磁共振图像的分割

近年来,磁共振图像在临床上的应用越来越广泛和深入,但是,制约磁共振图像在临床上广泛应用和研究的一个瓶颈问题是图像分割。自从７０ 年代末磁共振图像应用于临床检查以来,人们提出了众多的磁共振图像的分割方法。这些方法中有经典的方法,如阈值法、基于边界的方法和基于区域的方法;有现代的方法,如概率统计的方法、基于知识的方法、模糊方法和人工神经网络的方法等。本文对这些方法进行了综述和讨论。     

一种基于快速混合型K均值的水平集图像分割方法

目的:为提高水平集图像分割方法的速度。方法:本文介绍一种基于快速混合型K均值的水平集方法用于图像分割。首先介绍基于Mumford-Shah模型的水平集方法;然后介绍传统标准K均值方法与水平集方法的联系,分析其缺陷;最后提出了一种快速混合型K均值的方法,在保持传统水平集算法鲁棒性的前提下,较好地提高了计算的速度。结果:该方法与标准水平集方法相比,运算所花费时间相对减少。结论:该方法利用K均值算法的简易和高效率,达到提高水平集方法分割速度的目的,具有一定的实用价值。     

基于MR图像的脑组织分割方法研究进展

目的:探讨基于磁共振成像脑组织分割方法的研究进展。方法:对现有基于磁共振成像的脑组织分割方法进行分类,并对近年来国内外基于磁共振成像的脑组织分割方法的研究进展及其评价方法进行了比较详细的论述,最后对脑组织分割方法的发展趋势进行展望。结果:基于MRI的脑组织分割方法主要包括经典分割方法、统计学分割方法、形变模型分割方法、人工神经网络分割法,小波变换分割法和遗传算法等。结论:基于磁共振成像脑组织分割算法将趋向于自动化、快速化,并注重多种方法的有效结合,有望在新理论、新技术和新工具方面不断获得突破。     

光学相干层析医学图像分割研究现状

总结光学相干层析(OCT)医学图像的分割要求,对具有代表性的OCT医学图像分割方法进行详细论述,最后对OCT医学图像分割方法的发展趋势做出展望。代表性的OCT医学图像分割方法主要包括阈值分割方法、区域生长法、基于统计学的方法、基于活动轮廓的方法、基于图论的方法和形态学的方法等。综合利用多种医学图像信息,有效结合多种分割方法,注重提高方法的实时性、鲁棒性、精确性和自动化,将是OCT医学图像分割发展的重要趋势。     

2种诱导iPSC向神经干细胞分化方法的比较

目的:整体比较2种促进诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cells,i PSC)向神经干细胞(neural stem cells,NSC)分化的方法,确定一种稳定、高效的获得NSC的方法,并对NSC进行系统鉴定。方法:方法A:SB431542和drosomophorin的浓度均为5μmmol/L,诱导初始密度100%;方法 B:SB431542的浓度为5 mmol/L,drosomophorin的浓度为1 mmol/L,诱导初始密度为40%。比较及鉴定方法:镜下观察诱导获得NSC的状态;realtime PCR比较神经干细胞相关基因Pax6、nestin、Sox1、Sox2等表达量;流式细胞术分析诱导第16天Pax6阳性率;免疫荧光定性分析神经干细胞相关蛋白的表达及其自发分化的能力。结果:方法 A获得的NSC悬起后成球趋势明显,圆形,透明;方法 B诱导获得NSC形状不规则,色灰暗。Real-time PCR结果证明方法 A诱导获得的细胞神经干细胞相关基因的表达量高于方法 B。流式细胞术分析证明第16天,PAX6的阳性率,方法 A高于方法 B。经鉴定,方法 A获得的神经干细胞高表达Pax6、nestin、Sox2等基因自发分化30 d,形成明显的神经纤维束,表达TUJ-1、MAP2及GFAP等神经元和胶质细胞的特异性标志物。结论:方法 A整体优于方法 B,我们推荐方法 A作为诱导i PSC向神经干细胞分化的方法。     

石蜡包埋胃癌组织中DNA四种提取方法的探讨

目的探讨提取石蜡包埋胃癌组织中DNA的最佳方法。方法用蛋白酶K消化氯化钠盐析方法、蛋白酶K消化酚氯仿抽提方法、试剂盒方法及改良试剂盒方法,提取石蜡包埋胃癌组织中DNA,进行PCR扩增,应用凝胶电泳成像检出率(检出率=检出数/总例数)比较4种方法提取DNA质量的情况。结果改良试剂盒方法,凝胶电泳成像检出率95.5%(151/158),分别与蛋白酶K消化氯化钠盐析方法15.3%(4/26)、蛋白酶K消化酚氯仿抽提方法8.3%(1/12)、试剂盒方法19.2%(11/57)凝胶电泳成像检出率比较差异有统计学意义(P0.05)。结论 4种提取DNA方法中改良试剂盒方法,是提取石蜡包埋胃癌组织中DNA的最佳方法。     

基于神经网络学习的锥形束CT图像超分辨率重建算法

针对锥形束CT（CBCT）图像质量较差的问题,提出一种基于卷积神经网络的超分辨率重建（SRCNN）方法,旨在提高CBCT图像的分辨率。本研究分别对头颈、盆腔、胸部的CBCT图像进行研究,先使用非局部均值（NLM）方法对图像进行降噪处理,再分别使用双三次插值重建（BIC）方法和SRCNN重建方法进行超分辨率重建。结果表明,BIC方法和SRCNN重建方法均能提高CBCT图像的分辨率,SRCNN重建方法较BIC方法有更高的峰值信噪比,而在结构相似度和特征相似度上,BIC方法和SRCNN重建方法的差别不大。从图像峰值信噪比及特征相似度上看,此方法对盆腔部CBCT图像处理效果更为显著,对头颈部及胸部处理效果相近。     

生物方法制作输卵管炎性阻塞动物模型的研究进展

不孕症严重影响人类的生殖健康,而输卵管炎性阻塞是引起不孕症的主要病因之一.建立输卵管炎性阻塞动物模型,为研究输卵管性不孕证提供理论依据及新的治疗方法,具有重要意义.目前制作输卵管阻塞动物模型的方法主要有物理方法、化学方法、生物方法3种.物理方法是利用夹闭、电热、激光等方式使输卵管发生可逆性阻塞甚至不可逆的坏死粘连,该方法需要一定的实验设备且对组织的损伤大.化学方法多利用化学物质如苯酚糊剂、水凝胶等注入输卵管中使其发生炎性反应反应粘连阻塞,该方法能引起输卵管炎,病理结果有慢性炎性反应表现,但其致炎途径和人类盆腔炎有差异.生物方法是采用细菌、沙眼衣原体、支原体等病原体引起炎性反应反应,使输卵管粘连堵塞,该方法基本接近人类感染途径,具有较强的代表性,研究结果具有说服力,为目前较为理想的造模方法.本文就输卵管炎性阻塞动物模型生物造模方法的研究进展综述如下.     

共调控基因谱挖掘在基因表达数据功能关联分析中的应用

在基因表达数据中,常采用关联模式发现（APD）方法来识别共调控基因。但这些方法不能发现潜在的隐藏模式。我们提出挖掘共调控基因谱的方法,结果显示这种方法不但可以可以发现隐藏的模式,还可以发现模式中含有的生物学相关信息。此方法优于传统的APD方法和双向聚类法。