基于TCGA数据库分析ASPM在肺腺癌中的表达及临床意义

目的：探讨异常纺锤体样小头畸形相关基因（ASPM）在肺腺癌中的表达水平,及其与患者临床病理指标和预后的关系。方法：从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载肺腺癌组织和癌旁组织mRNA表达水平和临床病例资料,比较ASPM mRNA在癌组织和癌旁组织中的表达差异,统计学分析ASPM表达水平与肺腺癌患者临床病理指标及预后关系。通过R语言ballgown和ggplot包筛选高低表达ASPM组间差异基因并绘制火山图;利用DAVID工具对差异基因进行GO分析,采用GSEA预测ASPM可能调控的信号通路;STRING和Cytoscape分析关键基因及差异表达基因间的相互作用。结果：ASPM mRNA在肺腺癌中表达水平显著高于癌旁组织（P < 0.05）;ASPM表达水平与生存期相关,高表达ASPM肺腺癌患者预后较差（P < 0.05）,是肺腺癌患者预后的独立危险因素,R语言ballgown包筛选出ASPM高低表达组间的差异表达基因共183个,差异表达基因富集到生物过程（BP）、细胞组分（CC）、分子功能（MF）在3个类别共19个亚类和18条KEGG通路;Cytoscape软件发现4个枢纽蛋白。结论：ASPM mRNA在肺腺癌患者中呈高表达且高表达组预后差,可作为判断肺腺癌预后的标志物。     

ABL2在肺癌中的作用及机制研究

目的 探究ABL2在肺癌中的作用及其机制。方法 采用Realtime PCR方法检测ABL2在肺癌组织和癌旁组织中的表达情况。然后建立稳定低表达ABL2的肺腺癌A549细胞株;通过MTT、细胞迁移和克隆形成实验检测细胞增殖和迁移能力的变化情况;Western blot检测EMT、凋亡和PI3K/AKT信号通路相关蛋白的表达情况。结果 肺癌组织中ABL2的表达水平明显高于癌旁组织(P＜0.001)。在A549细胞系中沉默ABL2后,与对照组相比,48 h后细胞的迁移能力减弱(P＜0.001),从第3天开始细胞的生长速度开始明显减缓(P＜0.05),15天后形成的平均克隆数也减少(P＜0.01)。Western blot结果显示,沉默ABL2后上皮细胞标志物E-cadherin表达升高(P＜0.001),间质细胞标志物N-cadherin(P＜0.001)、Vimentin(P＜0.01)及Snail(P＜0.001)表达降低。凋亡相关蛋白Bcl-XL表达下降(P＜0.01),BAX表达上调(P＜0.001)。PI3K/AKT信号通路相关蛋白PI3K P110(P＜0.05)、AKT(P＜0.01)和p-AKT(P＜0.05)蛋白的表达都明显降低。结论 沉默ABL2基因能够通过PI3K/AKT信号通路促进细胞凋亡,抑制肺癌细胞的增殖和迁移。     

微小RNA-202对A549细胞增殖和周期的作用及机制

目的：探讨miRNA-202对肺癌细胞A549的调控作用和可能机制。方法：应用DIANA TOOLs及KEGG数据库对miR-202进行生物信息学分析,探讨其可能参与的信号通路和潜在靶基因。通过慢病毒转染,分别上调和下调A549细胞中miR-202的表达,应用MTT法和流式细胞技术检测miR-202对细胞增殖、周期和凋亡的影响。应用qPCR和Western blot技术分别检测miR-202对其预测靶基因PIK3R3的mRNA和蛋白表达水平的调控作用。结果：生物信息学分析显示,miR-202参与的信号通路可能通过对PIK3CA的靶向调控发挥作用。功能研究表明,与阴性对照组相比,上调miR-202表达可抑制A549细胞增殖（P < 0.05）,引起细胞周期G1/S期阻滞（P < 0.05）,对细胞凋亡无明显影响（P > 0.05）。靶基因研究结果显示,与阴性对照组相比,上调miR-202表达可引起PIK3CA蛋白表达量下降（P < 0.05）,但其mRNA的表达无显著改变（P > 0.05）。结论：miR-202可能通过对PIK3CA的负向调控影响A549细胞的增殖和周期,本研究为深入了解miRNA在肺癌中的作用与机制提供了新的线索。     

基于TCGA数据库分析叉头盒蛋白FoxO1在 前列腺癌中的表达及其作用

目的：分析叉头盒蛋白FoxO1在前列腺癌（PCa）组织中的表达,探讨其对PCa早期诊断和预后的作用。方法：利用癌症基因图谱（TCGA）数据库下载正常前列腺组织和PCa组织中FoxO1 mRNA表达谱及临床信息资料,通过GEPIA数据库分析FoxO1mRNA表达与PCa临床病理学指标的关系及对预后的影响。采用Cox回归分析探讨PCa患者预后的影响因素。应用人类蛋白质表达图谱中的免疫组化结果分析FoxO1蛋白在正常前列腺组织和PCa组织中的表达情况。结果：与正常前列腺组织相比,FoxO1mRNA在PCa中表达降低（P<0.05）,并且表达水平与肿瘤浸润深度、远处转移、分化程度存在相关关系（P均<0.05）。进一步研究发现FoxO1 mRNA高表达患者的无病生存率明显高于低表达患者（P<0.05）。Cox多因素分析结果表明,肿瘤浸润深度、分化程度和FoxO1表达水平是PCa患者预后的独立影响因素（P<0.05）。免疫组化结果显示,与正常前列腺组织相比,PCa中FoxO1的蛋白表达量亦显著降低（P<0.05）。结论：FoxO1基因在PCa组织中表达降低,其可能是一个抑癌基因,该基因的表达水平检测对前列腺癌患者的诊断和预后判断具有参考价值。     

原代培养大鼠心肌细胞低氧损伤时琥珀酸G蛋白偶联受体通路的变化

目的：探讨琥珀酸G蛋白偶联受体（GPR91）通路与低氧环境心肌细胞损伤之间的关系。方法：体外培养乳鼠原代心肌细胞，建立低氧模型，再利用siRNA干扰技术降低细胞内GPR91的表达，随机分为阴性对照组（CTL）、CTL+siGPR91组、琥珀酸盐组、琥珀酸盐+siGPR91组、低氧CTL组、低氧CTL+siGPR91组、低氧琥珀酸盐组和低氧琥珀酸盐+siGPR91组。10%氧含量下培养5 d后，CCK-8法检测心肌细胞的存活率、原代心肌细胞低氧模型的细胞ATP含量，Western blot法检测心肌损伤相关蛋白钙调素依赖蛋白激酶Ⅱ（CaMK Ⅱ）、B型尿钠肽（BNP）、GPR91以及PI3K/Akt蛋白通路Akt及P-Akt的表达变化。结果：与CTL组比较，低氧环境下可见心肌细胞存活率降低，ATP含量减少，BNP及CaMK Ⅱ表达上调（均为P < 0.05）；siRNA干扰组心肌细胞GPR91的表达水平下调（P < 0.05），心肌细胞存活率上升、ATP含量增多、BNP及CaMK Ⅱ蛋白表达下调、PI3K及下游信号分子Akt磷酸化水平降低（均为P < 0.05）。结论：GPR91可能通过调控PI3K/Akt通路的磷酸化介入心肌缺血损伤的病理过程。     

SOX30基因调控桥粒基因DSC3抑制肺腺癌的增殖与迁移

目的：探讨SOX30基因对桥粒基因DSC3的表达调控及其在肺腺癌发生中的作用。方法：利用基因功能富集分析（GO分析）获取SOX30调控的重要基因及通路;利用JASPAR数据库预测DSC3启动子区SOX30蛋白结合位点;利用TCGA数据库分析SOX30与DSC3在肺癌中表达的相关性,并用逆转录PCR检测A549细胞高表达SOX30后对DSC3 mRNA表达的影响;同时检测SOX30基因敲除小鼠肺组织中DSC3 mRNA的表达情况;利用平板细胞集落形成实验及细胞划痕愈合实验分析DSC3是否参与SOX30对肺腺癌细胞的增殖与迁移抑制。结果：GO分析显示SOX30基因与黏着斑、锚定连接、黏着连接等细胞连接基因表达显著相关;DSC3启动子区存在多个SOX30蛋白结合位点;SOX30与DSC3在肺腺癌中表达正相关（r=0.154,P=0.000）;高表达SOX30后,A549细胞中DSC3 mRNA水平较对照组显著上调（P < 0.05）;敲除SOX30基因后,纯合子（SOX30^-/-）小鼠肺组织中DSC3 mRNA水平显著低于杂合子（SOX30^+/-）及野生型（SOX30^+/+）小鼠（P均 < 0.01）;在高表达SOX30后的A549细胞中,干扰DSC3的表达后将显著减弱SOX30对A549细胞的增殖和迁移抑制（P均 < 0.05）。结论：SOX30是调控DSC3表达的关键分子,DSC3是SOX30发挥抑癌功能的重要下游基因,SOX30-DSC3调控可能在肺腺癌发生发展中起重要作用。     

亚硒酸钠与白藜芦醇联用对肺癌细胞抗氧化和细胞周期蛋白的影响

目的：研究亚硒酸钠与白藜芦醇联用对肺癌细胞抗氧化和细胞周期蛋白的影响,从而探讨其对肺癌细胞存活和凋亡的作用。方法：采用细胞培养技术培养肺癌A549细胞,分别将细胞分为对照组、亚硒酸钠组、白藜芦醇组、亚硒酸钠和白藜芦醇联用组,采用MTT法检测细胞存活率,流式细胞术检测凋亡率和ROS水平,用酶标仪检测谷胱甘肽（GSH）和丙二醛（MDA）表达水平,Western blot法检测细胞周期蛋白（P-Rb）表达水平。结果：与单独处理组相比,亚硒酸钠与白藜芦醇联用可降低肺癌A549细胞的存活率,促进其凋亡,且与对照组比较差异有统计学意义（P < 0.05）;同时,与单独处理组相比,联用组能显著降低GSH表达水平（P < 0.05）和显著增加MDA （P < 0.05）和ROS表达水平（P < 0.05）,联用组可以显著降低周期蛋白（P-Rb蛋白）的表达水平（P < 0.05）。结论：亚硒酸钠和白藜芦醇的联用对肺癌细胞有抑制增殖、促进凋亡的作用,其机制可能与增加氧化损伤及降低P-Rb蛋白表达有关。     

基于数据挖掘分析极光激酶A在食管癌中的表达及意义

目的：探讨极光激酶A（AURKA）在食管癌组织中的表达与功能，并分析其对患者生存预后的影响。方法：基于GEPIA及Oncomine数据库检索AURKA在食管癌组织与正常组织中的表达差异；通过STRING网络在线数据库构建有关AURKA的蛋白相互作用（PPI）网络，并将数据导入Cytoscape软件后采用CytoHubba分析插件筛选出核心基因；在GEPIA数据库中，基于TCGA和GTEx数据集分析AURKA与核心基因表达的相关性；采用DAVID网络分析工具对核心基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析；基于R2基因分析可视化平台分析AURKA的表达与食管癌患者生存预后的关系。结果：GEPIA、Oncomine数据库分析显示，AURKA在食管癌组织中的表达较正常组织明显升高（P < 0.05），但与患者肿瘤分期无关（P > 0.05）；AURKA与CDC20（r=0.78）、PLK1（r=0.83）等核心基因的表达呈显著正相关，其生物学功能主要富集于细胞分化、DNA损伤检测点、细胞增殖、负性调控细胞凋亡等；参与细胞周期调控、细胞衰老、P53以及FoxO等信号通路的调节；AURKA高表达组与低表达组患者相比预后较差，差异具有统计学意义（P < 0.05），且核心基因CCNB1、BUB1B、NEK2高表达组患者的生存率也显著低于低表达组（P均 < 0.05）。结论：AURKA在食管癌组织中表达升高，且高表达组患者预后不良；AURKA与CCNB1、NEK2等核心基因共同参与了肿瘤发生相关的功能与通路，AURKA有望成为食管癌患者早期诊断、治疗及判断预后的候选分子靶标。     

蛋白酪氨酸磷酸酶受体J在乳腺癌组织中的表达及其与临床预后的相关性

目的：探讨蛋白酪氨酸磷酸酶受体J（PTPRJ）在乳腺癌中的表达,并分析其与临床病理指标和预后的关系。方法：应用免疫组化SP法检测198例乳腺癌组织及其配对癌旁正常组织中PTPRJ的表达情况,并分析PTPRJ表达与乳腺癌临床病理指标及预后的关系。结果：免疫组化染色结果显示PTPRJ在癌旁正常组织中的表达显著高于乳腺癌组织（P=0.003）,PTPRJ表达水平与淋巴结转移（P=0.014）、TNM分期（P=0.003）,ER状态相关（P=0.048）。Kaplan-Meier生存分析显示PTPRJ低表达组患者的总生存率明显低于PTPRJ高表达组（P=0.002）。多因素COX比例风险模型分析显示TNM分期和PTPRJ表达是影响患者总生存的独立预后因素。结论：PTPRJ在乳腺癌中低表达,与肿瘤进展密切相关,可作为评价乳腺癌患者预后的有效指标之一。     

转录因子STAT5A启动子荧光素酶报告基因质粒的构建及鉴定

目的： 利用分子克隆的方法构建转录因子STAT5A启动子荧光素酶报告基因质粒并鉴定其效应。方法： 以乳腺癌MCF7细胞基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增STAT5A基因的启动子序列,并将其克隆至荧光素酶报告基因质粒pGL3-Enhancer中,经过菌液扩增、酶切、测序等方法获得目的质粒,并通过双荧光报告基因实验进一步验证其功能。结果： 构建的STAT5A启动子荧光素酶报告基因质粒pGL3-STAT5A-pro-luc-E序列正确,且具有转录活性。在双荧光报告基因实验中发现重组载体pGL3-STAT5A-pro-luc-E荧光素酶的相对活性约为阴性对照pGL3-Enhancer的8倍（P<0.01）,而pGL3-STAT5A-pro-N-luc-E荧光素酶的相对活性约是阴性对照pGL3-Enhancer的6倍（P<0.01）。结论： 本项目成功构建了转录因子STAT5A启动子荧光素酶报告基因质粒,为进一步研究STAT信号转导及转录激活蛋白信号通路提供了重要的研究工具。     

miR-93-5p和miR-106b-5p在酒精相关性肝癌中的表达及其临床意义

目的： 探讨miR-93-5p和miR-106b-5p在酒精性肝硬化肝癌（酒精相关性肝癌）患者中的表达水平及其临床意义。方法： 选取酒精相关性肝癌患者穿刺组织蜡块10例,根据性别、年龄配对原则选取10例酒精性肝硬化患者穿刺组织蜡块,采用实时荧光定量PCR（qPCR）检测组织中的miR-93-5p和miR-106b-5p表达水平。另收集河北医科大学第四医院2014年1月1日—2016年12月31日住院治疗的酒精相关性肝癌患者资料71例,治疗前抽取患者外周血,qPCR法检测血清中miR-93-5p和miR-106b-5p的表达水平,分析miR-93-5p和miR-106b-5p表达水平与患者临床病理指标和预后的关系。结果： 酒精相关性肝癌患者癌组织中miR-93-5p和miR-106b-5p的表达水平显著高于酒精性肝硬化患者（均P<0.01）。miR-93-5p或miR-106b-5p高表达组肿瘤最大径较低表达组显著增加（P<0.01）,且临床分期较晚（P<0.01）。全组患者中,年龄<60岁组患者生存率显著优于≥60岁组患者（P=0.03）;肿瘤最大径<5 cm组患者生存率显著优于≥5 cm组患者（P=0.01）;TNM分期Ⅰ+Ⅱ期患者生存率高于Ⅲ期患者（P=0.02）;miR-93-5p或miR-106b-5p高表达组患者生存率较低表达组患者显著降低（P≤0.01）;年龄和miR-106b-5p表达水平是患者预后的独立影响因素（P值分别为0.02和0.03）。结论： miR-93-5p和miR-106b-5p有作为酒精相关性肝癌肿瘤标志物的潜力,治疗前检测其表达水平可以预测患者临床病理指标和预后。     

血清谷胱甘肽过氧化物酶与晚期非小细胞肺癌患者临床病理指标及预后的相关性

目的：探讨血清谷胱甘肽过氧化物酶（GSH-PX）活性与晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者临床病理指标、放化疗联合治疗的疗效及预后的相关性。方法：收集174例2018年1—12月于河北工程大学附属医院肿瘤科初次确诊、未经抗癌治疗的晚期NSCLC患者作为研究对象,以80例健康体检者为对照,患者于放化疗联合治疗前采集外周血,分离血清。采用基因表达谱数据动态分析（GEPIA）数据库分析GSH-PX的编码基因GPX3在不同肿瘤组织中的表达情况;5',5-二硫硝基苯甲酸（DTNB）法检测GSH-PX活性,比较放化疗联合治疗前晚期NSCLC患者和对照组血清GSH-PX活性,并分析血清GSH-PX活性与晚期NSCLC临床病理指标、放化疗联合治疗疗效及预后的相关性。结果：GEPIA数据库分析显示33类肿瘤组织中,21类肿瘤组织的GPX3 mRNA表达低于正常组织,其中包括肺鳞癌和肺腺癌（P<0.05）;DTNB法检测结果显示晚期NSCLC患者血清GSH-PX活性显著低于健康对照组（P<0.05）;与年龄、性别、病理类型无明显相关（均为P>0.05）,与吸烟史和肿瘤大小呈负相关（r=-0.165、-0.267,均为P<0.05）,与卡氏（KPS）评分和病理分级呈正相关（r=0.295、0.228,均为P<0.05）;治疗有效患者和无效患者血清GSH-PX活性的差异无统计学意义（P>0.05）,但GSH-PX高活性组患者总生存期显著高于低活性组（P<0.05）,且呈正相关（r=0.238,P=0.000）。结论：晚期NSCLC患者血清GSH-PX活性降低,与患者吸烟史、KPS评分、肿瘤大小、病理分级和总生存期显著相关。GSH-PX可能参与了NSCLC的发生发展,可作为评估预后的指标。     

柠檬酸转运体SLC25A1对食管鳞癌细胞体外放射敏感性的影响及其分子机制

目的： 探讨线粒体柠檬酸转运体SLC25A1对食管癌细胞体外放射敏感性的影响及其分子机制。方法： 采用癌症基因组图谱（TCGA）数据库及UALCAN交互式网络工具比较分析184例食管癌组织与11例正常组织的SLC25A1 mRNA表达水平的差异；采用亚致死剂量X射线多次暴露法建立放射抵抗及对照组食管癌细胞系，放射克隆存活法线性二次靶模型分析两株食管癌细胞株放疗反应性的差异；多次X射线照射（总剂量6.0 Gy）上述两株食管癌细胞后，Hoechst33258染色荧光显微镜观察细胞凋亡形态学变化，流式细胞术检测细胞活性氧水平；免疫印迹法分析慢病毒小发夹RNA稳定转染敲低SLC25A1表达对DNA损伤修复关键信号分子H2AX和DNA-PKcs磷酸化水平的影响。结果： TCGA肿瘤组织数据库比较分析证实，与正常食管组织比较，食管癌组织SLC25A1 mRNA表达水平升高1.65倍（P=1.64×10^-4）；多轮亚致死剂量暴露法构建的放射抵抗食管鳞癌细胞株SLC25A1蛋白表达水平较对照组升高2.36倍（P < 0.05）；与对照组比较，稳定敲低SLC25A1表达的放射抵抗食管癌细胞株凋亡率增加1.58倍（P < 0.05）；活性氧水平下调（65.3±14.3）%（P=0.007）；并下调磷酸化H2AX（Ser139）和磷酸化DNA-PKcs（Ser2056）水平（P均 < 0.05）。结论： SLC25A1可能是一种参与食管鳞癌发病和放射抵抗的癌基因，通过下调活性氧水平，抑制DNA损伤修复，诱导细胞凋亡并可作为食管鳞癌放射增敏的潜在分子靶标。     

m白术内酯Ⅰ通过TLR4/MyD88通路调控肺癌A549细胞增殖侵袭的研究

目的 探究白术内酯Ⅰ在肺癌进程中的作用及分子机制。方法 用qRT-PCR和免疫组化实验检测肺癌组织和癌旁组织中TLR4及MyD88的mRNA和蛋白的表达;Transwell侵袭实验及MTT实验检测白术内酯Ⅰ(100 μM/L)对A549细胞侵袭、增殖能力的影响;Western blot检测白术内酯Ⅰ对TLR4及MyD88蛋白表达的作用。结果 qRT-PCR及免疫组化结果显示,相对于癌旁组织,TLR4及MyD88的mRNA和蛋白在肺癌组织中高表达(P＜0.05);与对照组相比,白术内酯Ⅰ处理组A549细胞侵袭能力显著下降,增殖活力显著抑制(P＜0.05);Western blot结果显示,白术内酯Ⅰ抑制TLR4及MyD88蛋白表达水平(P＜0.05)。结论 白术内酯Ⅰ通过抑制TLR4/MyD88通路抑制肺癌A549细胞侵袭转移。     

TRIM59在结直肠癌中的表达及其与临床病理指标的关系

目的： 探讨三结构域蛋白59（TRIM59）在结直肠癌组织中的表达及其临床意义。方法： 收集86例结直肠癌患者的癌组织及癌旁组织,分别采用实时荧光定量PCR（qPCR）和免疫组化检测TRIM59 mRNA和蛋白在结直肠癌及癌旁组织中的表达情况;分析其与患者临床病理指标和生存率的关系。结果： 结直肠癌组织中TRIM59 mRNA表达水平较配对的癌旁组织升高（t=12.86,P<0.01）。结直肠癌组织中TRIM59蛋白阳性表达率为62.79%（54/86）,高于癌旁组织的32%（37/86）,差异具有统计学意义（χ²=6.74,P=0.009）。TRIM59蛋白高表达与患者TNM分期（χ²=8.515,P=0.003）、肿瘤浸润深度（χ²=7.167,P=0.007）以及淋巴结转移情况（χ²=5.511,P=0.018）相关。Kaplan-Meier生存分析结果显示TRIM59高表达患者总生存率（OS）和无病生存期（DFS）均明显短于TRIM59低表达患者（均为P<0.05）。结论： 结直肠癌组织中TRIM59呈高表达,且与肿瘤TNM分期、肿瘤浸润深度、淋巴结转移情况及患者预后相关。     

食管鳞癌中SERPINB5表达降低的作用机制及其临床意义

目的：探索SERPINB5在食管鳞癌中的表达变化、作用机制及其临床意义。方法：利用癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达库（GEO）数据库的RNA表达数据、以及临床标本的Western blot分析,研究食管鳞癌组织中SERPINB5的mRNA和蛋白表达情况,并分析其表达水平与临床病理指标的相关性;通过细胞增殖和克隆形成实验,设置亲本组、空载组和SERPINB5过表达组,在体外检测SERPINB5对食管癌细胞增殖的影响;通过裸鼠移植瘤实验,设置空载组和SERPINB5过表达组,在体内检测SERPINB5对食管鳞癌细胞成瘤能力的影响;利用Western blot检测该分子调控的下游通路及关键分子;进一步利用靶向抑制实验,探讨SERPINB5对食管鳞癌治疗的可能意义。结果：与正常食管上皮相比,食管鳞癌组织中SERPINB5的mRNA和蛋白水平均明显降低（P<0.01）,且其mRNA低表达与肿瘤低分化（P=0.004）和较晚的分期（P=0.037）显著相关。体外及体内实验结果显示,与对照组比较,SERPINB5过表达可显著降低食管鳞癌细胞的增殖和集落形成、以及裸鼠成瘤能力（P<0.05）。分子水平检测表明,过表达SERPINB5显著降低AKT和mTOR的磷酸化水平。通过靶向抑制实验,观察到SERPINB5过表达可显著增强食管鳞癌细胞对Aurora A抑制剂Alisertib和mTOR抑制剂Everolimus的敏感性（P<0.01）。结论：SERPINB5在食管鳞癌中的表达降低,提高SERPINB5的表达水平,尤其是与Aurora A或mTOR抑制剂的联合使用,可作为食管鳞癌潜在的治疗策略。     

CCDC8和TGF-β1在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

目的 探讨CCDC8和TGF-β1在非小细胞肺癌中的表达及其与临床病理特征的关系。方法 比较TCGA数据库正常肺组织与肿瘤组织中CCDC8和TGF-β1的表达量,分析非小细胞肺癌中CCDC8和TGF-β1表达的相关性。免疫组织化学染色检测204例常规石蜡包埋非小细胞肺癌组织CCDC8、TGF-β1表达并分析其与肺癌临床病理特征关系。利用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,应用Cox回归分析CCDC8、TGF-β1表达与患者总生存期(OS)的关系。结果 TCGA数据中正常肺组织CCDC8与TGF-β1表达较肿瘤组织中高(P＜0.05),非小细胞肺癌患者CCDC8表达与TGF-β1表达呈正相关(P＜0.0001);鳞癌中CCDC8低表达患者OS长(HR=1.32,P=0.0437)。204例非小细胞肺癌组织中,CCDC8表达与TGF-β1表达呈正相关(P=0.023)。Cox单因素分析鳞癌中CCDC8表达与OS有关(P=0.013);而CCDC8和TGF-β1表达与腺癌患者生存无关(P=0.967,P=0.816)。Cox多因素分析TNM分期、CCDC8表达是肺鳞癌患者预后因子(P=0.016)。结论 非小细胞肺癌中CCDC8表达与TGF-β1表达正相关,CCDC8可能是肺鳞癌患者预后因子。     

基于TCGA数据库分析ASPM在肺腺癌中的表达及临床意义

目的：探讨异常纺锤体样小头畸形相关基因（ASPM）在肺腺癌中的表达水平，及其与患者临床病理指标和预后的关系。方法：从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载肺腺癌组织和癌旁组织mRNA表达水平和临床病例资料，比较ASPM mRNA在癌组织和癌旁组织中的表达差异，统计学分析ASPM表达水平与肺腺癌患者临床病理指标及预后关系。通过R语言ballgown和ggplot包筛选高低表达ASPM组间差异基因并绘制火山图；利用DAVID工具对差异基因进行GO分析，采用GSEA预测ASPM可能调控的信号通路；STRING和Cytoscape分析关键基因及差异表达基因间的相互作用。结果：ASPM mRNA在肺腺癌中表达水平显著高于癌旁组织（P < 0.05）；ASPM表达水平与生存期相关，高表达ASPM肺腺癌患者预后较差（P < 0.05），是肺腺癌患者预后的独立危险因素，R语言ballgown包筛选出ASPM高低表达组间的差异表达基因共183个，差异表达基因富集到生物过程（BP）、细胞组分（CC）、分子功能（MF）在3个类别共19个亚类和18条KEGG通路；Cytoscape软件发现4个枢纽蛋白。结论：ASPM mRNA在肺腺癌患者中呈高表达且高表达组预后差，可作为判断肺腺癌预后的标志物。     

成纤维细胞生长因子结合蛋白2过表达促进食管癌细胞的增殖

目的：检测成纤维细胞生长因子结合蛋白2（FGFBP2） mRNA在食管癌组织中的表达情况及其预后判断价值,探讨其在食管癌细胞中的作用。方法：采用组织微阵列联合RNA原位杂交技术在190例食管癌组织和42例配对癌旁正常组织中检测FGFBP2mRNA的表达情况,分析其阳性表达率,及其与食管癌患者临床病理指标和预后的关系。利用CCK-8体外增殖实验和Westernblot法检测FGFBP2敲降（转染siRNA）在食管癌细胞系中的作用。结果：RNA原位杂交结果显示,FGFBP2 mRNA在食管癌组织中的表达阳性率为25.8%（49/190）,在癌旁正常组织中不表达,两者间差异显著（P<0.01）。Kaplan-Meier生存分析结果显示,FGFBP2mRNA表达与食管癌患者术后生存期显著相关（P=0.002）,FGFBP2 mRNA表达阳性的患者预后较差。多因素Cox回归分析结果表明,FGFBP2 mRNA阳性表达是食管癌患者不良预后的独立预测因素（危险度为2.291,95%置信区间为1.271~4.129,P=0.006）。体外细胞实验结果表明敲降FGFBP2基因可抑制食管癌细胞系KYSE150和KYSE510的增殖。Western blot结果显示,敲降FGFBP2基因后AKT的磷酸化水平降低,ERK的磷酸化水平未发生明显变化（P>0.05）。结论：FGFBP2 mRNA在食管癌组织中表达升高,可能作为食管癌患者预后判断的分子标志物,FGFBP2高表达可能通过激活AKT通路而促进食管癌细胞增殖。     

基于生物信息学数据库探讨FOXO3基因在膀胱癌中的表达及临床意义

目的：探讨叉头转录蛋白O亚族3（FOXO3）基因在膀胱癌中的表达及临床意义。方法：利用GEPIA数据库分析FOXO3基因在膀胱癌与其癌旁正常组织中的表达情况，及其与患者预后的关系，利用UALCAN数据库分析膀胱癌中FOXO3表达与淋巴结转移的关系；通过TIMER数据库分析FOXO3基因表达与膀胱癌免疫浸润水平的相关性；通过String数据库分析与FOXO3相互作用的蛋白。结果：GEPIA数据库分析结果显示，FOXO3基因在膀胱癌组织中的表达显著低于癌旁正常组织（P < 0.01）；低表达FOXO3基因的患者总生存率（OS）和无疾病生存率（DFS）均显著高于高表达者（P < 0.05）。UALCAN数据库分析结果显示膀胱癌中FOXO3的表达与淋巴结转移无明显相关。TIMER数据库分析显示FOXO3基因表达与B细胞（r=0.133，P < 0.05）、CD8⁺T细胞（r=0.262，P < 0.01）、CD4⁺T细胞（r=0.12，P < 0.05）、巨噬细胞（r=0.252，P < 0.01）、中性粒细胞（r=0.242，P < 0.01）和树突状细胞（r=0.162，P < 0.01）的免疫浸润水平呈正相关。蛋白相互作用网络分析发现，AKT1、SIRT1、EP300、BCL2L11、SOD2、SGK1、AKT2、CREBBP、CDKN1B、SMAD4等蛋白与FOXO3具有明显相互作用。结论：基于肿瘤基因数据库分析发现，FOXO3基因在膀胱癌组织中低表达，其高表达与患者预后不良相关；FOXO3表达与膀胱癌免疫细胞的浸润水平有关。