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目的:分析胰腺癌组织和正常组织差异表达的miRNA,筛选与胰腺癌预后相关的生物标志。方法:下载并整理基因芯片表达汇编数据库(GEO)中GSE32678和GSE71533芯片数据集原始数据,应用R语言筛选差异表达miRNA,结合GSE24279数据集,获得差异表达的miRNA并取交集。应用生物信息学分析工具对交集miRNA进行靶基因预测,进而对靶基因进行功能分析,构建蛋白互作网络(PPI)、miRNA-mRNA调控网络、miRNA-mRNA-pathway调控网络,结合肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中胰腺癌样本的miRNA表达及预后数据,筛选出胰腺癌预后相关标志物。结果:共筛选出胰腺癌组织和正常组织22个交集miRNA,其中hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375与胰腺癌患者的生存预后密切相关。hsa-miR-125b-5p、hsa-miR-221-3p、hsamiR-31-5p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-10a-5p是miRNA-mRNA调控网络中的核心miRNA。结论:通过对GEO和TCGA数据库胰腺癌相关数据的分析发现hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375显著影响胰腺癌患者的预后,可以作为判断预后的标志。 相似文献
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胰腺癌是一种恶性程度很高的肿瘤,由于特异性症状、分子标志物的缺乏,胰腺癌的早期诊断非常困难。目前,已通过高通量技术发现了一些新的候选特异性分子标志物,如miRNA,胰腺癌中miRNA的异常表达特性使其成为胰腺癌早期诊断的一个重要生物标志物。 相似文献
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胰腺癌恶性侵袭转移能力很强,其机制仍未完全明确。近年来有研究发现微小RNA(miRNA)影响胰腺癌的发生发展,并与其转移密切相关。与胰腺癌转移相关的miRNA作用机制的揭示,将会为胰腺癌的治疗提供新的途径。 相似文献
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胰腺癌(pancreatic cancer)是目前世界范围内恶性程度最高的肿瘤之一,在消化系统恶性肿瘤中居第2位。胰腺癌起病隐匿,进展迅速,预后较差,术后5年生存率不超过5%。而且缺乏可靠的早期诊断肿瘤标志物,因此,寻找胰腺癌特异性的早期诊断肿瘤标志物显得尤为重要。近年来研究发现循环miRNA在胰腺癌的发生、发展及转移过程中发挥着重要的作用。本文就循环miRNA用于胰腺癌早期诊断的研究进展作一综述。 相似文献
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胰腺癌是消化系统恶性程度最高的肿瘤之一,早期发现早期手术是患者获得根治的唯一机会,然而多数患者发病即为晚期,在1-2年之内死亡。如何早期发现早期诊断,如何提高疗效改善晚期患者预后是胰腺癌研究中亟待解决的难题。miRNA是近年来新发现且研究较多的内源性短片段非编码小RNA,通过对mRNA转录后的调控影响基因的表达,越来越多的证据证实miRNA通过抑制抑癌基因或者上调癌基因的表达,参与了肿瘤发生发展、侵袭转移、血管形成和凋亡的过程,以特定miRNA为靶点可能成为肿瘤治疗的新途径。本文就miRNA在胰腺癌研究领域的新进展进行了综述。 相似文献
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人类基因组中大部分为非编码区,转录产生非编码 RNA(ncRNA) 。这些ncRNA可以在表观遗传水平、转录水平及转录后水平调控基因的表达,进而影响肿瘤的发生和发展,是肿瘤诊断、治疗及预后判断的潜在靶标。微小RNA(microRNA ,miRNA) 和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA) 是 ncRNA 的两个重要分类。越来越多的研究表明lncRNA、microRNA 参与生物体的各种生理及病理过程,其中恶性肿瘤的相关研究最多。卵巢癌是妇科常见的恶性肿瘤疾病,早期诊断困难、预后差。MicroRNA和 lncRNA 在卵巢癌的发生发展中的研究进展及相互作用关系近年来引起了人们的关注。本文就这两者在卵巢癌的发生发展过程中的相互作用机制及研究进展作一综述。 相似文献
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目的:通过对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的乳腺癌数据进行综合分析,寻找在乳腺癌中差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、微小RNA(microRNA,miRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA),构建乳腺癌竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络,识别和预测ceRNA网络在乳腺癌中的作用。方法:下载TCGA数据库中乳腺癌组织样本基因表达谱数据,寻找差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA,通过miRcode、miRTarBase、TargetScan和miRDB四个数据库对差异表达的RNA之间的关系进行分析,构建以上调和下调的miRNA为中心的ceRNA网络。采用Kaplan-Meier法分析乳腺癌ceRNA网络中的lncRNA、miRNA和mRNA表达量与患者生存预后的关系,采用基因富集分析法对乳腺癌ceRNA网络中mRNA基因功能和调控通路进行分析。结果:在乳腺癌中异常表达的350个lncRNA、185个miRNA和2 928个mRNA中,分别有23个lncRNA、27个miRNA、70个mRNA参与构建乳腺癌的ceRNA网络。Kaplan-Meier生存分析显示,lncRNA MAGI2-AS3(P=0.01)、GRIK1-AS1(P=0.03)以及miRNA hsa-miR-301b(P=0.01)、hsa-miR-503(P=0.04)和mRNA CCNE1(P=0.01)、KPNA2(P=0.02)、FLI1(P=0.02)、TGFBR2(P=0.02)这8个基因与乳腺癌患者的生存预后显著相关。70个mRNA主要被富集到20条通路上,其中有15条通路与肿瘤有关,最显著的通路为“Pathways in cancer”。结论:ceRNA网络在乳腺癌中发挥着重要的作用,多种差异表达基因与乳腺癌预后相关,可能成为潜在的肿瘤诊断标志物和治疗靶点。 相似文献
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竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)是一种新的转录后RNA相互调控机制,越来越多的研究发现长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)和假基因(pseudogenes)可以与微小RNA(microRNA,miRNA)竞争,影响靶RNA的稳定性或翻译,从而调控基因表达。近年来,不同基因作为ceRNA参与膀胱癌调控的研究已引起学者的广泛关注。为此,本文综述了lncRNA、circRNA和假基因作为ceRNA在膀胱癌中作用的研究进展,以及不同基因作为ceRNA调控膀胱癌的信号转导通路。从ceRNA分类的角度综述各类ceRNA在膀胱癌发生发展过程中的研究进展。 相似文献
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目的:探讨lncRNA BCAR4通过调节Wnt/β-catenin信号通路调控胃癌细胞的增殖和凋亡。方法:通过实时定量PCR法检测lncRNA BCAR4在胃癌组织和胃癌细胞中的表达;免疫组化方法分析胃组织中c-myc和cyclin D1蛋白的表达;通过MTT、克隆形成和流式细胞术分别检测lncRNA BCAR4对胃癌细胞SGC7901增殖和凋亡的影响,并通过Western blot法检测lncRNA BCAR4敲除前后对SGC7901细胞中c-myc、cyclin D1蛋白以及Wnt/β-catenin信号通路的影响。结果:相比于癌旁组织以及胃黏膜上皮细胞,lncRNA BCAR4在人胃癌组织和胃癌细胞中表达显著升高(P<0.01);同时,c-myc和cyclin D1蛋白的表达在胃癌组织和胃癌细胞中也有所增加,尤其在SGC7901胃癌细胞中上调最为显著(P<0.01); lncRNA BCAR4敲除能够显著降低细胞活力,促进细胞凋亡(P<0.01)。lncRNA BCAR4敲除能够显著抑制Wnt/β-catenin信号通路的活化(P<0.01),进而降低其下游增殖相关蛋白c-myc和cyclin D1的表达(P<0.01)。结论:降低lncRNA BCAR4能够通过抑制Wnt/β-catenin信号通路的活化,从而降低下游c-myc和cyclin D1蛋白表达,导致胃癌细胞的增殖抑制,促进细胞凋亡。 相似文献
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背景与目的:胰腺癌是一种恶性程度很高的肿瘤。由于其对一线化疗药物吉西他滨的耐受,往往导致预后较差。MicroRNA(miRNA,miR)是一类非编码小RNA,参与肿瘤的多种生物学功能。miR-33a作为代谢相关的miRNA被广泛研究,而与耐药之间关系的报道较少。该研究通过探讨miR-33a参与胰腺癌吉西他滨耐药及其作用解析,为胰腺癌化疗提供新的理论依据。方法:采用原位杂交方法检测胰腺癌组织中miR-33a的表达情况;采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测各胰腺癌细胞系中miR-33a的表达情况。利用SW1990和Miapaca-2胰腺癌亲本细胞株,构建吉西他滨耐药细胞株(SW1990res,Miapaca-2res)及miR-33a稳定表达细胞株(SW1990-miR-33a,Miapaca-2-miR-33a、SW1990res-miR-33a和Miapaca-2res-miR-33a);采用细胞毒性实验检测miR-33a的表达对胰腺癌细胞对吉西他滨敏感性的影响。结果:miR-33a在胰腺癌组织样本中普遍低表达。与HEK293T正常人胚肾细胞相比,其在各胰腺癌细胞系中均呈低表达。miR-33a过表达可以增加胰腺癌细胞对吉西他滨的药物敏感性,能有效逆转胰腺癌细胞对吉西他滨的耐药。结论:miR-33a在胰腺癌组织中低表达,导致胰腺癌患者对吉西他滨获得性耐药。增加miR-33a表达,从而增强了胰腺癌细胞对吉西他滨的药物敏感性,为开发新型胰腺癌分子靶向治疗药物,联合化疗提供新的理论依据。 相似文献
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竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)是一类能与miRNA结合位点(miRNA response element,MRE)结合从而抑制miRISC形成,并能进一步增加相应mRNA的表达来达到RNA间相互沟通及转录后调控基因表达的一类非编码RNA。ceRNA主要包括长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)、假基因、人工合成miRNA抑制剂及病毒miRNA抑制剂等。目前越来越多的研究表明ceRNA在肿瘤的基因调控及肿瘤细胞增殖、凋亡、细胞周期、侵袭和转移等各种生物过程中发挥重要作用。本文从ceRNA分类、调控网络及ceRNA在不同肿瘤中的研究进展作一综述。 相似文献
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长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肿瘤发生发展中发挥着重要的调控作用。浆细胞瘤多样异位基因1(plasmacytoma variant translocation 1,PVT1)是lncRNA的一种,其不具备编码蛋白质的功能,但对肿瘤增殖、迁移和侵袭有影响。在胃癌、肺癌等多种肿瘤中,PVT1高表达。因此,PVT1可能是肿瘤诊断和预后的预测因子,并有希望成为改善药物治疗耐药性的新靶点。本文针对PVT1在肿瘤诊断、发生发展、预后和耐药中的研究进展作一综述。 相似文献