2004—2005年中国A(H1N亚型流感病毒抗原性及基因特性研究

目的阐明2004—2005年中国流行的A(H1N1)亚型流感病毒血凝素抗原性及其基因变异情况。方法对2004—2005年分离的A(H1N1)亚型毒株先进行单向血凝抑制试验;在此基础上选取不同时间、地点的A(H1N1)亚型流感毒株进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因进化特性分析。结果单向血凝抑制实验结果表明,2004年A(H1N1)亚型病毒株对鉴定血清的血凝抑制效价与A/Shanghai/1/1999(H1N1)毒株没有4倍差异;2005年分离的A(H1H1)亚型毒株中有62株(占6·2%)病毒与A/Shanghai/1/1999(H1N1)毒株本身的血凝抑制效价相比有4倍差异。HA1区核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,我国2005年分离到的A(H1N1)亚型流感病毒株有以下位点发生变异,54K>R、90T>K、101Y>H、149R>K、169V>A、190D>N、212R>K、219K>R、245W>R、246Y>F、258T>N、318V>A,其中54、190位氨基酸位于抗原决定簇。结论我国2005年分离的A(H1N1)亚型流感毒株基因特性和抗原性已开始发生变异。     

2004-2005年中国A(H1N1)亚型流感病毒抗原性及基因特性研究

目的 阐明2004-2005年中国流行的A（H1N1）亚型流感病毒血凝素抗原性及其基因变异情况.方法 对2004-2005年分离的A（H1N1）亚型毒株先进行单向血凝抑制试验;在此基础上选取不同时间、地点的A（H1N1）亚型流感毒株进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因进化特性分析.结果 单向血凝抑制实验结果表明,2004年A（H1N1）亚型病毒株对鉴定血清的血凝抑制效价与A/Shanghai/1/1999（H1N1）毒株没有4倍差异;2005年分离的A（H1H1）亚型毒株中有62株（占6.2%）病毒与A/Shanghai/1/1999（H1N1）毒株本身的血凝抑制效价相比有4倍差异.HA1区核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,我国2005年分离到的A（H1N1）亚型流感病毒株有以下位点发生变异,54 K＞R、90T＞K、101Y＞H、149R＞K、169V＞A、190D＞N、212R＞K、219K＞R、245W＞R、246Y＞F、258T＞N、318V＞A,其中54、190位氨基酸位于抗原决定簇.结论 我国2005年分离的A（H1N1）亚型流感毒株基因特性和抗原性已开始发生变异.     

2006年中国流感病毒抗原性及基因特性研究

目的分析2006年中国季节性流感的流行状况，以及病毒的抗原性和基因变异情况。方法对来自流感监测网络的毒株进行单向血凝抑制试验，在此基础上选择不同时间、地点分离的毒株进行血凝素基因的序列测定，然后分析其基因特性。结果2006年我国同时流行A型（H1N1亚型、H3N2亚型）和B型流感病毒。H1N1亚型毒株和B型Victoria系流感病毒为优势毒株。对H1N1亚型毒株的HA1区序列比较发现，2006年分离的毒株与A，湖北洪山／53／2005（H1N1）比较，在192、193、196、198位发生氨基酸替换的毒株．这些位点位于抗原决定簇的B区。H3N2亚型毒株与A，云南，1145／2005（H3N2）比较，在142、144位发生氨基酸替换。我国流行的B型流感毒株无论是Victoria系和Yamagata系毒株的抗原性均没有发生变异，与2005--2006年我国的流行株B／shenzhen／155／2005、B／tianjin／144／2005类似。结论2006年中国流行的H1N1亚型和H3N2亚型流感病毒的抗原性及基因特性已经发生改变；B型流感病毒的抗原性和基因特性没有改变。     

2004-2005年中国B型流感病毒抗原性及基因特性研究

目的 阐明2004-2005年中国流行的B型流感病毒血凝素抗原性及其基因变异情况.方法 对2004-2005年分离的B型毒株先进行单向血凝抑制试验;在此基础上选取不同时间、地点的B型流感毒株进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因进化特性分析.结果 2004-2005年我国人群中同时流行着B型Yamagata系和Victoria系毒株.Yamagata系毒株与B/Shanghai/361/02比较,2004年有3.7%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,2005年有4.5%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,并且在血凝素基因HA1区发生9个氨基酸替换,在196为增加一个糖基化位点.Victoria系毒株与B/Hong kong/330/01比较,2004年有8.5%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,2005年有20.6%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,并且在HA1区发生9个氨基酸替换,在197位增加一个糖基化位点.结论 2004-2005年我国人群中流行的B型流感病毒的抗原性与B/Shanghai/361/02、B/Hong kong/330/01相比抗原性已经发生了变化.     

2004-2008年我国流行的A型流感病毒抗原性及HA1基因特性的研究

目的 了解我国2004-2008年A(H1N1、H3N2)型流感病毒流行情况、抗原性和基因特性变异关系,了解疫苗株与我国流行株之间抗原性变化情况.方法 选择2004年以来我国分离的A(H1N1、H3N2)型流感病毒进行抗原性及HA1区基因序列,通过比对HA1蛋白位点变异情况,分析我国流感病毒抗原性及基因特性变化情况.结果 A(H1N1)亚型流感毒株抗原性2004-2007年分离的A(H1N1)亚型流感病毒的抗原性与疫苗株A/New Caledonia/20/1999(H1N1)类似;2008年我国流行的A(H1N1)亚型毒株的抗原性与2008-2009年北半球的流感疫苗株A/Brisben/59/2007(H1N1)类似.2004-2005年分离的A(H3N2)亚型流感病毒的抗原性与疫苗株A/Fujian/411/12002(H3N2)比较发生了变异;2006-2007年我国流行的H3N2毒株与A/Wiscansin/67/2006(H3N2)类似,2008年我国流行的H3N2毒株与疫苗株A/Brisben/10/2006(H3N2)类似.结论 2004-2008年我国流行的A(H1N1、H3N2)亚型流感病毒的抗原性和基因特性发生了改变.     

2000～2002年我国流行的甲3(H3N2)亚型流感病毒抗原性及基因特性的研究

目的 了解2000～2002年我国流行的甲3流感病毒HA基因突变及其抗原变异情况。方法 鸡胚传代流感病毒，收获尿囊液作为抗原性分析抗原并提取病毒的RNA，进行逆转录—聚合酶链反应(RT-PCR)，扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序，用MegAlign软件进行基因种系发生树分析。结果 与A/武汉/359/1995(H3N2)、A／Sydney／5／1997(H3N2)相比，2000～2002年我国分离到的甲3亚型流感病毒的血凝素重链区氨基酸序列存在差异。2001～2002年分离到的甲3毒株与2000年分离出的毒株的血凝素蛋白重链区(HA2)氨基酸序列有4个位点差异，它们分别位于83、186、202和222位，其中83和186分别位于抗原决定簇E和B区，其余均位于受体结合位点(RBS)的左臂。结论 2000～2002年分离到的甲3亚型流感病毒的基因特性发生突变并导致其抗原性发生漂移。     

不同抗原性甲3 (H3N2) 亚型流感病毒的鉴定及分子生物学研究

目的：对不能用当年标准血清进行鉴定的甲3（H3N2）亚型流感病毒进行抗原性分析及分子生物学研究。方法：用交互血凝抑制试验对毒株进行抗原性分析,提取病毒RNA,用一步法逆转录聚合酶链反应（RT－PCR）扩增HA1（血凝素重链区）基因片段,产物纯化后测序并分析结果。结果：发现两株从鸡胚分离到的甲3（H3N2）亚型“D”相毒株与2株从MDCK细胞分离到的“0”相毒株抗原性已明显不同;其中1999年分离的“D”相与“0”相2毒株的抗原比大于256,氨基酸序列同源性为93％,抗原决定簇A区和B区氨基酸位点相差分别为50％及35％;受体结合部位（RBS）有6个氨基酸位点发生变异（左侧壁1个、前壁3个、右壁2个）。结论：人群中存在没有发生“0”相变异的甲（H3N2）亚型“D”相毒株,其抗原性与当前流行的“O”相变异株已明显不同,提示今后在鉴定甲3（H3N2）亚型毒株时,需根据毒株的来源和相特性选择适合的标准血清进行鉴定。     

2009年泉州市H1N1流感监测及基因特性分析

目的 了解2009年泉州地区H1N1流感监测情况,分析泉州市H1N1流感病毒的HA和NA基因特征,探讨该病毒的遗传变异及分子特性.方法 对泉州市H1N1流感监测期间的病人咽拭子采用real-time RT-PCR方法检测病毒核酸,MDCK细胞培养进行病毒分离、鉴定,并提取其中2株代表性毒株病毒RNA;采用RT-PCR扩增病毒HA和NA基因,纯化产物进行核苷酸序列测定;用DNAStar Megalign软件进行序列分析.结果 1020份咽拭子中有200份为H1N1流感病毒核酸阳性,70份季节性流感病毒核酸阳性,其中53份为H3N2亚型,14份为H1N1亚型,3份为B型,并分离到29株甲型H1N1流感病毒株.HA基因经核苷酸序列测定显示,该毒株与北美流行株高度同源,由HA基因核苷酸序列推导的氨基酸系列与疫苗株A/Brisbane/59/2007相比,有22个位于抗原决定簇的氨基酸位点发生变异,但受体结合特异性仍为人样受体.NA基因耐药性位点分析,显示对达菲药物依然敏感.结论 2009年泉州市H1N1流感流行毒株与北美流行株高度同源,相对于疫苗代表株出现了HA蛋白抗原性的改变.     

1999-2007年佛山市流感病毒活动情况及甲3亚型病毒HA1基因分析

目的总结1999-2007年佛山市流感病毒流行情况,分析甲3亚型（H3N2）毒株流行与其HA1基因进化的关系。方法用MDCK细胞分离流感病毒,培养后血凝阳性者进行型别鉴定。随机抽取每年2～3株甲3亚型毒株的细胞培养物提取RNA后进行HA1基因的逆转录,对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果甲型和乙型流感病毒在佛山市人群中同时流行。甲型流感毒株是人群感染流感的主要型别。HA1区氨基酸序列与历年的流感疫苗推荐株相比,点突变率为0.3%～6.08%。发生替换的重要位点包括了抗原决定簇的17个位点、抗体结合部位的10个位点和1个糖基化位点。结论佛山市的甲1和甲3亚型流感毒株活动呈此起彼伏的优势株转换现象。甲3亚型新旧毒株交替迅速,大致按照毒株分离的年代聚类成进化树的不同小侧枝,表明新的流行株出现后可能迅速突破地域局限。提示地区实验室及时监测和研究流感毒株的发生和发展是流感监测网络建设的基础。     

2006年广东省流感病毒流行的分子基础

目的了解广东省2006年流行性感冒（流感）流行情况的分子基础。方法选择广东省流感监测网络实验室分离的11株流感毒株,对血凝素基因进行基因和抗原性的分析。此外,还检测人群抗体水平。结果2006年流行的H1N1亚型病毒血凝素蛋白重链（HA1）区氨基酸序列与A/New Caledonia/20/99（H1N1）相比,同源性为95.7%～96.3%,有2个抗原决定簇的氨基酸发生了替换。Victoria系的HA1区基因与B/HongKong/330/2001相比,同源性为97.2%～97.5%,有6个位于抗原决定簇的氨基酸发生了替换,这种变化和B/Malaysia/2506/2004相一致,这在B型的基因种系发生树也得到证实。同时发现人群针对H1N1亚型和B/Victoria的抗体水平较低。结论2006年广东H1N1亚型和B/Victoria系病毒株发生了一定程度的变异,以及人群保护性抗体水平较低,共同造成其在本地的流行。     

Two residues in the hemagglutinin of A/Fujian/411/02-like influenza viruses are responsible for antigenic drift from A/Panama/2007/99

The H3N2 vaccine strain (A/Panama/2007/99) for the 2003-2004 influenza season did not antigenically match the circulating A/Fujian/411/02-like H3N2 viruses and had reduced effectiveness against influenza outbreaks. A/Wyoming/03/2003, an A/Fujian-like virus, was recommended as the vaccine strain for the 2004-2005 season. A/Wyoming differed from A/Panama by 16 amino acids in the HA1 molecule. Reverse genetics was used to determine the minimal amino acid changes that were responsible for the antigenic drift from A/Panama to A/Wyoming. After substitutions of 2 of the 16 amino acids in the HA (H155T, Q156H), the A/Panama HA variant was antigenically equivalent to A/Wyoming as determined by hemagglutination inhibition and microneutralization assays using ferret postinfection antisera. Conversely, A/Wyoming containing the His-155 and Gln-156 residues from A/Panama was antigenically equivalent to A/Panama. These results indicated that only these two HA residues specified the antigenic drift from A/Panama to A/Wyoming; other amino acid differences between these two H3N2 viruses had minimal impact on virus antigenicity but impacted virus replication efficiency in eggs.     

Molecular and phylogenetic analysis of human influenza virus among Iranian patients in Shiraz, Iran

Influenza is a viral respiratory pathogen responsible for frequent seasonal epidemics. There are currently three major human influenza viruses in global circulation namely A/H1N1, A/H3N2, and B. The objective of this study was to determine the human influenza virus genotypes in Shiraz, the capital of the Fars province of Iran. Three hundred patients suspected with human influenza virus infection were enrolled in this survey (2004-2005). The throat samples were cultured and titrated by hemagglutination (HA) assay. Typing and subtyping were performed by an in-house developed multiplex RT-PCR. Moreover, the phylogenetic analysis was carried out for HA gene. A total of 24 samples were found to be positive for human influenza virus infection, 17 H1N1 and 7 H3N2. These results were in agreement with the HI assay. The phylogenetic analysis results revealed that the Iranian H1N1 isolated were close to the A/New Caledonia/20/99 vaccine strain genetically and the Iranian H3N2 isolates were also related closely to the Fujian/411/021 and California/7/2004 vaccine strains. However, a slight genetic drift was found in these isolates. In conclusion, it was demonstrated that both influenza A subtypes A/H1N1 and A/H3N2 were dominant among Iranian patients in Shiraz during the 2004/5 winter season.     

Molecular and phylogenetic analysis and vaccine strain match of human influenza A(H3N2) viruses isolated in Northern Greece between 2004 and 2008

Influenza A viruses are characterized by a unique genome structure, causing genetic instability, especially to the genes of haemagglutinin and neuraminidase. The objectives of this research was molecular and phylogenetic analysis of influenza A(H3N2) strains that circulated in Northern Greece since 2004, particularly the identification of sequence variations and the comparison of circulating viruses with vaccine strains. Since 2004 in Northern Greece, a total of 216 clinical samples were positive for influenza virus infections, of which 83 (38.4%) were attributed to influenza A(H3N2). Molecular analysis of the HA genes of 23 isolates showed that all circulating strains had variations at antigenic sites. Receptor binding sites were conserved in 2004–2005 and 2005–2006 strains whereas a variation was observed in all 2006–2007 strains (H195Y). Furthermore, alternative amino acids for sialic acid receptor binding sites were observed in most of the 2004–2006 isolates. Some amino acid substitutions were also observed at the neuraminidase sequences, which however had no effect on the antigenicity of the viruses. Phylogenetic analysis of each year's circulating strains revealed a relatively low match with the vaccine strains A/Fujian/411/02 and A/California/7/04 for 2004–2005 and 2005–2006, respectively, whereas most 2006–2007 isolates match with the vaccine strain, A/Wisconsin/67/05. This year, unique variations were observed at antigenic and glycosylation sites of A/Serres/77/07-like stains. Constant surveillance of yearly variations is of great importance, so that vaccine strains can be evaluated.     

Antigenic variations of human influenza virus in Shiraz,Iran

Purpose: Influenza virus is a major cause of human respiratory infections and responsible for pandemics and regional outbreaks around the world. This investigation aims to determine the prevalent influenza genotypes during 2005-2007 outbreaks in Shiraz, the capital city of Fars province, southern Iran and compare the results obtained with those of previous study. Materials and Method: Of the 300 pharyngeal swabs collected from influenza patients, 26 were found to be positive by culture and hemagglutination (HA) assays. Typing and subtyping of the isolates carried out by using multiplex RT-PCR and phylogenetic analysis performed on isolated HA genes using neighbour-joining method. Result: Out of 26 positive isolates 12 and 14 were H1N1 and H3N2 respectively. The phylogenetic and amino acid sequence analyses of our H1N1 isolates showed 99-100% genetic resemblance to A/NewCaledonia/20/99 (H1N1) vaccine strain. Most of the Iranian H3N2 isolates varied form A/California/7/2004 vaccine strain in 20 amino acids of which positions 189,226 and 227 were located in antigenic sites of HA1 molecule. These substitutions were not observed in any of the H3N2 subtypes from the same region reported previously. Conclusion: The H3N2 subtype strains prevalent during the 2005/7 influenza outbreak in southern Iran demonstrated a drastic antigenic variation and differed from A/California/7/2004 vaccine strain. The H1N1 subtypes showed a notable resemblance to A/NewCaledonia/20/99 vaccine strain and therefore were predicted to be capable of conferring sufficient immunity against H1N1 subtypes.     

武汉市2003年流感监测及当前优势流行毒株的抗原性和基因特性分析

目的 探讨2003年武汉市流感流行概况，分析优势流行毒株抗原性和基因特性变异特征。方法 每周在流感监测哨点医院统计流行病学资料，采样分离流感病毒标本，对其中3株H3病毒做血凝抑制试验并对其编码HA1区基因进行序列测定和分析。结果 从418份咽拭标本中分离到流感病毒58株，其中5，7株为H3亚型，1株为乙型；全年月分离率和门诊流感样病例数的变化有冬、夏两个高峰，最高峰均出现在7月；新分离到的3株H3病毒的抗原性与本年度疫苗组分株A／Panama／2007／99有较大差异，编码HA1区的氨基酸序列有14个位点发生了变异，基因种系发生树分析也证实他们的HA1基因存在较大差异。结论 2003年武汉市流感活动呈双峰型增强，H3病毒活动显著加强，其抗原性和基因特性与疫苗株相比均发生了较大的变异。