NLGN4X基因3'UTR区多态性与孤独症关系的家系研究

【目的】 探讨NLGN4X基因与中国汉族儿童孤独症是否存在相关性,查寻中国汉族儿童孤独症的易感基因。 【方法】 选取NLGN4X基因3'UTR区两个多态性位点rs5916269和rs3810686作为遗传标记,采用直接测序法对92个孤独症核心家系的276名成员进行基因型测定,并进行传递不平衡检验(TDT)和单倍型相对危险度(HRR)分析。 【结果】 TDT检验及HRR分析均显示儿童孤独症与rs5916269遗传标记位点不存在传递不平衡(TDT χ²=0.385,P=0.620;HRR χ²=0.345,P=0.557);与rs3810686遗传标记位点存在传递不平衡(TDT χ²=6.368,P=0.015;HRR χ²=5.470,P=0.019)。 【结论】 NLGN4X基因rs5916269位点与中国汉族儿童孤独症无关;rs3810686位点与中国汉族儿童孤独症相关,NLGN4X基因可能是孤独症的易感基因。     

GABRA4基因多态性与儿童孤独症的相关性研究

目的:通过对GABRA4基因上单核苷酸多态性位点rs2229940的检测,探讨GABRA4基因多态性与儿童孤独症的关系。方法:在中国汉族孤独症49个核心家系(孤独症患者49人,父母94人)及正常对照人群(158人)中,应用聚合酶链反应-限制性酶切片段多态性(PCR-RFLP)技术,测定了本位点的等位基因和基因型,进行以核心家系为基础的传递不平衡检验(TDT)及病例对照的关联研究。结果:病例对照关联研究中,rs2229940多态位点等位基因频率(χ2=4.128,P=0.040)及基因型(χ2=9.438,P=0.009)比较均发现差异有统计学意义。结论:提示GABRA4基因可能与孤独症有关联。     

人类13q32精神分裂症易感基因的研究

目的　在中国人群中探讨人类 13q32区域内与精神分裂症相关的易感基因位点。 方法　以中国汉族精神分裂症患者和他们的健康父母双亲组成的 91个核心家系为研究对象。采用聚合酶链式反应 -限制性片段长度多态性 (PCR -RFLP)方法对 13q32区域内分别位于STK2 4位点和GPC6位点上的 2个单核苷酸多态性 (SNPs)rs1886 0 89和rs2 892 6 79进行检测。利用拟合优度卡方检验分析基因型分布频率是否符合Hardy -Weinberg平衡定律 ,单体型相对风险分析 (HRR)和传递不平衡检验 (TDT)用于数据基因型分析。结果　 (1)STK2 4 /GPC6基因型频率分布符合Hardy -Weinberg平衡 (P >0 0 5 ) ;(2 )HRR结果显示 ,rs1886 0 89和rs2 892 6 79两个基因多态性与精神分裂症无关联 (P >0 0 5 )。TDT结果表明 ,父母和受累子女之间不存在显著的传递不平衡 (P >0 0 5 ) ,即杂合父母传递给受累子女的等位基因无差异 ;(3)STK2 4rs1886 0 89等位基因与精神分裂症的两种临床症状真性幻听和情感淡漠相关 (χ2 =6 0 0 5df=1P <0 0 5 ;χ2 =6 0 74df=2P <0 0 5 )。GPC6rs2 892 6 79等位基因与精神分裂症的思维贫乏相关(χ2 =6 0 94df=2P <0 0 5 )。结论　STK2 4rs1886 0 89和GPC6rs2 892 6 79基因多态性与精神分裂症的 3种临床症状相关联     

TSC1、TSC2基因多态性和儿童孤独症的家系研究

目的 探讨结节性硬化症(tuberous sclerosis complex,TSC)相关基因TSC1、TSC2基因多态性与儿童孤独症之间的关联。 方法 利用SNaPshot基因分型技术,在97例孤独症核心家系中,对TSC1、TSC2基因上的8个标签SNP,即rs3761840、rs2809244、rs1050700、rs739441、rs2074968、rs2074969、rs2072314、rs8063461进行分型;通过FBAT软件及Haploview软件进行基于家系的单倍型分析。 结果 1)基于家系的关联分析发现8个SNPs等位基因中有2个SNPs的等位基因倾向于过传递(rs1050700 A:Z=2.708,P=0.006769;rs2074968 G:Z=3.244,P=0.001180),并且经过FDR校正后,2个SNPs仍显示出与孤独症之间存在显著关联性(校正P值分别为0.027,0.014)。2)rs3761840-rs2809244基因型的单体型A-C显示出显著的传递不平衡,双亲较少传递给子女(Z=-2.297,P=0.021629)。rs2074968-rs2072314基因型的2种单体型即 G-C及C-C均显示出显著的传递不平衡,单体型G-C能从双亲过传递给子女(Z=2.596,P=0.009444),单体型C-C则相反(Z=-3.657,P=0.000256)。 结论 TSC1、TSC2基因可能与儿童孤独症的发生存在关联。     

汉族人群PIP3-E基因多态性与精神分裂症关系

目的探讨中国北方汉族人群PIP3-E基因多态性与精神分裂症的关系。方法采用PCR和限制性内切酶片段长度多态性（RFLP）方法，在102个精神分裂症患者核心家系中检测PIP3-E基因上的4个单核苷酸多态性（SNPs），对结果进行传递不平衡检验（TDT）和单倍体相对风险（HRR）分析，并进行SNP与临床症状的关联性分析。结果PIP3-E基因上的4个SNP基因型在患者组和父母组的频数分布均符合Hardy-Weinberg平衡；TDT分析结果表明，杂合子父母双亲传递给患病子女的不同等位基因均未偏离50％（P〉0．05）；HRR分析结果表明，各位点等位基因在病例组和对照组中的频数分布差异均无统计学意义（P〉0．05）；rs2236257位点等位基因与关系妄想、自责自罪妄想以及思维连贯性障碍3种临床症状相关联，其基因型与关系妄想、自责自罪妄想相关联（P〈0．05）。结论PIP3-E基因可能不是精神分裂症的易感基因。     

遗传基因与精神分裂症的关系

目的探讨人类5q33区域内LOC345614基因位点与精神分裂症的关系。方法应用PCR-RFLP方法检测91个中国汉族精神分裂症患者及其健康父母双亲组成的核心家系单核苷酸多态性（SNP）rs154110。结果rs154110基因型频率的分布符合Hardy-Weinberg平衡；单倍型相对风险分析（HRR）显示，rs154110与精神分裂症无关联（0=0．011，P〉0．05）；传递不平衡检验（TDT）显示，杂合父母传递给受累子女与非传递等位基因频率分布差异无统计学意义（χ^2=0．011，P〉0．05）；该位点与精神分裂症阳性症状的被害妄想、自责自罪妄想及其他妄想密切相关。结论5q33LOC345614位点rs154110与精神分裂症无关联，但其位点多态性与精神分裂症的被害妄想、自责自罪妄想及其他妄想症状密切相关。     

精神分裂症与磷脂酶A2基因多态性关系

目的 探讨中国北方汉族人群磷脂酶A2,IVC亚组基因(PLA2G4C基因)多态性与精神分裂症的遗传关联性.方法 采用PCR和连接酶检测反应(LDR)法,在201个精神分裂症患者核心家系中检测PLA2G4C基因上的3个单核苷酸多态性(SNPs)(rs2307279、rs2162886和rs891014),对结果进行单倍型相对风险分析(HRR)、传递不平衡分析(TDT)和与临床症状的关联性分析.结果 各位点在精神分裂症病例组和对照组中基因型分布均符合Hardy-weinberg平衡.HRR和TDT分析表明,检测的3个SNPs位点与精神分裂症关联差异无统计学意义.临床症状关联性分析结果显示,rs2307279等位基因多态性与阳性症状自责自罪妄想相关联(X2=5.755.P:0.016),rs2162886和rs891014等位基因多态性与思维逻辑性障碍和病前人格相关联(X2=6.777,P=0.009;X2=11.113,P=0.001;X2=12.468,P=0.002;X2=9.924,P=0.007);rs2162886等位基因多态性与阳性症状怪异行为相关联(X2=5.409,P=0.020).结论 PLA2G4C基因多态性与精神分裂症阳性临床症状相关联.     

PLA2G4C基因多态性与精神分裂症的遗传相关性

目的探讨中国北方汉族人群PLA2G4C基因多态性与精神分裂症的遗传相关性.方法采用聚合酶链反应（PCR）和限制性内切酶片段长度多态性（RFLP）方法,在240个精神分裂症患者核心家系中检测PLA2G4C基因上的6个单核苷酸多态性（SNPs）,对结果进行单倍型相对风险（HRR）分析和传递不平衡分析（TDT）.结果在所检测的6个SNPs中,只有rs1366432和rs1549637位点在北方汉族人群中具有高度的多态性.rs1366432和rs1549637位点在精神分裂症病例组和对照组中基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡.HRR和TDT分析表明,rs1549637位点与精神分裂症关联具有显著性（X^2=5.364,P＜0.05;X^2=5.633,P＜0.05）,而rs1366432位点与精神分裂症不存在遗传相关性（X^2=0.027,P＞0.05;X^2=0.007,P＞0.05）.结论PLA2G4C基因可能是精神分裂症的易感基因.     

精神分裂症与亲核素β基因多态性关系

目的 探讨亲核索β(KPNBs)中KPNB1和KPNB2基因与精神分裂症的关系.方法 采用聚合酶链式反应一限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,收集中国吉林省汉族精神分裂症患者及其健康父母双亲组成的233个核心家系成员,分别检测位于KPNB1和KPNB2基因上的2个单核苷酸多态性(SNPs)rs11871606和rs266443.利用拟合优度x2检验分析等位基因和基因型分布频率是否符合哈迪-温伯格定律(Hardy-Weinberg Law),应用遗传统计学软件(UNPHASED)进行2个SNPs的传递不平衡检验(TDT)以及双位点联合作用分析.结果 患者组与其父母组比较,KPNB1基因rs11871606及KPNB2基因rs266443等位基因和基因型频率的分布差异均无统计学意义(P>0.05),符合Hardy-Weinberg平衡定律;TDT结果提示,KPNB1基因rs11871606及KPNB2基因rs266443与精神分裂症无连锁及关联.双位点联合作用分析结果显示,rs11871606与rs266443两位点未显示联合作用(P>0.05).结论 KPNB1基因rs11871606位点及KPNB2基因rs266443位点多态性可能与精神分裂症无关,但不能排除KPNB1基因及KPNB2基因其他SNPs与精神分裂症相关联.     

神经胶质素-4基因多态性与儿童孤独症关系的初步研究

【目的】探讨神经胶质素-4(Neuroligin-4)基因多态性与中国汉族儿童孤独症的关系。【方法】应用聚合酶链式反应与限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法对80名中国汉族孤独症儿童及82名正常对照儿童进行2个SNP位点rs3810686和rs5916271的等位基因和基因型测定。【结果】Neuroligin-4单核苷酸多态性片段rs3810686和rs5916271的基因型分布频率符合Hardy-Weinberg(P0.05),并且孤独症组和正常对照组在上述各位点等位基因频率和基因型分布无显著差异(P0.05)。【结论】Neuroligin-4基因上的2个单核苷酸多态性片段rs3810686和rs5916271与儿童孤独症的发病无关联。     

人类染色体22q11精神分裂症易感基因的筛查研究

目的 在人类22q11区域内筛查与精神分裂症相关的易感基因。方法 由中国汉族精神分裂症患者和他们的健康父母组成的100个核心家系作为研究对象。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法对22q11区域内分别位于腭心面综合征中缺失的犰狳重复基因(ARVCF)上的m165655(A/G碱基改变)、rs165815(C/T碱基改变)和LOC128979(EST序列)位点上的rs756656(A/C碱基改变)3个单核苷酸多态性(SNP)进行检测。用连锁不平衡方法分析基因型数据,连锁不平衡方法包括单体型相对风险分析(HRR),传递不平衡检验(TDT)和单倍型传递分析。结果 3个SNP基因型频率分布都符合Hardy-Weinberg平衡;HRR和TDT分析结果都显示rs165815与精神分裂症有关联(P<0.05),而rs165655和rs756656与精神分裂症无关联;单倍型传递分析结果显示,父母传递给患病子女的rs165655-rs165815单倍体和rs756656-rs165655-rs165815单倍体的频率偏离50％,差异具有统计学意义(P<0.01)。结论 对于中国汉族精神分裂症患者而言,ARVCF基因本身或其附近的基因可能与精神分裂症的易感性有关联。     

TGFA基因多态性与NSCL/P的遗传易感性

目的:探讨中国汉族人TGFA基因的多态性对非综合征性唇腭裂的遗传易感性的作用。方法:76例核心家庭和60例正常对照儿童的TGFA基因型,采用病例对照研究和传递不平衡检验进行分析。结果:病例对照研究结果表示:(2χ=7.77,P<0.05),TDT(2χ=5.26,P<0.05))。结论:TGFA C2等位基因在NSCL/P中存在连锁不平衡,TGFA基因多态性可能是中国汉族人NSCL/P的遗传易感性因素。     

基于核心家系的类黏蛋白1样蛋白质3基因多态性与学龄前儿童喘息易感性关联分析

目的 分析类黏蛋白1样蛋白质3(ORMDL3)基因多态性与学龄前儿童喘息之间的遗传关系,为临床治疗提供科学依据。方法 以2016年1月-2017年12月在连云港市妇幼保健院就诊的30例喘息预测指数(API)阳性的学龄前喘息儿童及60例生物学父母作为研究对象,利用Sanger测序技术对各组ORMDL3基因rs7216389、rs7216558位点进行基因多态性分析,应用FBAT 2.0.4软件对rs7216389、rs7216558位点进行基于家系的传递不平衡检验分析(TDT)和单体型相对风险分析(HRR)。结果 ORMDL3基因两个SNP位点rs7216389、rs7216558显示出完全一致的基因型;TDT分析显示,在可加模型和隐形模型下,遗传标记位点rs7216389、rs7216558与学龄前喘息相关联,等位基因T过多传递,为喘息的危险因素(可加模型:Z=2.268,P<0.05,隐形模型:Z=2.250,P<0.05);显性模型下,等位基因C与喘息相关(Z=-2.250,P<0.05),为喘息的保护因素;HRR分析显示,在可加模型下,rs7216389-rs7216558组成的T/T单倍型与喘息相关(Z=2.000,P<0.05),而C/C单倍型则具有保护效应(Z=-2.000, P<0.05)。结论 ORMDL3基因与学龄前儿童喘息的发生相关联,ORMDL3基因遗传多态性在喘息的发病中起重要作用。     

还原叶酸载体基因多态性与神经管畸形关联的父母-病例对照研究

目的对神经管畸形（NTDs）发病危险和还原叶酸载体基因（RFC1）A80G多态性进行关联研究，为寻找NTDs的遗传易感标志物提供流行病学依据。方法采用RFLP—PCR方法．对104例NTDs儿及其父母和99名正常儿童及其父母的外周血DNA进行RFC1第80位SNP检测，对核心家庭基因型进行病例对照研究，对NTDs杂合子父母G等位基因进行传递不平衡检验（TOT）。结果NTDs儿G等位基因频率高于对照儿，OR值为1．64（95％CI：1．08～2．49）；GG基因型的患儿发生NTDs危险高于AA基因型（OR=2．56，95％CI：1．04～6．36）；TDT结果显示，RFC1等位基因G与NTDs之间存在关联（x^2=5．2364，P〈0．05），携带G等位基因发生NTDs的危险是非携带者的1．56倍（95％CI：1．07～2．28）。结论发现在中国人群中RFC1基因多态性与NTDs存在关联，初步表明该基因G等位基因可能是NTDs发生的遗传易感基因之一。     

胞浆型磷脂酶A2家族基因多态性与精神分裂症的关联性研究

目的 探讨中国北方汉族人群胞浆型磷脂酶A2(cPLA2)家族基因多态性与精神分裂症的遗传关联性.方法 采用聚合酶链反应(PCR)和连接酶检测反应(LDR)方法,在201个精神分裂症患者核心家系中检测cPLA2家族基因上的10个单核苷酸多态性(SNPs),对结果进行单倍型相对风险分析(HRR)、传递不平衡分析(TDT)、单倍型分析和多位点联合分析.结果 各位点在精神分裂症病例组和对照组中基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡.HRR和TDT分析表明,检测的10个SNPs位点与精神分裂症无关联性(P＞0.05).单倍型分析结果显示,由同一染色体上各位点组成的单倍型与精神分裂症均无关联性(P＞0.05).多位点联合作用分析显示,rs2162886与rsl668589,rs891014与rsl668589,rs2307279与rs7542180位点的联合作用与精神分裂症相关联(χ²=6.913,P=0.032;χ²=8.393,P=0.015;χ²=8.447,P=0.038).结论 cPLA2家族基因中存在多个与精神分裂症关联的易感位点.     

FADS1、FADS2基因多态性与中国汉族孤独症谱系障碍的关联研究

目的分析参与多不饱和脂肪酸代谢的FADS1和FADS2基因单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族孤独症谱系障碍(ASD)患儿的相关性。方法采用病例对照的研究方法,收集病例和对照各243例,采集外周血并提取DNA。利用人类基因库数据和Haploview 4.2软件筛选FADS1和FADS2基因的标签SNPs,采用Sequenom Mass ARRAY系统对SNPs进行基因分型,采用Logistic回归分析标签SNPs与ASD发病风险之间的关联。结果病例组和对照组儿童FADS2基因的rs526126等位基因频率和基因型频率差异有统计学意义[G等位基因OR=0.54(0.41~0.72),G/G基因型OR=0.05(0.02~0.19),P均0.001]。结论 FADS2基因可能与中国汉族儿童ASD发病风险存在关联性。