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相似文献
 共查询到19条相似文献,搜索用时 140 毫秒
1.
目的:雌/孕激素受体(estrogen receptor/progesterone receptor,ER/PR)和癌基因人表皮生长因子受体2(hu-man epidermal growth factorreceptor2,HER2)与乳腺癌的发生和发展密切相关,其表达状态是乳腺癌分子分型、治疗方案选择和预后预测的重要依据。为了深入探讨 ER/PR/HER2在乳腺癌发生和恶性演进中的意义及相关机制,拟建立ER/PR/HER-2阴性和阳性乳腺癌的蛋白质表达谱,寻找 ER/PR/HER-2阴性和阳性乳腺癌中差异表达蛋白,为乳腺癌患者提供新的预后预测指标和治疗新靶点。方法应用蛋白质组学同位素相对标记与绝对定量(isobaric tags for rela-tive and absolute quantitation,iTRAQ)技术建立 ER/PR/HER-2阳性和阴性乳腺癌的蛋白质差异表达谱,鉴定2组乳腺癌的差异表达蛋白,对部分差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释、基因本体论分类分析(gene ontology classification analysis,GO 分析)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of gene and genome,KEGG)通路分析。结果应用 iTRAQ 蛋白质组学技术对乳腺癌组织进行了蛋白组学分析,鉴定出 ER/PR/HER-2阳性和阴性组间有差异表达的蛋白4999种,以 ER/PR/HER-2阳性∶ER/PR/HER-2阴性≥3为上调标准,确定 ER/PR 阳性组上调蛋白73种。以 ER/PR/HER-2阳性∶ER/PR/HER-2阴性≤0.5为下调标准,ER/PR/HER-2阳性组下调蛋白58种。GO 分析结果显示,ER/PR/HER-2阴性和阳性乳腺癌差异表达蛋白的分子功能、生物过程和细胞定位较为复杂,并且在上调蛋白和下调蛋白上存在分布差异。KEGG 通路分析发现,部分差异表达蛋白涉及200条信号通路。结论 ER/PR/HER-2阳性和阴性乳腺癌间存在差异表达蛋白,这些蛋白涉及复杂的分子功能、生物过程和信号通路,可能与 ER/PR/HER-2的表达状态有关。  相似文献   

2.
目的:研究鼻咽癌根治后远处转移(rM)和无转移组(CR)患者的血清蛋白质表达谱差异。方法:分别选取5例鼻咽癌根治后发生转移患者及5例无转移患者的血清样本,利用非数据依赖性采集(data-independent acquisition, DIA)质谱技术,比较两组患者的血清蛋白质表达谱,获取差异表达蛋白,并通过GO功能和KEGG通路分析方法对差异蛋白进行富集分析。结果:在所有待测血清样品中最终共鉴定到2 485个蛋白,经筛选共获得差异表达蛋白68个,其中转移组中上调表达蛋白61个,下调表达蛋白7个。富集分析表明差异表达蛋白在补体激活、免疫调控等生物学过程富集,与补体结合及多个酶活性等分子功能密切有关;主要在血液微粒、细胞外区域、细胞外间隙及细胞外泌体等细胞组分间发挥功能。涉及补体与凝血级联、肌动蛋白细胞骨架调控以及细胞凋亡等关键信号通路。结论:血清差异表达蛋白质可能与鼻咽癌转移密切相关,有望成为潜在的鼻咽癌转移预测指标和干预靶点。  相似文献   

3.
目的 利用基因芯片技术和生物信息学分析方法,筛选出多形性胶质母细胞瘤相关的核心基因和信号通路,为寻找多形性胶质母细胞瘤早期诊断和靶向治疗潜在标志物提供依据。方法 从GEO数据库中获取多形性胶质母细胞瘤mRNA表达谱芯片原始数据,利用R软件分析得到明显差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),对DEGs进行功能注释(GO ontology)和KEGG信号通路(KEGG signaling pathway)富集,进一步构建蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction network, PPI),筛选核心基因,最后利用TCGA肿瘤数据库进行验证。结果 通过Pearson聚类分析发现肿瘤和正常组织聚类区分明显,说明表达谱结果可靠;差异基因共2 142个,其中上调基因968个,下调基因1 174个;GO和KEGG富集结果显示,差异基因的功能主要涉及细胞周期、细胞分裂和增殖、突触传递等生物学功能和通路,通路网络分析表明MAPK信号通路起核心调控地位。通过构建PPI网络筛选出9个与GBM密切相关的核心基因,进一步利用TCGA肿瘤数据库验证,与芯片结果一致。结论 KEGG信号通路和核心基因可能揭示了多形性胶质母细胞瘤发生发展的分子机制,核心基因可能用作多形性胶质母细胞瘤的早期诊断的分子标志物和治疗靶点。  相似文献   

4.
目的:探讨上皮-间质转换标记物 E-cadherin 和Vimentin在乳腺癌新辅助化疗耐药患者中的表达及与HER-2的关系。方法:收集我院行乳腺癌改良根治术患者75例,其中经临床和病理诊断为对新辅助化疗耐药的患者32例,所有患者均手术切除病灶并行病理检查,采用免疫组化二步法检测上皮-间质转换标记物 E-cadherin 和Vimentin的表达水平。结果:乳腺癌耐药组Vimentin表达水平增加,而 E-cadherin表达下降,组间比较差异具有统计学意义(P<0.05);在43例HER-2阳性组织中,Vimentin表达水平增加,E-cadherin降低,与HER-2阴性表达组比较差异具有统计学意义(P<0.05);进一步采用spearman相关分析显示,HER-2与 E-cadherin蛋白表达呈负相关(r=-0.336,P=0.031),而与Vimentin表达呈正相关(r=0.587,P=0.004)。结论:在乳腺癌新辅助化疗耐药患者中,特别是HER-2阳性患者,可能存在上调Vimentin的表达、下调 E-cadherin的表达促进上皮-间质转换而促使耐药的发生。  相似文献   

5.
  目的  探讨组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)抑制剂下调乳腺癌HER-2的表达机制,为乳腺癌抗HER-2治疗提供新的实验依据。  方法  利用HDAC抑制剂处理HER-2阳性乳腺细胞,qPCR和Western检测HER-2基因和蛋白水平的变化,同时采用miRNA芯片筛选HDAC抑制剂相关的miRNA谱,qPCR验证miRNA表达变化。  结果  体外细胞实验证实HDAC抑制剂TSA和SAHA可下调乳腺癌细胞系HER-2的表达,TSA可下调BT474的HER-2基因表达,浓度为100 nmol时下调10.7%,浓度为200 nmol时下调38.9%(P < 0.05)。TSA对原代细胞HER-2基因表达无明显下调(P > 0.05)。SAHA对BT474中HER-2基因表达的影响,浓度5 μmol/L组下调93.9%(P < 0.05),而1 μmol/L组无明显下调。SAHA对原代细胞HER-2基因表达下调较为明显,浓度1 μmol/L时下调92.7%,浓度5 μmol/L时下调87.1%。通过miRNA芯片筛选出7条miRNA,qPCR监测SAHA、TSA处理后,miR-762基因表达上调2.11倍。  结论  HDAC抑制剂可能通过miRNA表达谱改变介导下调乳腺癌HER-2的表达。   相似文献   

6.
目的:鉴定全身照射大鼠尿液中的异常表达蛋白质,筛选辐射敏感生物标志,并分析其功能和相关生物学过程.方法:以未照射大鼠为阴性对照,分别采用1、5 Gy(剂量率1 Gy/min)的60Coγ射线全身照射30只大鼠,收集照射后第1和第3天的尿液样本,采用非标记(label-free)质谱技术检测样本中所鉴定蛋白的相对表达水平,筛选差异表达蛋白,进一步使用Uniport、DAVID数据库对其进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并使用STRING在线网站构建蛋白-蛋白相互作用网络.结果:本研究各样本共鉴定出1069种蛋白.照射后第1和第3天,与对照组比较1和5 Gy照射组均出现差异表达的蛋白279种,其中190种表达上调,97种表达下调.GO富集分析结果显示差异蛋白主要涉及对药物反应、氧化还原、老化等生物学过程,分布在细胞外泌体、细胞外空间等区域,发挥蛋白质同源二聚化活性、蛋白质结合以及钙离子结合等分子功能.KEGG富集分析结果显示差异蛋白主要涉及抗生素生物合成、谷胱甘肽代谢、碳代谢、代谢途径等多种信号通路.结论:γ射线照射后大鼠尿液蛋白质组学的综合分析表明,Gusb、Reg3g、GCLM、AZGP1蛋白上调和Ly6d蛋白下调可作为辐射敏感候选生物标志.  相似文献   

7.
目的:研究三羟异黄酮(genistein)膳食暴露对SD大鼠乳腺上皮细胞基因表达谱的影响,探讨三羟异黄酮对乳腺癌的化学预防机制。方法:应用BRB-AtrayTools软件对公共基因芯片数据库GEO中,三羟异黄酮膳食暴露的SD大鼠乳腺上皮细胞基因芯片表达数据进行统计学分析,找出发生变化的基因,DAVID工具进一步分析其功能及参与的生物学通路。PINA蛋白质互作平台分析这些基因的蛋白质相互作用情况。结果:得到419个差异表达基因,表达上调的175个,下调的244个,功能主要涉及钙调蛋白结合、嘌呤核苷酸结合、转录因子结合和配体依赖的核受体活性等相关的生物学过程,参与细胞信号转导。差异表达下调基因扰动的通路主要是NOD样受体信号通路,黏着斑信号通路,表皮生长因子受体信号通路,神经营养因子信号通路,均是细胞增殖、凋亡及异常的迁移能力的重要通路。上调基因扰动的通路主要是T011样受体(toll-1ikereceptor,TLR)和雷帕霉素靶蛋白(mammaliantargetofrapamycin,mTOR)2条途径,涉及免疫应答。结论:三羟异黄酮可能通过干扰蛋白质的磷酸化过程,影响了细胞增殖、凋亡及免疫等通路的关键分子,进而干预乳腺癌的发生。  相似文献   

8.
王佳玉 《抗癌之窗》2014,(10):33-35
HER-2(C-erbB2)的中文名称是人表皮生长因子受体-2,目前用于检测HER-2的主要方法两种:免疫组织化学法(IHC)用特异的抗体检测HER-2蛋白和荧光免疫杂交法(FISH)检测HER-2基因的扩增。一般情况下,所有乳腺癌的标本均进行IHC法检测HER-2,结果分为(-)、(+)、(++)、(+++)等几种情况,(-)和(+)通常定义为HER-2阴性,(+++)定义为HER-2阳性(过表达),而对于(++),HER一2可能为阴性,也可能为阳性,需要用FISH法进一步核实。  相似文献   

9.
目的:分析喉乳头状瘤(laryngeal papilloma,LP)中长链非编码 RNA(long chain non-coding RNA,lncRNA)的差异表达谱并预测其靶基因,为喉乳头状瘤的治疗及预防提供新的思路及靶点。方法:用RNA-seq技术对喉乳头状瘤组织及瘤旁组织测序,以差异倍数(FC)作为标准筛选差异表达lncRNAs,分析并提取10 kb范围内lncRNA顺式调控靶标基因,并进入基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析其生物学功能及参与信号通路等。结果:共筛选出227个差异表达基因(Log2FC≥2或≤0.5,P<0.05),其中高表达的上调基因76个(33%)、下调基因151个(67%)。满足位置要求和共表达关系的lncRNA顺式调控靶标基因共有44个,并进入GO和KEGG通路富集分析结果显示,差异表达基因GO BP显著富集在信号传导,KEGG通路显著富集在MAPK信号通路及PI3K-Akt信号通路。结论:lncRNA差异表达及其靶基因以及相关信号通路可能与喉乳头状瘤复发及其癌变密切相关。  相似文献   

10.
背景与目的:乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,2020年已成为全球新发病例最多的癌症。人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)阳性型乳腺癌约占所有乳腺癌病例数的20%,是一种复发转移率高的分子分型。因此,探索HER2阳性型乳腺癌相关生物标志物具有十分重要的意义。本文旨在探讨circ-0003910在HER2阳性型乳腺癌组织和细胞中的表达水平和定位,阐明circ-0003910对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响,探索高表达circ-0003910对乳腺癌细胞蛋白质组学的影响。方法:通过高通量环状RNA(circular RNA,circRNA)芯片筛选在HER2阳性乳腺癌细胞中差异表达的circRNA,选择显著高表达的circRNA作为研究目标;RNA荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)实验检测circ-0003910的亚细胞定位;采用BaseScope实验分析circ-0003910在乳腺癌组织中表达水平及临床诊断意义;通过体外转染克隆质粒和siRNA构建过表达和敲低circ-0003910的乳腺癌细胞;采用transwell迁移和侵袭实验检测circ-0003910对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响;通过TMT定量蛋白质组学技术,初步探索circ-0003910促进乳腺癌细胞迁移和侵袭的分子机制。结果:CircRNA芯片分析显示,在HER2阳性乳腺癌细胞和正常乳腺细胞中共筛选出1 843个差异表达的circRNA(fold change≥2,P<0.05),其中上调的circRNA有845个,下调有998个。与正常乳腺上皮细胞相比,circ-0003910在HER2阳性乳腺癌细胞中的差异表达倍数为24.39。实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)实验结果显示,circ-0003910在HER2阳性乳腺癌细胞中表达水平高于其他分子分型乳腺癌细胞;BaseScope实验结果表明,circ-0003910分布于HER2阳性乳腺癌细胞的细胞质和细胞核,但主要定位于细胞质中。过表达circ-0003910促进MDA-MB-231乳腺癌细胞的迁移和侵袭;敲低circ-0003910抑制SK-BR-3乳腺癌细胞的迁移和侵袭。蛋白质组学鉴定结果显示,过表达circ-0003910后,共有197个蛋白表达发生改变,其中104个蛋白质上调,93个蛋白质下调。GO和KEGG富集分析提示,差异表达蛋白质参与细胞黏附分子合成和癌症中转录失调等重要生物学进程。结论:Circ-0003910在HER2阳性乳腺癌细胞中表达上调,能够促进乳腺癌细胞迁移和侵袭,可能是HER2阳性乳腺癌新的生物标志物和抗肿瘤转移治疗靶点。  相似文献   

11.
目的:探讨人表皮生长因子受体-3(human epidermal growth factor receptor-3,HER-3)表达对HER-2阳性型乳腺癌细胞放射敏感性的影响。方法:使用慢病毒颗粒感染HER-2阳性型乳腺癌细胞系(AU-565、SKBR-3)构建HER-3基因敲低细胞系模型,蛋白质印迹法(Western blot)及实时定量PCR(RT-qPCR)技术检测感染的效率。克隆形成实验测定不同组别乳腺癌细胞放射增敏效果。将HER-3敲低组与对照组细胞分别给予X线照射(6 Gy,6 MV,源皮距100 cm),流式细胞术测定不同组别细胞凋亡率以及细胞周期分布的变化。免疫荧光法检测细胞辐射后不同时间段的γH2AX焦点数,评估辐射后DNA损伤情况,蛋白质印迹法检测细胞周期调控相关蛋白CyclinB1的表达。结果:克隆形成实验结果显示,HER-3敲低组乳腺癌细胞放射敏感性增强。流式细胞术结果显示,HER-3敲低后,HER-2阳性型乳腺癌细胞辐射后凋亡率明显增加,细胞周期G2期分布比例提高。免疫荧光结果显示,HER-3敲低后,HER-2阳性型乳腺癌细胞γH2AX焦点数目在辐射后先增加后降低,较对照组峰值更高,降低时趋势更慢,提示HER-3敲低可增强辐射诱导的DNA损伤,减少DNA修复。蛋白质印迹法结果显示,细胞周期相关驱动蛋白CyclinB1表达降低。结论:HER-3基因敲低后一方面增加了HER-2阳性型乳腺癌细胞辐射后DNA的损伤并减缓其修复能力,促进细胞凋亡;另一方面通过下调细胞周期蛋白CyclinB1的表达,增加G2期细胞分布,提升了放射敏感性。  相似文献   

12.
目的:探讨乳腺癌组织中HER-2的表达与肿瘤超声声像图特征及其弹性硬度的相关性。方法:收集2016年5月至2019年5月于我院就诊并确诊的282例乳腺癌患者,采用免疫组化法检测HER-2的表达水平,所有乳腺癌均行常规超声及弹性超声检查。分析乳腺癌二维声像图、血流及弹性特征与HER-2表达的相关性,并比较它们在HER-2阳性和HER-2阴性组之间的差异。统计学方法采用Pearson相关性分析及卡方检验。结果:乳腺癌的声像图特征多呈现为形态不规则、边缘不光整,以后方衰减、微小钙化发生、血流分级0-2级、淋巴结转移、组织弹性硬为主。相关性分析显示,HER-2表达阳性与乳腺癌肿瘤边缘光整程度、肿瘤边界、后方衰减具有显著的正相关性(P<0.05)。结论:HER-2阳性表达与乳腺癌患者的乳腺超声特征显著相关,可作为乳腺癌诊断的指标。  相似文献   

13.
14.
目的:利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术筛选预测食管鳞癌放化疗疗效的血清差异蛋白,以指导临床个体化治疗。方法:纳入52例诊断明确的局部晚期和晚期食管鳞癌患者,行规范放化疗,判断疗效及长期随访,同时收集患者治疗前、后血清。应用iTRAQ技术筛选放化疗疗效相关的血清差异蛋白。应用Uniprot、KEGG等数据库对差异蛋白进行生物学分析,筛选出与肿瘤相关、具有核心作用且介导肿瘤相关通路的优势蛋白。结果:疗效评价结果:放化疗敏感组(CR+PR)食管癌患者占59.62%(31/52例);放化疗抗拒组(SD+PD)占40.38%(21/52例)。放化疗敏感组对比放化疗抗拒组:共筛选出17个有显著差异的差异蛋白,其中上调蛋白为脂联素(ADIPOQ)、IgL C7、血清转铁蛋白(TF)、中性粒细胞防御素(DEFA1)共4个,下调蛋白为聚合物免疫球蛋白受体(PIGR)、单核细胞分化抗原14(CD14)等13个。KEGG通路分析显示,TF、CD14可能分别参与HIF-1、MAPK信号通路的调节。结论:食管鳞癌患者外周血中能够筛选出预测放化疗疗效的潜在优势蛋白,并参与一些关键通路;TF、ADIPOQ、PIGR、CD14对于食管鳞癌放化疗疗效具有潜在的预测价值。  相似文献   

15.
16.
目的:研究血管内皮生长因子(VEGF)、环氧化酶-2(COX-2)在91例HER-2阴性乳腺癌组织中的表达及相互关系,分析其与临床病理特征及预后的关系。方法:采用免疫组化SABC法,检测91例HER-2阴性乳腺癌组织中VEGF、COX-2蛋白的表达,并与临床病理特征进行相关性分析。结果:HER-2阴性乳腺癌组织中VEGF阳性表达率为94.5%,其中47.2%为高表达(+++),VEGF的表达与肿瘤大小、淋巴结转移相关(P<0.05)。HER-2阴性乳腺癌组织中COX-2阳性表达率为86.8%,其中34.0%为高表达(+++),COX-2的表达与患者年龄、组织学分级、肿瘤大小、淋巴结转移及TNM分期无关(P>0.05)。VEGF与COX-2的表达呈正相关(r=0.1798,P=0.018),VEGF/COX-2均高表达的患者淋巴结转移率高。结论:VEGF、COX-2在HER-2阴性乳腺癌组织中均高表达且两者呈正相关,联合检测VEGF、COX-2的表达对HER-2阴性乳腺癌预后判断可能具有重要价值。  相似文献   

17.
目的 采用色素原位杂交(CISH)检测乳腺癌HER-2蛋白过表达者的HER-2基因状态,探讨HER-2蛋白表达与基因扩增的一致性。方法 采用Zymed公司SpoT LightHER-2CISTTM试剂盒,按照美国临床肿瘤学会/美国病理医师学会(ASCO/CAP)联合工作组推荐的结果判读标准,经免疫组织化学(IHC)方法确认236例HER-2蛋白表达阳性,其中IHC(++)148例,IHC(+++)88例,对上述乳腺癌石蜡标本的HER-2基因行CISH检测。结果 乳腺癌HER-2蛋白高表达者总基因扩增率为70.34%,其中HER-2表达IHC(++)者基因扩增率为59.46%(88/148),IHC(+++)者基因扩增率为88.64%(78/88),两者基因扩增状态差异有统计学意义(χ2 =26.35,<0.01)。CISH检测的HER-2基因扩增情况与雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)表达呈明显负相关(<0.01)。结论 CISH是一项简便经济的检测HER-2基因扩增技术,IHC(+++)与CISH阳性的一致性较高,但IHC(++)与CISH阳性的符合率略低,有必要进一步行CISH或荧光分子探针原位杂交(FISH)检测明确基因扩增状态。  相似文献   

18.
 目的 探讨荧光原位杂交法(Fluorescence in situ hybridization,FISH)检测乳腺癌HER-2基因扩增在临床病理诊断及分子靶向治疗中应用的可能性。方法 用FISH技术和免疫组化(Immunohisto—chemistry,IHC)技术检测50例乳腺导管癌石蜡包埋标本并比较两种方法的结果以及与临床病理的关系。结果 16/50例HER-2蛋白表达阳性,其中强阳性5例,中度阳性9例,弱阳性2例;11/50(22%)例乳腺癌标本FISH技术检测HER-2基因扩增阳性,其中5/5为免疫组化HER-2蛋白强阳性病例;6/9为中度阳性病例,其中1例为17号染色体多倍体与HER-2基因扩增。HER-2基因扩增与蛋白表达与乳腺癌转移有关(P〈0.05)。结论 FISH技术可稳定地检测用IHC确定的HER-2蛋白阳性乳腺癌中HER-2基因的扩增状况,并用于临床赫赛汀分子靶向治疗病例的筛选。  相似文献   

19.
目的探讨Crk在乳腺癌中的表达及其临床意义。方法应用免疫组化方法检测Crk在125例乳腺癌和20例乳腺良性肿瘤组织中的表达,分析其与乳腺癌临床病理特征及预后的关系。结果Crk在乳腺癌组织中的阳性表达率为39.2%,明显高于在乳腺良性肿瘤中的表达(χ^2=6.447,P=0.011),Crk表达与乳腺癌组织学分级(χ^2=4.965,P=0.026)有关,与TNM分期(r=0.258,P=0.004)、淋巴结转移(r=0.261,P=0.004)和HER-2(r=0.287,P=0.021)呈正相关;Crk表达阳性组和阴性组的5年特异生存率分别为38.4%和63.4%,差异有统计学意义(P=0.018)。结论Crk蛋白在乳腺癌组织中表达上调,其高表达提示乳腺癌生物学恶性度较高,预后不良。对乳腺癌患者组织标本进行Crk检测,有助于指导乳腺癌患者的个体化治疗。  相似文献   

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