β-地中海贫血产前基因诊断的临床应用

目的建立β-地中海贫血产前基因诊断方法并应用于临床诊断.方法对高风险孕妇于孕中期抽取羊水10ml,应用双重PCR结合反向斑点杂交技术（PCR-RDB）,进行产前基因诊断.结果 85例受检病例中,检出β-地贫基因突变46例,其中杂合子37例,双重杂合子5例,纯合子4例.结论 PCR-RDB法是β-地贫产前诊断的有效方法,灵敏、准确、重复性好,值得在临床上应用推广.     

用PCR方法进行复合型地中海贫血产前诊断

本文介绍用聚合酶链反应和特异性寡核苷酸探针斑点杂交方法对6种不同形式的复合型地中海贫血高危胎儿12例进行产前诊断，结果是正常胎儿3例．β地贫杂合子3例，HbE杂合子1例，α地贫1复合HbE杂合子1例，α地贫1复合β地贫1例，重型α地贫(Hb—Batrs’水肿胎儿)2例，重型α地贫1例。     

广州海珠区地中海贫血基因诊断结果分析与研究

目的对育龄人群进行地中海贫血筛查以预防重症地贫患儿的出生。方法利用血液学表型的分析、Gap-PCR及反向斑点杂交检测技术(reverse dot blot,RDB),对8095例育龄人群进行α、β地中海贫血筛查和基因诊断。结果血液学筛查出地贫阳性携带者为43.1%;其中3460例接受α、β地贫基因诊断,其中检出α地贫511例、β地贫352例、αβ复合地贫20例,检出率分别为14.77%、10.17%和0.58%。结论地贫在中国南方人群携带率很高,加强对育龄人群的地贫筛查和产前诊断,是预防重型地贫儿出生的有效措施。     

桂林地区产前地中海贫血基因诊断175例分析

目的探讨分子诊断技术在产前地中海贫血基因诊断中的应用,以此降低出生缺陷。方法 2016年1月至2016年12月在本院确诊为同型地贫携带者夫妇共175对(其中3例为双胎妊娠),通过羊膜腔穿刺术获取胎儿标本提取DNA,应用跨跃断裂点PCR和PCR结合反向斑点杂交技术进行α,β地贫基因诊断。结果检测出正常胎儿30例,异常胎儿148例,中重型胎儿38例(21.35%)。夫妇为同型α地贫共122对,产前诊断检出正常胎儿22例(18.03%),轻型α地贫73例(59.84%),中间型α地贫17例(13.93%)及Bart′s水肿胎10例(8.20%);夫妇为同型β地贫共30对,产前诊断检出正常胎儿5例(16.67%),杂合子20例(66.67%),纯合子3例(10.00%)及双重杂合子2例(6.67%);夫妇同型地贫且一方为α复合β地贫共20对,产前诊断检出正常胎儿3例,轻型α地贫3例,中间型α地贫1例,β地贫杂合子6例,β地贫纯合子1例,α复合β地贫6例;双胎妊娠孕妇3例,检出轻型α地贫2例,Bart′s水肿胎2例,β地贫杂合子2例。结论应用分子诊断技术,对高危人群在孕中期行羊水地贫基因检测,可以尽早发现中、重型地贫胎儿,从而有效地降低出生缺陷。     

应用高效液相色谱技术检测小儿β地中海贫血的研究

目的探讨应用高效液相色谱技术(HPLC)快速诊断小儿β地中海贫血(β地贫)的实际应用价值。方法应用HPLC技术,对150例临床疑似珠蛋白生成障碍性贫血患儿进行血红蛋白分析,检测其血红蛋白A2(Hb A2)与血红蛋白F(Hb F)的含量。同时对上述患儿采用缺口聚合酶链反应技术(GAP-PCR)检测α地中海贫血(α地贫)缺失型突变,反向点杂交法(RDB)检测α地贫基因点突变与17种β珠蛋白基因突变。结果 1.以Hb A24.0%或Hb F10.0%作为HPLC方法诊断β地贫的诊断标准,共检测出90例β地贫。与基因分析方法比较,应用HPLC方法检测小儿β地贫的敏感性为98.9%,特异性为100.0%,准确性为99.3%,阳性预测值为100.0%,阴性预测值为98.3%。2.β地贫纯合子或双重杂合子与β地贫杂合子的Hb F含量有显著性差异。结论应用HPLC方法检测小儿β地贫敏感性高,特异性强,与基因分析方法有很高的符合率,且其操作简便,快速,适用于小儿β地贫的诊断分型。     

广东中山地区β-地中海贫血基因突变类型分析

目的建立β-地中海贫血基因诊断方法并统计分析本地区β-地贫基因突变类型.方法应用双重PCR结合反向斑点杂交技术(reverse dot blot),检测中国人8个常见及9个罕见β-地贫基因突变位点.结果1025例受检标本中,检出β-地贫基因突变209例,涉及11个基因突变位点.CD41-42(-TTCT)、IVS-Ⅱ-654(C→D)、nt-28(A→G)、CD17(A→G)、CD71-72、βE为本地区最常见的β-地贫基因突变位点,各占40.1%、22.9%、13.3%、12.4%、2.8%、2.4%,上述6种突变类型占所有检出突变位点的93.9%.结论PCR结合反向斑点杂交技术(PCR-RDB)是地β-地贫检测的有效方法.β-地贫基因突变类型分布存在区域差异.     

β地中海贫血的基因芯片检测

目的 探讨基因芯片诊断β地中海贫血的方法。方法 应用聚合酶链反应及基因芯片分析了我院24份已知基因分型的血液样品。结果 检测到正常个体4例，β地贫20例。包括6种突变类型CDl7(A→T)、IvS2nt-642(C→T)、CD41—42(-TCTT)、TATAbox nt-29(A→G)、TATA box nt-28(A→G)、CD37／N(G→A)。结论 基因芯片法能同时筛查多种β地贫突变，对开展遗传咨询、基因分析及产前诊断具有重要意义。     

广西南宁市农村育龄人群地中海贫血筛查参数的截断值探讨

目的探讨筛查地中海贫血(地贫)一些重要参数的截断值。方法采用法国MgthicL 18全自动血细胞分析仪、法国Sebia公司全自动电泳仪、Gap-PCR技术和反向斑点杂交技术检测育龄人群728例,对检测结果进行分析。结果以HbA2>3.99%为截断值诊断轻型β地贫的准确度为99.72%,以全自动琼脂糖凝胶电泳出现HbH或HbBart′s区带、Hb Constant Spring(HbCS)区带分别诊断HbH病、HbCS的准确度分别为99.72%、99.45%,以MCV<75.50fl、HbA2<3.50%串联联合检测筛查α地贫1的敏感度、特异度分别为96.68%、89.13%。结论通过Sebia全自动琼脂糖凝胶电泳对β地贫、HbH病、HbCS可以作最后诊断,以MCV及HbA2筛查α地贫1效果理想。     

南宁地区农村育龄人群地中海贫血筛查参数的截断值及基因型分部特点

目的 探讨筛查地中海贫血（地贫）一些重要参数的截断值.方法 采用法国MgthicL18全自动血细胞分析仪、法国Sebia公司全自动电泳仪、Gap-PCR技术和反向斑点杂交技术检测育龄人群728例,对检测结果进行分析.结果 以HbA2＞3.99%为截断值诊断轻型β地贫的准确度为99.72%,以全自动琼脂糖凝胶电泳出现HbH或HbBart＇s区带、Hb Constant Spring（HbCS）区带分别诊断HbH病、HbCS的准确度分别为99.72%、99.45%,以MCV＜75.50fl、HbA2＜3.50%串联联合检测筛查α地贫1的敏感度、特异度分别为96.68%、89.13%.结论 通过Sebia全自动琼脂糖凝胶电泳对β地贫、HbH病、HbCS可以作最后诊断,以MCV及HbA2筛查α地贫1效果理想.     

湖南部分地区β地中海贫血分子遗传学背景调查

目的调查湖南地区育龄人群中β地中海贫血(β地贫)基因的突变类型及其构成比。方法采集血液学筛查阳性个体及其配偶样本,应用PCR结合反向斑点杂交法进行β地贫基因分析。结果在2610例检测对象中,1540例为β地贫基因杂合突变携带者。共检测到12种突变,其中以IVS-2-654(C-T)、CD41-42(-CTTT)和CD17(A-T)为最常见突变,上述3种突变类型占所有检出突变的84.73%。结论湖南地区β地贫基因突变构成比具有区域性特征,需在地贫的预防干预中应给予足够重视。     

GST－π基因和癌基因int－2在乳腺癌中的扩增与基因的表达

采用ＤＮＡ和ＲＮＡ的斑点杂交分析方法，对３２例乳腺癌和相应的癌旁正常组织中ＧＳＴ－π和ｉｎｔ－２基因的ＤＮＡ扩增和ＲＮＡ转录表达情况进行研究，发现ＧＳＴ－π在乳腺癌中存在基因扩增和明显的ｍＲＮＡ表达增强，ＧＳＴ－π基因表达调控主要在转录水平进行；癌基因ｉｎｔ－２与乳腺癌的发生有一定关系。同时还发现乳腺癌中ＧＳＴ－π与ｉｎｔ－２基因之间存在有共扩增和共表达现象。     

β地中海贫血杂合子基因突变及Gγ珠蛋白基因-158位点SNP与Hb F的关系

目的　探讨 β地中海贫血 (简称 β地贫 )杂合子基因突变类型和 Gγ珠蛋白基因启动子 - 15 8位点 (Gγ- 15 8)单核苷酸多态性与胎儿血红蛋白 (fetal hemoglobin,Hb F)水平的关系。方法　抗碱 -比色法测定 Hb F水平 ;PCR-寡核苷酸斑点杂交法检测β地贫基因型 ;限制性内切酶 Xmn 消化经 PCR扩增的Gγ基因启动子 DNA片段 ,分析Gγ- 15 8位点的单核苷酸多态性。结果　 6 3例受检的轻型β地贫中 15例 Hb F≥ 2 % (2 .0 6 %～ 10 .4 4 % )。共检出 6种β地贫基因突变 ,分别是 :CD4 1/42 (- TTCT)、CD17(A→T)、nt- 2 8(A→ G)、CD71/72 ( A)、IVS- II- 6 5 4 (C→ T)、IVS- I- 1(G→ T)。 CD4 1/42、CD17、CD71/72、IVS- II-6 5 4的杂合子在 15例 Hb F升高组和 4 8例 Hb F正常组各自所占比例相同。 6 3例个体中有 10例为Gγ-15 8(C→T)突变的杂合子 ,总检出率为 15 .9% ;其中 15例高 Hb F个体中检出 8例 (检出率 5 3.33% ) ,HbF正常的 4 8例检出 2例 (检出率 4 .17% ) ,两组检出率差异有显著性 (P<0 .0 0 1)。结论　 β地贫基因突变CD4 1/42、CD17、CD71/72、IVS- II- 6 5 4与 β地贫杂合子的 Hb F水平无关 ;而 Gγ- 15 8(C→ T)突变与广西地区 β地贫杂合子 Hb F升高密切相关。     

应用基因芯片诊断宫颈石蜡组织样本中人乳头状瘤病毒感染及其临床意义

目的探讨应用基因芯片检测宫颈石蜡组织标本中人乳头状瘤病毒（HPV）感染的可能性及其临床意义。方法收集解放军总医院诊断为宫颈鳞状上皮病变的石蜡组织标本40例,其中宫颈浸润性鳞癌18例,宫颈上皮内瘤变（CIN）Ⅲ12例,CINⅠ4例,CINⅡ6例。从组织中提取DNA后采用基因芯片检测23种常见HPV基因亚型,即PCR扩增后产物在基因芯片上进行杂交。同时选用10例经基因芯片检测16型和18型基因阳性的宫颈鳞癌的石蜡组织切片做原位杂交。基因芯片检测结果与部分原位杂交结果进行比较并分析。结果基因芯片检测的18例宫颈鳞癌HPV高危亚型均为阳性（100％）,其中1例为混合阳性;12例CINⅢ中11例为高危亚型阳性（91．7％）,1例阴性;6例CINⅡ的宫颈病变中高危型5例阳性,低危型1例阳性;4例CINⅠ中有2例低危型阳性、2例阴性;宫颈鳞癌和CINⅢ组与CINⅠ和Ⅱ组比较,差异有统计学意义（U=80．0,P〈0．01）。10例宫颈鳞癌基因芯片HPV16型和18型阳性组织中,原位杂交同型探针6例检测显示阳性。结论HPV基因芯片技术可用于检测多种亚型,特异性强,敏感性高,对HPV感染亚型的鉴别及宫颈癌的预防和治疗具有重要意义。     

Typing of herpes simplex virus isolates with monoclonal antibodies and by nucleic acid spot hybridization

Fifty-one clinical isolates of herpes simplex virus (HSV) were typed by an enzyme immunoassay (EIA) using mouse monoclonal antibodies, by DNA spot hybridization, and by restriction enzyme analysis using restriction endonuclease Eco RI. Extracts of VERO cells infected with the isolates were used for coating microtitre plates or denatured and spotted onto nitrocellulose filters. Viral antigens passively adsorbed to microtitre plates were detected by an indirect EIA using mouse monoclonal antibodies specific for HSV type 1 (HSV-1) or HSV type 2 (HSV-2). Spotted DNA was hybridized with 32P-labeled probes containing Hind III/Sal I-fragments of either HSV-1 or HSV-2 DNA and bound radioactivity was detected by autoradiography and counted in a liquid scintillation counter. All the three methods gave identical results for the 51 isolates studied. Twenty-six isolates were identified as HSV-1 and 25 as HSV-2. An additional 30 specimens were tested only by EIA and hybridization. Results by both techniques were in complete agreement.     

利用基因芯片技术快速检测结核杆菌耐药性的初步研究

目的：探讨利用基因芯片技术检测结核杆菌的耐药性。方法：结核杆菌耐药性检测基因芯片的制备；临床分离株结核杆菌培养和药敏检测；结核杆菌基因组DNA的制备和结核杆菌耐药基因的聚和酶链反应；基因芯片的杂交、洗涤、检测与分析。结果：临床分离株结核杆菌培养和药敏检测结果：1株为药物敏感株结核杆菌(对异烟肼、利福平、链霉素、乙肤丁醇4种药物均敏感)；4株为多耐药株结核杆菌(对异烟肼、利福平、链霉素、乙肤丁醇4种药物均耐药)；药敏检测结果与5位患者临床的诊断性治疗的结果完全一致；进一步利用基因芯片技术进行检测，检测结果与上述结果相符合。结论：利用基因芯片技术检测结核杆菌的耐药性，准确、快速、高效。     

一个少见的β地中海贫血突变家系

目的　鉴定中国人中 1个少见的 β地中海贫血 (β-地贫 )家系成员的基因转录突变 (- 90C→ T)。　方法　表型分析采用常规的红细胞指数和血红蛋白电泳分析技术 ;反向点杂交技术用于检测中国人 18种已知类型的β-地贫突变 ;β珠蛋白基因全长 DNA测序技术用于确定样品的基因突变及其基因型 ;RT- PCR半定量法分析该突变对 β-珠蛋白基因转录水平的影响。　结果　家系分析发现 :先证者、先证者之兄和其母亲为有典型 β-地贫特征的个体 ,反向点杂交筛查未发现已知的 β-地贫突变 ,DNA直接测序分析发现该家系的这 3个成员均携带有 1种中国人中未见报道的 β地贫等位基因—— β-珠蛋白基因启动子区近侧 CACCC盒中 - 90位的 C→ T转录突变。RT- PCR分析显示该突变引起β-珠蛋白基因转录水平下降 (突变 :2 .2 33± 0 .0 1vs正常 :3.779± 1.19;95 % CI:3.0 6 0 ,4 .4 99) ,与其他类型的β-地贫杂合子β-基因的表达水平相当 (2 .110± 0 .5 3,95 % CI:1.732 ,2 .4 88)。　结论　 - 90位的 C→ T转录突变是中国人中未见报道的稀少类型的 β-地贫转录突变。     

Wide geographic distribution of a unique methicillin-resistant Staphylococcus aureus clone in Hungarian hospitals

Objective: To determine the genetic relatedness of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates recovered from six provincial hospitals in Hungary between 1993 and 1994.
Method: Molecular fingerprinting methods were used: hybridization with a mecA -specific DNA probe after Cla I restriction; hybridization with a probe for Tn 554 ; and pulsed-field gel electrophoresis after Sma I digestion of chromosomal DNA.
Results: All strains were resistant to penicillin, oxacillin, erythromycin, gentamicin, tetracycline, imipenem, and cephalosporins, and variably resistant to ofloxacin, clindamycin and tobramycin; all isolates were susceptible to vancomycin. Forty-eight of the 51 isolates carried the mecA gene as determined by Southern hybridization, using a mecA -specific DNA probe, indicating that the methodology used for initial identification may have been in error in three of the cases. Forty-seven of the 48 mecA -positive isolates showed very similar genetic backgrounds as defined by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) patterns after Sma I digestion of chromosomal DNAs: a unique PFGE pattern was seen in 32 isolates and minor variants of it in 15 additional isolates. All the 47 isolates carried the same mecA polymorph ( Cla I type III), as determined by DNA hybridization after Cla I digestion of chromosomal DNA. Only one of the MRSA isolates had a completely different PFGE pattern and a novel mecA polymorph.
Conclusions: The findings demonstrate the existence of a unique, epidemic MRSA clone, in both invasive and colonizing strains, which is widely dispersed in Hungarian hospitals hundreds of kilometers apart.     

利用基因芯片技术快速检测结核杆菌耐药性的初步研究

目的:探讨利用基因芯片技术检测结核杆菌的耐药性。方法:结核杆菌耐药性检测基因芯片的制备;临床分离株结核杆菌培养和药敏检测;结核杆菌基因组DNA的制备和结核杆菌耐药基因的聚和酶链反应;基因芯片的杂交、洗涤、检测与分析。结果:临床分离株结核杆菌培养和药敏检测结果:1株为药物敏感株结核杆菌(对异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇4种药物均敏感);4株为多耐药株结核杆菌(对异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇4种药物均耐药);药敏检测结果与5位患者临床的诊断性治疗的结果完全一致;进一步利用基因芯片技术进行检测, 检测结果与上述结果相符合。结论:利用基因芯片技术检测结核杆菌的耐药性, 准确、快速、高效。     

Pitfalls in genetic counselling for β-thalassemia: an individual with 4 different thalassemia mutations

This paper describes a complex combination of four thalassemia genes (delta(+), beta(0), nondeletion and deletion alpha-thalassemia) in the spouse of a typical high Hb A2 beta-thalassemia carrier presenting for genetic counselling. This complex gene combination resulted in a hematological phenotype, characterized by thalassemia-like red cell indices, normal Hb A2 and Hb F levels and slightly reduced alpha/beta globin chain synthesis ratio, and therefore not indicative for the presence of beta-thalassemia trait. Family studies in combination with alpha-globin gene mapping, haplotype analysis at the beta-globin gene cluster and definition of the beta-thalassemia mutation by oligonucleotide hybridization led us to identify a beta-thalassemia mutation, to define the molecular basis for this phenotype and give the appropriate genetic counselling.     

beta-Globin mutation detection by tagged single-base extension and hybridization to universal glass and flow-through microarrays

To test the feasibility of developing a diagnostic microarray for a specific disease, we selected all pathogenic changes of the beta-globin gene occurring at a frequency >/=1% in the multi-ethnic Dutch population for analysis. A tagged single-base extension (SBE) approach was used to detect 19 different mutations causing beta-thalassemia or abnormal hemoglobins. In the SBE reaction, the primers were elongated at the 3'site with a fluorescently labeled dideoxyribonucleotide triphosphate (ddNTP) complementary to the mutation, following tag hybridization to a glass or flow-through microarray. We compared the performance of a generic glass array and a porous system, by testing each mutation separately using heterozygous carriers and by screening a cohort of 40 unknown beta-thalassemia carriers and patients. The results were verified by direct sequencing. The microarray system was able to detect 17 beta-globin mutations simultaneously with >95% accuracy in a single SBE reaction. The flow-through array performed slightly better (96%), but the main advantages of the system included real-time data recording and a considerable time saving achieved through a reduced hybridization time.