本的2.46％ (3/122).5岁以下儿童患者标本病毒核酸阳性检出率为24.3％ (109/449),其中诺如病毒GⅡ型的检出率最高;5～18岁患者标本病毒核酸阳性检出率为14.29％(1/7),标本检验结果为诺如病毒GⅡ型;18岁以上患者标本阳性检出率为26.67％ (12/45),其中诺如病毒GⅡ型检出率最高.9、10、11 3个月病毒核酸检出率较高,其中9月份病毒核酸检出率最高为36.51％ (23/63).结论 成都地区人杯状病毒感染性腹泻的病原体以诺如病毒GⅡ型为主,主要在秋冬季节高发,且婴幼儿和成人同样容易感染.     

杭州地区2009-2010年急性腹泻患者中杯状病毒的检测和分型

目的 了解2009-2010年杭州地区急性腹泻患者中杯状病毒基因型别和分子流行病学特征.方法 收集2009-2010年杭州地区920例急性腹泻患者的粪便标本和流行病学资料,用多重PCR方法进行杯状病毒检测,测定部分标本的阳性扩增片段基因序列,并对序列进行系统进化分析.结果 急性腹泻患者杯状病毒检出率为21.8％(201/920),其中诺如病毒(NV)G Ⅰ型25例、GⅡ型170例、札如病毒(SAV) 11例,4例为NVⅠ型和Ⅱ型混合感染、1例为NVⅡ型和SAV混合感染.NV基因型别包括:GⅠ-1(3株)、G Ⅰ-2(1株)、GⅡ-4/2006b变异株(7株)、GⅡ-2(1株)、GⅡ-7(1株)和GⅡ-4/2008变异株(2株);SAV基因型别包括:G Ⅰ -2(5株)、GⅠ-1(4株)和GⅡ-1(1株).杯状病毒的流行在不同季节、年龄组人群均有发病.结论 杯状病毒是2009-2010年引起杭州地区急性腹泻的主要病原之一,其病原具有病毒多样性和基因型别多样性,NVGⅡ-4/2006b变异株或类似株可能是2009-2010年杭州地区流行的优势株.     

广东省2012年病毒性腹泻病原学特征分析

目的系统掌握广东省病毒性腹泻的病原学特征及变化趋势,为病毒性腹泻防治工作提供参考依据。方法在广东省选择广州、深圳、肇庆等11个地级市23家哨点医院,每家哨点医院每周至少收集≤5岁和〉5岁门诊就诊腹泻病例粪便样本各3份进行轮状病毒和诺如病毒检测。结果2012年广东省11个哨点监测市23家哨点医院共采集门诊腹泻病例粪便样本4644份,轮状病毒和诺如病毒阳性检出率分别为13．94％（645／4627）和22．14％（1028／4644）。轮状病毒≤5岁年龄组阳性率为18．60％（445／2393）,〉5岁年龄组阳性率为8．95％（200／2234）,差异有统计学意义（P〈0．01）。诺如病毒≤5岁年龄组阳性率为21．88％（524／2395）,〉5岁年龄组阳性率为22．41％（504／2249）,差别无统计学意义（P〉0．05）。轮状病毒阳性检出率最高的月份是1月,为41．50％（105／253）;诺如病毒阳性检出率最高的月份是10月,为40．15％（218／543）。从1028份诺如病毒阳性样本中随机抽取226份进行序列测定,结果显示诺如病毒基因型GII型203份、GI型23份。203份GIL型中,GIL4型172份（其中GIL 4Sydney2012变异株87份、GIL 42006b变异株78份、GIL42010变异株4份、未分型3份）。结论2012年广东省病毒性腹泻的优势病毒是诺如病毒,而诺如病毒占优势与出现新的诺如病毒GIL4Sydney2012变异株有关。     

乌鲁木齐地区腹泻患儿腺病毒感染的检测和分型

目的:了解2011年乌鲁木齐地区腹泻患儿腺病毒(AdV)的感染情况,分析该地区AdV的基因亚型,进行AdV感染分子流行病学调查。方法:采集在新疆维吾尔自治区人民医院住院和门诊≤5岁腹泻患儿粪便标本315份,采用胶体金法检测轮状病毒(RV)抗原,采用聚合酶链反应(PCR)法对上述标本进行AdV检测,并对AdV阳性标本测序明确基因型。结果:315份粪便标本中共检出AdV阳性12例,总阳性率为3.81%,低于RV检出率26.35%,AdV和RV混合感染3例。AdV阳性标本中肠道腺病毒(EAdV,F组)Ad41占2.54%(8/315),其次是非肠道腺病毒(NEAdV)占1.27%(4/315),分别为Ad1、Ad3、Ad5、Ad7、Ad31型。12份阳性标本测序结果提示该地区AdV与参考株的核苷酸序列同源性为73%～99%。结论:乌鲁木齐地区AdV感染呈全年散发流行,未表现出明显的季节性,其主要的流行株为Ad41型。     

Molecular characterization of norovirus GII.17 detected in healthy adult,intussusception patient,and acute gastroenteritis children in Thailand

Noroviruses (NoVs) have been recognized as a leading cause of sporadic cases and outbreaks of acute gastroenteritis in all age groups. During the surveillance of NoVs in Chiang Mai, Thailand, four cases of the novel GII.17 NoVs were sporadically detected by RT-PCR in 2014–2015. The first case of GII.17 was detected in a healthy adult who worked for a restaurant. The second case was found in a pediatric patient who admitted to the hospital with intussusception. The third and fourth cases were found in acute gastroenteritis children. Phylogenetic analysis clearly demonstrated that GII.17 NoVs detected in this study were genetically closely related with the novel GII.17 Kawasaki reference strains. These four GII.17 NoV positive specimens were also tested by two immunochromatographic test kits in order to evaluate the sensitivity for GII.17 NoV detection. The viral loads in those specimens were determined by real-time RT-PCR. The sensitivity of GII.17 NoV detection varies by individual test kits and also depending on the amount of the viruses contained in the fecal specimens. In summary, our study reported the detection of novel GII.17 NoVs in a wide range of subjects with and without diarrhea. Therefore, continued comprehensive screening and genetic molecular characterization of NoV strains circulating in this area need to be further investigated.     

2012-2014年湖南省感染性腹泻哨点医院儿童诺如病毒感染及基因型别分析

目的 了解湖南省感染性腹泻哨点医院儿童诺如病毒的感染状况及基因型别。 方法 2012年1月-2014年12月采集湖南省哨点医院腹泻患儿的粪便标本,应用诺如病毒特异性引物进行扩增,选择扩增阳性产物进行基因测序和进化分析。 结果 936份粪便标本RT-PCR检测诺如病毒核酸,阳性100份,阳性率10.68%。对40份诺如病毒核酸阳性标本进行基因序列测定与分析,38份为GⅡ型,其中31份为GⅡ.4型。在31株GⅡ.4型中,Sydney 2012和GII.4 Den Haag 2006b各栓出14株。 结论 2012-2014年湖南省哨点医院儿童腹泻病例中诺如病毒的感染率较高,GⅡ.4是优势株,其中GⅡ.4 sydney 2012和Den Haag 2006b是主要型别。     

厦门地区婴幼儿腹泻诺如病毒分子流行病学研究

目的:了解厦门地区婴幼儿腹泻诺如病毒(NV)分子流行病学特征。方法:收集2010年5月～2011年4月全年轮状病毒抗原阴性的急性非细菌性腹泻标本,用实时荧光RT-PCR法扩增NV ORF1-ORF2结合区,测序扩增片段后进行比对、分型及构建系统进化树。结果:全年共获得366份标本,共检测出81份为NV阳性标本,其中GI组5例,GII组76例;NV在厦门地区全年可见散发,但在每年7和11月有明显的流行高峰,且腹泻感染患儿主要集中在3岁以下;已分型的NV基因组(55例)以GII-4/2006b占绝对优势,其构成比达60.00%(33/55),其余为GII-3占25.45%(14/55),GII-6占5.45%(3/55),GII-2占3.64%(2/55),此外GII-12、GI-4、GI-5各占1.81%(1/55)。结论:厦门地区NV夏秋季发病率较高,GII-4/2006b变异株为优势株,且感染的NV可能存在病毒重组。     

Novel intergenotype human norovirus recombinant GII.16/GII.3 in Bangladesh

Noroviruses (NoVs) are one of the major etiological agents of acute gastroenteritis in all age groups. In this study, we identified an intergenotype NoV recombinant strain in the fecal specimens of two male infants with acute diarrhea in Bangladesh. Phylogenetic analysis showed that the identified strains were recombinant NoV strains with a GII.3 capsid and a GII.16 polymerase gene. The recombination breakpoint was located in the ORF1/ORF2 overlap region. To the best of our knowledge this is the first report of a NoV recombinant GII.16/GII.3 strain worldwide.