FCRL5基因多态性对安徽省汉族人群强直性脊柱炎易感性及临床表现型的影响

目的 探讨FCRL5基因中rs6427384和rs12036228位点单核苷酸多态性(SNP)对强直性脊柱炎(AS)易感性和临床表现型的影响。方法 收集安徽汉族人群AS患者169例和健康对照184名,采用基于高温连接酶的连接酶检测反应( LDR)—聚合酶链反应(PCR)方法检测其FCRL5基因中rs6427384和rs12036228位点的SNP,分析比较其等位基因频率及基因型频率在患者组和对照组中的分布,并比较不同基因型AS患者的临床表现型的差别。采用x2检验和方差分析进行统计学处理。结果 AS患者组和对照人群中rs6427384位点C等位基因频率(17.3％,25.0％)和T等位基因频率(82.7％,75.0％)及rs12036228位点C等位基因频率(92.3％,87.2％)和T等位基因频率(7.7％,12.8％)分布差异均有统计学意义(P＜0.05)。FCRL5基因rs6427384位点CC、CT和TT基因型频率在AS组（3.7％、27.2％和69.1％）和对照组（3.9％、42.2％和53.9％）之间的分布差异有统计学意义(-8.7637,P=0.0 125)。AS患者组rs6427384位点各基因型间骶髂关节X线分期(x2=34.159,P=0.0001)、疾病首发症状（腰痛或外周关节炎）发生率(x2=7.254,P=0.027）、晨僵持续时间(F=4.159,P=0.018)、Bath AS疾病活动指数(BASDAI)平均积分(F=4.461,P=0.014)差异均有统计学意义。AS患者组rs12036228位点各基因型间仅在疾病首发症状上有明显不同（=6.640,P=0.036）。结论 安徽籍汉族人群AS易感性与FCRL5基因rs6427384和rs 12036228位点单核苷酸多态性有关;其基因型的不同对AS的临床表现型有影响。     

尾加压素Ⅱ基因多态性与多囊卵巢综合征相关性的研究

目的 探讨尾加压素Ⅱ(UTS2)基因多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)发病的关系.方法 用熔解温度不同的基因分型法.检测PCOS患者101例(PCOS组)及其父母202名和105名健康妇女(对照组)UTS2基因rs228648、rs2890565位点单核苷酸多态性(SNP),并检测基础状态下FSH、LH、睾酮、空腹血糖、空腹胰岛素水平.结果 PCOS组的UTS2基因rs228648 A/G多态性位点与对照组比较,基因型与等位基因频率均无明显差异,两组的SNP rs2890565基因型频率差异有统计学意义(P<0.05),PCOS组A等位基因频率明显高于对照组(P<0.05).传递不平衡检验(TDT)显示,SNP rs228648A/G在杂合子父母的2个不同等位基因无优势传递(P>0.05),而rs2890565 A/G在杂合子父母A等位基因优势传递(P<0.05).PCOS组UTS2基因SNP rs228648 GG基因型较携带A等位基因的PCOS患者稳态模型评估的胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)明显增高(P<0.05).SNP rs2890565从和AG基因型空腹血糖、空腹胰岛素较GG基因型明显增高,从基因型HOMA-IR较GG基因型明显增高(P<0.05).结论 UTS2基因SNP rs228648 A/G多态性与PCOS无相关性,但与胰岛素抵抗存在关联.UTS2基因SNP rs2890565可能在PCOS的遗传易感性中起一定作用,A等位基因可能与PCOS的发生有关.     

IL-17A基因多态性及血浆水平与病毒性心肌炎的相关性研究

目的:探讨白细胞介素17A(interleukin-17A,IL-17A)rs2275913(G-197A)位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)及血浆水平与重庆汉族人群病毒性心肌炎(viral myocarditis,VMC)的关系。方法:收集VMC患者200例,根据病程将患者分为急性期组112例和恢复期组88例,并选择同期200例健康体检的正常人作为对照组,采用聚和酶链反应-限制性内切酶片断长度多态性(PCR-RFLP)、DNA测序等方法检测全部受试者IL-17A基因rs2275913(G-197A)位点SNP,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定两组血清IL-17水平。结果:VMC组IL-17A基因rs2275913(G-197A)多态位点AA基因型和A等位基因频率均显著高于对照组(P0.05),携带AA基因型及携带A等位基因(AA+AG基因型)可增加患VMC的易感性(矫正后ORAA=2.197,95%CIAA=1.208-4.279,PAA=0.003;矫正后ORAA+AG=2.051,95%CIAA+AG=1.134-3.995,PAA+AG=0.009)。VMC组血清IL-17水平明显高于对照组(P0.05),尤以急性期为著(P0.05)。不论是VMC组还是对照组,IL-17A基因rs2275913(G-197A)多态位点中含A等位基因(AA+AG)者血清IL-17水平均显著高于非A等位基因(GG)携带者(P0.01)。结论:IL-17A基因rs2275913位点SNP可能与中国重庆地区汉族人群VMC有关,A等位基因是VMC的易感基因。     

血管紧张素Ⅱ1型受体基因rs388915多态性与原发性高血压的相关性

目的:研究血管紧张素Ⅱ1型受体(angiotensinⅡtype 1 receptor,AT1R)基因rs388915多态性与汉族人群原发性高血压(EH)的相关性,为EH的诊断、治疗及易感性研究提供依据。方法:选取在北京安贞医院就诊的北方汉族原发性高血压患者640例(EH组)和442例体检血压正常者(正常对照组NT),应用荧光定量聚合酶链反应方法进行AT1R基因rs388915位点的多态性检测,比较不同分组人群的差异。结果:rs388915位点在EH组和NT组的基因型分别为GG型23/8、AG型211/125、AA型393/305;G等位基因频率分别为79.5%/83.9%,A等位基因频率分别为20.5%/16.1%。2组之间基因型和等位基因频率差异有统计学意义(分别为P=0.03;P=0.01)。显性模型、加性模型在2组间差异有统计学意义(P=0.019;P=0.03)。根据性别进行亚组分析,在女性人群中,EH组和NT组基因型分别为GG型7/3、AG型87/51、AA型132/127,2组之间基因型频率有差异(P=0.045);G等位基因频率28.7%/15.7%和A等位基因频率71.3%/84.3%,发现2组差异无统计学意义(P=0.000)。男性人群中,2组(EH/NT)患者基因型分别为GG型6/5、AG型124/74、AA型261/178,2组间差异无统计学意义(P=0.26);G等位基因频率19.5%/16.3%和A等位基因频率81.5%/83.7%,2组间差异无统计学意义(P=0.15)。经Logistic逐步回归分析,rs388915等位基因与EH发病密切相关(P=0.024,OR=1.341,95%Cl=1.039～1.1731)。结论:AT1R基因rs388915多态性可能与中国北方汉族人群原发性高血压的发病有关,特别是在女性人群中。     

CDKAL1基因多态性与妊娠期糖尿病及其临床特点的相关性研究

目的 探讨我国南方人群中CDKAL1基因两个SNP位点rs7754840和rs10448033的多态性与GDM易感性的关系. 方法 采用病例对照研究,分别选取GDM患者(GDM组)153例和正常糖耐量的孕妇(GNGT组)180名.采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性分析法(PCR-RFLP)测定两个SNP位点多态性分布,并进行统计学分析. 结果 GDM组孕前BMI、FPG、TG均高于GNGT组,TC、HDL-C及LDL-C均低于GNGT组(P＜0.05).SNP位点rs7754840基因型(CC,GC,GG)频率和等位基因频率与GNGT组比较,差异均无统计学意义(P=0.937、0.933);而SNP位点rs10440833基因型(AA,AT,TT)与GNGT组比较,差异有统计学意义(P=0.024),且风险基因型TT的频率高于GNGT组(TTvs TC+CC,P=0.032);GDM组A等位基因频率高于GNGT组[OR(95％CI):1.519(1.114～2.071),P=0.008];AA基因型患者的FPG高于其他基因型(P=0.011),TG高于TT基因型(P=0.007),HDL C低于TT基因型(P=0.001). 结论 CDKAL1基因SNP位点rs7754840与GDM无相关性;SNP位点rs10440833与GDM的易感性相关,且该位点多态性可能与血糖、TG及LDL-C的水平有关.     

蛋白质Z基因多态性与急性缺血性脑卒中的关系

目的:分析蛋白质Z(PZ)基因多态性在广东珠三角地区汉族人群中的分布及其与急性缺血性脑卒中(AIS)的关系。方法:采用聚合酶链反应和限制性内切酶片段长度多态性方法结合基因测序技术,对502例AIS和482例健康老人的PZ基因启动子A-13G位点基因型及其内含子F中G79A位点基因型进行测定,并进行相关性比较。结果:首次发现珠三角地区汉族人群中存在PZ启动子A-13G和PZ内含子F中G79A两种基因多态性。PZ启动子A-13G基因型中AA型、AG型、GG型分别为15.9%、52.7%和31.4%;A、G等位基因频率分别为42.4%和57.6%。PZ内含子F中G79A位点基因型AA型、AG型、GG型分别为31.5%、52.0%、16.5%;A、G等位基因频率分别为57.5%和42.5%。AIS组PZ基因内含子F中G79A位点A、G等位基因频率与对照组比较差异有统计学意义(54.1%∶61.1%,45.9%∶38.9%,均P0.05),且基因型与对照组比较亦差异有统计学意义(P=0.05)。结论:PZ基因内含子F中G79A位点G→A突变,即A等位基因对中国珠三角地区汉族人群AIS的发生有保护作用。     

TBX5基因rs3825214位点多态性和心房颤动的相关性

目的探讨TBX5基因多态性与心房颤动的相关性。方法房颤患者100例(房颤组)和非房颤患者(对照组)107例进行TBX5基因rs3825214单核苷酸多态性和房颤的关联研究。所有患者均采集外周血提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)检查患者TBX5基因rs3825214多态性的基因型和等位基因分布。结果 TBX5基因rs3825214位点在入选人群中存在多态性,分别为GG、AG和AA型,其基因型频率在房颤组和对照组分别依次为28.0%,60.0%,12.0%和15.9%,50.5%,33.6%。GG基因型在房颤组的频率分布显著高于对照组(P=0.035),AA基因型在房颤组的频率分布明显低于对照组(P<0.001)。G和A等位基因频率在房颤组和对照组分别为56.0%,44.0%和41.1%,48.9%,G和A等位基因频率在两组间的差异有统计学意义(P=0.001)。结论 TBX5基因rs3825214位点多态性与房颤的发生有相关性,G等位基因可能是房颤的易感基因,GG基因型可能增加了房颤发生的危险性。     

白细胞介素-22基因单核苷酸多态性与肺结核易感性的相关性研究

目的 探讨IL-22基因单核苷酸多态性(SNP)与肺结核易感性的关系.方法 选取2009年1月至2010年12月深圳市第三人民医院收治并确诊的肺结核患者479例为病例组,其中男212例,女267例;年龄18～ 69岁,平均(36±17)岁;对照组为同期在该医院体检者358名,其中男162名,女196名,年龄18～60岁,平均(34±13)岁.应用MassARRAY时间飞行质谱生物芯片技术,检测IL-22基因6个SNP位点(rs1182844、rs2227473、rs2227476、rs2227480、rs2227485和rs2227508)基因型,对SNP位点进行Hardy-Weiberg平衡检验,并计算各SNP位点等位基因频率及比值比.选取rs2227473不同基因型肺结核患者外周血单个核细胞(PBMC),使用抗人CD3和CD28抗体联合刺激后,采用ELISA法测定不同基因型患者细胞上清液中IL-22浓度.分别采用x2检验和t检验对两组SNP等位基因频率和IL-22浓度进行统计学分析.结果 病例组和对照组6个IL-22基因SNP位点的基因型分布均处于遗传平衡状态.其中rs2227473位点存在GG、GA和AA基因型,病例组仅有等位基因G频率(90.0％,862/958)显著高于对照组(85.6％,613/716),差异有统计学意义(x2=7.448,P ＜0.01,OR=1.509,95％CI-1.121～2.030).rs2227473位点GG基因型的PBMC培养上清液中IL-22浓度为(19 ±5) ng/L,显著低于AA/GA基因型的(39±6)ng/L,差异有统计学意义(t=2.686,P＜0.01).结论 IL22基因rs2227473多态性与肺结核易感性有显著相关性,其等位基因G是肺结核的易感基因.rs2227473多态性影响宿主PBMC的IL-22表达水平,在调节肺结核保护性免疫过程起重要作用.     

广西巴马长寿人群PON1基因多态性与血脂水平的关系

目的探讨广西巴马长寿人群对氧磷酶-1(PON1)基因rs662位点多态性与血脂水平的关系。方法调查巴马长寿老人151例、无长寿家族史健康成年人198例(对照1组)及南丹无长寿家族史的健康成年人176例(对照2组),分析其PON1基因频率分布特点并比较各基因型人群血脂水平。结果长寿组与对照两组的基因型和等位基因频率差异显著(P0.05),长寿组与对照两组A等位基因频率分别为35.8%和23.0%;长寿组AG基因型的HDL水平高于GG的HDL水平,GG及G等位基因携带者的HDL水平高于对照1组,AG、GG及G等位基因携带者TG水平低于对照两组。结论长寿组与对照两组rs662位点基因型及等位基因频率分布存在差异;巴马长寿人群rs662位点多态性与血脂水平相关。     

冠心病患者OX40配体蛋白基因多态性的研究

目的:探讨中国重庆地区汉族人群OX40配体蛋白基因(TNFSF4)单核苷酸多态性与冠心病的关系。方法:提取262例冠心病患者和191例对照者的基因组DNA,采用Taqman实时荧光定量PCR法检测TN-FSF4 rs3850641(A/G)单核苷酸多态性。结果:重庆地区汉族人群中存在TNFSF4 rs3850641(A/G)单核苷酸多态性,冠心病组中基因型分布为:AA型70.5%,AG型22.0%、GG型7.5%;对照组基因型分布为:AA型69.8%,AG型20.8%、GG型9.4%。冠心病组和对照组之间的基因型频率和等位基因频率均差异无统计学意义(P0.05)。结论:OX40L基因rs3850641(A/G)单核苷酸多态性与中国重庆地区汉族人群冠心病发病无关。     

Correlation between single nucleotide polymorphism of rs3811047 in IL-1 F7 gene and rheumatoid arthritis susceptibility among Han population in central plains of China

ObjectiveTo discuss the association between single nucleotide polymorphism (SNP) of rs3811047 in IL-1 F7 gene and rheumatoid arthritis (RA) susceptibility among the Han population in central plains of China.MethodsA total of 276 RA patients admitted to our hospital from December 2009 to December 2011 together with 276 healthy physical examinees in the same period were chosen as the subjects. The typing for rs3811047 SNP in IL-1 F7 gene was carried out by using ligase detection reaction and polymerase chain reaction technique. And the frequency of each allele and genotypes distribution was calculated so as to evaluate the association between genotype distribution and RA susceptibility.ResultsThe frequency of A allele of rs3811047 in IL-1 F7 gene in RA group and control group was 16.27% and 17.68%, respectively, and that of G allele in two groups was 83.73% and 82.32%, respectively. The difference between two groups wasn't statistical significant (P >0.05). The frequency of genotype AA, AG and GG in RA group was 2.19%, 27.84% and 69.97%, respectively, while that in control group was 2.94%, 29.78% and 67.28%, respectively. The difference of distribution of three genotypes was not statistically significant (P >0.05). RA patients with A allele were better than those without A allele in joint swelling index, rest pain, HAQ scoring and blood sedimentation. There was significant difference between two groups in above indexes (P<0.05/P<0.01).ConclusionsNo significant correlation between RA susceptibility among the Han population in central plains of China and rs3811047 SNP inIL-1 F7 gene is observed. However, A allele of rs3811047 has certain influence on the condition of RA patients.     

白细胞介素-23R单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎的相关性研究

目的 探讨白细胞介素(IL)-23R基因单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎(AS)的关系.方法 常规方法对104例As患者和95名健康人群外周血进行基因组DNA抽提,用TaqMan探针对rs1343151位点进行聚合酶链反应(PCR)分型.应用x2检验统计分析病例组和对照组等位基因频率、等位基因型频率及其患病风险.结果 rs1343151位点各基凶型频率在AS组中分别为90.4%(C/C)、9.6%(C/T),在对照组中分别为91.6%(C/C)、8.4%(C/T),2组之间的基因型频率分布差异无统计学意义(x2=0.086,P>0.05);2组C和T等位基凶频率差异无统计学意义(x2=0.082,P>0.05).结论 IL-23R单核苷酸多态性rs1343151不是影响中国人群AS患者致病的主要因素.     

白细胞介素-23R单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎的相关性研究

目的 探讨白细胞介素(IL)-23R基因单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎(AS)的关系.方法 常规方法对104例As患者和95名健康人群外周血进行基因组DNA抽提,用TaqMan探针对rs1343151位点进行聚合酶链反应(PCR)分型.应用x2检验统计分析病例组和对照组等位基因频率、等位基因型频率及其患病风险.结果 rs1343151位点各基凶型频率在AS组中分别为90.4%(C/C)、9.6%(C/T),在对照组中分别为91.6%(C/C)、8.4%(C/T),2组之间的基因型频率分布差异无统计学意义(x2=0.086,P>0.05);2组C和T等位基凶频率差异无统计学意义(x2=0.082,P>0.05).结论 IL-23R单核苷酸多态性rs1343151不是影响中国人群AS患者致病的主要因素.     

白细胞介素-23R单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎的相关性研究

目的 探讨白细胞介素(IL)-23R基因单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎(AS)的关系.方法 常规方法对104例As患者和95名健康人群外周血进行基因组DNA抽提,用TaqMan探针对rs1343151位点进行聚合酶链反应(PCR)分型.应用x2检验统计分析病例组和对照组等位基因频率、等位基因型频率及其患病风险.结果 rs1343151位点各基凶型频率在AS组中分别为90.4%(C/C)、9.6%(C/T),在对照组中分别为91.6%(C/C)、8.4%(C/T),2组之间的基因型频率分布差异无统计学意义(x2=0.086,P>0.05);2组C和T等位基凶频率差异无统计学意义(x2=0.082,P>0.05).结论 IL-23R单核苷酸多态性rs1343151不是影响中国人群AS患者致病的主要因素.     

MD-1基因单核苷酸多态性与华南汉族成人支气管哮喘发病的相关性研究

目的 探讨MD-1基因的单核苷酸多态性与华南汉族成人支气管哮喘(简称哮喘)发病及肺功能的相关性.方法 选取2006年2月至2010年2月南方医院确诊的华南汉族成人哮喘患者332例[男169例,女 163例,平均年龄(44±16)岁]作为病例组,选取同期健康查体者276例[143例,女 133例,平均年龄(45±15)岁]作为对照组,利用MassARRAY-IPLEX技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱平台(MALDI-TOF-MS)对MD-1基因的rs2233128和rs7740529位点进行基因分型,并对其中105例初次确诊哮喘患者的肺功能进行检查.结果 在华南汉族人群中MD-1的rs2233128位点检出 AG和GG两种基因型,rs7740529位点检出CC、CT和TT 3种基因型,分型成功率为94.74%.与对照组比较,病例组rs2233128的基因型分布(x2=0.030,P=0.863)和等位基因分布(x2=0.029,P=0.865)差异均无统计学意义,而rs7740529的基因型分布(x2=8.681,P=0.013)和等位基因分布(x2=8.005,P=0.005)差异均有统计学意义.与TT基因型比较,rs7740529的CC和CC+CT基因型均能显著增加哮喘发生的危险性,OR值(95%可信区间)分别为2.451(1.299～4.963)和2.172(1.173～4.020).在初次确诊的105例哮喘患者中,rs7740529的3种不同基因型(CC、CT和TT)患者的FVC占预计值%(F=18.405,P=0.000)和FEV1占预计值%(F=25.700,P=0.000)差异均有统计学意义,与TT基因型[(86±9)%,(88±8)%]相比,CC基因型患者的FVC占预计值%[(65±12)%]和FEV1占预计值%[(64±11)%]下降最明显(均P＜0.05),但在初诊为哮喘且病情严重程度不同分级患者的rs7740529基因型分布比较,差异无统计学意义(x2=5.017,P=0.081).结论 MD-1可能是华南汉族成人哮喘的易感基因,rs7740529位点的基因型分布可能与初诊哮喘患者的肺功能改变有关.

Abstract：

Objective To investigate the correlation between MD-1 gene single nucleotide polymorphism ( SNP ) and bronchial asthma in adults of the Han nationality in Southern China as well as their lung functions. Methods From 2006 to 2010, 332 adult asthmatic patients of the Han nationality diagnosed in Nanfang Hospital, Southern Medical University, and 276 healthy volunteers were recruited for the study. The SNPs of MD-1 gene loci rs2233128 and rs7740529 were genotyped by using MassARRAYIPLEX technology and matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry platform (MALDI-TOF-MS). In addition, the lung function of 105 cases initially diagnosed with asthma was measured. Results There was no significant difference in sex ( x2 = 0. 50, P = 0. 824 ) and age ( t = 0. 930,P =0. 357 ) between the asthma and the healthy groups. Genotypes AG and GG were detected in MD-1 gene at rs2233128 locus and genotypes CC, CT and TT at rs7740529 locus in this Han population at SouthernChina. Genotyping success rate was 94. 74%. The rs2233128 genotype distribution ( x2 = 0. 030, P =0. 863 ) and allele ( x2 = 0. 029, P = 0. 865 ) showed no significant difference between the asthma and the control groups. However, the rs7740529 genotype distribution ( x2 = 8. 681, P = 0. 013 ) and allele ( x2 =8.005,P = 0.005) were significantly different in the asthma group as compared to the control group.Compared with the TT genotype, the rs7740529 of the CC and CC + CT genotypes could dramatically increase the risk of asthma, the odds ratio (95% confidence interval) being 2. 451 (1. 299 -4. 9626) and 2. 172 ( 1. 173 - 4. 020 ), respectively. In the 105 patients initially diagnosed with asthma, FVC% and FEV1 % were significantly different among the 3 different genotypes (CC, CT and TT) of the rs7740529 locus (F= 18.405, P=0.000 and F=25. 700, P=0.000). The percentages of predicted value of FVC and FEV1were decreased [ ( 65 ± 12 ) %, ( 64 ± 11 ) % ] in the CC genotype as compared to the TT genotypes [ ( 86 ±9) %, (88 ± 8) % ], P ＜ 0. 05. There was no significant difference of genotype distribution of rs7740529 in different grades of severity of newly diagnosed asthma ( x2 =5. 017 ,P =0. 081 ). Conclusions MD-1 may be a susceptible gene for adult asthma in a Southern Han population in China. Genotype distribution of rs7740529 locus in newly diagnosed patients with asthma may be related to their lung function changes.     

白细胞介素-23R单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎的相关性研究

目的 探讨白细胞介素(IL)-23R基因单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎(AS)的关系.方法 常规方法对104例As患者和95名健康人群外周血进行基因组DNA抽提,用TaqMan探针对rs1343151位点进行聚合酶链反应(PCR)分型.应用x2检验统计分析病例组和对照组等位基因频率、等位基因型频率及其患病风险.结果 rs1343151位点各基凶型频率在AS组中分别为90.4%(C/C)、9.6%(C/T),在对照组中分别为91.6%(C/C)、8.4%(C/T),2组之间的基因型频率分布差异无统计学意义(x2=0.086,P>0.05);2组C和T等位基凶频率差异无统计学意义(x2=0.082,P>0.05).结论 IL-23R单核苷酸多态性rs1343151不是影响中国人群AS患者致病的主要因素.     

白细胞介素-23R单核苷酸多态性rs1343151与强直性脊柱炎的相关性研究

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