HLA-B40组等位基因多态性和血清学分型不明确标本分析

目的：利用DNA分型技术调查上海汉族人群HLA－B40组等位基因多态性并比较配型标本中HLA－B40抗原血清学和DNA分型的结果：方法：采用反向PCR－SSOP技术进行DNA分型，可检出HLA－B＊4001－4011等11个等位基因，结果：所有标本DNA分型均获成功，无假阳性和假阴性结果出现，质控DNA分型结果与UCLA结果相符，上海地区汉族人群共检出B＊4001－4003，4005－4007，4011等等位基因，未检出B＊4004，4008－4010等等位基因，296名无关个体中HLA－B40＊组等位基因频率为0．1402，血清学方法检测HLA－B40组抗原错误率为12．82％（10／78），结论：该技术用于HLA－B40分型分辨率高，分型结果较血清学方法更加精确，可确保HLA分型的准确。     

中国彝族人群HLA-Cw位点基因多态性研究

目的　应用DNA分型技术 ,分析中国彝族人群在HLA Cw位点的等位基因分布频率 ,为进一步研究HLA Cw与HIV感染及其发病进程的关联提供背景资料。方法　设计合成 2 6条特异性分型引物和 1对内对照引物 ,组成 2 4个PCR反应 ,建立PCR SSP分型方法 ,对 10 2例随机选取的无亲缘关系的中国彝族健康人作HLA Cw基因分型。结果　在彝族健康人群中共检测到HLA Cw位点的12种等位基因 ,其中HLA Cw 0 1、Cw 0 7和Cw 0 8为主要分布型别 ,基因频率分别为 0 .3 3 3 3、0 .2 5 0 0和 0 .1765 ,检出了HLA Cw 12、Cw 13 0 1、Cw 14和Cw 15等血清学方法不能鉴定的HLA Cw基因 ;统计分析表明HLA Cw位点的基因型分布符合Hardy Weinburg平衡 (χ2 =65 .983 1,df=66,P >0 .0 5 )。结论　证实了PCR SSP法用于HLA Cw基因分型的可靠性和适用性 ,在DNA水平上提供了中国彝族群体的HLA Cw基因分布频率资料     

HLA-Cw基因的高分辨分型在造血干细胞移植中意义的初步探讨

目的研究HLA-Cw基因的高分辨分型在急性白血病非亲缘性造血干细胞移植中的意义。方法对中国造血干细胞捐献者资料库中提供的76例白血病患者（ALL21例、CML32例、AML23例），采用序列特异性引物聚合酶链反应（PCR—SSP）联合序列特异性寡核苷酸探针（PCR．SSOP）方法进行HLA高分辨分型。结果舭患者中HLA—Cw高分辨分型的常见位点：Cw＊0102、Cw＊0304、Cw＊0302、Cw＊0702、Cw＊0801；表型频率分别为0．57、0．33、0．19、0．14、0．14。ALL患者与志愿者相比其Cw＊0102、Cw＊0304的表型频率差异有统计学意义，P〈0．05；而Cw＊0302、Cw＊0702、Cw＊0801的表型频率无统计学意义，P〉0．05。7例ALL患者与供者HLA的10个位点全相合，占33．3％，mA-Cw全相合最常见的基因亚位点为Cw＊0102（4，7），次之为Cw＊0702（2／7）。CML患者中mA-Cw高分辨分型的常见位点：Cw＊0702、Cw＊0102、Cw＊0304、Cw＊0801、Cw＊0401、Cw＊0303；表型频率分别为0．41、0．34、0．22、0．19、0．16、0．13，这些基因位点与志愿者相比其表型频率均无统计学意义，P〉0．05。8例患者与供者的10个位点全相合，占25．0％，HLA—Cw全相合最常见的基因亚位点为Cw＊0702（5／8），次之为Cw＊0304（3／8）。在23例AML患者中4例与供者HLA的10个位点全相合患者均为M2型。结论在ALL患者中其Cw＊0102和Cw＊0304基因表型频率明显增高，有利于ALL患者寻找到相合位点的供体。HLA—Cw基因是造成移植物抗宿主病（GVHD）发生和影响移植效果的重要因素，在非亲缘性和单倍体移植中必须进行HLA-Cw基因的高分辨检测。     

造血干细胞移植供受体人群HLA-Cw基因遗传多态性研究

目的调查了人类白细胞抗原（human leucocyte antigen，HLA）Cw位点在中国汉族人群中的等位基因分布规律，为进一步研究Cw位点的遗传特征提供背景资料。方法采用序列特异性引物扩增技术对1285名无关个体进行HLA-Cw基因特异性分析，并对其分布规律进行统计学分析。结果共检测到23种HLA-Cw位点的等位基因，其中HLA-Cw＊01、＊03、＊07、＊08为主要基因型，其基因频率分别为0．1529、0．2385、0．1747、0．1004，并检出HLA-Cw＊12、＊14、＊15、＊16、＊17等血清学方法不能鉴定的HLA-Cw基因；统计结果表明HLA-Cw位点的基因分布符合Hardy-Weinberg平衡（χ^2=73．74，df=98，P〉0．5）。结论本研究结果为中国汉族人群提供了一套较为完整HLA-Cw基因遗传学参数。     

江浙沪汉族人群HLA-DRB1基因座遗传特征及不同人群频率分布比较

目的 调查江浙沪汉族人群HLA—DRBl基因座的遗传多态性，分析不同人群HLA-DRBl基因频率分布特征。方法 利用聚合酶链反应—序列特异寡核苷酸探针反向杂交和聚合酶链反应—序列特异引物技术对江浙沪地区626名健康无关汉族人进行HLA—DRBl基因分型，可检出DRBl*0101-1001，DRB3，DRB4，DRB5等等位基因，计算HLA—DRBl等位基因频率并与不同人群HLA—DRBl基因的多态性进行比较。结果 在江浙沪汉族人群中检出HLA—DRBl*0101、0301、0701、09012、1001、1201、1202、1301／02、1303／04、1401／04／05、1402／03／1305、1501／02、16021以及04xx、08xx等等位基因，其中DRBl*09012(17．97％)、04xx(12．53％)、1202(11．42％)及1501／02(11．02％)基因频率分布较高。江浙沪汉族人群无偏倚期望杂合性为0．9634，多态性信息含量为0．9024。结论 江浙沪汉族人群HLA-DRBl基因具有中国汉族人群共有的遗传特征，但也有其自身的分布特点，频率分布介于南、北汉族之间。在所比较的不同人群中中国汉族人群HLA—DRBl多态性较为丰富。     

广东汉族人群HLA-Cw基因多态性分析

检测HLA Cw在广东汉族人群中的基因频率 ,与其他人群进行比较 ,分析该人群HLA Cw等位基因多态性及其特点。骨髓移植供者 15 8例 ,抗凝血提取DNA ,半量全自动PCR RSSO分型检测Cw。结果显示 ,广东汉族人群HLA Cw基因频率分布由高至低依次为 :Cw 0 3(0 2 5 80 ) >Cw 0 7(0 1887) >Cw 0 1(0 1732 ) >Cw 0 8(0 10 70 ) >Cw 14 (0 0 6 5 4 ) >Cw 0 4(0 0 5 87) >Cw 15 (0 0 4 5 3) >Cw 12 (0 0 387) >Cw 0 6 (0 0 32 2 ) >Cw 0 5 (0 0 12 7) >Cw 16 (0 0 0 32 )。Hardy Weinberg平衡检验 χ2 =6 0 35 ,υ =5 4 ,P >0 1。表明广东汉族群体Cw 0 3、 0 7、 0 1、 0 8出现频率较高 ,该人群Cw等位基因处于遗传平衡状态 ,具有较为丰富的多态性及特点。     

脐血HLA-A位点PCR-SBT分型的研究

目的建立HLA—A位点等位基因的PCR-SBT高分辨分型方法，探讨DNA测序技术在脐血库样本HLA分型中的应用价值。方法利用PCR产物直接测序，对广州脐血库保存的547份脐血样本进行HLA—A位点2、3、4外显子的序列分析，由分型结果得出基因频率，与中华（上海）骨髓库北方人群、上海地区人群及德国白种人进行比较。结果采用PCR-SBT分型方法并结合分析软件确定了全部样本的HLA—A基因型，广州地区人群HLA-A等位基因以A＊110101（30．8％）最为常见，其后依次是A＊24020101／02L（16．18％）、A＊0207（11．88％）、A＊3303（9．42％）。A＊110101在广州汉族人群中出现的频率明显高于中华（上海）骨髓库北方人群，而A＊010101、A＊3001明显低于后者；在HLA-A2亚型人群中，A＊020101在广州、上海两地汉族人群中的频率明显低于德国白种人，而广州汉族人群中A＊020101与A＊0206均明显低于上海汉族人，但A＊0203明显高于后者。结论基于核酸序列测定的HLA分型技术能够直接、准确、快速地进行高分辨分型，将有助提高无亲缘关系供者脐血移植的临床效果。改进实验条件、升级分型软件，可以降低试剂成本和节约时间。     

中国南方汉族人群MICA-STR的遗传多态性

目的人类MICA(MHC classⅠ chain relaed geneA)基因位于HIAⅠ类区HLA-B近着丝粒端46kb。MICA遗传多态性与器官移植、多种疾病的遗传易感性有密切关系。本工作研究中国南方汉族正常人群MICA基因第5外显子微卫星(MICA-STR)遗传多态性。方法采用荧光PCR/sizesequencing和PCR／SSP技术分析231例中国南方汉族健康个体MICA-STR等位基因及MICA缺失型(MICA*Del)频率。结果在该群体中发现MICA*A4、MICA*A5、MICA*A5．1、MICA*A6、MICA*A9、MICA*Del，其中以MICA*A5、MICA*A5．1最为常见，频率分别为0．362、0．313；共检出MICA*Del携带者3例，MICA*Del基因频率为0．006，该3例样本经PGWKSP定型，均为HLA-B48阳性。MICA-STR基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论中国南方汉族人群MICA-STR等位基因的构成不同于其他人群；此外，该人群存在低频率的MICA基因缺失。     

湖南汉族人群HLA-DP、-DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性

目的 探讨湖南汉族人群HLA—DP、HLA—DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间的关系。方法 应用聚合酶链反应—特异性寡核苷酸探针基因分型技术对87例湖南汉族鼻咽癌患者与91名健康对照作HLA—DPAl、—DPBl、—DQAl及—DQBl的基因分型，采用x^2检验比较两组各位点等位基因频率，单倍型频率分布的差异。结果 发现鼻咽癌组DPAl*0201、DPBl*1901、DQAl*0201较对照组明显降低，DPBl*0402、DQAl*0101较对照组明显升高；单倍型DPAl*0201—DPBl*1401及DQAl*0201—DQBl*0201较对照明显降低；但P值经Bonferroni校正后，差异均无显著性(Pc＞0．05)。结论 湖南汉族人群HLA—DP和—DQ位点与鼻咽癌无明显相关，与以往用受累同胞对方法在鼻咽癌家系中未能证实鼻咽癌易感基因与HLA—DP和—DQ位点连锁的结果一致。     

中国北方汉族HLA基因C位点遗传多态性研究

目的：研究北方汉族人群HLA(人类白细胞抗原)基因c位点的遗传特征。方法：采用序列特异性引物扩增(Polymerase Chain Reaction-Sequence-Specific Primers PCR-SSP)方法对205个样本进行HLA-C及-A、-B基因特异性分析。结果：检出C位点特异性14个，其中Cw*01、*07基因表现频率最高，分别为30．73％和27．80％；血清学方法检测不出的HLA-Cw*12、*14、*15表现频率分别为13．17％、4．88％、8．78％。统计显示显著性连锁不平衡的HLA-B-C单倍型24个，HLAs-A-C单倍型5个。结论：作为中国北方人HLA遗传多态性群体调查，提供了一套比较完整准确的基因频率和连锁不平衡参数，为人类学及疾病相关性等研究提供了较为完整的正常参考数据。     

丙型肝炎病毒基因型分布及HLA-Cw基因多态性的关联性分析

目的 对邯郸不同HCV基因型的分布情况进行统计,结合HLA-Cw的基因多态性,分析HCV与HLA-Cw的关联性.方法 采用荧光PCR法进行HCV基因分型检测,计算不同HCV基因型的阳性率,从而对该地区的丙肝病毒感染者进行流行病学调查;采用病例-对照研究,对所有研究对象的基因组进行HLA基因分型,统计HCV感染者和健康对照者之间HLA-Cw基因频率的差异和关联度;对所有丙型肝炎病毒感染者,采用统计学方法分析HLA基因型别和血清中HCV-RNA的基因型别的关联性,从而寻找与不同HCV基因型感染相关的HLA-Cw基因型.结果 邯郸HCV 1b亚型在人群中的分布最多,其次为混合型1b/2型;HLA-Cw* 8与HCV的慢性感染有关,而其他7个基因位点经研究关联不大,进一步研究发现,HLA-Cw * 8基因与HCV 1b亚型的易感性密切相关.结论 HLA-Cw基因与HCV感染密切相关,可进行易感人群分析,为控制HCV的传播提供可参考的理论依据.     

A newly identified HLA-C allele: Cw*1210, and confirmation of HLA-Cw*080102

HLA-Cw*1210 and -Cw*080102 were identified in Taiwan populations using reverse-line SSO typing method. Sequencing showed that HLA-Cw*1210 and -Cw*120201/02 were identical at exon 2 but differed at exon 3 with three nucleotide substitutions at codons 99 and 105 and an amino acid change from tyrosine to phenylalanine at codon 99. Also, allele HLA-Cw*080102 differed from HLA-Cw*080101 in exon 3 by a single synonymous nucleotide transition at codon 99. HLA-Cw*080102 was found only in the Puyuma indigenous tribe of Taiwan and had a frequency of 5%. Interestingly, nucleotide substitutions of HLA-Cw*1210 and -Cw*080102 were located in a noticeably heterogeneous region of the 5' end of exon 3, where similar substitution motifs are frequently found in other HLA-C alleles, therefore suggesting preferential gene conversion in this region.     

Polymorphism of HLA class I genes in the Brazilian population from the Northeastern State of Pernambuco corroborates anthropological evidence of its origin

The allelic distribution of human leukocyte antigen (HLA) class I genes (HLA-A, HLA-B, and HLA-Cw) of the population from the State of Pernambuco in Northeastern Brazil was studied in a sample of 101 healthy unrelated individuals. Low to medium resolution HLA class I typing was performed using polymerase chain reaction-amplified DNA hybridized to sequence specific primers (PCR-SSPs). Twenty allele groups were detected for HLA-A, 28 for HLA-B, and 14 for HLA-Cw. The most frequent alleles were HLA-A*02(0.2871), HLA-B*15(0.1238), and HLA-Cw*04(0.2277), and the most frequent genotypes were A*02/A*02(0.0990), B*15/B*15(0.0594), and Cw*04/Cw*04 and Cw*07/Cw*07, both with a frequency of 0.0792. The observed heterozygosity for the studied loci was 79.21% for HLA-A, 87.13% for HLA-B, and 77.23% for HLA-Cw. The most frequent haplotype was A*02-Cw*04-B*35(0.0485), which is also present in Western European, Amerindian, and Brazilian Mulatto populations, but absent in African populations. Taken together, these data corroborate the historic anthropological evidences of the origin of the Northeastern Brazilian population from Pernambuco.     

中国人类风湿关节炎与PAD14功能基因多态性及部分HLA-DRB1等位基因相关性研究

目的 分析类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)中4型肽精氨酸转亚胺基酶(peptidylarginine deiminase IV,PAD14)功能基因多态性,探讨PAD14基因多态性与RA易感性的关系,以及编码与RA易感性相关HLA共同表位(shared epitope,SE)的HLA-DRB1等位基因与PAD14基因多态性的相关性.方法 采用逆转录合成cDNA、DNA测序和T载体克隆方法 分析67例RA患者、81名正常人PAD14基因外显子4个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),包括PADH_89*A/G,PADl4 90*C/T,PAD1492*C/G,PAD14 104*C/T;采用PCR-序列特异性引物方法 分析HLA-DRB1.*-01、*04、* 10基因型.结果 RA患者PAD14 89、90、104位基因多态性分布与正常对照组比差异有统计学意义,携带PAD14少见等位基因者对RA的危险性较携带常见等位基因者显著增加;分析编码SE等位基因与PAD14 SNPs的相关性发现,SE+/PAD14_89G-携带者较SE-/PAD14_89G-携带者发生RA的危险性高4.7倍(OR=4.7,95%CI:1.6～13.4,P=0.003),携带SE+/PAD14 89G+者高5.6倍(OR=5.6,95%CI:2.0～15.7,P=0.003).在PAD14 90、92、104位均出现相似的情况.结论 PAD14功能基因多态性与中国人RA的易感性相关,编码SE的HLA-DRB1等位基因仍然是RA的重要遗传标记,而且HLA-DRB1等位基因与PAD14的少见等位基因间可能存在一定的协同作用.     

中国北京人群HLA-DRB1基因多态性的研究

目的 调查北京人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen，HLA)—DRBI基因多态性，获得完整准确的遗传学数据。方法 应用聚合酶链反应—序列特异性引物方法对2810名北京出生的汉族人进行HLA—DRBI基因型检测，并对随机抽取的217名个体进行DRBI高分辨分型。结果 检出DRBI基因型(低分辨率)14个，DRBI等位基因亚型(高分辨率)39个，其中DRBI*09012、*1501、*07011、*08032等位基因频率较高。结论 从基因水平分析了HLA—DRB1基因的群体分布特征，提供了一套比较完整准确的DRBI基因频率，为人类学及疾病相关性等研究提供了重要的参考数据。     

Anchored PCR cloning of the novel HLA-Cw*0704 allele detected by PCR-SSP

Abstract: The novel HLA-Cw*0704 allele, previously detected as the PCR-SSP variant Cw7/8v, has been cloned and sequenced from the homozygous typing cell KR03/4 after amplification by anchored PCR. The nucleotide sequence of Cw*0704 is closely related to those of other Cw*07 alleles, but carries specific changes in exon 3 consistent with its serological behavior - a short Cw7 cross-reactive with antibodies directed against HLA-Cw8. Some of the substitutions of Cw*0704 have not been previously described for HLA-C but are found in HLA-B alleles and in published C sequences of non-human primates. The new allele carries a novel polymorphism in its 5' untranslated region (5'ut) that could be shared by all Cw*07 alleles. By PCR-SSP, Cw*0704 is a relatively common allele in English Caucasoids at a frequency of 4.6%. It is most often observed on HLA-B44 haplotypes previously described as HLA-C "blank", although linkage disequilibria with other HLA-B specificities have been found.     

HLA-DRB1、DQB1基因与汉族人群寻常型天疱疮的相关性研究

目的　探讨 HL A- DRB1、DQB1位点基因在汉族人群寻常型天疱疮易感性中的作用。方法用序列特异性引物 -聚合酶链反应方法 ,对 6 1例寻常型天疱疮 (pemphigus vulgaris,PV)患者和 5 7名正常对照进行了 HL A- DRB1、DQB1等位基因的分型 ,并分析了 DRB1、DQB1基因在两组中的分布。结果　与正常对照组比较 ,PV组 DR4、DRB1* 14 (* 14 0 1、* 14 0 4、* 14 0 5 )基因频率明显增高 (Pc分别 <0 .0 5及P<0 .0 1) ,差异有显著性 ;PV组 DQB1* 0 5 0 3、DQB1* 0 30 2基因频率明显增高 (Pc均 <0 .0 5 ) ,差异有显著性。对 DR4阳性样本的组内基因亚型分型结果发现 ,PV组中 DRB1* 0 4 0 3、DRB1* 0 4 0 6频率显著增高(Pc<0 .0 5 ) ,差异有显著性。 PV患者组单倍型 HL A- DRB1* 0 4 ,DQB1* 0 30 2和 HL A- DRB1* 14 ,DQB1* 0 5 0 3频率明显增高 (P<0 .0 5 )。结论　HL A- DRB1* 0 4 ,DQB1* 0 30 2和 HL A- DRB1* 14 ,DQB1* 0 5 0 3可能是汉族人 PV推测的易感单倍型。     

A study of the killer cell immunoglobulin-like receptor gene KIR2DS1 in a Caucasoid Brazilian population with psoriasis vulgaris

Psoriasis is a chronic inflammatory skin disease whose pathogenesis and genetic background remain unclear. Considering that previous studies have suggested an association of psoriasis vulgaris (PV) and killer cell immunoglobulin-like receptors (KIRs), we typed 15 KIR genes and human leukocyte antigen (HLA)-Cw in 79 Brazilian Caucasoid patients with PV and 110 healthy controls by polymerase chain reaction (PCR) using sequence-specific oligonucleotides and sequence-specific primers. We did not observe a relevant increase in the frequency of the activating KIR2DS1 gene in the PV group [KIR2DS1, 46 of 79 cases (58.2%) vs 40 of 110 controls (36.4%)]. However, an association of KIR2DS1 with Cw*0602+ in 26.5% of PV patients was observed, while it was present in only 5.4% of controls. These results suggest that activating KIR2DS1 gene may not confer susceptibility to PV, and an association of KIR2DS1 gene with the HLA-Cw*0602+ was observed in these patients.