天津市HIV/AIDS病人未治疗人群pol基因多态性及耐药性分析

目的了解天津市艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人)未治疗人群中,耐药基因的变异情况,比较不同基因亚型之间pol基因多态性耐药突变的分布差异。方法收集2010年天津市HIV/AIDS病人未治疗人群的血液样本,提取样本DNA,用巢式聚合酶链式反应扩增病毒pol基因,并进行亚型及耐药基因型分析。结果在79例样品中,扩增并得到有效pol基因序列的共有51例,共发现3种基因亚型。其中CRF01_AE为主要亚型,占49.02%(25/51);其次是B亚型,占41.18%(21/51)。检出耐药者8例,占15.69%(8/51),分别为低度和潜在低度耐药。耐药相关突变位点为K103R、V106I、V106IV、E138G、V179E和V179DINV。不同HIV-1基因亚型中,pol基因蛋白酶区和反转录酶区的基因突变差异较大。结论天津市HIV/AIDS病人未治疗人群中,存在一定程度的耐药问题,应加强对HIV-1耐药情况的监测,及时调整防治策略。     

山州某县HIV-1感染者治疗前耐药情况及影响因素分析

目的 分析凉山州某县HIV-1感染者治疗前耐药情况及影响因素，为制定针对性抗反转录病毒治疗（antiretroviral therapy, ART）方案，减少整体抗病毒治疗失败率提供理论依据。方法?选取2022年6—12月间，于凉山州某县医院就诊的拟启动ART的HIV-1感染者107例，完善治疗前耐药（pretreatment drug resistance, PDR）基因检测及HIV-1亚型检测，同时收集基线血CD4+ T细胞计数、HIV-1病毒载量及常规检查指标，分析PDR总体发生率及相关危险因素。结果?107例HIV-1感染者中基因扩增成功101例，成功率为94.4%。101例感染的HIV-1主要基因型为B+C亚型（48/101，47.5%）和CRF07_BC重组型（46/101，45.5%）。共检测出存在耐药基因突变者21例，PDR发生率为20.8%，实际耐药者11（耐药率10.9%）。核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变1例为A62V位点。非核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变15例，主要突变位点为K103N、Y181C、V179D及V179VD等，分别造成依非韦仑、奈韦拉平、利匹韦林、依曲韦林等药物的不同程度耐药。还有6例为整合酶抑制剂耐药突变，突变位点包含E157Q、A128T及G163R。经单因素及多因素Logistic回归分析，汉族及B+C亚型与发生PDR突变具有相关性，其中汉族为风险因素，B+C亚型为保护性因素。结论?凉山州某县初始ART的HIV-1感染者中，存在较大比例的PDR基因突变，除了常见的核苷类及非核苷类逆转录酶抑制剂耐药外还出现了整合酶抑制剂的耐药突变，应该引起高度注意。     

黑龙江省未经治疗的艾滋病患者蛋白酶和反转录酶基因型耐药性检测与分析

目的 对黑龙江省流行的HIV-1毒株的蛋白酶基因及反转录酶基因进行基因型耐药分析,为开展大规模临床抗病毒治疗提供本底数据.方法 采用套式-PCR法扩增黑龙江省内49例HIV-1感染者及AIDS患者外周血单个核细胞中前病毒cDNA的部分蛋白酶和反转录酶基因,分析基因序列,与国际耐药数据库比对,分析耐药变异.结果 49例患者HIV毒株亚型分析为B'亚型.在扩增出蛋白酶基因的47份标本中,未发现对蛋白酶抑制剂的原发突变,但发现大量对蛋白酶抑制剂的次要突变,V771占91.5%、L63P占76.6%、I93L占74.5%、E35D占61.7%、R57K占19.1%、R41K占10.6%、A71V占8.5%、M36I占8.5%、L10I占6.4%、D60E占6.4%、L89M占4.2%和G16E占2.1%.在扩增出反转录酶基因的44份标本中,1份有反转录酶抑制剂的原发突变M184I,占2.3%,均有反转录酶抑制剂的次要突变,I135L/T/R/V占81.8%、V106I占22.7%、V179D/E占11.4%、R211K占9.1%、L214F占4.5%、V189I占4.5%和V108I占2.3%.结论 目前在黑龙江省未接受抗反转录病毒治疗的患者中未发现对蛋白酶抑制剂耐药的原发突变,耐药突变处于低水平,但应及时进行耐药突变检测,防止多重耐药和交叉耐药的出现和流行.     

重庆市医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人HIV-1遗传分化和耐药突变研究

目的调查重庆市医疗机构中艾滋病病毒(HIV)1型(HIV-1)感染者/艾滋病(AIDS)病人中的HIV-1基因亚型、群体动力学及耐药性。方法收集2013年12月至2016年4月重庆多家医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人血浆,通过提取核糖核酸(RNA)、反转录、巢式聚合酶链式反应(PCR),系统发育学和群体遗传学的方法,扩增及分析HIV基因组pol区序列,并检测耐药相关突变。结果共收集657份HIV-1感染者/AIDS病人静脉血样本,扩增及测序得到256份有效的pol基因片段,HIV基因亚型分析显示,重庆医疗机构中流行的HIV-1毒株以CRF07_BC(43.8%,112份)、CRF01_AE(34.8%,89份)为主要基因型;随后依次为CRF08_BC(8.2%,21份)、B(3.5%,9份)、CRF55_01B(2.7%,7份)、CRF68_01B(0.4%,1份)和CRF86_BC(0.4%,1份)。检出耐药基因突变者94例(占36.7%),无耐药基因突变者162例(占63.3%)。不同基因亚型间,pol基因蛋白酶区和反转录酶区的基因突变位点差异无统计学意义(P0.05)。对优势群体CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC的群体遗传学分析,证实重庆市医疗机构中的HIV-1部分基因型群体正在经历扩张。结论重庆市医疗机构中HIV-1病毒基因突变和重组普遍存在。HIV-1CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC基因亚型正在经历缓慢扩张的过程。需持续研究和监控重庆地区HIV-1在感染者中的遗传分化及耐药进展。     

上海市新诊断114例人类免疫缺陷病毒Ⅰ型感染者的分子生物学研究

目的对上海市2004至2005年新诊断的114例人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（H1V-1）感染者进行分子流行病学调查，为确定上海市流行的HIV-1的分子生物学特征提供监测依据。方法应用逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1多聚酶基因，DNA测序后进行进化系统树分析确定基因亚型并与国际耐药数据库比对辨别耐药性突变位点。结果1．114例中除1例不详外，本市户口33例，占28．95％，外来人口80例，占70．18％；经性传播感染51例，占44．74％，经静脉注射吸毒感染43例，占37．72％，经采供血和输血感染3例，占2．63％，感染途径不详17例，占14．91％；2．基因亚型分别为B亚型9例，占7．89％，B’亚型15例，占13．16％，C亚型1例，占0．88％，G亚型1例，占0．88％，CRF01_AE38例，占33．33％，CRF07_BC46例，占40．35％和CRF08BC4例，占3．51％；3．耐药分析结果表明本次研究人群的耐药性主突变率为18．42％。与蛋白酶抑制剂（PRIs）和逆转录酶抑制剂（RTIs）耐药相关的基因主突变率分别为2．63％（3／114）和17．54％（20／114）。蛋白酶基因主突变位点突变频率为M46I，占66．67％，M46L，占33．33％。逆转录酶基因主突变位点突变频率分别为M41L，占7．69％、A62V，占7．69％、T69S，占7．69％、V75I／L，占15．38％、K103R，占25．00％、V118I,占23．08％、V179D／E／T，占33．33％、G190R，占8．33％、L210K／M／X，占38．46％、F227L／I，占16．67％、M230R，占8．33％和P236R，占8．33％。结论上海市新诊断的HIV-1感染者依然以静脉吸毒和性传播为主，感染者以外省市流动人口为主。HIV-1基因亚型流行呈多样性，主要以CRF01_AE、CRF07_BC和B／B’为主。在114例新诊断、尚未经抗病毒治疗的HIV-1感染者中，已存在与PRIs和RTIs耐药相关的基因主突变。     

绍兴市HIV-1毒株的耐药变异研究

目的了解绍兴市1型艾滋病病毒(HIV-1)株的耐药变异情况。方法分析2013-2014年绍兴地区新确认未经抗病毒治疗的130例HIV-1感染者,以及2014年前抗病毒治疗满一年且病毒未抑制的34例感染者样本,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和巢式-聚合酶链式反应(Nested-PCR)方法扩增HIV-1的pol基因区全长,参照美国斯坦福大学HIV耐药数据库,确定HIV亚型及耐药突变位点。结果 34例新诊断HIV感染者及33例病毒未抑制感染者的样品检测到耐药突变,主要亚型为CRF01_AE和CRF07_BC。仅在病毒未抑制感染者中检测到针对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)的耐药突变,主要类型有M184V(42.42%)、K70R(15.15%)、D67N(12.12%)。在新确认感染者和病毒未抑制感染者两组人群中,均检测到针对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药的突变,主要类型有V179D/E/T(10.00%和18.18%)、K103N(2.22%和21.21%);在病毒未抑制感染者中还有Y181CY(21.21%)、V90I(12.12%)、G190A(15.15%)。在反转录酶(RT)区和整合酶(IN)区仅检测到少量次要耐药突变。结论绍兴市HIV经抗病毒治疗后易产生耐药性,部分可在新感染人群中传播,应对HIV耐药变异加强监测。     

凉山州部分彝族人群2011年HIV耐药警戒线监测研究

目的分析凉山州部分彝族人群2011年艾滋病病毒1型(HIV-I)在未治疗的感染人群中耐药毒株变异情况,为指导抗病毒治疗、评价治疗效果、合理调整治疗方案和制定应对措施提供依据。方法对129例25岁以下新确诊的HIV阳性血清样本,用In-house方法进行基因型耐药检测。共91例扩增测序成功,检测耐药传播相关的耐药突变,并分析其相关的亚型及其比例。结果 91例样本中,没有针对PR区的主要耐药性基因突变,但有7例样本存在针对RT区耐药性基因突变,4例为交叉突变(T215Y和V179E),3例为单一突变(T215Y、V179D和P225H),导致对齐多夫定(AZT)和司坦夫定(D4T)不同程度的耐药。RT区耐药株流行率为5.43%(7/129),属于中等流行水平(5%~15%)。91例样本中,CRF07-BCⅡ型所比例最大,达91.21%(83/91),B亚型仅占8.79%(8/91)。结论凉山州部分彝族人群未经抗病毒治疗的新发现HIV-1感染者中,已出现pol区耐药突变株,且传播水平达中度流行状态,需进一步加强抗病毒治疗患者的用药督导,提高其用药依从性,并持续性监测该地区抗病毒治疗人群的耐药情况。     

2018年广西崇左边境地区新报告HIV-1感染者治疗前耐药监测结果分析

目的了解广西边境城市崇左市新报告艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的基因亚型及治疗前耐药(PDR)情况,为评估现有一线疗法的长期效果和调整抗病毒治疗方案提供参考。方法选取2018年1～9月广西崇左市大新县、龙州县和宁明县新报告的HIV-1感染者149例为研究对象,检测分析其基因亚型和PDR情况;对影响感染者发生PDR的因素进行单因素Logistic回归分析。结果新报告HIV-1感染者的HIV基因亚型中CRF01_AE占87.9%,CRF08_BC和CRF07_BC分别占6.0%和4.7%;基因距离分析显示CRF01_AECRF07_BCCRF08_BC;149例新报告HIV-1感染者中,发生PDR10例(6.7%),其中对非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药6例,其优势耐药位点为V106I;对核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)和蛋白酶抑制剂(PIs)耐药各2例;未发现同时对2种及以上抗逆转录病毒(ARV)药物耐药的新报告HIV-1感染者。单因素Logistic回归分析结果显示,耐药与不耐药的新报告HIV-1感染者的性别、年龄、所在地、民族、文化程度、职业、危险因素等比较差异均无统计学意义(P0.05)。结论广西崇左市边境地区新报告的HIV-1感染者治疗前耐药发生情况已达到警戒线水平,加强耐药监测、及时调整优化抗病毒治疗方案,将有助防止耐药毒株的广泛传播、控制疫情。     

温州地区未治疗AIDS病人的HIV毒株耐药基因变异研究

目的对温州地区未治疗艾滋病(AIDS)病人体内艾滋病病毒(HIV)毒株耐药基因的突变情况进行调查分析,了解该地区AIDS病人的本底耐药情况。方法对50例未接受抗病毒治疗的AIDS病人HIVpol区的蛋白酶(PR)全长和部分反转录酶(RT)基因进行扩增、脱氧核糖核酸(DNA)测序、亚型鉴定,并与国际HIV耐药数据库比对分析。结果共获得38份有效序列,根据pol区亚型分析发现,CRF01_AE占36.8%(14例),CRF07_BC重组占36.8%(14例),C亚型占18.4%(7例),B亚型占7.89%(3例)。未检出针对蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)的耐药病例。针对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)检出3例耐药病例,突变类型分别为V179D、E138A和K103N。同时,2015年温州HIV耐药毒株的传播水平5%,处于低传播水平。结论对于未经抗病毒治疗组,耐药基因型以CRF01_AE重组、BC重组为主,HIV耐药毒株在温州仍处于低度传播水平,发现一个重要耐药基因突变位点是K103N。     

浦东新区MSM HIV-1分子流行病学的研究

目的了解上海市浦东新区近年来男男性行为人群(MSM)中,未经抗病毒治疗的艾滋病病毒1型(HIV-1)抗体阳性者,其HIV-1亚型分布和原发性耐药特征,监测该地区MSM HIV-1毒株的最新流行情况,为当前该区制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法选取2011年至2014年4月份期间确认的MSM HIV-1感染者血浆标本70份,应用巢式反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增pol基因,并对扩增产物进行测序,用Mega 6.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据系统进化树分析确定基因亚型及其特征以及耐药情况。结果获62份pol区基因全序列片段,得到CRF01-AE、CRF07_BC、01B(CRF01_AE与B重组亚型)和B四种亚型。分布显示:CRF01-AE占58.06%(36/62),CRF07_BC占30.65%(19/62),01B占6.45%(4/62),B占4.84%(3/62)。离散率显示:CRF01-AE亚型的平均离散率为(2.1±0.2)%(n=36),CRF07-BC亚型的平均离散率也为(2.1±0.2)%(n=19),B亚型的平均离散率为(5.7±0.6)%(n=3),01B重组亚型的平均离散率为(6.3±.0.6)%(n=4)。耐药特征:62例中有7例分别产生了对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)及蛋白酶类抑制剂(PIs)的耐药突变,其中2例产生了低度耐药,4例具有潜在的耐药特点。结论上海市浦东新区2011年至2014年4月间,MSM新确证HIV-1感染者中,基因亚型呈多元化趋势,以CRF01-AE和CRF07-BC为主,并已形成了浦东新区范围内的局部流行趋势,新的01B重组毒株已在浦东新区开始出现;HIV-1原发耐药株的传播尚处于低度流行水平,密切监视其流行趋势已显十分必要。