广西汉族群体与其他群体的群体差异分析

目的 获取15个STR基因座在南宁地区汉族群体的群体遗传学和法医学数据,并分析南宁汉族群体与广西其他群体的遗传关系.方法 利用复合扩增技术,对15个STR基因座进行基因型分型.Arlequin 3.1软件分析群体间遗传差异和遗传距离,用邻接法构建12个群体的系统树.结果 15个STR基因座的多态信息量(polymorphic information content,PIC)为0.51～0.84,观察杂合度为0.59～0.88,期望杂合度为0.54～0.89,个人识别率(discrimination power,DP)为0.77～0.96,非父排除率(probability of exclusion,PE)为0.24～0.77.在TH01基因座,南宁汉族群体与广西回族、京族的群体间非差异exact P值均大于0.05.结论 在南宁汉族群体中,TPOX基因座的个人识别能力和非父排除能力较差,其他基因座的个人识别能力和非父排除能力较好.在南宁汉族与回族、京族之间,TH01基因座的等位基因频率分布无差异.广西各民族间存在基因交流,具有部分相同血缘,其中南宁汉族群体与壮族、侗族遗传距离较近.     

广西汉族群体与其它群体的群体差异分析

目的 通过群体遗传学调查，获取15个STR基因座在南宁地区汉族群体的群体遗传学和法医学数据，并分析南宁汉族群体与广西其它民族群体的遗传关系。方法 利用复合扩增技术，分析南宁地区汉族样本在15个STR基因座的等位基因和基因型分布。Arlequin 3.1软件分析群体间遗传差异和遗传距离，用邻接法构建13个群体系统树。结果 15个STR基因座的PIC值为0.51-0.84，观察杂合度为0.59-0.88，期望杂合度为0.54-0.89，DP值为0.77-0.96, PE值为0.24-0.77。TH01基因座，南宁汉族群体与广西回族、京族间的群体间非差异exact P值均大于0.05。构建12个群体的系统树。结论 在南宁汉族群， TPOX基因座个人识别能力和非父排除能力较差，其它基因座较好。南宁汉族群体与壮族、侗族遗传距离较近。     

牡丹江地区汉族群体6个STR基因座的遗传多态性研究

目的 调查牡丹江地区汉族群体6个基因座的基因多态性。方法 应用扩增片段长度多态性（Amp-FLP）分型技术，检测牡丹江地区100名无血缘关系汉族个体CSFlPO，TPOX，TH01， D16S539，D7S820，D13S317 6个基因座等位基因频率和基因型分布。结果 经χ2检验表明6个STR基因座基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡；6个基因座的总偶合率为1.98618E-06，总个体识别率达1.000，三联体累计非父排除率OCE=0.9878，二联体累计非父排除率0.9160。结论 6个基因座在牡丹江地区汉族群体中有较高的非父排除率和个人识别机率，可应用于法医学亲子鉴定和个体识别。牡丹江地区的汉族与朝鲜族基因频率相比较，TPOX、TH01和D16S539基因座有显著性检差别，CSFlPO、D7S820和D13S317基因座无显著性差别。     

湖北土家族群体15个短串联重复序列基因座遗传多态性

目的 调查湖北地区土家族人群15个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座遗传多态性分布和群体遗传学数据,比较分析湖北土家族与重庆土家族等位基因的分布频率.方法 采用毛细管电泳技术和五色荧光复合扩增的方法,对湖北土家族333名无关个体的15个STR基因座进行基因分型.结果 共检出151个等位基因,多于重庆土家族的等位基因检出数(141个),其频率分布在0.002～0.498之间.经Statistical genetics软件分析,各基因座的群体基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05).15个STR基因座的杂合度在0.652～0.867之间,个体识别力在0.802～0.971之间,累积个体识别力大于0.9 999 999;非父排除率在0.357～0.730之间,累积非父排除率为0.9 999 997;多态信息含量在0.57～0.87之间.结论 建立了湖北土家族人群的STR基因座的群体资料,为土家族人群的群体遗传学研究、法医个人识别、亲子鉴定提供了基础数据;湖北土家族与重庆土家族亲缘关系相近,等位基因频率差异无统计学意义(P＞0.05),但在等位基因检出数及部分基因分布频率上仍存在差异.     

广州地区汉族群体15个短串联重复序列基因座遗传多态性分析

目的:调查广州地区汉族人群15个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座遗传多态性分布。方法:应用荧光标记多重PCR方法和毛细管电泳技术,检测156名汉族无关个体的15个STR基因座基因型。结果:15个STR基因座的基因频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡,15个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度均超过0.64,15个基因座的个体识别力在0.816～0.966之间,非父排除率在0.343～0.725之间,匹配概率在0.038～0.184之间。15个基因座的累积个体识别能力为0.999 999以上,累积非父排除率为0.999 75,累积匹配概率为8.84×10-18。结论:该15个STR基因座具有高度多态性,可用于移植术后供者植入状态的监测。     

西藏昌都藏族15个短串联重复序列基因座的遗传多样性

的分布特点.用ARLEQUIN 3.0软件计算等位基因频率和各种多态性参数.结果 西藏昌都藏族群体中15个STR位点上观察到135个等位基因,等位基因频率分布在0.0065～0.5455之间;平均杂合度为0.7340,个体识别力除了TPOX(0.7927)和TH01(0.7919)外均大于0.8,累计个体识别力为0.9999998,累计非父排除率为0.99999997.结论 西藏昌都藏族15个STR位点均具有高度遗传多态性,是群体遗传学研究和法医学鉴定的可选位点.     

桂林地区汉族15个短串联重复序列基因座的遗传多态性

目的 分析15个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)在桂林汉族群体的遗传多态性.方法 应用Chelex法提取DNA,用AmpFISTR IdentifilerTM试剂盒分析15个STR基因座.结果 发现4种稀有等位基因:FGA*10,D2S1338*10,D3S1358*16.2,D3S1358*17.2.15个STR基因座的累积匹配概率为2.89×10-17,累积非父排除率为0.9999993.结论 15个STR基因座在桂林汉族群体有较好的个人识别率和非父排除率.     

PowerPlex~Fusion Kit 24个STRs在河南汉族人群中的遗传多态性研究

目的 调查河南地区汉族人群24个短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性研究。方法 本研究所使用的PowerPlexFusion System是美国Promega公司新近推出的一种扩增24个位点的多重复合扩增系统。包括22个常染色体位点1个性别位点Amelogenin及1个男性专有的DYS391位点。使用AB9700 PCR扩增仪和3500Dx遗传分析仪,对河南地区1503名汉族无关个体进行基因组多态性检测,并用Genemapper ID-X软件进行基因分型。结果 22个常染色体STR基因座在1503名河南汉族无关个体中的等位基因频率介于0.0003-0.7200,个体识别能力介于0.4330-0.9870,多态性信息含量值介于0.3800-0.9100,观察杂合度值介于0.6310-0.8720,期望杂合度值介于0.4329-0.9987,非父排除率值介于0.3440-0.7300,经典父权指数值介于0.5000-3.9100。22个常染色体STR基因座中,Penta E的各项多态性指标均为最高,TPOX基因座的各项指标值均为最低。结论 PowerPlexFusion System扩增体系所包含的22个常染色体STR及1个Y-STR在河南汉族中具有极高的遗传多态性、个体识别力和非父排除率,可用于河南汉族群体的亲子鉴定、个体识别以及DNA数据库建设。     

厦门地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性研究北大核心CSCD

目的调查福建厦门地区汉族群体15个短串联重复序列（short tandem repeat,STR）基因座多态性参数,同时评估AmpFLSTR Identifiler^TM体系应用于本地区汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值。方法应用AmpFLSTR Identifiler^TM体系荧光标记复合扩增系统,检测400名福建厦门地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性,统计计算群体遗传学参数。结果15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0．05）。15个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度0．580～0．868,匹配概率0．036～0．148,个体识别力0．798～0．967,多态性信息含量0．560～0．850,非父排除率0．268-0．730。结论15个STR基因座在福建厦门地区有较高的多态性。通过检测等位基因频率,为福建厦门地区人群法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性提供了客观依据。     

温州汉族人群TH01和TPOX基因座的遗传多态性研究

目的研究STR位点TH01和TPOX在温州汉族人群的遗传多态性,获得相应的群体遗传学数据。方法EDTA抗凝血样采自温州197名无血缘关系汉族个体,用chelex-100法提取DNA,PCR扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染显色分析。结果TH01观察到6个等位基因及16种基因型;TPOX观察到5个等位基因及12种基因型。各基因座的杂合度（H）分别为0.659和0.619;非父排除率（PE）分别为0.367和0.315;个人识别能力（Dp）分别为0.839和0.766。结论TH01和TPOX基因座在温州地区汉族群体中具有较高杂合度,等位基因分布符合Hardy-Weinberg平衡,在法医学应用和群体遗传学研究中有较高的价值。     

华北地区汉族群体15个短串联重复序列基因座遗传多态性分析

目的调查华北地区汉族人群15个短串联重复序列(shorttandemrepeat,STR)基因座遗传多态性分布和群体遗传学数据。方法应用毛细管电泳技术和五色荧光复合扩增的方法,检测597名汉族无关个体的15个STR基因座基因型。结果15个STR基因座的基因频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡,所检测的15个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度均超过0.62,15个基因座的个体识别力在0.802~0.967之间,非父排除率在0.320~0·697之间,匹配概率在0.033~0.198之间。15个基因座的累积个体识别能力为0.999999以上,累积非父排除率为0.99999571,累积匹配概率为8.93×10-18。结论联合检测15个基因座可为亲缘鉴定和个体识别提供可靠的法医学证据,这15个STR基因座适用于中国人群的法医物证学检验。     

云南汉族15 个短串联重复序列基因座遗传多态性特征及分析

目的:调查云南地区汉族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA 15 个短串联重复序列(Short tandem repeat,STR)基因座的遗传多态性。方法:收集云南汉族313 名无关个体血样,提取DNA,PCR 复合扩增并利用ABI鄄3130 型基因分析仪进行毛细管电泳检测每个样本各基因座的等位基因大小,分别统计每个STR 基因座各基因型的频率,并进行Hardy-Weinberg 遗传平衡检验。结果:云南汉族这15 个STR 基因座各基因型频率分布符合Hardy-Weinberg 平衡(P>0.05),杂合度在0.636 ~0.901,匹配概率在0.034 ~0.220,单一STR 位点的个体识别率在0.780 ~0.966、非父排除率在0.336 ~0.797、多态性信息总量在0.555 ~0.860,联合使用这15个位点所产生的累积个体识别率大于0.999 999 99,累积非父排除率等于0.999 998 408。与中国其他地区汉族群体这15 个STR 基因座等位基因频率分布相比有较高的相似性,但也有轻微的地区差异。结论:云南汉族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA 这15 个STR 基因座具有高度的多态性,与中国其他地区汉族群体有较高的相似性,在法医学中的亲子鉴定和个人识别方面具有较高应用价值。     

Genetic analysis of 15 STR loci from a Xibe population in Liaoning,Northeast of China

Background: In view of their high level of variability, autosomal short tandem repeats (STRs) are very useful as markers in the disciplines of forensic and population genetics studies.

Aim: To investigate the diversity distributions of allelic frequencies of 15 loci from a sample from the Chinese Xibe ethnic group in Liaoning.

Subjects and methods: Fifteen STR loci for 150 unrelated Xibe individuals from Liaoning, China were amplified simultaneously in a fluorescence-based reaction using a 2720 Thermal cycler (ABI). Separation and detection of the amplified product were conducted with the Li-COR 4300 DNA Analyzer.

Results: In total, 117 alleles were observed, with the corresponding allele frequencies ranging from 0.001 to 0.507. D18S51 had the highest polymorphism (PIC?=?0.840) among all 15 STR loci, whereas TPOX had the lowest (PIC?=?0.590). The power of discrimination ranged from 0.801 for TH01 locus to 0.957 for D18S51 locus, whereas the power of exclusion ranged from a minimum 0.316 for TPOX locus to a maximum 0.720 for D21S11 locus. The phylogenetic tree established among worldwide populations showed that the Xibe population is far from other populations.

Conclusion: Databases for the 15 STR loci will be useful for personal identification and paternity tests in the Xibe population and for the establishment of phylogenetic relationships between populations.     

浙江畲族和汉族人群六个短串联重复序列位点遗传多态性的研究

目的 了解浙江畲族和汉族人群D3S1358、D16S539、TH01、TPOX、CSFlPO、D7S8206个短串联重复序列(short tandem repeat，STR)位点遗传多态性特征。方法 随机抽取108名浙江景宁畲族和102名浙江汉族无血缘关系个体的静脉血，应用AmpFlSTR Cofiler试剂盒扩增6个STR位点，PCR产物经ABI Prism377序列分析仪电泳后，用基因扫描软件进行分析。结果 畲族和汉族人群6个STR位点均符合Hardy—Weinberg平衡，畲族人群D3S1358、D16S539、TH01、TPOX、CSFlPO、D7S820位点杂合度分别为0．8028，0．9148，0．7522，0．6728，0．9123，0．8338，期望排除率分别为0．4067，0．6057，0．4437，0．3200，0．5250，0．5358，个人识别率分别为0．6690，0．7841，0．6447，0．5382，0．7298，0．7296。累积个人识别率为0．9991，累积期望排除率为0．9805，累积多态信息含量是0．9988。在D3S1358、D16S539、TPOX位点畲族人群与汉族人群之间存在显著差异。结论 浙江畲族人群有其自身的STR等位基因分布特征。所得到的数据可为法医个人识别、亲子鉴定及遗传学研究提供依据。     

中国朝鲜族六个基因座遗传多态性

目的 了解中国朝鲜族群体中6个X染色体短串联重复序列(short tandem repeat,X-STR)基因座DXS7132、DXS6854、DXS6769、DXS9898、DXS8378和GATA31E08在中国朝鲜族群体中的遗传多态性.方法 用PCR扩增、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染方法对6个X-STR基因座进行检测.结果 6个基因座中分别检出8个、6个、8个、8个、5个和lO个等位基因,6个基因座基因型频率分布(女性个体)均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);观测杂合度均大于0.4660、多态信息含量均大于0.5293、女性个人识别力均大干0.7737、男性个人识别力均大于0.6107,男性单倍型多样性为0.9993.结论 6个基因座均具有较高的遗传多态性,是较理想的遗传标记系统.为中国朝鲜族起源的研究和朝鲜族群体的亲子鉴定和个人识别提供了宝贵的基础资料.     

四川汉族群体8个Y—STR的遗传分析

目的调查四川汉族群体8个Y-染色体STR的遗传多态性,分析8个Y染色体STR的等位基因序列。方法利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对8个Y-STR基因座进行分型。结果DYS443、DYS453、DYS455、DYS456是简单重复序列的Y—STR,DYS444、DYS448、DYS457、DYS458是复杂重复序列的Y-STR。108位男性个体观察到106种单体型。8个Y—STR的基因变异度在0．355—0．821之间,单体型变异度为0．9996。结论在四川汉族群体,8个基因座构成的单体型具有较好的个人识别能力和非父排除率。     

中国汉族人群四个STR的多态性及其与IDDM的相关性研究

目的 获得Ｄ１５Ｓ６５７、Ｄ１１Ｓ１３６９、Ｄ６Ｓ２４２０、Ｄ６Ｓ５０３位点在中国成都汉族人群中的群体遗传数据，并研究上述４种短串联重复序列（ｓｈｏｒｔ ｔａｎｄｅｍ ｒｅｐｅａｔｓ，ＳＴＰ）的多态性与胰岛依赖型糖尿病（ｉｎｓｕｌｉｎ－ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｄｉａｂｅｔｅｓ ｍｅｌｌｉｔｕｓ，ＩＤＤＭ）的关系。方法 应用ＰＣＲ－ｐｏｌｙａｃｒｙｌａｍｉｄｅ ｇｅｌ ｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ（ＰＡ     

中国四川汉族人群Y染色体单核苷酸多态性分析

目的 评估Y染色体单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)遗传标记的法医学应用价值.方法 用等位基因特异性PCR,限制性酶切和直接扩增法检测了161名中国四川汉族人Y染色体上10个SNPs位点M9,M15,M45,M89,M95,M122,M134,M145,M173和P25的多态性.结果 有8个位点发现遗传多态性,多态性频率0.988/0.012～0.752/0.248.个人识别能力0.094～0.373,累积个人识别能力为0.8308,M122和M134在中国四川汉族人群中的多态性最高.按照国际Y染色体学会的命名原则,10个位点命名了9种单倍组型,单倍组型频率1.2%～52.2%,其中75.2%的中国四川汉族人主要是K*(XO2a,O3,P),O3*(XO3e)和O3e 3种单倍组型.结论 该研究获得了中国四川汉族人群Y染色体的10个SNPs位点的多态性频率分布及其构建的9种单倍组型,为Y-SNPs做为法医遗传学个人识别和亲子鉴定的遗传标记奠定了基础.