MiRNA基因及miRNA相关基因单核苷酸多态性与肿瘤易感性

MircoRNAs（miRNAs）是一类进化上高度保守的重要的转录后调控因子,通过调节基因的表达而参与调控细胞死亡、增殖及分化等生理过程,同时与肿瘤等疾病的发生、发展密切相关。随着miRNAs基因以及靶基因结合位点的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）和miRNA相关基因SNP的生物预测和筛选技术的不断成熟,以及下一代测序技术在肿瘤基因组研究中的广泛应用,将发现大量新的miRNAs基因的SNP位点,这些miRNAs基因以及靶基因结合位点的SNP和miRNA相关基因的SNP与肿瘤等复杂疾病的易感及预后密切相关,通过检测miRNAs基因SNP或靶基因结合位点SNP或miRNA相关基因的SNP位点,即可进行肿瘤发病风险的判断和预后预测。     

自发性高血压大鼠延髓microRNA差异表达分析

目的　探讨自发性高血压大鼠延髓microRNA（miRNA）差异表达谱及其靶基因生物信息学分析。 方法　采用自发性高血压大鼠模型（SHR组）,同周龄SD大鼠为对照组（Control组）。利用miRNA芯片检测大鼠延髓中miRNAs差异表达谱。 结果　与对照组比较,SHR组尾动脉收缩压显著升高（P＜0.0001）;SHR组延髓组织miRNAs有显著差异表达谱,16个miRNAs表达上调和7个miRNAs表达下调（1.5-fold change cutoff, P<0.05）。qRT-PCR验证结果显示,与对照组比较,SHR组延髓miR-153、miR-193及miR-301a表达显著下降,与芯片结果一致。生物信息学分析显示,差异表达miRNAs可能调控2775个靶基因（target score≥83）。这些靶基因主要富集在12个信号通路,包括磷脂酰肌醇3-激酶（Phosphatidylinositide3-kinase,PI3K）通路等。 结论　自发性高血压大鼠延髓组织中miR-153、miR-193及miR-301a明显下调,且生物信息学分析提示PI3K通路介导神经炎症可能作为高血压中枢相关差异表达miRNAs调控靶基因介导的主要致病通路。     

microRNA调控结核分枝杆菌感染巨噬细胞凋亡的研究进展

细胞凋亡对于机体抑制或清除胞内结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)尤为重要,Mtb感染巨噬细胞后,往往会诱导机体启动一系列机制调控巨噬细胞凋亡。在Mtb感染的巨噬细胞内存在差异表达的microRNAs(miRNAs),miRNA可直接结合凋亡基因的3′UTR(3′-untranslated region)非翻译区结合位点,通过调控凋亡基因表达参与线粒体或死亡受体途径调控巨噬细胞凋亡。本文综述了现阶段与Mtb感染巨噬细胞凋亡的相关miRNAs及其调控巨噬细胞凋亡的主要机制。     

室间隔缺损胎儿心室肌组织微小RNAs时序性表达差异研究

目的采用微小RNAs（miRNAs）表达谱芯片分析不同孕龄（孕早期与孕中期）室间隔缺损（VSD）胎儿心室肌组织中时序性表达差异的miRNAs。方法连续性纳入2009年7～12月南京医科大学附属南京妇幼保健院因病理因素流产经解剖证实为VSD且不合并其他畸形的胎儿为VSD组。以同期因生理性难免流产,并经解剖证实无心脏畸形和其他器官畸形的胎儿为对照组,依据孕龄与VSD组1：1匹配。根据孕龄,将VSD组和对照组分别分为孕早期亚组和孕中期亚组。采用Agilent Human2.0 miRNAs表达谱芯片观察胎儿心室肌组织miRNAs表达变化,芯片数据采用生物信息学方法进行分析,包括差异miRNAs筛选,预测miRNAs靶基因Gene Ontology分析,靶基因信号通路分析,并采用实时PCR法验证芯片结果。结果 VSD组和对照组各纳入6例,两组孕早期亚组和孕中期亚组均各3例。①通过差异miRNAs筛选,发现孕早期VSD亚组与孕中期VSD亚组间有33个时序性表达差异的miRNAs。19个miRNAs在孕早期VSD亚组表达上调,在孕中期VSD亚组表达下调;14个miRNAs在孕早期VSD亚组表达下调,在孕中期VSD亚组表达上调。②生物信息学预测到2761个靶基因,大部分miRNAs的靶基因中含有与心脏发育直接相关的关键基因（TBX5、GATA4、TBX1和NKX2-5等）。③靶基因GeneOntology分析表明其中与细胞进程、代谢过程和生物调控相关的靶基因分别占整个靶基因数量的23.5%、18.3%和17.7%。④靶基因信号通路分析发现,WNT信号通路中的靶基因在孕早期VSD亚组与孕中期VSD亚组中存在时序性差异。⑤随机挑选孕早期VSD亚组与孕中期VSD亚组时序性表达差异的4个miRNAs（hsa-miR-19a、hsa-let-7e、hsa-miR-134和hsa-miR-206）进行验证,定量PCR结果显示,孕早期VSD亚组分别上调3.2（hsa-miR-19a）和4.1倍（hsa-let-7e）,下调5.3（hsa-miR-134）和4.4倍（hsa-miR-206）;孕中期VSD亚组分别下调4.8（hsa-miR-19a）和3.4倍（hsa-let-7e）,上调4.5（hsa-miR-134）和3.9倍（hsa-miR-206）。结论时序性表达差异的miRNAs在胎儿VSD畸形的发生中可能起着重要作用,但本研究样本量较小,需要进一步扩大样本量进行验证。这些差异表达miRNAs的预测靶基因与细胞发育、分化和代谢密切相关,含有与心脏发育直接相关的关键基因,部分靶基因为WNT信号通路中的关键因子,提示VSD的发生发展是机体在miRNAs的参与下,在多个层面上使基因表达失控的共同结果。     

microRNAs和自身免疫性疾病

microRNAs（miRNAs）是一类进化上保守的微小非编码RNA,通过与靶基因mRNA3’端非翻译区相互作用致使mRNA降解或翻译抑制,在转录后水平调控基因表达,进而影响细胞周期、分化及凋亡等多种细胞生理过程。nfiRNAs在免疫系统的发育及功能行使中具有重要调控作用。研究表明,miRNAs在多种自身免疫性疾病中表达异常,提示miRNAs在自身免疫性疾病的发生发展及防治中具有重大作用。     

MicroRNA与癌症的相关性研究进展(文献综述)

MicroRNAs（miRNAs）是一类长约22 nt的非编码单链RNA分子,在转录后水平调控基因的表达。miRNA能特异性诱导靶基因mRNA降解及抑制靶基因mRNA的翻译,同时在细胞的发生、发展、增殖、分化和凋亡过程中发挥重要的调节作用[1]。目前,人类基因组中已确认的miRNAs约500个,     

MicroRNAs与病毒性肝炎的研究进展

MicroRNAs（miRNAs）是近年来新发现的一组高度保守的非编码RNAs,在转录后水平调节真核基因的表达,在人类许多疾病中发挥着重要的作用。miRNAs在许多重要的生理、病理过程如细胞分化、     

MicroRNA在肝病中的研究与应用

微小RNA（miRNAs, miR）是一类长约21~22核苷酸的单链非蛋白编码小RNA分子。在肝脏,多种miRNA的表型改变或表达异常均可在基因水平影响肝炎病毒的复制,靶向调控肝组织炎症向肝纤维化、肝硬化,甚至原发性肝癌进展,并因此成为一类新型肿瘤相关基因;不仅如此,miRNAs数量或功能异常还通过干扰胰岛素信号传导,诱导胰岛素抵抗发生,从而影响机体正常脂质代谢,促进脂肪性肝病的形成。因此,寻找特效的药物或方法,纠正肝细胞内miRNAs异常,将成为人类攻克多种慢性肝病的一类新型重要手段。     

MicroRNA在免疫系统中的作用

MicroRNAs(miRNAs)是一类新型保守的非编码单链小分子RNA,广泛存在各种生物体中.miRNAs转录后水平调节基因的表达,主要通过结合到特定靶日标mRNA的3′UTRS端,导致蛋白翻译抑制或促进靶mRNA降解.miR-NAs在固有免疫和适应性免疫细胞中通过特定的表达谱调节细胞的分化和功能,其表达和功能失调将导致各种免疫性疾病发生,如癌症和自身免疫性疾病.本文中主要阐述目前miRNAs在免疫系统中的研究及其对各种自身免疫性疾病的影响.     

唾液腺腺样囊性癌中相关微小RNAs及其靶基因的生物信息学分析

目的 探讨唾液腺腺样囊性癌(SACC)潜在的微小RNAs(miRNAs）分子标志物,构建miRNA-mRNA调控网络,并阐明其潜在的分子机制。 方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载2个SACC的微阵列芯片数据,通过R语言进行分析差异的miRNAs与mRNA。应用FunRich 3.1.3软件对差异miRNA进行转录因子富集分析以及预测差异miRNAs的靶基因。对SACC中差异miRNAs的靶基因进行基因本体论（GO）富集分析与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析以及蛋白互作分析。使用Cytoscape 3.7.0构建miRNA-mRNA调控网络。 结果 1. 共筛选出144个差异表达的miRNAs (DEMs)和1216个差异表达的mRNAs(DEGs);2. KEGG信号通路富集分析发现,靶基因主要参与Rap1信号通路、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）信号通路以及肌动蛋白细胞骨架的调节;3. STRING蛋白相互作用分析发现,ACSL1、SCD、MGLL、FABP4在蛋白相互作用网络中处于核心地位。 结论 我们筛选出SACC与相对正常组织间差异明显的miRNA和mRNA,并分析发现了这些差异分子主要参与的信号通路和功能。     

MicroRNA与胃癌的关系

微小RNA(microRNA)是一类内源性、长度约为16～29 nt非编码小RNA,在细胞发育、增殖、分化、凋亡等方面都起了重要作用.通过与靶mRNA完全或不完全互补配对,引起mRNA的降解或翻译抑制,从而对基因转录后水平进行调控.microRNA既可作为促癌基因参与恶性肿瘤的发生和发育过程,又可作为抑瘤基因控制恶性肿...     

MiR-429生物学功能的研究进展

微小RNA(miRNA)是一类长度在22个核苷酸左右的内源性非编码单链RNA.这类RNA在细胞中发挥着重要的生物学功能,其中miR-429经大量研究证实,可以通过对不同靶基因的表达进行调控从而发挥抑制肿瘤发生和进展的重要作用,同时也能够在细胞分化和神经性疾病中发挥作用.我们对miR-429及其下游靶基因在细胞增殖、凋亡...     

肿瘤相关性microRNA研究进展

microRNA是一类长约19~25 nt, 能在转录后水平负性调节靶mRNA表达的小分子非编码单链RNA。它们广泛存在于真核生物体内，参与生物体发育过程中细胞分化、增殖、凋亡等多种生理病理途径的调控。 microRNA与肿瘤相关基因表达的调控密切相关，直接或间接影响肿瘤细胞的增殖与凋亡过程。     

MicroRNAs in the Diagnosis and Treatment of Cancer

Immune cells are recruited into the tumor microenvironment and regulate anti- and pro-tumor signals. MicroRNAs (miRNAs) markedly control the immune system responses in cancer development. miRNAs that affect the immune system could be interesting targets for immunomodulation against cancer, either through the activation of effector cells or through the down-regulation of regulatory cells. Bioinformatic calculations can predict the immune system and miRNA interactions. In this review, we discuss the most recent studies about miRNA as the main regulator of recruitment and the activation of the immune system in the tumor microenvironment and finally we propose several miRNAs that could serve as therapeutic molecules in the immunotherapy of cancer.     

Tracking miRNAs' footprints in tumor–microenvironment interactions: Insights and implications for targeted cancer therapy

In the past decades, cancer medicine studies have mainly focused on tumor cell biology as the main promoter of solid tumor progression. However, tumor biology does not explain the intertwinement and ambiguity of the tumors' territory. Recently, the approach of understanding cancer has shifted from investigating the biology of tumor cells to studying the microenvironment surrounding them. MicroRNAs (miRNAs), which play a role in exploiting indigenous stromal cells and are components that cooperate and produce a favorable microenvironment for progressive tumor formation, have been implicated in numerous processes essential for tumor initiation and growth. Understanding the mechanisms underlying interactions between tumor cells and their adjacent environment holds many promises for the future of cancer‐targeted therapies. Herein, we provide a step‐by‐step account of miRNA involvement in tumor–microenvironment interactions as the micromediators of tumor cell and stroma communications. We also focus on the clinical challenges in using miRNAs tof overcome therapy resistance mechanisms and tumor heterogeneity bias in cancer therapy. © 2015 Wiley Periodicals, Inc.     

miRNA靶向RAS-MAPK通路的表观遗传性激活与肿瘤

肿瘤作为一种难治性疾病，全世界都在为其治疗寻找新靶点。高度保守的RAS-MAPK通路在生物界大多数细胞内都广泛存在，主要通过各种级联反应刺激来控制细胞增殖分化等功能。体细胞基因突变编码RAS-MAPK通路经常发生在许多肿瘤中。miRNAs作为近年来研究较多的一种基因表达调控方式，其是通过与相关靶基因3’-UTR区结合来降解mRNA或抑制翻译表达。明确miRNA调控RAS-MAPK在肿瘤发生发展中的机制，可能为肿瘤的治疗提供新靶点。     

MicroRNA生物学功能及其在肿瘤中的作用机制

MicroRNA是新近发现的一类调控性小分子RNA,通过降解靶基因mRNA或者转录后抑制靶基因表达而发挥作用。目前的研究已经发现microRNA参与调控发育、细胞分化、细胞凋亡、细胞能量代谢等多种生理过程以及心血管疾病、神经系统疾病、糖尿病、肿瘤等多种病理过程。本文就microRNA的生物学功能及其在肿瘤发生、发展中的作用机制做一综述。     

Oncogenic cooperation between SOCS family proteins and EGFR identified using a Drosophila epithelial transformation model

MicroRNAs (miRNAs) are emerging as cooperating factors that promote the activity of oncogenes in tumor formation and disease progression. This poses the challenge of identifying the miRNA targets responsible for these interactions. In this study, we identify the growth regulatory miRNA bantam and its target, Socs36E, as cooperating factors in EGFR-driven tumorigenesis and metastasis in a Drosophila model of epithelial transformation. bantam promotes growth by limiting expression of Socs36E, which functions as a negative growth regulator. Socs36E has only a modest effect on growth on its own, but behaves as a tumor suppressor in combination with EGFR activation. The human ortholog of SOCS36E, SOCS5, behaves as a candidate tumor suppressor in cellular transformation in cooperation with EGFR/RAS pathway activation.     

MicroRNA在脑胶质瘤中的作用

icroRNAs (miRNAs) are critical regulators of gene expression. These small, non-coding RNAs are believed to regulate more than one third of protein-coding genes, and have been implicated in the control of many biological processes, including the biology of glioma. The functional significance in some of the miRNAs begins to emerge. This paper reviews the biogenesis of miRNAs, their roles in neuronal development and tumorigenesis of gliomas, and their contribution as tumor biomarkers. Research in this area is quickly gathering pace and is illuminating important aspects of the diseases that may ultimately lead to novel therapeutic interventions, as well as diagnostic and prognostic tools for brain tumors.