生物信息学数据库的新进展

随着人类基因组计划的完成,涌现出大量的基因组测序数据,这些基因数据的出现促进了数据库、分析工具以及网络连接的快速发展。本文对目前生物信息学中使用的主要数据库进行了回顾与展望。     

基于DICOM标准的医学图像数据库

DICOM标准是医疗影像设备信息交换的基础 ,本文依据DICOM的信息模型 ,在关系数据库的平台上 ,设计了基于DICOM标准的图像数据库。经过实验检验 ,本方案具有库结构简单 ,构造方便 ,存储效率高 ,系统扩充余地大 ,数据转换的开销小等优点。本数据库可应用在PACS、远程医疗等系统中。     

生物信息数据库与查询检索的简介

随着生物信息学与生物技术的不断发展,生物信息数据库中数据呈指数增长,理解其中所包含的生物学知识,揭示生物内在规律将成为今后自然科学研究中的重要课题,本文对近几年来国内外生物信息数据库做了简介,同时,也描述了著名的有特色的国外信息数据库的查询检索,为广大读者用户提供生物信息数据库与查询检索的概况,方便各位读者。     

HIS系统备份与恢复方案

本文结合医院实际情况,对HIS系统的备份和恢复方案进行了探讨,并简单介绍了ORACLE数据库的备份和恢复方法.     

蛋白质数据库对蛋白质组鉴定的影响

在蛋白质组学研究中,通常使用数据库检索算法进行蛋白质的鉴定。使用完整性较高但注释不准确的数据库,可能能够鉴定到更多的蛋白质,但存在数据不准确的风险;使用注释准确但完整性较低的数据库,则有可能漏掉一些数据库中未收录的蛋白。如何兼顾蛋白质鉴定结果的完整性和准确性是一个重要的问题。本研究以人类蛋白质组为例,采用不同质谱仪及不同样品产生的蛋白质组数据,比较了常用的IPI数据库、UniProt数据库和Swiss-Prot数据库的检索结果。结果表明,3个数据库在不同的蛋白质组数据中表现各有优劣,但总体来讲差异很小;每个数据库可鉴定到的、特有的多肽数不超过总数的5%,蛋白数的差异为1%～5%。说明3个数据库都覆盖了常见的人类蛋白序列,完整性很高。因此,推荐采用通过人工注释、在不断更新中的Swiss-Prot数据库作为检索对象。当研究目的为鉴定或定量未收录在Swiss-Prot数据库中的蛋白序列（如一些特殊的蛋白异构体或突变体）时,可将目的序列加入该数据库进行检索,或考虑使用其他完整性更高的数据库。     

医院信息系统备份方案探讨

本文对基于ORACLE数据库、适用于不同级别医院的医院信息系统的备份方案进行了探讨，并详细阐述了一种简单、可靠、可行的备份方案。     

郑重声明

<正>本刊被CNKI系列数据库、万方数据库、重庆维普数据库等收录,因此凡本刊录用的稿件,均以印刷、光盘和网络版的形式同时刊发。稿件刊登后一并酌致稿酬,如作者不同意将文章编入该数据库,请在来稿时声明!     

修复被破坏的FOXPRO数据库的二种方法

在我国医院里 ,有相当一部分正在运行的应用程序是用Foxpro编写的 ,由于突然断电、程序非法关闭等原因 ,经常会导致 Foxpro数据库 .DBF文件被破坏 ,如果数据库被破坏了 ,用 Foxpro打开数据库 .DBF时 ,会出现“nota table/dbf”错误提示 ,导致无法用 Foxpro打开。数据的输入、修改、查询等操作均无法进行。不过出现这种情况时无需惊恐 ,可按下面的方法进行修复。首先介绍一下 Foxpro数据库 .DBF的文件结构 :Foxpro数据库 * .DBF的文件结构由头记录和数据记录组成 ,头记录定义该 * .DBF的结构并包含与该库相关的其它信息。头记录由文…     

基于Entrez系统利用生物信息数据库

阐述生物信息数据库分类及特点,着重介绍如何使用Entrez系统充分利用生物信息数据库。指出生物信息数据库在生物信息学的发展过程中发挥了巨大作用,促进了生物信息学的发展。     

通用人事管理软件GPMS在医院人事管理中的应用

通用人事管理软件ＧＰＭＳ使广大人事工作者从繁琐、低效、重复的手工劳动中解脱出来， 提高了人事管理工作的效率和水平。本文着重阐述了ＧＰＭＳ系统的设计原则、结构组成、运行环境及主控模块的主要功能特点， 并结合工作实际对ＧＰＭＳ系统在日常人事工作中的具体应用问题作一探讨。     

常用医学全文数据库的比较介绍

由于全文检索及数据库技术的快速发展,一种独立的电子资源-全文数据库逐渐受到广大用户的普遍关注.全文数据库是将文献全文以机读形式存储,用自然语言表达检索课题,借助于截词、逻辑等匹配方法,直接对文献正文进行查找,以检出所需文献的一种方式.由于具有检索直接、使用方便、专指性好等优点,给用户查找和获取全文带来了极大方便.我馆以建立镜像系统及内部用户等形式引进几种外文全文数据库,针对用户在选择数据库和使用上的问题,本文主要介绍几种常用的中外文医学全文数据库及检索方法,对用户迅速准确获取原始文献提供指导和帮助.     

介绍一种医用计算机图文管理系统

医用计算机图文管理系统是计算机应用于医学图像诊断领域的一种实用性技术,但某些采用ＦＯＸＰＲＯ编程数据库在实际临床运行中灵活性不佳,甚至不适宜进入医院的日常诊断紧张过程,耗材也难以随本文则采用了全新设计的数据库,将图文同步混排,存储对于每录入数据库一例诊断结果,均为寒带页面方式,而且格式可由用户根据学科需要任意更改、增删,并增强了数据库的检索功能。耗材大大降低的程序处理也使该数据库更为适用于临床。     

生物医学异构数据库集成的研究进展

随着生物医学的快速发展,不断地涌现出许多生物医学数据库。将这些相互独立的数据库有机地组织在一起,对于提高一个学科或领域的整体知识水平,以及对该学科或领域进行更深入、更全面的理解是十分重要的。数据集成可以实现数据更广泛的共享和更有效的利用,已经成为生物信息学的核心研究内容之一。介绍生物医学异构数据库集成的方法,综述生物医学异构数据库集成领域内最新的研究进展,并且讨论和总结各种方法的特点及使用条件。     

Ovid医学信息平台的特点及功能

Ovid Technologies是世界最大的医学数据库公司，是全球著名的数据库提供商。2001年6月与银盘公司（SilverPlatter Information）合并，组成全球最大的电子数据库出版公司。     

CBM与网上二种中文期刊全文数据库收录医学文献的包含关系

对CBM、《中国期刊全文数据库》和《中文科技期刊数据库》三种期刊数据库收录医学文献的包含关系进行了9年小样本多学科主题抽样的对比研究，结果显示，CBM的收录范围和覆盖面更大一些，《中国期刊全文数据库》和《中文科技期刊数据库》各有优势和特点。     

SERFILE数据库的评价与使用

SERFILE数据库收录期刊数量多，内容丰富，是生物学、基础医学及临床各科人员了解世界生物及医学期刊信息的最佳选择。本文介绍了该数据库的结构和使用方法，并力求客观的评价了该数据库的实际应用价值。     

MIT-BIH心率失常数据库的识读及应用

本文对美国MIT-BIH心率失常数据库的数据文件的格式进行了研究,提出的识读方法可使使用该数据库数据的研究人员能绕过其工具包而灵活地使用这些数据.本文还以其中一段数据记录为例进行了说明.     

医学数据库中时间变量的处理研究

本文从理论上、实践应用设计等方面对数据库中的时间量进行研究分析，并给出若干实例。     

HIS数据库数据文件故障及恢复一例

前几天，对我院HIS服务器进行了关库冷备的处理，在重启后出现数据库服务无法正常启动的问题，错误代码报ORA-01033，经过网上查找同类问题的解决方案，最终网满的排除了故障。下面对这类问题的解决步骤介绍如下，并提出了分析思路，供同行参考。     

ELF5在乳腺癌的表达及意义

目的研究E74-like factor 5 (ELF5)在乳腺癌的表达,探讨ELF5的表达与不同分型乳腺癌预后的关系。方法利用Oncomine数据库挖掘ELF5在乳腺癌组织中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析ELF5表达水平与雌激素受体阳性/阴性表达乳腺癌生存的关系。结果 Oncomine数据库分析ELF5在乳腺癌中表达降低(P=8.29e~(-10));KM plotter数据库分析结果显示ELF5表达量与雌激素受体阳性表达的乳腺癌无复发生存(RFS)呈正相关,即高表达ELF5的患者无复发生存较高(P=0.008)。结论 ELF5在乳腺癌组织中表达低于癌旁正常组织,其表达水平越高预后越好。