Toll样受体9基因多态性与尖锐湿疣的研究

目的探讨Toll样受体9的单核苷酸多态性与尖锐湿疣(CA)发病的相关性.方法抽取63例CA患者和23例正常人对照组的外周静脉血,采用TLR9基因直接测序的方法分析TLR9受体的单核苷酸多态性.结果 TLR9基因自翻译起始点第1 174、1635、1269、1724位均存在单核苷酸多态性位点,分别称为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4,其中SNP3、SNP4为新发现位点,SNP1、SNP2为NCBI数据库中公布的位点,登录号分别为rs352139、rs352140.CA患者与正常人对照组的SNP1位点的等位基因A的频率分别为0.690、0.609,等位基因G的频率0.309、0.391,两组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).SNP2位点的等位基因A的频率分别为0.302、0.369,等位基因G的频率0.698、0.630,两组间比较差异无统计学意义(P>0.05).SNP1、SNP2两个多态性位点存在4种单倍体型,分别为AA、AG、GA、GG.每种单倍体型在CA患者组和正常人对照组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 TLR9基因在广东汉族人群中存在4个单核苷酸多态性位点,分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4.SNP1、SNP2两位点与CA的发病易感性可能无相关性.     

Toll样受体9基因多态性与尖锐湿疣的研究

目的探讨Toll样受体9的单核苷酸多态性与尖锐湿疣(CA)发病的相关性.方法抽取63例CA患者和23例正常人对照组的外周静脉血,采用TLR9基因直接测序的方法分析TLR9受体的单核苷酸多态性.结果 TLR9基因自翻译起始点第1 174、1635、1269、1724位均存在单核苷酸多态性位点,分别称为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4,其中SNP3、SNP4为新发现位点,SNP1、SNP2为NCBI数据库中公布的位点,登录号分别为rs352139、rs352140.CA患者与正常人对照组的SNP1位点的等位基因A的频率分别为0.690、0.609,等位基因G的频率0.309、0.391,两组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).SNP2位点的等位基因A的频率分别为0.302、0.369,等位基因G的频率0.698、0.630,两组间比较差异无统计学意义(P>0.05).SNP1、SNP2两个多态性位点存在4种单倍体型,分别为AA、AG、GA、GG.每种单倍体型在CA患者组和正常人对照组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 TLR9基因在广东汉族人群中存在4个单核苷酸多态性位点,分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4.SNP1、SNP2两位点与CA的发病易感性可能无相关性.     

Toll样受体9基因多态性与尖锐湿疣的研究

目的探讨Toll样受体9的单核苷酸多态性与尖锐湿疣(CA)发病的相关性.方法抽取63例CA患者和23例正常人对照组的外周静脉血,采用TLR9基因直接测序的方法分析TLR9受体的单核苷酸多态性.结果 TLR9基因自翻译起始点第1 174、1635、1269、1724位均存在单核苷酸多态性位点,分别称为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4,其中SNP3、SNP4为新发现位点,SNP1、SNP2为NCBI数据库中公布的位点,登录号分别为rs352139、rs352140.CA患者与正常人对照组的SNP1位点的等位基因A的频率分别为0.690、0.609,等位基因G的频率0.309、0.391,两组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).SNP2位点的等位基因A的频率分别为0.302、0.369,等位基因G的频率0.698、0.630,两组间比较差异无统计学意义(P>0.05).SNP1、SNP2两个多态性位点存在4种单倍体型,分别为AA、AG、GA、GG.每种单倍体型在CA患者组和正常人对照组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 TLR9基因在广东汉族人群中存在4个单核苷酸多态性位点,分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4.SNP1、SNP2两位点与CA的发病易感性可能无相关性.     

NOD2基因单核苷酸多态性与彝族麻风病相关性研究

【摘要】 目的 探讨NOD2基因单核苷酸多态性（SNP）位点与中国彝族人群麻风病的关系。方法 单碱基延伸法（SNaP shot）检测300例彝族麻风病患者和300例彝族健康对照NOD2基因的4个SNP位点：rs9302752、rs7194886、rs8057341、rs3135499的基因型。 结果 4个位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P > 0.05）,rs3135499位点的基因型频率和等位基因频率在麻风病组和对照组间的差异有统计学意义（均P < 0.01）。rs9302752、rs7194886、rs8057341位点的基因型频率和等位基因频率在麻风病组和对照组间的差异无统计学意义（均P > 0.05）。 结论 NOD2基因单核甘酸多态性位点rs3135499与中国彝族人群麻风病发病相关。 【关键词】 麻风; 彝族; 多态性,单核苷酸; 基因,NOD2     

梅毒患者白介素4和Toll样受体2基因单核苷酸多态性研究

目的 探讨IL-4基因-590C/T位点、Toll样受体2(TLR2)基因Arg753Gln位点单核苷酸多态性与梅毒遗传易感性之间是否存在关联.方法 分别采用实时荧光定量PCR技术和DNA测序法检测56例早期显性梅毒患者、38例早期潜伏梅毒患者和102例正常人对照组IL-4基因-590C/T位点、TLR2基因Arg753Gln位点单核苷酸多态性.结果 早期梅毒组IL-4-590位点C、T等位基因的分布频率分别为0.229、0.771,对照组IL-4-590位点C、T等位基因的分布频率分别为0.216、0.784,两组相比差异无统计学意义(P＞0.05);显性梅毒组IL-4-590位点C、T等位基因的分布频率分别为0.232、0.768,潜伏梅毒组IL-4-590位点C、T等位基因的分布频率分别为0.224、0.776,两组相比差异无统计学意义(P＞0.05).各组TLR2Arg753Gln位点基因型均为GG型,GA、AA型缺如.早期梅毒组TLR2 Arg753Gln位点G、A等位基因的分布频率与对照组TLR2 Arg753Gln位点G、A等位基因的分布频率相比差异无统计学意义;显性梅毒组TLR2 Arg753Gln位点G、A等位基因的分布频率与潜伏梅毒组TLR2 Arg753Gln位点G、A等位基因的分布频率相比差异无统计学意义.结论 IL-4基因-590C/T位点、TLR2基因Arg753Gln位点单核苷酸多态性与梅毒遗传易感性无相关性.     

广西壮族、汉族系统性红斑狼疮与Toll样受体9基因多态性研究

目的 探讨TLR9单核苷酸多态性与广西系统性红斑狼疮（SLE）患者发病的相关性,以及其在壮族、汉两个民族间的差异。 方法 聚合酶链反应-限制性酶切技术、聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析技术（PCR-RFLP）对97例广西SLE患者和202例广西健康对照者的TLR9基因多态性进行检测,分析其基因型和等位基因频率与SLE部分临床实验室指标的关联性,并比较两民族间的差异。 结果 TLR9 rs352140CC、CT、TT基因型频率在汉族SLE组与汉族对照组中分别为42.9%、41.1%、16.1%和38.3%、55.8%、5.8%,差异有统计学意义（P < 0.05）,其C、T等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。TLR9rs352140 C/T基因型频率和等位基因频率在壮族SLE组与壮族健康对照组间、壮族SLE组与汉族SLE组间差异无统计学意义（均P > 0.05）。TLR9 rs352140TT基因型频率在ds-DNA阳性组比阴性组高（P < 0.05）,而T等位基因频率在两组间差异无统计学意义（P > 0.05）。TLR9 rs352140TT基因型频率和T等位基因的频率在SLEDAI ≥ 9组比SLEDAI < 9组高,差异有统计学意义（均P < 0.05）。TLR9 rs352140TT基因型频率和T等位基因的频率在ANA阳性组与阴性组间差异无统计学意义（均P > 0.05）。 结论 TLR9 rs352140基因多态性可能与广西汉族人SLE的易感性有关, TLR9基因多态性与部分SLE指标可能具有相关性。     

TAP-1等位基因多态性与复发性尖锐湿疣间的关系

目的 探讨TAP-1333、TAP-1637基因多态性与中国人群复发性尖锐湿疣（CA）的关系。方法 采用扩增阻滞突变系统-聚合酶链反应（ARMS-PCR）技术检测88例复发性CA患者和81例正常人对照者TAP-1333基因位点的A/G单核苷酸多态性，以及60例复发性CA患者和60例健康对照者（对照组）TAP-1637基因位点的A/G单核苷酸多态性。结果 CA组TAP-1333等位基因AA、GG、AG基因频率分别为86.36%、0%和13.64%，对照组各等位基因频率分别为79.01%、0%和20.99%，组间差异无统计学意义（χ2 = 1.604，P ＞ 0.05），OR值 ＝ 1.682（0.748 ~ 3.783）。CA组TAP-1637等位基因AA、GG、AG基因频率分别为3.33%、95.00%和1.67%，而对照组各等位基因频率分别为10.00%、60.00%和30.00%,在CA组，天冬氨酸（Asp）杂合型和纯合型出现频率明显低于对照组，而甘氨酸纯合型明显高于对照组，组间差异有统计学意义（χ2 = 23.682，P ＜ 0.01）。AA型：OR值 = 0.310（0.060 ~ 1.604）；GG型：OR值 = 12.667（3.555 ~ 45.135）；AG型：OR值 = 0.04（0.005 ~ 0.308）。结论 TAP-1333位点基因多态性与复发性CA无关；TAP-1637基因位点多态性可能与复发性CA有相关性。     

TNFSF4基因多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究

目的 探讨湖北汉族人群OX40配体蛋白基因rs844648位点和rs3850641位点基因多态性与SLE的相关性.方法 SLE患者82例和正常人对照组100例,采用PCR及限制性片段长度多态性方法(PCR-RFLP)检测TNFSF4基因rs844648和rs3850641位点多态性分布.结果 ①SLE组rs844648位点AA、AG和GG基因型频率分别为20.7％、62.2％、17.1％,正常人对照组为14.0％、55.0％、31.0％.SLE组rs844648多态性位点A等位基因携带者显著高于正常人对照组[73.2％比69.0％％,x2=4.69,P＜0.05,OR值=2.182( 1.068～ 4.458)],SLE组与正常人对照组间差异有统计学意义;②SNP位点rs3850641的正常人对照组AA、AG和GG基因型频率分别是76.0％、21.0％和3.0％,而SLE组分别为62.2％、31.7％和6.1％,SLE组rs3850641位点G等位基因携带者显著高于正常人对照组[37.8％比24.0％,x2=4.07,P＜0.05,OR值=1.925 (1.015 ～ 3.651)],SLE组与正常人对照组间差异有统计学意义.结论 TNFSF4基因rs844648和rs3850641位点存在单核苷酸多态性变异,该多态性与湖北地区汉族人群SLE的发病有相关性.     

内蒙古汉族寻常型银屑病REL基因多态位点检测

目的：检测内蒙古汉族人寻常型银屑病（PsV）患者禽网状内皮组织增殖病毒癌基因V-Rel同源基因（REL）的多态性。方法：提取301例PsV患者及292例正常对照外周血DNA,利用连接酶检测反应检测REL基因区域的4个单核苷酸多态性（SNP）（rs702873、rs842636、rs13031237 和 rs13017599）。结果：PsV患者rs702873和rs842636的等位基因频率分别为0.126和0.128,对照组中分别为0.182和0.181,差异有统计学意义(P<0.05)且rs702873和rs842636间存在强连锁不平衡（D’=0.993,r2=0.980）。rs13031237和rs13017599等位基因频率在PsV患者和对照组中差异无统计学意义(P>0.05)。结论：REL基因位点（rs702873和rs842636）多态性可能与内蒙古汉族人PsV的易感性相关。     

TNIP1基因多态性与中国北方汉族寻常性银屑病关联性分析

目的 探讨人肿瘤坏死因子α诱导蛋白3（TNFAIP3）相互作用蛋白1（TNIP1）基因多态性与中国北方汉族人寻常性银屑病的遗传关联性。 方法 收集寻常性银屑病患者465例,健康对照476例。受试者知情同意后采集外周静脉血5 ml。选择位于TNIP1基因区域的3个单核苷酸多态性（SNP）,即rs17728338、rs3762999和rs999556,利用连接酶检测反应基因分型。利用PLINK1.07软件进行统计分析,卡方检验比较病例组及对照组等位基因频率及基因型频率,计算等位基因的相对危险度估计值比值比OR及其95%可信区间（95% CI）。对 3个SNP间进行连锁不平衡检验,计算两两间的r2和D′值。 结果 位于TNIP1基因区域的3个SNP在病例组和对照组中等位基因频率分布存在差异,但rs3762999和rs999556未达到Bonferroni校正水平。在显性模式下,rs3762999、rs999556的基因型频率在病例组和对照组间差异有统计学意义,达到Bonferroni校正水平（P < 0.016 7）。分层分析发现,3个SNP的等位基因频率、基因型频率在有家族史寻常性银屑病患者与健康对照组间的差异均具有统计学意义（均P < 0.016 7）,rs17728338等位基因A的频率在寻常性银屑病组及各型（早发型、晚发型、有家族史、无家族史）病例组均显著高于对照组（均P < 0.0167）。rs3762999与 rs999556间存在强连锁不平衡（r2 = 0.910,D′ = 0.982）,rs17728338与rs3762999和rs999556之间有中等程度的连锁不平衡（r2分别为0.371和0.353,D′分别为0.989和1）。 结论 TNIP1基因多态性rs17728338、rs3762999及rs999556与汉族人寻常性银屑病具有相关性。     

IL-12B和IL-23R基因多态性与中国汉族人银屑病易感性关联研究

目的 探讨中国汉族人群中IL-12B和IL-23R基因多态性与银屑病易感性的关系。方法 在217例银屑病患者和288例正常人对照中,采用DNA直接测序法对IL-12B和IL-23R基因的多态性位点进行基因分型,并将阳性结果在一个更大的包括578例银屑病患者和1422例正常人对照的整合样本群中,使用Taqman探针荧光PCR技术进行重复检验。实验数据进行Hardy-Weinberg平衡检验、卡方检验、单倍型分析和Logistic回归模型分析。结果 IL-12B rs6887695位点等位基因频率在病例组与对照组之间差异有统计学意义,OR = 1.33（95% CI 1.03 ~ 1.73）,P = 0.028;IL-23R rs11465817和rs1343152位点等位基因频率在病例组与对照组之间差异无统计学意义（P > 0.05）。连锁不平衡分析发现,rs11465817和rs1343152位点之间有一定的连锁不平衡（D′ = 0.744,r2 = 0.281）。对2个位点进行单倍型分析发现,A-A ∶ OR = 2.890,P = 0.0018,提示这一单倍型具有显著的发病风险。结论 IL-12B基因rs6887695多态性与中国汉族人群银屑病易感性相关;IL-23R基因rs11465817、IL-23R基因rs1343152位点多态性与中国汉族人群银屑病易感性无显著相关性,但是,IL-23R基因rs11465817-rs1343152位点A-A单倍型的中国汉族人具有更高的银屑病发病风险。     

山东汉族寻常性银屑病患者eIF4E、MMP-9基因多态性研究

目的 探讨真核细胞翻译起始因子（eIF4E ）、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）基因内的单核苷酸多态性与山东汉族寻常性银屑病的关系。方法 基于群体的病例对照关联分析方法,利用Taqman分型方法对188例银屑病患者及280例正常对照人群MMP-9基因内的2个位点以及eIF4E基因内的1个位点进行分析,对基因型频率及等位基因频率采用PLINK软件进行统计学分析。结果 位于MMP-9基因上游调控区域的 rs4810482等位基因T在银屑病组中的频率显著低于对照组（OR = 1.49,95% CI = 1.12 ~ 1.99,P < 0.01）,在隐性与显性遗传模型分析中,差异具有统计学意义。生物信息学分析表明,该位点可能改变了转录因子的结合位点。在研究中分析的其余两个位点rs3918254和rs11723037与银屑病无相关性。结论 位于MMP-9基因上游调控区域的rs4810482与银屑病具有显著相关性,可能是银屑病的一个易感基因。     

中国汉族人群白癜风6q27区域易感基因精细定位研究

目的:对中国汉族人群白癜风6q27易感区域进行精细定位研究,以期发现白癜风易感基因。方法:收集2942例白癜风患者和2850名正常对照标本,对6q27易感区域内的24个标签SNP位点进行基因分型。采用Plink 1.07和SPSS19.0软件进行统计分析,同时进行条件回归分析和连锁不平衡分析。结果:(1)SNP位点rs2236313、rs9457258、rs720325、rs968334、rs3093025、rs55802221、rs1012656、rs6930998和rs1331299的等位基因频率在病例组和对照组之间具有显著差异,但是通过条件回归分析结果提示没有新的独立信号存在;(2)连锁不平衡分析结果显示rs2236313、rs9457258、rs720325、rs968334和rs30930255位点间具有中度连锁关系(D'0.7,r20.4)。结论:本文证实既往报道的SNP是标签SNP,根据基因型填补以后的注释结果认为白癜风6q27区域的关联基因为RNASET2基因。     

云南汉族痤疮与CYP11B1基因多态性的相关性研究

【摘要】 目的 探讨CYP11B1基因多态性与痤疮发病风险之间的相关性。 方法 SNaPshot法对云南汉族403例痤疮患者（包括轻型痤疮166例 、重型痤疮237例）和207例健康对照CYP11B1基因2个单核苷酸多态性位点：rs4736312和rs4534位点进行分型,ABI 3730XL扫描分型结果。结果 rs4736312位点：男性轻型痤疮组AA、AC和CC基因型频率分别为0、20.6%、79.4%,重型痤疮组为1.8%、26.8%、71.4%,男性健康对照组为7.6%、34.8%、57.6%。A等位基因的频率分布在男性痤疮组与健康对照组间、男性轻型痤疮与健康对照组间以及男性重型痤疮与健康对照组间,差异均具有统计学意义（分别为P < 0.01、< 0.05、< 0.05）,而女性痤疮组、女性轻型痤疮组、女性重型痤疮组A、G等位基因频率分布与健康对照组相比,差异均无统计学意义（P > 0.05）。rs4534位点：男性、女性两组别的痤疮组、轻型痤疮组及重型痤疮组的AA、AG、GG基因型频率分布和A、G等位基因频率分布与各自健康对照组间,差异均无统计学意义（P > 0.05）。 结论 CYP11B1基因中rs4736312位点与云南汉族男性痤疮发病相关,而rs4534位点与云南汉族痤疮的发病无相关。 【关键词】 痤疮,寻常; 11β-羟化酶; 多态性,单核苷酸