CYP 2E1 5''''侧翼区基因多态性与职业性锰中毒易感性病例对照研究

[目的]探讨CYP2E1 5'侧翼区基因多态性与职业性慢性锰中毒易感性的关系.[方法]本研究以51例职业性锰中毒患者为病例,以相同环境锰暴露而未发病、匹配条件相当者为对照,进行11配对病例-对照研究,应用PCR-RFLP方法进行CYP2E1 5'侧翼区基因Pst Ⅰ/Rsa Ⅰ位点和DraⅠ位点多态性分析.[结果]CYP2E1基因Rsa Ⅰ位点基因型及等位基因的分布在病例组和对照组之间差异无统计学意义.CYP2E1 Dra Ⅰ位点基因型分布在病例组和对照组有差别.CYP2E1基因Dra Ⅰ位点野生型纯合子(DD)在病例组的分布明显高于对照组,突变型纯合子(CC)在病例组的分布明显低于对照组.[结论]携带野生型CYP2E1基因者,其Dra Ⅰ位点更易突变,对锰的神经毒性可能更敏感,推测CYP2E1基因的多态性可能与锰中毒的易感性有关.     

母亲解偶联蛋白(UCP2)基因多态性与后代神经管畸形的关系

目的:探索山西省母亲解偶联蛋白(UCP2)基因多态性与后代神经管畸形发生的关系。方法:采用1:1配对病例对照研究方法,对山西省116例曾孕育过NTDs患儿的母亲和116例配对的未孕育过任何畸形患儿的母亲采血并进行UCP2基因的多态性分析。结果:病例组母亲3’末端缺失纯合子基因型D/D显著高于对照组母亲(P0.01),而A55V基因多态性与NTDs无相关(P0.05)。结论:母亲UCP2基因第8外显子45bpD/I多态性可能是后代发生神经管畸形的遗传危险因素。     

还原叶酸载体基因多态性与宫颈癌关系的病例对照研究

目的 探讨叶酸代谢相关酶基因还原叶酸载体基因(RFC-1)多态性与宫颈癌易感性的关系以及与人乳头瘤病毒(HPV)16在宫颈癌发生中的交互作用.方法 采用以医院为基础的频数匹配病例对照研究,选择经病理学确诊的宫颈鳞状细胞癌新发病例107例作为病例组,子宫肌瘤患者107例作为对照组,应用特异性PCR和限制性片段长度多态性(RFLP)分别检测HPV16及RFC-1基因A80G多态性.结果 (1)HPV16感染率病例组(56.07%)高于对照组(31.78%),调整OR值为3.25(95%CI:1.74～6.08).(2)病例组与对照组各基因型频率符合Hardy-Weinberg平衡,病例组RFC.1基因80AA、AG和GG各基因型频率在病例组和对照组间差异有统计学意义(X2=6.66.P=0.03).A80G等位基因在两组的分布存在差异(X2=7.41,P=0.01).(3)RFC-1基因ASOG多态性与宫颈癌易感性的分析结果显示,与携带AA基因型者相比,携带GG基因型者患宫颈癌的危险性增高(OR=2.42.95%CI:1.01～5.81).(4)REC-1基因多态性与HPVl6感染经logistic回归模型分析,在宫颈癌发生中交互作用无统计学意义.结论 RFC-1基因A80G位点的纯合型(GG)可增加宫颈癌发生的危险.     

CYP1A1基因多态性及血清锌水平与非小细胞肺癌的关系

[目的]探讨细胞色素P450(A)(CYP1A1)的基因多态性、血清锌水平单独作用以及联合作用与非小细胞肺癌发生危险的关系.[方法]采用病例对照研究方法,病例78例,对照78例.用限制性片断长度多态性PCR技术(PCR-RFLP)检测CYP1A1的MspI多态性,用电感耦合等离定子体发射光谱法(ICP-AES)测血清锌水平.[结果]CYP1A1的MspI多态性单独作用时与肺癌危险性关系差异无统计学意义(P>0.05);病例组血清锌水平显著低于对照组(P<0.01);以血清锌≥117.0mg/dL且CYP1A1野生型基因携带者为参照组(OR=1.00),则血清锌<117.0mg/dL且携带CYP1A1突变型或杂合型或野生型基因者的OR分别为5.50(P<0.05)、10.63(P<0.01)、10.08(P<0.01).[结论]CYP1A1基因多态性单独作用时NSCLC发生无显著相关;血清锌水平与NSCLC发生呈负相关;CYP1A1基因多态性与血清锌联合作用时明显提高NSCLC发生的危险性,在NSCLC发生中存在协同作用.     

醛固酮合成酶基因单核苷酸多态性与心房颤动的关系

目的 探讨醛固酮合成酶(CVP11B2)基因的单核苷酸多态性与中国汉族人群非家族性心房颤动(房颤)的关系.方法 采用1:1配对的病例对照研究方法,选择297例住院房颤患者作为病例组,同时期、同病房的297例非房颤患者作为对照组.应用GenomeLab~(TM) SNPstream基因分型系统,对CYP11B2基因的两个标签单核苷酸多态位点(tSNPs-rs4545、rs3802228)进行多态性检测.结果 两位点多态性的分布均符合Hardy-Weinberg平衡.病例组患者左心房直径(LA)显著高于对照组(P<0.0001),两个tSNPs的基因型频率及等位基因频率分布在病例组和对照组的差异均无统计学意义,但在病例组3'端非编码区(3'UTR)的rs3802228位点中,具有GG基因型患者的LA显著高于其他型者.多元logistic回归模型在校正年龄、吸烟、BMI、高血压之后,未发现CYP11B2基因两位点基因多态性与房颤发病相关联.两个位点间也不存在连锁不平衡.结论 CYP11B2基因的rs4545tSNPs位点多态性可能与房颤无相关性,位于3'端非编码区的rs3802228tSNPs位点可能与心房结构重构有关.     

母亲和新生儿GSTM1、GSTT1和细胞色素P_(450)1A1基因多态性与早产易感性关系

目的探讨母亲和新生儿GSTM1、GSTT1基因以及细胞色素P4501A1基因多态性对早产的影响。方法采用病例-对照调查方法,应用多重PCR和限制性内切酶PCR(RFLP-PCR)技术对早产母亲和对照母亲以及早产新生儿和对照新生儿GSTM1、GSTT1基因和CYP1A1基因MSPI位点多态性分别进行检测。结果GSTM1、GSTT1基因和CYP1A1基因MSPI位点多态性在早产母亲和对照母亲组中没有显著性差异(P>0.05);以上基因在早产新生儿和对照新生儿组中也没有显著性差异(P>0.05)。GSTM1与GSTT1联合基因型在母亲和新生儿的病例与对照组中也没有显著性差异(P>0.05);GSTT1缺失型和CYP1A1变异型联合基因在早产母亲组与对照母亲组中有显著性差异(χ2=4.683,P<0.05,OR=2.440)。结论携带GSTT1缺失型基因以及CYP1A1变异型基因的母亲,其发生早产的危险性增大。     

CYP2E1 5′侧翼区基因多态性与职业性锰中毒易感性病例对照研究

[目的]探讨CYP2E1 5′侧翼区基因多态性与职业性慢性锰中毒易感性的关系。[方法]本研究以51例职业性锰中毒患者为病例,以相同环境锰暴露而未发病、匹配条件相当者为对照,进行1∶1配对病例-对照研究,应用PCR-RFLP方法进行CYP2E1 5′侧翼区基因PstI/RsaI位点和DraI位点多态性分析。[结果]CYP2E1基因RsaI位点基因型及等位基因的分布在病例组和对照组之间差异无统计学意义。CYP2E1DraI位点基因型分布在病例组和对照组有差别。CYP2E1基因DraI位点野生型纯合子(DD)在病例组的分布明显高于对照组,突变型纯合子(CC)在病例组的分布明显低于对照组。[结论]携带野生型CYP2E1基因者,其DraI位点更易突变,对锰的神经毒性可能更敏感,推测CYP2E1基因的多态性可能与锰中毒的易感性有关。     

ERCC1基因多态性与肝癌易感性研究

目的 研究ERCCl基因多态性与福州地区人群肝癌易感性之间关系,及其与环境因素交互作用对肝癌发生的影响.方法 采用病例对照研究收集病例和对照暴露信息,采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对ERCCl-C8092A基因多态性进行检测;通过广义线性模型模拟ERCC1-C8092A基因多态性与肝癌主要环境危险因素交互作用的结构模型.结果 以ERCC1-C8092ACC作为参照,ERCC1-C8092ACA/AA基因型可以增加原发性肝癌的发病危险性(OR=3.789,95%CI:2.792～5.142);ERCCl-C8092A突变与饮沟塘水、乙型肝炎病毒感染的联合作用最适模型均为超相加模型,与霉变食品联合作用为超相乘模型.结论 ERCC1-C8092A多态可能与肝癌遗传易感有关,并与肝癌主要环境因素间存在协同作用.     

醛固酮合成酶基因单核苷酸多态性与心房颤动的关系

目的 探讨醛固酮合成酶(CVP11B2)基因的单核苷酸多态性与中国汉族人群非家族性心房颤动(房颤)的关系.方法 采用1:1配对的病例对照研究方法,选择297例住院房颤患者作为病例组,同时期、同病房的297例非房颤患者作为对照组.应用GenomeLabTM SNPstream基因分型系统,对CYP11B2基因的两个标签单核苷酸多态位点(tSNPs-rs4545、rs3802228)进行多态性检测.结果 两位点多态性的分布均符合Hardy-Weinberg平衡.病例组患者左心房直径(LA)显著高于对照组(P<0.0001),两个tSNPs的基因型频率及等位基因频率分布在病例组和对照组的差异均无统计学意义,但在病例组3'端非编码区(3'UTR)的rs3802228位点中,具有GG基因型患者的LA显著高于其他型者.多元logistic回归模型在校正年龄、吸烟、BMI、高血压之后,未发现CYP11B2基因两位点基因多态性与房颤发病相关联.两个位点间也不存在连锁不平衡.结论 CYP11B2基因的rs4545tSNPs位点多态性可能与房颤无相关性,位于3'端非编码区的rs3802228tSNPs位点可能与心房结构重构有关.     

多不饱和脂肪酸代谢限速酶基因多态性与吉林省汉族偏执型精神分裂症的病例-对照研究

目的探讨FADS1(Δ-5去饱和酶基因)、FADS2(Δ-6去饱和酶基因)和ELOVL2(长链脂肪酸延长酶基因)多态性在中国吉林省汉族偏执型精神分裂症发生中的作用。方法研究对象为吉林省100例偏执型精神分裂症患者和95例健康人,采用PCR-RFLP方法检测FADS1、FADS2和ELOVL2基因3个SNPs(单核苷酸多态性)位点的基因型。结果 FADS1基因rs174556位点和FADS2基因rs174617位点基因型在病例组与对照组的分布无显著差异(P>0.05);ELOVL2基因rs3756963位点基因型在病例组与对照组的分布有统计学差异(P<0.05),T等位基因携带者在病例组的分布高于对照组(P<0.05)。trans-phase基因联合作用分析发现包含rs3756963位点T/T的基因型组合在病例组分布多于对照组(P<0.05)。结论 FADS1基因rs174556位点和FADS2基因rs174617位点与偏执型精神分裂症可能不相关,ELOVL2基因rs3756963位点多态性可能与偏执型精神分裂症的发生相关。     

甘露糖结合凝集素基因与中国北方汉族人群2型糖尿病的关系

目的 探讨甘露糖结合凝集素(MBL)基因与中国北方汉族人群2型糖尿病(T2DM)的关系。方法收集318例北方汉族T2DM患者和448名血糖正常健康对照,应用多重SNaPshot技术检测MBL2基因rs 1800450、rs1800451和rs11003125位点多态性。Logistic回归分析该基因变异和其他危险因素对T2DM的作用。Haploview软件对3个位点进行连锁不平衡分析和单倍型分析。结果rs1800451位点检测到的基因型均为CC,在病例和对照中均不存在变异,rs1800450和rs11003125位点多态性的分布符合Hardy-Weinberg平衡。Rs 1800450多态位点基因型频率和等位基因频率在病例组和对照组中分布的差异均有统计学意义(P=0.006和P=0.003),rs11003125多态位点基因型频率和等位基因频率的差异也均有统计学意义(P=0.010和P=0.004)。多元logistic回归模型分析显示超重、中心性肥胖、高胆固醇血症是T2DM的危险因素。携带rs1800450位点GG基因型以及rs11003125位点(GC+CC)基因型患T2DM危险显著增高。单倍型分析结果显示rs1800450和rs11003125单倍型构成为GC患糖尿病的风险明显增高(OR=2.21,95％ CI:1.47～3.33,P=0.000)。结论 MBL2基因第1外显子rs 1800450多态、启动子rs11003125多态与T2DM可能相关。携带rs1800450位点G等位基因以及rs11003125位点C等位基因可能是汉族人群发生T2DM的危险因素。     

2型糖尿病基因多态性的病例对照研究

[目的]研究2型糖尿病与脂联素基因SNP+45、SNP+276的相互关系。[方法]采用单因素非条件Logistic回归分析,对上海市浦东新区常住居民中新发糖尿病患者(糖尿病组)及社区正常人群(对照组)各590人进行病例-对照研究。[结果]糖尿病组与对照组比较,脂联素基因SNP+45的3种基因型和等位基因分布的差异无统计学意义(χ2=1.44,P>0.05;χ2=1.35,P>0.05)。脂联素基因SNP+276的3种基因型和等位基因分布的差异有统计学意义(χ2=8.45,P<0.05;χ2=8.99,P<0.05),糖尿病患者T/T基因型多于对照组人群。单因素分析显示,脂联素基因SNP+276与糖尿病的关系有统计学意义。[结论]脂联素基因SNP+276与浦东新区汉族人群2型糖尿病的发病相关,脂联素基因的变异可能在2型糖尿病发病过程中起重要作用。     

Genome‐wide interaction with the insulin secretion locus MTNR1B reveals CMIP as a novel type 2 diabetes susceptibility gene in African Americans

Although type 2 diabetes (T2D) results from metabolic defects in insulin secretion and insulin sensitivity, most of the genetic risk loci identified to date relates to insulin secretion. We reported that T2D loci influencing insulin sensitivity may be identified through interactions with insulin secretion loci, thereby leading to T2D. Here, we hypothesize that joint testing of variant main effects and interaction effects with an insulin secretion locus increases power to identify genetic interactions leading to T2D. We tested this hypothesis with an intronic MTNR1B SNP, rs10830963, which is associated with acute insulin response to glucose, a dynamic measure of insulin secretion. rs10830963 was tested for interaction and joint (main + interaction) effects with genome‐wide data in African Americans (2,452 cases and 3,772 controls) from five cohorts. Genome‐wide genotype data (Affymetrix Human Genome 6.0 array) was imputed to a 1000 Genomes Project reference panel. T2D risk was modeled using logistic regression with rs10830963 dosage, age, sex, and principal component as predictors. Joint effects were captured using the Kraft two degrees of freedom test. Genome‐wide significant (P < 5 × 10^?8) interaction with MTNR1B and joint effects were detected for CMIP intronic SNP rs17197883 (P_interaction = 1.43 × 10^?8; P_joint = 4.70 × 10^?8). CMIP variants have been nominally associated with T2D, fasting glucose, and adiponectin in individuals of East Asian ancestry, with high‐density lipoprotein, and with waist‐to‐hip ratio adjusted for body mass index in Europeans. These data support the hypothesis that additional genetic factors contributing to T2D risk, including insulin sensitivity loci, can be identified through interactions with insulin secretion loci.     

A Dietary Pattern Derived by Reduced Rank Regression is Associated with Type 2 Diabetes in An Urban Ghanaian Population

Reduced rank regression (RRR) is an innovative technique to establish dietary patterns related to biochemical risk factors for type 2 diabetes, but has not been applied in sub-Saharan Africa. In a hospital-based case-control study for type 2 diabetes in Kumasi (diabetes cases, 538; controls, 668) dietary intake was assessed by a specific food frequency questionnaire. After random split of our study population, we derived a dietary pattern in the training set using RRR with adiponectin, HDL-cholesterol and triglycerides as responses and 35 food items as predictors. This pattern score was applied to the validation set, and its association with type 2 diabetes was examined by logistic regression. The dietary pattern was characterized by a high consumption of plantain, cassava, and garden egg, and a low intake of rice, juice, vegetable oil, eggs, chocolate drink, sweets, and red meat; the score correlated positively with serum triglycerides and negatively with adiponectin. The multivariate-adjusted odds ratio of type 2 diabetes for the highest quintile compared to the lowest was 4.43 (95% confidence interval: 1.87–10.50, p for trend < 0.001). The identified dietary pattern increases the odds of type 2 diabetes in urban Ghanaians, which is mainly attributed to increased serum triglycerides.     

四川凉山汉族2型糖尿病与脂联素基因多态性

目的探讨四川凉山彝族自治州汉族居民2型糖尿病与脂联素基因第2外显子第45位+45T/G单核苷酸多态性的关联及2型糖尿病危险因素。方法采用病例-对照研究方法,利用聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性(PCR-RELP)技术,对2型糖尿病病例组与对照组进行SNP 45基因型检测,并测定身高、体重、血压、空腹血糖及血脂等指标。结果 SNP 45 TT、TG、GG基因型在病例组和对照组的频率分别为57.52%、35.29%、7.19%和55.70%、39.24%5、.06%;T,G等位基因在病例组和对照组的频率分别为75.16%、24.84%和75.32%2、4.68%,2组基因型频率与等位基因频率比较差异均无统计学意义;非条件logistic回归分析结果显示,体质指数和糖尿病家族史是凉山州汉族居民2型糖尿病的危险因素。结论脂联素基因SNP 45多态性与凉山州汉族居民2型糖尿病的关联尚不确定。     

2型糖尿病合并非酒精性脂肪肝患者颈动脉内膜中层厚度与脂联素的相关性

目的探讨脂联素与2型糖尿病合并非酒精性脂肪肝患者颈动脉内膜中层厚度(IMT)的关系。方法选择85例2型糖尿病患者,按是否合并非酒精性脂肪肝分为2型糖尿病合并非酒精性脂肪肝组(合并组,41例)和无非酒精性脂肪肝的糖尿病组(对照组,44例)。检测两组患者空腹血糖(FPG)、空腹胰岛素(FINS)、脂联素、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG),测定IMT,同时计算体质指数(BMI)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR),并进行相关分析。结果合并组患者的FPG、BMI、TG、TC、LDL-C、FINS及HOMA-IR均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。合并组患者左、右两侧颈动脉内膜中层厚度高于对照组,而脂联素水平较对照组低,差异均有统计学意义(P<0.01,P<0.05)。Pearson相关分析结果表明,IMT与BM(Ir=0.435,P<0.01)、FPG(r=0.402,P<0.01)、FINS(r=0.410,P<0.01)、HOMA-IR(r=0.596,P<0.01)、TG(r=0.416,P<0.01)、LDL-C(r=0.458,P<0.01)呈正相关,与脂联素(r=-0.306,P<0.05)、HDL-C(r=-0.347,P<0.05)呈负相关。结论 2型糖尿病合并非酒精性脂肪肝患者较无非酒精性脂肪肝的糖尿病患者存在更明显的代谢紊乱和胰岛素抵抗,与动脉粥样硬化的发生发展有关。     

雌激素受体β基因多态性与子宫肌瘤相关性研究

目的:探讨雌激素受体β基因多态性与中国北方汉族人群子宫肌瘤的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测167例子宫肌瘤患者和170例健康女性的雌激素受体β基因rs1256064和rs1256049SNPs位点的基因型,应用SPSS12.0分析基因多态性与子宫肌瘤的相关性。结果:病例组与对照组人群2个SNPs的基因型分布均符合Hardy-W e inberg平衡定律;rs1256064位点的等位基因及基因型的频数在病例组和对照组间的分布差异有统计学意义(P<0.05),rs1256049位点的基因型频数在病例组和对照组间的分布差异无统计学意义,而等位基因的频数分布差异有统计学意义(P<0.05)。结论:雌激素受体β基因rs1256064位点基因多态性可能与中国北方汉族人群子宫肌瘤相关联。     

SLC30A8 rs13266634位点基因多态性、内脏脂肪指数与糖前期和糖尿病的关系

目的 研究SLC30A8 rs13266634位点基因多态性、内脏脂肪指数与糖前期和糖尿病的关系,为其科学防治提供依据。方法 采用1∶2配对病例对照研究的方法,病例组为浦东新区2013—2016年队列人群中随访和新增的677例糖尿病病例,对照组按社区、年龄、性别、是否有血缘关系共匹配1354例,对选取的人群进行流行病学调查及基因型分析。采用卡方检验、多元logistic回归和分层Cox回归模型等方法对糖前期和糖尿病的影响因素进行分析。结果 单因素分析发现C等位基因在对照组、糖前期、糖尿病组中的分布具有明显差异(x2=6.169,P=0.046)。调整后的多元logistic回归分析表明,基因型CC患糖前期和糖尿病的风险分别为TT的1.187倍(P=0.343, 95%CI:0.833~1.693)和1.501倍(P=0.010, 95%CI:1.101~2.045);内脏脂肪指数的OR值在两组中均随数值的增加而增加,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 SLC30A8 rs13266634 C等位基因为2型糖尿病的易感基因,CC基因型为2型糖尿病的潜在危险因素,内脏脂肪指数与糖前期和糖尿病的患病风险有关。     

妊娠期糖尿病患者血清脂联素和TNF-α浓度的检测及与胰岛素抵抗关系研究

目的:探讨妊娠糖尿病患者血清脂联素和TNF-α水平的变化,研究其与胰岛素抵抗的关系。方法:选取12名妊娠糖尿病患者和20名正常妊娠妇女作为研究对象。测定受试者血浆脂联素和TNF-α水平,比较脂联素和TNF-α水平的关系,分析两者与胰岛素抵抗指数的相关性。结果:妊娠期糖尿病患者脂联素水平下降(P<0.05),TNF-α水平升高(P<0.05),脂联素与TNF-α呈负相关(r为0.32,P<0.05);脂联素与IR呈负相关(r为0.41,P<0.05);TNF-α与IR呈正相关(r为0.36,P<0.05);结论:妊娠糖尿病患者血清脂联素升高,同时TNF-α水平下降,两者与胰岛素抵抗有着密切的关系。     

抗结核治疗队列人群药物性肝损害的易感基因多态性研究

目的 探索药物代谢、转运和免疫反应基因多态性与中国人群抗结核药致肝损害的关联。方法 利用“中国结核病防治规划抗结核病药品不良反应研究”的人群资料和样本,构建1：4巢式病例对照研究,选择与抗结核药物所致肝损害相关的三相代谢基因以及相关免疫基因,采用TaqMan分型技术检测基因单核苷酸多态性（SNP）,结合Lasso回归和多因素条件logistic回归筛选易感基因。结果 共检测33个基因的75个SNP位点,Lasso回归和logistic回归的合并分析显示,SLCO1B1 rs4149014、HSPA1L rs2227956、STAT3 rs1053023和IL-6 rs2066992基因多态性与抗结核药致肝损害的关联有统计学意义（P<0.05）。结论 SLCO1B1、HSPA1L、STAT3和IL-6 基因可能是抗结核治疗人群发生药物性肝损害的易感基因。