2006–2017年辽宁省脑膜炎奈瑟菌分子分型研究

目的 对2006 — 2017年辽宁省流行性脑脊髓膜炎（流脑）患者、密切接触者分离的17株脑膜炎奈瑟菌（Nm）进行分析,了解菌群种类及分子分型特征。 方法 采用多位点序列分型技术,应用Splits Tree软件、eBURST方法进行菌株遗传进化和聚类分析。 结果 17株菌株共有11种不同序列型（ST）,分属于ST-5、ST-4821、ST-11克隆群和其他无序列群分类（UA）。ST-5 complex/subgroup Ⅲ所占比例最多,占47.06%（8/17）,来自A群的患者5株,密切接触者3株,ST-7型为主要优势型别。ST-4821克隆群有ST-4821型和ST-5664型。ST-4821型来自1例2012年的C群患者,ST-5644型来自1例2012年的B群密切接触者。ST-11克隆群仅1株为ST-11型,来自2009年W135群的密切接触者。B群和不可分群6株有6种ST型,呈多样性,不存在优势序列群。其中ST-12994为新发现ST,来自2017年密切接触者。 结论 辽宁省流脑菌株分子基因型别多样性,存在多个克隆群,ST-5 complex/subgroup Ⅲ克隆群为A群优势克隆群。初步揭示了辽宁省Nm的遗传进化关系,为流脑疾病控制和预防提供了有力科学依据。      

2014—2018年仙桃市伤寒沙门菌分子分型及耐药性分析

目的了解仙桃市伤寒沙门菌的耐药性及分子分型特征。方法收集2014—2018年分离的29株伤寒沙门菌开展药敏试验、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型及多位点序列分型(MLST)分析。结果药敏结果显示,29株伤寒沙门菌中27株菌对26种临床常见抗菌药物均为敏感/中度敏感,余2株菌有不同程度的耐药性,其中1株菌株耐药谱分布较广,对β-内酰胺/β-内酰胺抑制剂复合物类药物耐药。PFGE结果显示,29株伤寒沙门菌可分为6种PFGE型别,其中流行优势型为HuBXTSal003型别。MLST分型显示,29株菌株共有2种序列型,其中ST2为优势ST型。结论仙桃市伤寒沙门菌株存在优势PFGE带型及优势ST型,有多重耐药菌株出现。     

中国不可分群脑膜炎奈瑟菌的分子分型分析

目的了解我国血清不可分群(non-serogroupable,NG)脑膜炎奈瑟菌分子分型特征。方法选取我国2005-2011年分离的104株血清不可分群脑膜炎奈瑟菌作为研究对象,采用多位点序列分型(MLST)和聚合酶链反应(PCR)基因分群(A、B、C、W、E、X、Y、Z、H、I、L、K、cnl)方法,检测其ST序列群及基因群。结果 104株不可分群脑膜炎奈瑟菌中,基因群分布为荚膜基因缺失菌株(capsule null locus,cnl)(36株)、B群(20株)、C群(14株)、W群(9株)、E群(9株)、X群(3株)和Y群(3株),余下10株未鉴定出基因群;未发现其他基因群菌株。MLST分型将104株NG菌株分为45种ST型,其中14种为新的ST型;17种ST型可归为7个序列群(65株);cnl菌株全属于ST-198序列群,B群和C群菌株以ST-4821为优势序列群,W群以ST-11和ST-174序列群为主。结论我国NG脑膜炎奈瑟菌具有基因多态性,其中ST-198序列群全部为cnl菌株。     

山东省济南市脑膜炎奈瑟菌多位点序列分型研究

目的 分析2005 — 2018年山东省济南市分离的脑膜炎奈瑟菌（Nm）分子流行病学特征。 方法 采用多位点序列分型（MLST）方法,对Nm的分子分型进行研究,并使用BioNumerics软件进行分子分型分析。 结果 2005 — 2018年,共分离到130株Nm,涵盖A、B、C、W135、Y 5种血清群及不可分群（NG）。 130株Nm分为37种序列型（ST）:2株A群分为2种ST,分别属于已知克隆群（cc）5和未知克隆群（UA）;24株B群分为17种ST,分别属于cc4821、cc162及UA;39株C群分为8种ST,分别属于cc4821、cc32及UA;54株W135群分为3种ST,分别属于cc11和cc4821;1株Y群为ST-92型,属于cc92;10株NG分为8种ST,分别属于cc4821、cc198及UA。 108株已知cc菌株中,cc11占48.15%（52/108）,cc4821占45.37%（49/108）;22株UA菌株包括18种ST,其中,15株B群具有10种ST。 结论 济南市2005 — 2018年分离的Nm ST型别分布呈现多态性,在NG和B群中尤为明显。 cc4821和cc11为两大优势克隆群,B群Nm呈现多克隆化趋势。      

陕西省ST4821克隆群的B群 脑膜炎奈瑟菌的发现

目的 针对一起流行性脑脊髓膜炎疫情的处理,对患者标本及其接触者进行脑膜炎奈瑟菌检验,了解感染原因、分析密切接触者的脑膜炎奈瑟菌携带情况及菌株的分子流行病学特征。 方法 对患者标本和接触者的咽拭子标本同时进行分离培养并提取核酸,PCR检测脑膜炎奈瑟菌;分离菌株和患者血清核酸进行血清分群及多位点序列分型(MLST)分析。 结果 患者血清及4份咽拭子标本核酸检测ctrA基因阳性。其中密切接触者中分离到3株脑膜炎奈瑟菌;患者血清标本及分离菌株均为B群脑膜炎奈瑟菌;MLST分型显示患者血清为ST4821序列型、其余3株细菌分别为ST7623、ST4821、ST5586。 结论 实验显示一种高致病性的ST4821型脑膜炎奈瑟菌已存在于陕西省健康人群中并引发感染病例致患者死亡,应全面了解本地区脑膜炎奈瑟菌的健康携带和病例状况。     

2008-2009年中国部分地区脑膜炎奈瑟菌对体外抗生素敏感性检测

目的了解2008-2009年中国部分地区脑膜炎奈瑟菌(Nm)分离株的抗生素敏感性变化趋势。方法药敏纸片扩散(K-B)法和E-test试纸条检测方法对本研究室2008-2009年收集的68株分离自患者和健康带菌者菌株进行体外抗菌药物敏感性检测。结果所有菌株对3种治疗药物头孢噻肟、头孢曲松和氯霉素均敏感,1株C群患者菌株对美洛培南耐药,13株对青霉素不敏感菌株,6株对氨苄西林不敏感菌株。6种预防用药组中,除1株Y群带菌者菌株对利福平耐药外,其他菌株对阿奇霉素、米诺环素和利福平均敏感,70.59%菌株对萘啶酸,72.06%对环丙沙星,95.59%对复方新诺明耐药。W135群带菌者菌株对青霉素和氨苄西林敏感株比例较大,2株对磺胺类药物敏感。患者菌株和带菌者菌株药敏谱略有不同。结论磺胺类和喹诺酮类药物仍不被考虑作为流脑的预防性药物,加强对青霉素和氨苄西林治疗药物在各种血清群Nm的耐药性监测。长期对Nm药敏监测非常必要,对流行性脑脊髓膜炎预防和治疗药物的选择应因时因地而宜。     

2005－2016年北京市侵袭性脑膜炎奈瑟菌分子分型特征研究

目的 了解2005 — 2016年北京市侵袭性脑膜炎奈瑟菌（Nm）分子分型特征,为完善预防控制措施提供依据。 方法 通过玻片凝集对经过生化方法鉴定的24株Nm进行血清分群,用荧光聚合酶链式反应对所有菌株和4份核酸阳性标本进行基因分群检测;采用多位点序列分型方法对收集的28份标本Nm序列进行分型分析,同时对porA和fetA基因进行分型分析。 结果 北京市侵袭性Nm主要为A、B、C血清群,2009年前16份标本全部为A群和C群,2009年后12份标本全部为C群和B群。 A群序列型均属于ST-5克隆群,porA P1.20,9仅在ST-7型中检出,fetA均为F3-1;ST-4821克隆群在C群菌株中占绝对优势,ST-4821型porA有P1.12-1,16-8、P1.7-2,14和P1.20,23-7,fetA均为F3-3。 B群序列型结构复杂、分散。 结论 北京市侵袭性Nm优势菌特征为A:P1.20,9,F3-1:ST-5（ST-5克隆群）和C:P.12-1,F3-3:ST-4821（ST-4821克隆群）,且有A群明显减少、B群增长趋势。 提示侵袭性Nm随时间变迁已经发生改变,需加强其分子流行病学监测,尤其要关注尚无有效疫苗应对的B群菌株。      

2012－2018年江苏省无锡市肠炎沙门菌药物敏感性与分子分型研究

  目的   分析2012 — 2018年江苏省无锡市肠炎沙门菌分离株的药物敏感性和分子分型。   方法   收集2012 — 2018年分离自无锡市食源性疾病监测哨点医院门诊腹泻患者、从业体检人员、食物中毒以及环境水样监测的110株肠炎沙门菌菌株,采用BD Phoenix全自动细菌鉴定/药敏系统测试方案和脉冲场凝胶电泳（PFGE）方法,进行药物敏感性试验和PFGE分子分型分析。   结果   110株肠炎沙门菌对环丙沙星、厄他培南、亚胺培南、美罗培南、阿奇霉素和头孢他啶/阿维巴坦6种抗生素均敏感,对萘啶酮酸、氨苄西林和氨苄西林/舒巴坦的耐药率较高;77（70.00%）株菌为多重耐药,以耐3种抗生素为主（45.45%,50/110）。PFGE将110株菌分为39个带型,各带型包含1～31株菌,EN17、EN21和EN24为优势带型。   结论   无锡市肠炎沙门菌耐药状况严重,应引起重视,菌株的分子分型多样,具有优势带型。     

2003-2012年中国部分地区脑膜炎奈瑟菌体外抗生素敏感性分析

目的 了解我国脑膜炎奈瑟菌对抗生素敏感性的变化趋势. 方法 对2003-2012年本研究室收集的脑膜炎奈瑟菌菌株,根据分离年份、血清群和来源(患者或健康携带者)选择487株,采用微量肉汤稀释法和E-test浓度梯度扩散法,对其进行体外12种抗生素敏感性检测和分析. 结果 所有菌株对头孢噻肟、头孢曲松、阿奇霉素、美洛培南、氯霉素和米诺环素均敏感;对青霉素和氨苄西林不敏感的菌株分别是4.9%(24/487)和3.5%(17/487),75.6%(368/487)的菌株对萘啶酸耐药,87.1%(424/487)对复方新诺明耐药,48.9%(238/487)对环丙沙星耐药.从2005年开始出现对环丙沙星耐药的菌株23.8%(24/101),从2006年开始出现对青霉素类药物不敏感菌株2.4%(2/82).患者和健康携带者来源的菌株对萘啶酸、复方新诺明和环丙沙星3种药物显现不同的耐药率. 结论 我国流脑菌株对磺胺类和喹诺酮类药物具有较高的耐药性,对青霉素类药物不敏感的菌株也逐渐增多.这种耐药性与菌株分离年份、血清群和菌株来源具有相关性.     

2012-2014年辽宁省大连市某医院分离粪肠球菌耐药性及多位点序列分析

目的 了解大连市某医院2012-2014年住院患者分离粪肠球菌耐药性、携带毒力基因情况和多位点序列分型（MLST）的型别。方法 使用自动化仪器法对分离菌株的耐药性进行鉴定。应用聚合酶链式反应（PCR）方法检测4种常见毒力基因的携带情况。应用MLST对分离菌株进行分型。结果 分离的55株粪肠球菌中耐药菌株比例为92.72%,其中多重耐药菌的比例为65.45%。分离的粪肠球菌对四环素的耐药率最高,对红霉素、高浓度庆大霉素和利福平也有较高的耐药率。对青霉素耐药率为7.27%,未发现对糖肽类和脂肽类抗生素耐药的菌株。55株粪肠球菌共有28个MLST型别,其中CC （Clonal complex）16为优势克隆群,占菌株总数的43.64%。有多株同一克隆群的粪肠球菌具有相似的耐药谱和毒力携带情况。结论 大连市某医院分离到多株属于同一克隆、多重耐药且携带多种毒力基因的粪肠球菌,需要针对优势克隆菌株的特点指导临床用药和院内感染的预防控制。     

我国脑膜炎奈瑟菌中nalP基因的分布特征

目的 了解我国脑膜炎奈瑟菌（Nm）菌株的nalP基因分布特征,为其功能和作用机制研究提供依据。 方法 采用多位点序列分型方法对187株分离自我国的Nm菌株进行分子分型。利用菌株全基因组框架图获得nalP基因及其两侧序列,对基因序列进行同源性比对及聚类分析。 结果 178株Nm携带nalP基因;Nm中nalP基因与淋病奈瑟菌（Ng）中nalP基因的同源性为95% ~ 96%,但系统进化分析明显分为两支,两侧间隔区同源性＞85%。9株无nalP基因菌株中6株为?nalP2型,新发现3种排布方式。C群患者和健康携带者来源phase on菌株数差异有统计学意义。 结论 Nm中nalP基因可能由Ng获得后各自独立进化,无nalP基因菌株可能是nalP基因丢失,能够表达NalP的C群患者来源菌株可能缺失NalP的补偿机制。      

2019年新疆喀什地区健康人群脑膜炎奈瑟菌携带情况调查研究

目的 了解新疆喀什地区健康人群脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)的携带情况.方法 在喀什地区4个县(市),按年龄分组采取整群随机抽样方式采集703份健康人咽拭子,通过细菌培养和实时荧光定量PCR(real-time PCR)方法检测Nm带菌率,采用血清玻片凝集法和real-time PC...     

Antimicrobial susceptibility and molecular epidemiological analysis of clinical strains of Pseudomonas aeruginosa

Three hundred and seventy-one strains of Pseudomonas aeruginosa were isolated at the laboratory of Kyushu University Hospital in Japan from May 2002 through January 2003. Large proportions of isolated strains were resistant to carbapenems: 37.5% to imipenem, 21.3% to biapenem, and 18.3% to meropenem. A survey of injectable antibacterial agents used in our hospital during the corresponding period showed that carbapenems were most frequently used. Multidrug-resistant P. aeruginosa (MDRP) strains and metallo-β-lactamase producing strains were isolated at frequencies of 1.6% (6 strains) and 0.81% (3 strains), respectively. By molecular epidemiological analysis, neither MDRP nor metallo-β-lactamase producing strains were molecularly related, whereas some imipenem-resistant strains appeared to be epidemic strains, suggesting a possibility that they might spread by nosocomial infection. To control nosocomial infection, it is important to know a trend in drug-resistant P. aeruginosa and to prevent the spread of not only MDRP and metallo-β-lactamase producing strains but also imipenem-resistant P. aeruginosa strains.     

中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征

目的了解中国脑膜炎奈瑟菌（Neisseria meningitidis,Nm）高致病性ST-4821克隆群（CC4821）荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析荚膜基因簇序列差异性、序列重组和基因排布等特征。结果荚膜基因簇ACE区差异较大,重组现象多集中在AC区。 D和D′区有明显差异序列,表明这2个区并非精准复制。 荚膜基因簇存在基因反转现象。结论Nm高致病性CC4821荚膜基因簇呈现多态性、重组和基因反转等多种荚膜调节机制,可能有助于该克隆群菌株的传播扩散。     

我国首例感染Y群脑膜炎奈瑟菌CC23病例的实验室分析

目的对广东省首例Y群流行性脑脊髓膜炎病例及其密切接触者进行病原学及分子分型分析。方法对分离自患者及171例密切接触者咽拭子的菌株,进行生化、血清鉴定、荧光聚合酶链式反应（PCR）及多位点序列分型（MLST）检测。结果生化、血清鉴定以及PCR检测结果均显示,该分离自患者的菌株为Y群脑膜炎奈瑟菌（Nm）菌株,MLST结果分析其属于ST-23克隆群（CC23）,从171份密切接触者咽拭子中分离到1株Y群Nm,4株B群Nm。 Y群Nm属于CC23,4株B群Nm中1株为ST-11110型,无克隆群归类,2株可能属于ST-4821克隆群,1株为ST-5664,属于ST-4821克隆群。结论该病例为广东省首例Y群流脑病例,也是我国首例由Y群CC23引起的流脑病例,提示今后需进一步加强Y群流脑的病原学监测。     

101株军团菌耐药谱分析

目的了解不同来源、不同血清型/群军团菌菌株耐药性情况。方法采用E-test试纸条法对101株17个血清型的军团菌（包括67株环境分离菌株,16株临床分离菌株以及18株国际参考菌株）进行红霉素、利福平、左氧氟沙星、舒巴坦、阿奇霉素、莫西沙星和头孢呋辛7种抗生素药敏实验。结果所有实验菌株中只有3株未出现耐药情况。 其余98株菌株对7种抗生素均有不同程度的耐药。 对头孢呋辛耐药率为69.31%（n＝70）,阿奇霉素耐药率为8.91%（n＝9）,莫西沙星耐药率为7.92%（n＝8）,利福平耐药率为5.94%（n＝6）,舒巴坦耐药率为4.95%（n＝5）,红霉素耐药率为2.97%（n＝3）,左氧氟沙星耐药率为0.99%（n＝1）。 17个血清型中,13个血清型对头孢呋辛耐药,4个血清型出现耐多药（≥2种抗生素）。 嗜肺军团菌血清（LP）4型对舒巴坦和头孢呋辛2种抗生素同时耐药,LP5型对头孢呋辛和莫西沙星2种抗生素同时耐药,LP9型对红霉素、舒巴坦和头孢呋辛3种抗生素同时耐药,LP1型对红霉素、阿奇霉素、左氧氟沙星、莫西沙星、利福平、舒巴坦和头孢呋辛7种抗生素同时耐药;其余9个血清型只对头孢呋辛耐药。 非嗜肺军团菌血清型（L. oakridgensi）仅对阿奇霉素和头孢呋辛耐药,而血清型LP3、博兹蔓军团菌（Legionella bozemanii）和菲氏军团菌（L. feeleii）对所有抗生素均敏感。结论临床上用于治疗军团菌病的一线抗生素如红霉素仍然可以作为首选药物。 此外奎诺酮类抗生素左氧氟沙星在治疗军团菌病时也可作为备选。 耐药最为严重的头孢呋辛不能用于治疗军团菌病。     

2016年天津市健康人群脑膜炎奈瑟菌W135群、Y群抗体水平调查

目的 了解健康人群W135群、Y群脑膜炎奈瑟菌（Nm）的抗体水平,为科学防控流行性脑脊髓膜炎（流脑）提供依据。 方法 2016年在天津市市区、近郊和远郊的不同地理区域按年龄分层随机抽样,采集健康人群血清811份,用酶联免疫吸附试验检测Nm W135群、Y群IgG抗体水平。 结果 811名调查对象的Nm W135群和Y群的抗体阳性率分别为26.51%、29.96%,抗体浓度中位数均＜0.01 μg/ml。W135群抗体阳性率男性与女性分别为21.07%、31.20%,差异有统计学意义（χ2＝10.610,P＝0.001）。Y群抗体阳性率男性与女性分别为26.93%和32.57%,差异无统计学意义（χ2＝3.051,P＝0.081）。不同地区Nm W135群和Y群抗体阳性率的差异有统计学意义（χ2＝7.682,P＝0.001;χ2＝89.559,P＝0.001）,市区最高（W135群抗体阳性率44.00%,Y群抗体阳性率49.50%）、其次是近郊（W135群抗体阳性率27.49%,Y群抗体阳性率31.87%）、最低的是远郊区（W135群抗体阳性率7.00%,Y群抗体阳性率6.50%）。不同年龄组Nm W135群和Y群抗体阳性率有统计学差异（χ2＝81.434,P＝0.001;χ2＝34.391,P＝0.001）,均以50岁及以上年龄组人群最高（W135群抗体阳性率为52.50%,Y群抗体阳性率为40.00%）。 结论 天津市存在Nm W135、Y群感染,且人群易感性较高,应加强对流行性脑脊髓膜炎的监测,严防流脑W135、Y群暴发流行。