2010-2015年广州地区手足口病Cox A6,Cox A4和Cox A10的病原监测和流行分析

目的 了解引起广州地区手足口病（HFMD）的柯萨奇病毒A组6型（Cox A6）、A组4型（Cox A4）和A组10型（Cox A10）的分子流行病学特征。方法 对2010-2015年收集的HFMD病例标本进行荧光定量PCR检测,以Cox A6、Cox A4和Cox A10的VP1部分基因序列进行同源分析和构建系统发育树。运用统计学方法对不同肠道病毒引起的HFMD流行特征进行描述性分析。结果 从广州地区HFMD患儿的12 054份临床标本中检出8945份肠道病毒阳性,其中2174份为Cox A6（24.30%）,144份为Cox A4（1.61%）,155份为Cox A10阳性（1.73%）。Cox A6和Cox A10的主要感染人群为1~2岁幼儿,Cox A4为3~4岁幼儿,男性病例多于女性。HFMD发病时间集中于的4-10月。广州市肠道病毒Cox A6、Cox A4和Cox A10流行株与国内其他地区的流行株亲缘关系接近。结论 广州地区引起HFMD流行的优势病毒株包括EV71、Cox A16和Cox A6 3种肠道病毒,并呈交替或共同流行状态。Cox A4和Cox A10也是重要的病原体。应加强肠道病毒流行趋势的长期监测及深入研究,以掌握HFMD流行的变化趋势。     

2012～2013年杭州市萧山区手足口病病原谱及临床特征分析

目的：了解杭州市萧山区手足口病（H FM D ）病原谱及临床特征。方法采用荧光定量反转录聚合酶链反应,对2012年5月至2013年7月就诊的208例H FM D疑似患儿咽拭子标本（45份）和粪便标本（208份）进行病原体检测,结合患儿临床资料分析检测结果。结果208例患儿中,肠道病毒（EV ）检出率为83．17％,其中EV71、柯萨奇病毒A16（CoxA16）和其他EV亚型所占比例分别为55．49％、13．29％和31．21％;男、女性患儿EV检出率比较差异无统计学意义（P＞0．05）。5岁及其以下患儿以EV71感染为主,5岁以上患儿以其他EV亚型感染为主。HFMD患儿临床症状主要为发热伴疱疹,各种类型临床症状患儿均以EV71感染为主。粪便标本EV检出率高于咽拭子标本（P＜0．05）。结论 EV71和其他EV亚型是该地区 HFMD患儿常见病原体,CoxA16感染流行趋势有所下降。加强EV、EV71和CoxA16检测有助于 HFMD的预防和控制。     

浙江省湖州市柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区序列测定及系统进化分析

目的了解浙江省湖州市引起手足口病(HFMD)的柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)分离株的VP1区基因特征。方法采用荧光定量反转录聚合酶链反应方法,对2011-2012年湖州市538份HFMD临床标本进行肠道病毒核酸检测;采用RD、Hep2细胞对Cox A16核酸阳性的标本进行病毒分离。选取17株具有代表性的Cox A16分离株进行VP1区的序列测定和分析。结果 2011-2012年湖州市HFMD的主要病原为Cox A16和肠道病毒71型(EV71);湖州地区Cox A16分离株VP1区的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为89.5%~100%和99.3%~100%。与Cox A16的B1基因亚型代表株核苷酸同源性最高,在系统进化树上与B1亚型代表株相聚在一起,并且同时存在B1a和B1b两个进化分支。结论湖州市的Cox A16分离株与国内其他地区类似,同属于B1基因亚型,并且有B1a和B1b两个进化分支共同进化和循环。     

2019年冬季青岛市手足口病患者感染柯萨奇病毒A组16型基因特征分析

  目的  调查2019年冬季青岛市妇幼医院和中心医院手足口病（HFMD）住院患儿病原感染情况,分析柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）基因进化特征。  方法  收集2019年冬季青岛地区HFMD住院患儿104份咽拭子,采用实时荧光定量PCR进行肠道病毒核酸检测。 使用肠道病毒通用分型引物扩增阳性样本,扩增序列测序后进行Blast比对。 设计Cox A16 VP1全长引物,通过半巢式PCR扩增测序,使用DNAStar进行核苷酸和氨基酸的基因分析,使用MEGA软件构建进化树。  结果   HFMD住院患儿的咽拭子样本肠道病毒总体阳性率为57.7%（60/104）。 其中Cox A16阳性率为30.8%（32/104）,Cox A6阳性率为26.9%（28/104）。 对32份Cox A16阳性的样本进行VP1区全长扩增、测序并进行比对和同源性分析,其核苷酸同源性为87.0%～100%,氨基酸同源性为98.3%～100%。 系统进化分析表明,32株Cox A16中有17株为Cox A16 B1a基因型,另外15株为Cox A16 B1b基因型。  结论  引起2019年冬季青岛地区住院HFMD的病原体之一是Cox A16,且同时流行Cox A16的B1a和B1b型。     

2014年昆明某三甲医院手足口病病原及流行特征分析

目的 对2014年昆明市延安医院就诊的手足口病(HFMD)病例进行回顾性分析总结,了解其病原分布及流行病学特点.方法 应用实时荧光定量PCR对130例手足口病临床诊断病例的粪便标本进行病毒核酸检测,并对其年龄分布特点、季节分布情况进行分析.结果 非重复性的130例临床诊断病例中,病原阳性检出79例,总阳性率为62.2％,其中EV71占检出病原的5.1％(4/79),CA16占检出病原的17.7％(14/79),其他型占77.2％(61/79).4个年龄组中,1～3岁组和3～6岁组高于0～1岁、＞6岁组,4年龄组间阳性率比较差异有统计学意义(P＜0.05).5～7月为HFMD发病高峰期,在全年发病例数及全年阳性检出例数的构成比中均为最高,8月开始发病例数有减少趋势,但12月又有所增加.结论 手足口病5～7月为发病高峰期,以6月为最高;发病率以幼儿及学龄前儿童(2～6岁)为最高.     

2011~2013年杭州市手足口病病原谱流行特征及柯萨奇病毒A16型VP1区基因变异研究

目的了解杭州市手足口病病原谱流行特征及柯萨奇病毒A16型(CA16)分离株的VP1基因变迁规律。方法采集杭州市2011~2013年手足口病患者的2 197份临床标本,用通用引物进行肠道病毒实时荧光定量RT-PCR检测,对阳性标本进行分型,对部分CA16感染阳性重症患者标本测定VP1基因序列并进行同源性比对和系统进化树分析。结果杭州地区肠道病毒通用型核酸检出率为56.0%(1 317/2 197),肠道病毒71(EV71)、CA16和其他肠道病毒的检出率分别为24.1%(530/2 197)、13.9%(306/2 197)和22.8%(501/2 197)。在咽拭子和粪便标本中EV71检出率均最高,分别为23.9%(301/1 258)和23.6%(148/627),而在疱疹液标本中其他型肠道病毒检出率最高,为32.6%(76/233),脑脊液标本中无CA16检出。咽拭子标本和粪便标本在发病初期的检出率较高,发病后第5天和第6天后检出率低于发病初期检出率,而脑脊液和疱疹液不同病程阶段的检出率无统计学意义。9株CA16分离株VP1基因的核苷酸同源性为90.8%~99.7%,分属于B1b亚型和B1a亚型。结论 2011~2013年杭州地区手足口病患者主要病原体以EV71和CA16为主,样本类型和采样时间是影响肠道病毒检出率的重要原因。杭州地区CA16毒株VP1区基因的变异程度较低,需进一步加强开展手足口病的监测。     

2011～2012年武汉地区柯萨奇病毒A16型VP1基因的遗传进化分析

目的了解武汉地区手足口病(HFMD)患儿柯萨奇病毒A16型(CA16)的基因型及重组特点。方法收集2011年4月至2012年3月武汉地区1 844例HFMD患儿的咽拭子标本,用实时荧光定量PCR检测CA16核酸,阳性标本进行病毒分离,对分离株进行VP1基因序列测序,选择2株来自重症和1株来自轻症患儿的CA16病毒株构建VP1序列系统进化树并分析其全基因组序列的重组特点。结果 1 844例HFMD患儿的咽拭子标本中分离出42株CA16,VP1序列系统进化分析显示,所有分离株均属于B1亚型,其中13株属于B1a亚群,29株属于B1b亚群。重组分析表明,3株CA16分离株均为亲本株CA16 A型毒株FY18/AH/CHN/2008和EV71 A型毒株Hubei-09/HB/CHN/2009型间重组所产生,重组交叉位点为基因组P2区2A和2B基因交界处。结论武汉地区的CA16分离株均为B1亚型,其中B1b亚群占明显优势,且CA16分离株存在亲本株CA16A型和EV71 A型毒株的型间重组。     

2016年湖北省部分地区手足口病肠道病毒病原谱及柯萨奇病毒A6型和A10型基因特征分析

目的 了解2016年湖北省部分地区手足口病病原谱特征,对其中的柯萨奇病毒A组6型（Cox A6）和A组10型（Cox A10）基因特征进行分析。方法 采集2016年湖北省部分地区手足口病患者阳性标本,提取病毒核酸,通过一步法反转录-PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对其中Cox A6和Cox A10的VP1全长序列进行同源性和系统进化分析。结果 病原学监测结果显示,肠道病毒71型（EV71）阳性率为29.4%（599/2 035）,柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）阳性率为25.7%（522/2 035）,其他肠道病毒阳性率为44.9%（914/2 035）。对该地区收集的83份肠道通用阳性的非EV71和非Cox A16进行病毒分型分析,Cox A6阳性检出率为56.6%（47/83）,Cox A10阳性检出率为22.9%（19/83）,还检测出其他肠道病毒如Cox A2（2株）、Cox A4（7株）、CB4（2株）、CB5（2株）、CB6（1株）、Echo5（1株）、Echo9（1株）和Echo25（1株）。对Cox A6和Cox A10的VP1基因同源性比对及系统进化分析显示,2016年湖北省22株Cox A6的VP1基因核苷酸同源性为95.1%~100.0%,11株Cox A10的VP1基因核苷酸同源性为95.2%~100.0%。我国与其他国家Cox A6和Cox A10可分别划分为8个（A~H）和7个基因谱系（A~G）。湖北省Cox A6与我国其他Cox A6位于H基因谱系上;湖北省Cox A10与我国其他Cox A10位于G基因谱系上。结论 2016年湖北省部分地区手足口病病原体除了EV71和Cox A16两种主要病毒外,还检测出Cox A6和Cox A10等手足口病的病原。其他肠道病毒中以Cox A6和Cox A10为主,仍需进一步加强对其他肠道病毒的监测和分子流行病学特征的分析。     

2008-2012年陕西省宝鸡市手足口病流行病学特征分析

目的 了解2008-2012年陕西省宝鸡市手足口病的流行特点及分布状况,为手足口病防治提供参考依据。 方法 利用SPSS 12.0 统计软件对资料进行分析。 结果 2008-2012 年宝鸡市共报告手足口病12 469例,其中重症病例90例,死亡10 例,年发病率为66.25/10 万,发病高峰为5 7月,高发年龄为1~4岁儿童,其中1~岁组发病最多;普通病例以肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)感染为主,重症病例以EV71感染为主。 结论 宝鸡市手足口病疫情处于逐年上升趋势,应采取综合性防治措施,预防和控制手足口病的流行。     

2008—2012年吉林省手足口病流行病学特征分析

目的描述2008-2012年吉林省手足口病的流行病学特征,探讨吉林省手足口病发病变化趋势。方法使用中国疾病预防控制信息系统数据,采用描述流行病学方法对2008-2012年吉林省手足口病发病情况进行分析。结果 2008-2012年吉林省共报告手足口病95 907例。2010年发病率最高(105.27/10万),之后呈下降趋势。发病高峰在6-8月,呈单峰分布。年均发病率最高的是通化市(108.11/10万)。男女性别比1.48∶1。5岁以下儿童占79.72%。散居儿童占所有病例的60.94%。2008年和2011年阳性标本中EV71病毒所占比例在60%以上。结论吉林省手足口病呈明显季节分布,男性所占比例较高,5岁以下儿童是发病主要人群。散居儿童所占比例较高。不同年份优势毒株不同。     

2013~2014年杭州地区手足口病柯萨奇病毒A6型和A10型VP1基因特征分析

目的了解2013~2014年杭州地区手足口病病原谱的分布,并对其病原基因特征进行分析。方法采集2013年3月至2014年4月手足口病患儿标本1 340例,提取病毒核酸,通过逆转录和PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对柯萨奇病毒A6型(CA-A6)和A10型(CA-A10)VP1全长序列进行同源性比对分析,并构建系统进化树。结果1 340例手足口病患儿标本中,肠道病毒检出阳性率为81.43%(1 090/1 340)。其中,CV-A6阳性率为41.04%,取代EV-71(14.48%)成为杭州地区检出阳性率最高的肠道病毒;CV-A10检出率(8.51%)也高于CV-A16(3.81%),列于第三位。同源性比对及系统进化分析显示,2013~2014年的25株CV-A6病毒核苷酸同源性为89.0%~99.7%,主要分布于G、H基因亚型;15株CV-A10病毒核苷酸同源性为95.3%~99.9%,分布于F、G基因亚型。结论 2013~2014年杭州地区儿童手足口病的主要病原体发生重大变化,CV-A6病毒成为最主要病原,CV-A10病毒也存在潜在威胁,需加强对其他肠道病毒的持续监测和分子特征分析。     

2010-2013年浙江省湖州市手足口病流行特征及病原学监测分析

目的 分析湖州市2010-2013年手足口病的流行病学特征,为手足口病防控提供依据。方法 运用描述性流行病学方法对国家疾病监测信息报告管理系统收集的湖州市2010-2013年手足口病病例的个案资料进行分析。用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应方法对采集的病例咽拭子标本进行肠道病毒核酸检测和型别鉴定。结果 2010-2013年湖州市累计报告手足口病病例16 641例,平均发病率为156.15/10万,病例主要集中在2-8月,发病年龄主要集中在5岁以内,男性平均发病率高于女性,以散居儿童和幼托儿童居多。采集手足口病病例的咽拭子样本1355例,检出阳性病例754例,阳性率为55.65%;其中肠道病毒71 型(EV71)阳性率为16.68%,柯萨奇病毒A 组16 型(Cox A16)阳性率为16.53%,其他肠道病毒阳性率为22.44%。各县(区)之间发病率有差异,流动人口较多的区域发病率较高。结论 手足口病是湖州市重要传染病之一,应加强相应的监测工作,保障儿童健康。     

2008-2015年浙江省手足口病流行特征分析

目的 分析浙江省2008-2015年手足口病流行特征,为其防控提供建议。方法 收集2008-2015年浙江省手足口病发病数据及实验室诊断病例个案信息,使用Excel 2007软件和R 3.2.3软件进行数据整理和描述性分析,Arcgis 10.0软件进行发病热点分析,SAS 9.2软件进行重症及死亡病例的相关特征分析。结果 2008-2015年,浙江省共报告手足口病875 945例,年度报告发病数呈现波动上升态势;时间分布上呈双峰流行特点,4-7月为主要发病高峰;温州等浙南地区为主要高发区域;病例集中在5岁以下儿童,且男性多于女性;病原学特征上,其他肠道病毒逐渐取代肠道病毒71型（EV71）与柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）转变为优势病毒基因型;男性、年龄 5岁、居住在城镇和EV71导致重症病例可能性大,年龄 24月龄且病原为EV71的病例发生死亡的可能性更大。结论 浙江省手足口病仍广泛流行,疾病监测和疫情防控不能放松。强化病原监测应是今后监测工作的发展方向,针对重点人群的健康教育和疫苗接种则是疫情防控的重点。     

2008-2012年北京市昌平区手足口病时空聚集性分析

目的分析2008-2012年北京市昌平区手足口病流行特征,为防控工作提供依据。方法从"疾病监测信息报告管理系统"中获取以乡镇为单位的昌平区2008-2012年手足口病疫情资料,使用SaTScan 9.0软件进行乡镇为空间单位、月为时间单位的时空扫描分析,利用ArcGIS 9.1软件建立数据库并展示病例时空聚集区域。结果 2008-2012年昌平区累计报告手足口病18 227例,年均发病率为324.91/10万。发病的季节性明显,高峰出现于每年4-6月。0~5岁儿童占病例总数的92.93%,散居儿童占多数。全区各乡镇均有手足口病流行,高发乡镇集中于南部。时空扫描分析探测到时间维度为5-8月,空间维度覆盖7个乡镇的一级聚集区(平均RR=1.83,P0.001),此聚集区在4年中位置相对固定。结论北京市昌平区手足口病发病存在明显季节差异和高发区域。高发聚集区位于昌平区南部,具有城乡结合部特征。高发聚集区的手足口病防控工作尚待加强。     

2008-2013年河北省张家口地区手足口病流行病学调查

目的 分析2008-2013年张家口地区手足口病流行病学调查结果.方法 收集张家口地区2008-2013年手足口病流行病学资料,对其男女比例、发病趋势、发病时间、发病年龄、地区分布、职业分布进行统计分析.结果 张家口地区2008-2013年共出现手足口病病例22 268例,其中男12 944例,女9 324例,男女比例为1.39∶1;各年中每10万人中发病数依次为56.74、122、160.35、29.48、108.8、37.91例次,差异有统计学意义(P<0.05);高发年龄段集中在0~<3岁、3~5岁2个年龄段;发病时间集中在6月、7月;临近北京的赤城县发病率最高,散居儿童发病率显著高于其他职业(P<0.05).结论 张家口地区2008-2013年手足口病发病率呈现出先上升-后下降-再上升趋势,每年的6月和7月、0~<3岁及3~5岁、男性、临近北京周边的散居儿童成为该病症的主要发病人群,应予以重点关注.     

2008-2013年湖北省十堰地区手足口病病原谱动态分析

目的分析十堰地区手足口病病原谱构成及其动态变化,为该病的预防控制提供参考。方法 2008年5月至2013年12月,从十堰市各县(市、区)收集2076例手足口病临床诊断病例标本,用一步法反转录聚合酶链反应(one-step RT-PCR)和实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real-time RT-PCR)法进行手足口病毒核酸检测并分型,结合病例基本信息,对判定为手足口病的确诊病例,采用描述流行病学方法进行病原谱动态分析。结果 2008-2013年,肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组(Cox A16、Cox A6、Cox A10)及其他型人肠道病毒(EV)在手足口病确诊病例中的病原构成比依次为46.35%(24.19%~62.23%)、38.12%(13.06%~70.97%)、5.99%(0~13.06%)、3.75%(0~8.28%)和5.79%(1.37%~15.12%)。Cox A6与Cox A10致病对象为≤5岁婴幼儿;4-6月出现夏季流行高峰,10-11月出现冬季流行小高峰;各县(市、区)流行的手足口病毒均在4种以上,Cox A6所占比例持续上升,2013年达到13.06%。结论 2008-2013年十堰地区手足口病流行较为严重,病原体包括EV71、Cox A16、Cox A6、Cox A10等多种型别肠道病毒,EV71与Cox A16逐年交替维持着优势地位,Cox A6近2年有持续上升的趋势值得关注。国家在今后的疫情防控、疫苗策略和临床管理中,应高度重视手足口病持续流行过程中病原谱的变化。