上海市肠炎沙门菌流行特征和分子分型研究

[目的]分析上海市2006—2007年肠炎沙门菌菌株,了解上海市肠炎沙门菌分子流行病学特征。[方法]回顾2002—2007年肠炎沙门菌食品株来源并与肠炎沙门菌腹泻株作耐药性比较;对2006—2007年全球沙门菌监测(GSS)病例和食品分离的肠炎沙门菌进行表型验证、药敏试验和脉冲凝胶电泳(PFGE)分析。[结果]2006—2007年肠炎沙门菌在本市非伤寒沙门菌病例中列首位,而80%的食品株源自禽及禽肉制品,食品株的抗生素耐药性高于腹泻株。2007年肠炎沙门菌腹泻株的耐药谱和2006年有较大差异。包括13株食品株在内共76株肠炎菌株可分为21种PFGE带型,遗传同源性接近80%,优势带型依次为3型(34株)、1型(12株)、2型(5株)和5型(5株),除2型外均发现有与腹泻株同型的食源株。2006和2007年的PFGE 1/2型病例分别为4例和12例。[结论]上海市肠炎沙门菌病例与食用污染的鸡肉等禽类制品有密切关系,PFGE 3型肠炎沙门菌是目前上海市肠炎沙门菌流行株的优势菌型,2007年发现由鹅肝传播的1/2型肠炎沙门菌可能是3型的变异株并有取代之成为流行菌株的趋势。开展对腹泻病例和食物链的综合监测和以实验室为主的实时分子分型检测能快速预警肠炎沙门菌散在爆发和追溯污染源。     

北京市不同来源非伤寒沙门菌的分子分型和耐药性分析

目的分析北京市不同来源非伤寒沙门菌的分子流行病学特征及耐药情况。方法对腹泻患者粪便和食品中分离的53株非伤寒沙门菌进行血清分型,并对所有菌株进行PFGE分型和抗生素敏感性检测。结果腹泻患者粪便来源和食品来源沙门菌的血清型分布不同,食品中分离到6株鼠伤寒沙门菌单项变种1,4,[5],12:i:-。53株非伤寒沙门菌通过PFGE分型分为31个不同的带型,每个带型包含1~10株菌,同一血清型菌株PFGE带型聚集成簇。抗生素敏感性结果显示,79.25%的菌株对至少一种抗生素耐药,其中多重耐药菌株14株。耐药率高的前三种抗生素分别是:萘啶酸60.38%、四环素35.85%、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑18.88%。两种来源的印第安纳沙门菌的耐药情况严重。结论北京市不同来源非伤寒沙门菌的耐药情况比严重,多重耐药菌株的PFGE带型多样,加强耐药监测和分子分型网络化、合理使用抗生素意义重大。     

上海市虹口区2010—2012年腹泻病例沙门菌监测及分子型特征

[目的]研究基于公共卫生实验室主动监测哨点医院沙门菌腹泻及优势菌型的耐药性和分子型特征。[方法]选择辖区内2家医院作为主动监测哨点,甄别食源性感染性腹泻的病例并采集粪便标本进行沙门菌培养、血清型鉴定和抗菌药物耐药性试验,通过脉冲场凝胶电泳（ PFGE ）分析优势菌型的遗传同源性。[结果]2010—2012年,共检测2579份标本,分离沙门菌185株（年度阳性率分别为9．1％、6．8％、5．1％,总阳性率为7．2％）,涵盖23种不同血清型,最常见的为肠炎和鼠伤寒沙门菌。所有沙门菌感染病例的男女性别比为0．9∶1;肠炎和鼠伤寒沙门菌感染均以21～60岁（68．9％）和60岁以上（21．4％）者居多。肠炎和鼠伤寒沙门菌对萘啶酸、磺胺异噁唑、链霉素、甲氧嘧啶、庆大霉素、四环素等6种抗菌药物的耐药率分别为27．7％～96．9％和2．6％～63．2％,且肠炎沙门菌的耐药率显著高于鼠伤寒沙门菌（P值均＜0．05）。22株肠炎和20株鼠伤寒沙门菌经PFGE各自分为11个和6个分子型。[结论]肠炎和鼠伤寒是区域内最常见的沙门菌腹泻菌型,分子分型提示存在优势克隆的聚集性爆发和分散爆发,应警惕多重耐药的肠炎沙门菌克隆株形成潜在爆发的风险。加强以实验室为基础的主动监测对控制食源性感染性腹泻具有重要的公共卫生意义。     

鼠伤寒沙门菌临床分离株对喹诺酮类药物耐药机制的研究

目的 研究引起儿童腹泻鼠伤寒沙门菌对喹诺酮类抗菌药物的耐药机制.方法 采用K-B法测定62株鼠伤寒沙门菌对常用抗菌药物的敏感性;应用PCR法和DNA测序法检测喹诺酮耐药决定区(QRDRs)和质粒介导的喹诺酮耐药基因;采用接合试验测定耐药基因的转移性;PFGE法测定耐药菌株的同源性.结果 62株肠伤寒沙门菌中有40株对环丙沙星耐药(MIC≥0.5 μg/ml),其中28株为低水平耐药,12株为高水平耐药,且所有对环丙沙星耐药菌株同时对其他多种抗菌药物耐药;40株环丙沙星耐药菌株分属于4种PFGE型,分别是A型7株、B型4株、E型1株、D型28株;两株对环丙沙星高水平耐药菌株同时存在gyrA和parC两个位点的突变,其余环丙沙星耐药菌株仅发现gyrA 1个位点的突变,未检测到qnr和qepA基因;62株鼠伤寒沙门菌中有23株为aac-(6′)-Ib-cr阳性,其中19株PFGE分型为D型.结论 腹泻患儿分离的肠伤寒沙门菌对环丙沙星耐药率高,喹诺耐耐药决定区gyrA基因的点突变和携带aac-(6′) -Ib-cr基因是导致鼠伤寒沙门菌对环丙沙星耐药的主要原因.     

玉林市婴幼儿腹泻感染非伤寒沙门菌分子分型和耐药情况分析

目的了解婴幼儿感染的非伤寒沙门菌的分子分型和耐药情况。方法收集了2018年玉林市中医医院综合儿科门诊3岁以下腹泻患儿401份粪便标本,按照《2018年食源性疾病监测工作手册》进行沙门菌增菌、分离鉴定、分子分型及药物敏感试验。同时,把检出优势的非伤寒沙门菌血清型通过脉冲场凝胶电泳分析技术(PFGE)进行分子分型;把优势血清型与其他血清型沙门菌的药敏结果进行比对来了解其不同之处。结果腹泻患者共分离出29株非沙伤寒沙门菌,检出率为7.2%(29/401)。血清型主要为鼠伤寒沙门菌,占非伤寒沙门菌总数的62.1%(18/29)。18株鼠伤寒沙门菌可分为17个PFGE型别,其中2株为同一PFGE型,4株PFGE带型相近。药敏结果显示所有非伤寒沙门菌菌株均对亚胺硫霉素、头孢西丁、环丙沙星、氨苄西林/舒巴坦、阿奇霉素敏感,对其余9种抗菌药物产生不同程度的耐药。29株非伤寒沙门菌总体耐药率为96.6%(28/29),其中氨苄西林耐药率为86.2%(25/29),四环素为75.9%(22/29),氯霉素为69.0%(20/29),甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲噁唑为62.1%(18/29)。鼠伤寒沙门菌四环素耐药率高于其他血清型非伤寒沙门菌四环素耐药率;多重耐药方面:鼠伤寒沙门菌以4、5种耐药占比大,1或2种耐药占比较少,尤其是2种耐药比率明显低于其他血清型非伤寒沙门菌(P值=0.014)。结论婴幼儿感染的非伤寒沙门菌部分菌株高度同源且耐药情况相当严重。     

自贡市2007-2010年鼠伤寒沙门菌感染的脉冲场凝胶电泳分析

目的 回顾性分析自贡市2007-2010年分离到的沙门菌菌株,评估分子分型技术在食源性传染病暴发识别和处置中的价值。 方法 对自贡市2007-2010年从食品和腹泻患者中分离的沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,用 BioNumerics软件分析菌株之间的相似度。 结果 55株沙门菌中,来源于2007-2008年的10个腹泻患者粪便和2008年的15个皮蛋中的25株鼠伤寒沙门菌菌株PFGE带型相似度为100%,均为P9带型。 结论 感染鼠伤寒沙门菌的皮蛋是导致自贡市2007-2008年10名患者腹泻暴发的污染源,为快速准确识别食源性疾病暴发并及时溯源、控制,应在食品安全监测中普及PFGE等分子分型技术。     

广西食源性鼠伤寒沙门菌血清型和分子特征研究

目的掌握广西食源性沙门菌优势血清型,建立广西食源性沙门菌优势血清型脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱资料库。方法对2015年收集的菌株进行血清分型,用PFGE方法对优势血清型鼠伤寒沙门菌进行分子分型,结合相关流行病学信息进行分析。结果 2015年从广西共收集到330株沙门菌,80株经血清学鉴定为鼠伤寒沙门菌,其中哨点医院病例中77株,食品中3株。80株鼠伤寒沙门菌经Xba I酶切分为67种型别,其中24株菌11种型别同源性分别达到100%,优势型别为JEX001.CN0056(3株)和JEX001.CN0062(3株)。36株菌26种型别同源性达到96%以上,JEX001.CN0015为食品分离株与腹泻病例株完全匹配型别。结论鼠伤寒沙门菌是2015年广西食源性沙门菌的优势血清型,呈高度散发状态。食品分离株与临床株之间同源性不高,但大部分散发腹泻菌株具有高度同源性。     

广东省2009-2013年沙门菌对环丙沙星耐药特征分析

目的了解广东省2009—2013年腹泻病例分离沙门菌对环丙沙星的耐药状况。方法采用纸片扩散法测定广东省通过全球沙门菌加强监测系统(ESS)收集的腹泻病例分离沙门菌对环丙沙星的耐药性,对耐药和中度敏感菌株的病例进行描述性流行病学分析,并对耐药菌株的脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分型。结果广东省2009—2013年间通过ESS监测系统共分离到沙门菌2939株,其中耐环丙沙星菌253株(8.61%),中度敏感菌665株(22.63%)。7岁以下携带耐药菌株的病例占总携带耐药菌株的病例的73.52%(186/253),携带中度敏感菌株的病例则为总携带中度敏感菌株的病例的76.84%(511/665)。2009—2012年环丙沙星耐药率呈升高趋势(P0.01)。东莞、佛山、广州、中山及珠海地区分离到的耐药菌株占全省的86.96%(220/253)。253株耐药菌株涵盖34种血清型,鼠伤寒沙门菌、I4,5,12:i:-、肠炎沙门菌、斯坦利沙门菌、德尔卑沙门菌为主要血清型。PFGE结果显示同一血清型中有部分相同的克隆系,呈现高多态性。结论广东省沙门菌对环丙沙星总体耐药率低,2009—2012年间逐步升高。耐药菌株PFGE型别多样,呈现遗传多态性。     

长沙市沙门菌表型特征及PFGE分子分型

目的研究长沙市沙门菌的血清型分布、耐药特点及分子流行病学特征。方法对分离自长沙地区食源性疾病粪便标本及市售食品中的70株沙门菌,用玻片凝集试验确定血清型,微量肉汤稀释法检测14种抗生素的敏感性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果鼠伤寒沙门菌为优势血清型,占51.43%,其次是肠炎沙门菌,占7.15%。在抗生素敏感性测试中,对氨苄青霉素、磺胺嘧啶和氯霉素的耐药率较高,分别为68.57%、61.43%和57.14%。62.86%(44/70)的沙门菌呈多重耐药,且鼠伤寒沙门菌的多重耐药率比其他血清型高,差异有统计学意义(χ2=7.068,P0.01)。PFGE分型结果显示69株沙门菌按照100%的相似度可分为57个PFGE型,36株鼠伤寒沙门菌可分为4个聚类,相似度在58.1%~100%之间。结论本市的沙门菌以鼠伤寒和肠炎沙门菌为主,PFGE分型结果显示可能存在沙门菌的流行株,且菌株耐药形势严峻。     

2007年四川省鼠伤寒沙门菌PFGE分型及溯源

目的 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术.研究四川省2007年鼠伤寒沙门菌分子流行病学,查找沙门菌污染源,为预测疫情和制定防治措施提供依据.方法 选择Xba I酶对12株鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切,用PFGE对菌株进行分子分型,Bionumerisc统计软件聚类分析.结果 12株鼠伤寒沙门菌用XbaI限制性酶切后,分成5个PFGE图谱类型,其中1个PFGE图谱类型有7株菌株,其指纹图谱的相似性达到100%,该型别占分析菌株的58.33%.其余4个PFGE图谱类型分别有2株菌和1株菌.含7株菌的PFGE图谱型中,源于成都市的菌株4株,攀枝花、自贡和内江市的菌株各1株.结论 PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对鼠伤寒沙门菌食源性疾病的溯源和预警.     

2009年茂名市食源性沙门菌菌型分布及药敏结果分析

目的:分析茂名市食源性沙门菌菌型分布和耐药性,为防治沙门菌引起食源性疾病提供科学依据。方法:对27株分离于食品、腹泻病例和食物中毒的沙门菌进行血清学分型和药物试验。结果:27株沙门菌分属6个血清群11个血清型,以德尔卑沙门菌占主要优势,占29.63%,其次是鼠伤寒沙门菌和伦敦沙门菌,分别占14.81%;对加替沙星和亚胺硫霉素(泰能)100%敏感,对罗米沙星、氧哌嗪青霉素/泰舒和头孢他定的敏感率均为96.30%,对复方新诺明、氨苄青霉素、阿莫西林/棒酸和丁胺卡那霉素,耐药率分别为96.30%、92.59%、62.96%和62.96%,对头孢西丁等13种其他抗生素有不同程度耐药。结论:茂名市食源性沙门菌血清型主要是德尔卑沙门菌、鼠伤寒沙门菌和伦敦沙门菌;加替沙星和亚胺硫霉素(泰能)为首选治疗药物。     

志贺菌261株菌型分布及耐药分析

目的了解上海市闵行区志贺菌菌型分布及药物敏感特点,为痢疾防治提供科学依据。方法将2007—2009年送检的肠道腹泻病人中分离出的志贺菌进行菌型分型,采用K-B法进行药物敏感试验。结果 2007—2009年间共检出261株志贺菌,主要为福氏志贺菌和宋氏志贺菌。其中福氏志贺菌190株(72.80%),宋氏志贺菌71株(27.20%)。190株福氏志贺菌中有10个血清型(F1 a14株,F2 a100株,F2b13株,F4 a4株,F4 c38株,FX变种7株,FY变种11株,F4b、F5 a、F6型各1株)。261株志贺菌对复方新诺明、氨苄西林、四环素、利福平、萘啶酸的耐药率分别为87.36%、88.12%、86.97%、81.23%、96.93%。结论该区志贺菌的耐药情况严重,且多重耐药,所以应加强耐药性监测和防治。     

支原体耐药性变迁的研究

目的了解解放军174医院临床标本分离的支原体耐药性变迁,更好地指导临床合理用药。方法对2006-2008年就诊的可疑非淋菌性阴道炎（NGU）患者进行支原体的培养及药敏检测,抽取2006年230例,2007年和2008年各300例进行耐药变迁分析。结果交沙霉素（JOS）3年的耐药率均〈20％,喹诺酮类药物氧氟沙星（OFL）、左氧氟沙星（LEV）和司帕沙星（SPA）的耐药率呈较高水平。大环内酯类药物阿奇霉素（AZI）和罗红霉素（ROX）耐药率较高,尤其在解脲脲原体（Uu）＋人型支原体（Nh）混合感染中,喹诺酮类和大环内酯类的耐药率均在持续高水平状态,四环素类抗生素在混合感染中耐药率显著上升。结论强力霉素（DOX）、美满霉素（MIN）和交沙霉素（JOS）为治疗支原体的首选药物,但应定期监测支原体的耐药性变迁。     

南宁市住院结核病患者耐药情况分析

[目的]分析近年来南宁市住院结核病患者结核分枝杆菌耐药情况,为临床治疗和制订预防措施提供参考依据。[方法]回顾性研究某院1999年1月~2006年12月住院结核病患者结核分枝杆菌耐药性检验资料,并与2000年第四次全国结核病流行病学调查资料比较。[结果]结核分枝杆菌培养阳性2769株,总耐药率、初始耐药率和获得性耐药率分别为36.8%、25.1%、59.6%。总耐多药率,初始耐多药率和获得性耐多药率分别为15.6%、6.7%、32.6%。耐药株的耐药顺位由高到低依次为利福平(R)25.3%、异烟肼(H)22.0%、链霉素(S)17.4%、乙胺丁醇(E)13.0%。[结论]该区结核病耐药情况十分严峻,需进一步加强结核病治疗和管理。     

一起由鼠伤寒沙门菌引起食源性疾病的调查

目的探究一起群体性食源性疾病的病因。方法依据GB／T4789—2003、GB15984—1995、GB17012—1997、GB16002—1995进行调查和致病菌检测。结果7份患者肛拭样品检出鼠伤寒沙门菌,检出率33．3％;8份厨房工作人员肛拭中,5例检出鼠伤寒沙门菌,检出率62．5％。结论结合流行病学调查、临床资料和实验室检测结果进行分析,确认该次食源性疾病由鼠伤寒沙门菌所致。     

2004—2007年某医院1885株临床病原菌的分布与耐药分析

目的了解新乡市第一人民医院2004—2007年1885株临床常见病原菌分布及耐药情况。方法菌株鉴定采用复星公司FORTUNE.2000和珠海黑马生物工程有限公司全自动微生物鉴定系统,药敏试验用纸片扩散法（K-B法）。结果在1885株病原菌中革兰阴性杆菌60.3%,革兰阳性球菌35.7%,真菌4.0%。对革兰阴性杆菌耐药率较低的抗菌药物为亚胺培南、头胞他啶、阿米卡星、呋喃妥因等。某些常见抗菌药物,如头孢他啶、哌拉西林、左氧氟沙星、四环素等2004、2005、2006年耐药率逐年提高,2007年明显降低。对革兰阳性球菌耐药率较低的抗菌药物为万古霉素、亚胺培南、利福平等,青霉素、苯唑西林等2004、2005、2006年耐药率逐年提高,2007年明显降低。红霉素、阿奇霉素、复方新诺明、环丙沙星2006年已开始降低,亚胺培南、头孢唑林、克林霉素、利福平、四环素等有耐药率升高的趋势。结论开发抗菌药物、加强细菌的耐药性检测及强调抗菌药物的合理使用等,依然是今后抗感染界控制细菌耐药性蔓延的主要措施。     

广东省2007年度非伤寒沙门菌监测及病原学特征分析

目的 了解广东省腹泻病患者中非伤寒沙门菌感染情况和菌株的血清型别、分布、耐药性变化.方法 对纳入研究的腹泻病患者进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型.结果 2007年度共检测1128份腹泻粪便标本,分离到71株沙门菌,阳性检出率为6.29%;共分得29种血清型,肠炎和鼠伤寒沙门菌居多;大多数沙门菌对常用的头孢类和喹诺酮类抗生素敏感,鼠伤寒沙门菌的耐药率普遍较肠炎和斯坦利沙门菌高;除肠炎沙门菌外,其余的血清型没有同一PFGE型别的菌株;用Xba Ⅰ酶切17株肠炎沙门菌可分为PFGE-XbaⅠ 1～8型,其中PFGE-XbaⅠ 4型为优势型别.用Sfi Ⅰ和Not Ⅰ酶对12株肠炎沙门菌进行再分型,综合用Xba Ⅰ/Sfi Ⅰ/Not Ⅰ三种酶的结果 发现仍有三组菌的PFGE图谱是完全一致的.结论 2007年度广东省非伤寒沙门菌的感染多数为散发病例,头孢类和喹诺酮类抗生素是治疗非伤寒沙门菌感染的首选药物.     

商丘市2006～2010年沙门菌感染性腹泻监测结果分析

[目的]了解某市沙门氏菌所致感染性腹泻发病特征、主要血清型别和耐药谱,帮助分析流行趋势,指导临床用药。[方法]在城市2个区的监测点社区门诊采集监测病例的粪便标本进行沙门菌培养,菌株进行血清分型及耐药监测,收集病人临床及流行病学。[结果]5年来共采集2327份腹泻病例标本,检出85株沙门菌,总检出率3.65%。鉴定出14个血清型,5株未定型,占前4位的依次为阿贡纳沙门菌、山夫登堡沙门菌、肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌,构成比分别为28.24%、15.29%、10.59%、10.59%,并检出了一些少见血清型如胥伐成格隆、旺兹沃斯。已知血清型的80株沙门菌对头孢噻肟、头孢他啶等头孢类抗生素敏感率100%,对奈啶酸、四环素、复方新诺明、氯霉素的耐药率分别为45%、26.25%、16.25%、12.5%。[结论]应加强沙门菌监测,追踪传播来源,提高暴发流行的预警能力,经验用药治疗时选择敏感药物。     

2010年北京市西城区肠道病原菌监测结果

目的监测北京市西城区感染性腹泻发病情况,分析主要病原菌种类变化及耐药趋势,为感染性腹泻的流行病学研究及临床合理用药提供依据。方法参照中华人民共和国卫生行业标准WS 287-2008、WS 271-2007、WS 289-2008进行病原菌分离、鉴定。参照美国临床和实验室标准协会(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)推荐的Kirby-Bauer法进行药物敏感性试验。结果监测结果显示,8—10月份为腹泻病高发期,308份标本中,检出病原菌39株,检出阳性率为12.66%。以弧菌属为优势菌群,其次为沙门菌和志贺菌,志贺菌以宋内血清型为主。药敏试验结果显示,各菌属对抗生素的敏感性有明显差异,病原菌对青霉素类抗生素耐药较普遍,但对头孢类和喹诺酮类抗生素较敏感。结论该区引起感染性腹泻的病原菌种类较多,并且有年龄、季节的分布特点,有些流行菌型也出现明显变化,应加强日常监测,并根据病原菌的菌型变化和耐药性监测结果合理使用抗生素药物。