TBX20基因启动子区的单核苷酸多态性与扩张型心肌病的相关性分析

目的:探讨TBX20基因启动子区的单核苷酸多态性(SNP)与扩张型心肌病(DCM)的相关性。方法:采用病例-对照研究方法,收集136例DCM患者和210例健康对照。采用PCR和Sanger测序的方法获得TBX20基因启动子区的SNPs。通过细胞转染和电泳迁移率变动分析(EMSA)对TBX20基因启动子区的SNPs进行遗传功能分析。采用卡方检验和两独立样本t检验对数据进行统计学分析。使用SNPStats在线软件进行相关性分析。结果:校正混杂因素后,rs73099190在共显性遗传模型和超显性遗传模型中的TC基因型和显性遗传模型中的TC+CC基因型均与DCM显著相关(OR=1.96,95%CI:1.20~3.20,P=0.019;OR=1.98,95%CI:1.22~3.24,P=0.006;OR=1.86,95%CI:1.15~3.03,P=0.012)。转染结果显示,TBX20基因启动子区的SNPs显著改变了TBX20基因启动子的转录活性(P<0.01)。进一步EMSA实验表明,rs1191745927和rs73099190影响了TBX20基因启动子与转录因子的结合。结论:DCM患者TBX20基因启动子的变异可能影响转录因子的结合,进而改变了TBX20基因的转录活性,可能作为罕见的低频危险因素促进DCM的发生发展。     

CTLA-4基因启动子区单核苷酸多态性与特发性扩张型心肌病的关联研究

目的探讨特发性扩张型心肌病（idiopathic dilated cardiomyopathy，IDC）患者细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（cytotoxic T lymphocyte assoccated antigen 4，CTLA-4）表达状况及由CTLA-4基因启动子区单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）导致的不同遗传易感性机制。方法采用限制性片段长度多态性分析151例IDC患者，120名正常健康人CTLA-4基因启动区-1772、-1661及-318位点SNP；免疫酶联吸附测定法检测血清sCTLA-4、干扰素-7及白介素-4水平；综合分析CTLA-4启动区基因型、等位基因频率及与sCTLA-4、干扰素-γ／白介素一4的相关性。结果IDC患者sCTLA-4水平与CTLA一4基因启动区SNP相关，携带-1772T／C变异者sCTLA-4表达增高。-1772TC基因型频率在IDC组尤其低射血分数亚组显著高于对照组，IDC组-1661G和-1661GG频率显著降低，具有-1772TC-1661AA及-1772TC-1661AG单倍型IDC患者sCTLA-4显著升高。结论IDC患者CTLA-4表达异常，CTLA-4基因启动区-1772C／T和-1661A／GSNP与IDC遗传易感性相关。-1772T／C变异可能影响CTLA-4基因剪接，干扰蛋白表达和功能，阻止负性调节信号传递而导致对IDC的易感。     

干扰素基因多态性与扩张型心肌病的相关研究

目的探讨北方地区汉族人干扰素（IFN-r）基因单核苷酸多态性（SNP）与扩张型心肌病（IDC）的相关性。方法应用顺序特异性引物和聚合酶链反应（PCR-SSP）技术，检测了31例IDC患者（患者组）和35例健康献血者（对照组）中IFN-r启动子基因874位点的多态性变化。结果结果表明IDC组IFN-r（874T）等位基因频率（32，26％）显著高于对照组IFN-r（11．43％），P〈0．05，两组之间比较差异有显著性意义，提示该等位基因频率增高与IDC相关。结论我国北方地区汉族人IFN-r基因874T位点的多态性在IDC的疾病病程中有重要作用，IFN-r启动子基因874T可能是IDC的易感性基因之一。     

IL-2基因多态性与中国汉族人群特发性扩张型心肌病的相关性研究

目的 研究中国西南地区汉族特发性扩张型心肌病(idiopathic dilated cardiomyopathy,IDCM)患者白细胞介素-2(interleukin-2,IL-2)基因启动子区-384T/G、-475A/T、-631G/A多态性与IDCM的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术分析中国西南地区无血缘关系的109例汉族IDCM患者和210名正常对照者IL-2基因启动子区-384、-475、-631位点的单核苷酸多态性.结果 IL-2基因启动子区-384位点TT+TG基因型频率和T等位基因频率在IDCM患者中升高,与正常对照组相比差异有统计学意义(分别为95.41%vs.87.62%,P=0.042和72.94%vs.64.52%,P=0.039);而IL-2基因-631位点与-475位点基因型和等位基因频率在IDCM组与正常对照组之间无差异.结论 IL-2基因启动子区单核苷酸多态性与人类IDCM相关,IL-2基因启动子区-384位点T等位基因可能会增加发生IDCM的危险性.     

CTLA-4基因多态性与特发性扩张型心肌病的相关性

目的包括细胞和体液免疫在内的自身免疫机制至少参与了部分特发性扩张型心肌病(Idiopathicdilatedcar-diomyopathy,IDC)患者的发病,且前者介导的心肌损害在IDC中更重要。CTLA-4是特异性细胞免疫的负性调节因子。本研究旨在探讨CTLA-4基因启动子-318C/T、外显子A/G多态性及3′非翻译区(AT)n微卫星多态性与IDC及血清可溶性CT-LA-4(sCTLA-4)水平的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(Polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphisms,PCR-RFLP)方法分析黑龙江省无血缘关系汉族人群(包括72例IDC患者,100例正常健康人)CTLA-4基因-318C/T、49位点A/G多态性及3′微卫星多态性;ELISA法检测血清sCTLA-4水平。综合分析CTLA-4基因型频率、等位基因频率与IDC及sCTLA-4水平的相关性。结果IDC组外显子1GG基因型和G等位基因频率显著高于正常对照组(P=0.012,P=0.008);3′非翻译区共发现18种等位基因,106bp等位基因频率在IDC患者中显著增高(22.22%vs1%,P=0.0002,OR=23.56,95%CI9.65~83.74);两组间-318C/T多态性分布无统计学差异。与对照组相比,IDC组sCTLA-4水平显著升高[(1.87±1.06)μg/L比(0.54±0.19)μg/L,P<0.05];直线回归分析显示,IDC组GG基因型及G等位基因频率与血清sCTLA-4水平(r=0.57,P=0.021)显著相关,而AA、A/G基因型及A等位基因频率与sCTLA-4水平无相关性。启动子-318C/T多态性及3′非翻译区(AT)n微卫星多态性与sCTLA-4水平的亦无相关性。结论CTLA-4基因外显子1A49→G变异与IDC相关,携带G等位基因者易患IDC,其机制可能为该多态性造成CTLA-4信号肽中编码苏氨酸和甘氨酸的替换,从而影响蛋白翻译后加工、修饰,使sCTLA-4功能发生变化。提示3′末端非翻译区(AT)n重复序列中106bp等位基因可能是IDC的易感基因。     

TBX21基因rs16947078位点的多态性与哮喘易感性的研究

目的研究TBX21基因的rs16947078位点的多态性与哮喘易感性的关系。方法应用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)平台及MassARRAY-IPLEX技术,分别对重庆地区汉族人群中199名正常对照组和223名哮喘患者组的TBX21基因rs16947078位点进行检测并分析其基因型及等位基因分布情况,研究TBX21基因rs16947078位点的多态性与哮喘易感性间的关系。结果 TBX21基因rs16947078位点基因型和等位基因在病例组与对照组间均存在显著差异,P值分别为0.010和0.011;对年龄和性别进行校正后,相对于AA基因型,AG基因型的人群患哮喘的风险增加(OR=9.433,95%CI:1.170~76.022);等位基因G的携带者患哮喘的风险也有所增加(OR=9.232,95%CI:1.152~74.006)。结论研究结果提示TBX21基因中rs16947078位点与哮喘的易感性相关。     

特发性扩张型心肌病CTLA-4基因3''非翻译区(AT)n微卫星多态性研究

目的 特发性扩张型心肌病（idiopathic dilated cardiomyopathy，IDC）的发病机制与T细胞免疫应答密切相关。细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（cytotoxic T lymphocyte antigen-4，CTLA-4）主要在已激活的T细胞上表达，通过与CIY28竞争结合B7，抑制T细胞过度激活，维持免疫系统内环境稳定。CTLA-4基因3’非翻译区（AT）n微卫星多态性影响CTLA-4功能。本研究旨在探讨外周血单个核细胞（PBMC）CTLA-表达状况及3’非翻译区（AT）n微卫星基因多态性与IDC的相关性。方法分别用原位杂交、免疫组化、序列特异性引物PCR等方法检测38例无血缘关系的北方汉族IDC患者以及50例正常对照者的CTLA-4mRNA、蛋白质表达、CTLA-4基因外显子3’末端非翻译区（AT）n重复序列多态性，并对PCR扩增产物进行序列分析。结果IDC组与对照组相比，PBMC经金黄色葡萄球菌肠毒素B刺激后CTLA-4mRNA、蛋白质表达强度显著减弱，且无一定规律；3’末端非翻译区共发现18种CTLA-4等位基因，与对照组比较，106bp等位基因频率在IDC患者中显著增高[22．22％ vs 1％，P=0．0002．OR=23．56，95％可信区间（CI）：9．65～83．74]。结论IDC患者CTLA-4基因转录和表达缺陷，该缺陷与CTLA-4基因3’末端非翻译区（AT）n重复序列多态性存在关联。     

HLA基因多态性与扩张型心肌病遗传易感性研究进展

扩张型心肌病(DCM)是以左心室或双心室扩大并伴有收缩功能受损为特征的心脏疾患, 其发病机制可能与遗传、病毒感染及自身免疫等有关。人类白细胞抗原(HLA)是人类最复杂的免疫调 节基因,其基因多态性控制着对于自身免疫性心肌细胞损伤的抑制性或易感性。本文就HLA基因多态 性与DCM遗传易感性相关性的研究进展作简要综述。     

特发性扩张型心肌病CTLA-4基因3′非翻译区(AT)n微卫星多态性研究

目的特发性扩张型心肌病(idiopathic dilated cardiomyopathy,IDC)的发病机制与T细胞免疫应答密切相关。细胞毒性T淋巴细胞相关抗原24(cytotoxic Tlymphocyte antigen-4,CTLA-4)主要在已激活的T细胞上表达,通过与CD28竞争结合B7,抑制T细胞过度激活,维持免疫系统内环境稳定。CTLA-4基因3′非翻译区(AT)n微卫星多态性影响CTLA-4功能。本研究旨在探讨外周血单个核细胞(PBMC)CTLA-4表达状况及3′非翻译区(AT)n微卫星基因多态性与IDC的相关性。方法分别用原位杂交、免疫组化、序列特异性引物PCR等方法检测38例无血缘关系的北方汉族IDC患者以及50例正常对照者的CTLA-4 mRNA、蛋白质表达、CTLA24基因外显子3′末端非翻译区(AT)n重复序列多态性,并对PCR扩增产物进行序列分析。结果IDC组与对照组相比,PBMC经金黄色葡萄球菌肠毒素B刺激后CTLA-4 mRNA、蛋白质表达强度显著减弱,且无一定规律;3′末端非翻译区共发现18种CTLA24等位基因,与对照组比较,106bp等位基因频率在IDC患者中显著增高[22.22%vs1%,P=0.0002,OR=23.56,95%可信区间(CI):9.65～83.74]。结论IDC患者CTLA-4基因转录和表达缺陷,该缺陷与CTLA-4基因3′末端非翻译区(AT)n重复序列多态性存在关联。     

CYP11B2基因-344T/C多态性与扩张型心肌病关联研究

目的研究CYP11B2基因4/344T/C多态性是否与汉族人扩张型心肌病关联。方法多聚酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测扩张型心肌病和健康对照组CYP11B2基因4/344T/C多态性,χ^2验比较各组基因型和等位基因频率。结果对照组TT、TC与CC基因型频率分别为49%、46%和5%,扩张型心肌病组TT、TC与CC基因型频率分别为49%、44%和7%,经χ^2验两组之间基因型分布差异无显著性（P〉0.05）。对照组T、C等位基因频率分别为72%和28%,扩张型心肌病组T、C等位基因频率分别为71%和29%,经χ^2验两组之间等位基因分布差异亦无显著性（P〉0.05）。结论本研究尚不支持CYP11B2基因4/344T/C多态性与汉族人扩张型心肌病存在关联。     

Association of OSMR gene polymorphisms with dilated cardiomyopathy in a Han Chinese populationCSCD

Objective To assess the association of polymorphisms of oncostatin M receptor (OSMR) gene with dilated cardiomyopathy (DCM) in a Han Chinese population. Methods For 351 DCM patients and 418 healthy controls, two single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the OSMR gene, namely rs2292016 (promoter, -100G/T) and rs2278329 (missense, Asp553Asn), were genotyped with a TaqMan SNP genotyping assay. Two hundred of the patients were also followed up for (49. 85 ± 22. 52) months. Results For rs2292016, carriers of GT genotype were more likely to develop DCM compared to those with GG and TT genotypes (OR= 1.45, 95%CI:1. 09-1. 92, P = 0.01). For those who did not receive cardiac resynchronization therapy, the GG genotype of rs2292016 was an independent indicator for poor prognosis (OR-1. 69, 95%C/:1. 11-2. 63, P = 0. 017). No association was found between genotypes of rs2278329 with the susceptibility or prognosis of DCM. Conclusion Polymorphisms of the OSMR rs2292016 locus are related to the development and outcome of DCM. © 2018 West China University of Medical Sciences. All rights reserved.     

RANTES基因-28C／G单核苷酸多态性与子宫内膜异位症遗传易感性的研究

目的探讨调节正常T细胞表达和分泌活性因子（regulated on activation, normal T cell expressed and secreted,RANTES）基因启动子区-28C／G单核苷酸的多态性与广东籍汉族患者子宫内膜异位症的关系。方法应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性技术（PCR—RFLP）并进行基因测序的方法检测广东籍汉族子宫内膜异位症患者59例（内异症组）,非子宫内膜异位症患者49例（对照组）,比较分析各组间基因型频率和等位基因频率。结果RANTES基因启动子区-28C／C基因型在子宫内膜异症组及对照组分布频率分别为81．36％、81．63％,C／G基因型分布频率分别为18．64％、18．37％;两组间的基因型分布频率比较差异无显著性（P〉0．05）。RANTES基因启动子区-28位点C等位基因型在内异症组及对照组中的分布频率分别为90．68％、90．82％,G等位基因型分布频率分别为9．32％、9．18％,两组间等位基因型频率比较差异无统计学意义（P〉0．05）。结论在广东籍汉族妇女中,RANTES基因启动子区-28C／G单核苷酸多态性与子宫内膜异位症遗传易感性可能无关联。     

幼年特发性关节炎患儿甘露糖结合凝集素基因启动子区SNP研究

目的探讨甘露糖结合凝集素(MBL)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)与幼年特发性关节炎(JIA)易感性的关系。方法对50例JIA患儿和48名正常健康儿童MBL基因启动子区SNP位点-550(G/C,称H/L等位基因)和-221(G/C,称X/Y等位基因)采用等位基因特异性PCR法(PCR-SSP)检测,并分析其单元型及基因型频率。结果共检出HY、LY和LX三种单元型,在JIA患儿中的频率依次为0.540、0.270和0.190,而在正常儿童中频率分别为0.594、0.292和0.114;两组间各单元型比较均无显著性差异。结论MBL基因启动子区单核苷酸多态性与JIA无相关性。     

Association of single nucleotide polymorphisms of CDH13 gene with metabolic syndrome among ethnic Han ChineseCSCD

Objective: To assessthe association of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the T-cadherin (CDH13) gene with metabolic syndrome (MS) among ethnic Han Chinese. Methods: Genotypes of 6 SNPs(rsll646213, rsl2596316, rs3865188, rsl2444338, rsl2051272, and rs7195409) of the CDH13 gene among 453 patients with MS and 526 controls were determined with a TaqMan method, and their association with MS was assessed. Results: For 5 SNPs (rsll646213, rs3865188, rsl2444338, rsl2051272, and rs7195409), no difference was found in allelic and genotypic frequencies of the CDH13 gene between the two groups. Comparing with rsl2596316 (AA+GG) genotype, rsl2596316 AG genotype has significantly increased the risk of MS(P = 0.01, OR=1.38, 95%CI: 1.07-1.78), though no association was found between particular alleles of the rsl2596316 with MS. There was no difference in the frequencies of rsll646213-rsl2596316-rs3865188-rsl2444338-rsl2051272 haplotype between the two groups(P>0.05). Conclusion: No association was found between the five SNPs (rsll646213, rs3865188, rsl2444338, rsl2051272 and rs7195409) of the CDH13 gene with the MS, while the rsl2596316AG genotype of the CDH13 gene is associated with the susceptibility to MS among ethnic Han Chinese. © 2018 West China University of Medical Sciences. All rights reserved.     

重症肌无力单核苷酸多态性的研究进展

重症肌无力（MG）是一种由神经-肌肉接头处传递功能障碍所引起的获得性自身免疫性疾病,其发病机制目前尚未完全明确。经相关研究表明,多因素多基因的积累共同导致了重症肌无力的发生,其中遗传因素占有重要作用。单核甘酸多态性（ SNP ）是人类基因组中最常见的多态性,在已经发现的多态性中有高达90％以上是以单核苷酸多态性的形式存在的。目前研究人员已经发现大量与重症肌无力密切相关的风险单核苷酸多态性,该文将对最近几年重症肌无力发病风险与单核苷酸多态性的相关性研究进行综述。