Network pharmacology-based strategy to investigate harmacological mechanisms of Isodon serra (Maxim.) Hara for treatment of inflammatory

Widely distributed in plants, ent-kaurane diterpenoids could reduce the incidence of inflammatory. The most important active ingredient of Isodon serra (Maxim.) Hara is ent-kaurane diterpenoids, which contribute to the anti-inflammatory pharmacological effects of Isodon serra. However, the ingredients, the active compounds, drug targets, inflammatory targets and exact molecular mechanism of Isodon serra in treating inflammatory are still unclear. The purpose of this study was to use the method of network pharmacological analysis to find the active compounds in Isodon serra. These active compounds match the library of ent-kaurane diterpenoids compounds we established, and we find all the eligible ent-kaurane diterpenoids compounds. Isodon serra related and anti-inflammatory targets were found and then combined to get intersection, which represented potential anti-inflammatory targets of active compounds in Isodon serra. Moreover, anti-inflammatory targets and active compounds targets protein-protein interaction network were merged to get the protein-protein interaction network intersection and core genes in anti-inflammatory target protein-protein interaction network. For the anti-inflammatory targets of Isodon serra, Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analysis were executed to confirm gene functions of Isodon serra in antagonizing inflammation. Finally, TCMSP analysis identified 10 active compounds out of 48 ent-kaurane. The pathway analysis showed enrichment for different pathways like AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications, small cell lung cancer and human cytomegalovirus infection, which were all connected to inflammatory. On the whole, the proposed method clearly identified the ent-kaurane diterpenoids of Isodon serra and the results gave the active compounds of Isodon serra for the first time. The combining use of the qualitative analysis of traditional Chinese medicine (TCM) and network pharmacological methods could discover potential drug targets and reveal the biological process of TCM, which would open up a new approach in the study of TCM in future.     

基于网络药理学的荆芥挥发油主要成分抗炎机制研究

目的应用网络药理学方法研究荆芥挥发油抗炎的主要成分和分子机制。方法通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)和Swiss Target Prediction平台获得主要成分对应靶点,筛选活性成分,构建分子-靶点网络。进行蛋白质相互作用分析,靶点基因本体(GO)富集分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。应用Systems Dock分子对接,结合文献验证。结果荆芥挥发油13个主要成分对应45个靶点,IL-6、TNF、IL-1β、IL-10、PTGS2、PTGS1、CHRM1、CHRNA7为炎症靶点,作用于NF-κB、IL-17信号通路,通过药物反应、γ-氨基丁酸通路等生物过程,胞外配体门控离子通道活性、GABA-A受体结合等分子功能发挥作用,与酒精滥用、2型糖尿病、精神疾病、肠病、肺病等相关。分子对接得到8,9-去氢百里香酚、苯甲醛、石竹烯、葎草烯、D-吉玛烯、胡薄荷酮是重要成分,对CHRNA7、PTGS2和PTGS1作用明显。结论该方法初步揭示荆芥挥发油抗炎的有效成分及潜在靶点。     

基于“胃脘痈”与“炎-癌链”理论治疗慢性萎缩性胃炎的机制分析

目的探讨黄连-蒲公英药对治疗慢性萎缩性胃炎阻断“炎-癌链”的可能机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库获取黄连-蒲公英药对的主要活性成分,并用Uniprot数据库矫正靶点,利用人类基因数据库(Gene Cards)筛选慢性萎缩性胃炎的疾病靶点,采用Venny 2.1软件将药物靶点和疾病靶点取交集,获得黄连-蒲公英治疗慢性萎缩性胃炎的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制蛋白相互作用网络(PPI),使用DAVID 6.8数据库进行潜在基因的基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并绘制中药-成分-靶点-通路图。结果最终得到黄连-蒲公英药对有效成分17个,交集基因63个,最主要的有效成分为槲皮素、巴马汀、七叶亭、黄连素等,PPI网络图中度值较高的靶点有白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、细胞肿瘤抗原53(TP53)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素8(CXCL8)、转录因子AP-1(JUN)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、Caspase3、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK1)、基质金属蛋白酶(MMP)-9、IL-10。GO富集分析共430个生物学过程;KEGG通路图中与慢性萎缩性胃炎密切相关的有:癌症的途径、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、细胞凋亡、癌症中的蛋白多糖、核转录因子(NF)-κB信号通路。结论基于“胃脘痈”理论的黄连-蒲公英药对治疗慢性萎缩性胃炎是通过多成分、多靶点、多通路共同阻断“炎-癌链”的进程。     

基于网络药理学分析麻黄-苦杏仁、辛夷-苍耳子治疗儿童过敏性鼻炎哮喘综合征的作用机制

目的 基于网络药理学分析麻黄-苦杏仁、辛夷-苍耳子药对治疗儿童过敏性鼻炎哮喘综合征(CARAS)的多成分、多靶点、多途径作用机制.方法 结合文献报道,利用TCMSP数据库筛选出麻黄、苦杏仁、辛夷、苍耳子的化学成分和潜在靶标;利用GeneCards、OMIM数据库获取CARAS的疾病靶点;通过R软件获取药物-疾病交集靶基...     

生血宁片有效成分及其治疗肾性贫血的作用机制研究

目的 检测生血宁片主要化学成分,并预测其治疗肾性贫血的有效成分及潜在的作用机制。方法 根据甲醇提取液色谱质谱信息,并结合对照品的质谱碎片裂解规律和文献数据,对生血宁片化学成分进行鉴定;利用SwissTargetPrediction网站预测成分的作用靶点及GeneCards数据库收集肾性贫血相关靶点,获得交集靶点;通过String数据库构建蛋白相互作用网络及Metascape网站对交集靶点基因进行基因本体功能富集分析及KEGG通路富集分析,最后利用分子对接进一步分析。结果 通过UPLC-Q-TOF-MS技术共推测出生血宁片提取液中24个化学成分,其中9个为可能的活性成分,对应作用靶点363个;筛选出2 722个与肾性贫血相关的疾病靶点,疾病-药物交集靶点166个,涉及与肾性贫血相关的信号通路186条,通路主要与肿瘤、抗纤维化、炎症、氧反应等方面相关。分子对接结果显示,筛选的生血宁片活性成分西得罗、焦脱镁叶绿酸a、二甲基原卟啉IX二甲酯、31,32-二氢-脱镁叶绿酸盐a等与SRC、HSP90AA1、PIK3CA等潜在靶点之间结合力较强。结论 生血宁片可能通过补充铁元素、减轻炎症状态、抗纤维化等方面改善肾性贫血。     

基于网络药理学探索复方生地合剂治疗系统性红斑狼疮的作用机制

目的：利用网络药理学研究复方生地合剂治疗系统性红斑狼疮的关键靶标和潜在分子机制。方法：通过中国科学院化学数据库和文献搜索构建药材化合物成分数据库,以分子类药性DL、口服生物利用度OB、Lipinski规则和Veber规则筛选活性化合物,并以TCMSP和STITCH数据库预测活性成分靶点,GeneCards、TTD数据库获取系统性红斑狼疮相关靶点,两者相互映射得到复方生地合剂作用系统性红斑狼疮的交集靶点,STRING数据库构建蛋白质相互作用网络,DAVID数据库进行GO和KEGG分析,Cytoscape 3.7.1软件构建成分-靶点-通路网络,分析主要通路。结果：经筛选共获得复方生地合剂20个活性成分,对应285个靶点,46个为交集靶点,复方生地合剂的潜在活性成分为槲皮素、木犀草素等12个化合物,治疗关键靶点有肿瘤坏死因子、白介素6、白介素2等,主要作用于6条通路。结论：复方生地合剂可能通过细胞因子-细胞因子受体相互作用、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等途径和基因表达、炎症反应、RNA聚合酶II启动子转录的正调控等生物过程发挥作用。     

基于网络药理学探讨二白膏治疗慢性湿疹的作用机制

目的 基于网络药理学技术探索二白膏治疗慢性湿疹的分子机制。方法 2022年1―5月通过TCMSP数据库及《中国药典（2015版）》筛选二白膏主要活性成分并通过SwissTargetPrediction网站进行靶点预测;同时从OMIM数据库、GeneCards数据库筛选慢性湿疹的相关靶点;成分靶点与疾病靶点映射后使用String网站及Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,并采用分子对接技术对潜在活性成分与关键靶点进行匹配;通过DAVID网站进行GO与KEGG分析;Cytoscape3.9.1软件构建药材-成分-靶点-通路网络图。结果 从二白膏中筛选出17个活性成分和97个潜在靶点,其中15个核心靶点18条通路与其治疗慢性湿疹有密切关系。结论 二白膏治疗慢性湿疹具有生物学支撑。不同的蛋白存在协同作用,其中AKT1、SRC和EGFR等靶点起着关键作用。生物过程主要涉及细胞因子受体结合、炎症反应、免疫反应等,并主要富集在PI3K-Akt、JAK-STAT信号通路上,发挥抗炎、抗氧化、调控细胞增殖和凋亡、修复皮肤屏障等作用。     

基于网络药理学的金振口服液干预新冠肺炎的机制研究

目的 探讨金振口服液治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的分子靶点及可能机制。方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选金振口服液潜在的入血活性成分与靶点。通过GeneCard数据库检索COVID-19相关的靶点。利用String构建公共靶点的蛋白互作网络。利用Bioconductor数据库进行GO与KEGG富集分析。结果 根据口服生物利用度和药物相似性筛选出141种有效成分。从GeneCard数据库中获得350个与COVID-19直接相关的靶基因,从组分靶点与疾病靶点PPI网络的交叉点获得47个基因。这些基因主要参与细胞内脂多糖反应、氧化应激反应等生物学过程。分子功能主要与细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性等有关。活性物质主要作用于IL-17信号通路、TNF信号通路、甲型流感等信号通路。结论 金振口服液中的化合物可能通过抗病毒、抗炎对新冠病毒导致的感染、炎症以及肺损伤疾病具有潜在的治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接分析薤白治疗心肌缺血再灌注损伤的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨薤白治疗心肌缺血再灌注损伤的作用机制。方法：在中药系统药理学分析平台（TCMSP）上检索和筛选薤白的活性成分、作用靶点;利用OMIM数据库和CTD数据库搜集疾病靶点;找出薤白作用靶点和疾病靶点共有交集靶点,分子对接软件SYBYL验证薤白活性成分与交集靶点结合活性。然后利用String数据库和Cytoscape软件绘制靶点蛋白互作网络,利用DAVID数据库对靶点进行信号通路富集分析,利用Cytoscape软件构建薤白活性成分-靶点-信号通路网络。结果：筛选获得薤白活性成分10个,治疗疾病作用靶点19个。蛋白互作分析结果显示,17个靶点蛋白存在相互作用关系,IL6、TNF、NOS3、CCL2、VEGFA、SOD1、CAT与10个及以上蛋白存在互作关系。信号通路富集结果显示,上述靶点主要与流体剪切应力与动脉粥样硬化、过氧化物酶体、HIF-1信号通路、松弛素信号通路、细胞因子-细胞因子-受体相互作用、IL-17信号通路以及肿瘤坏死因子信号通路等23条信号通路有关。结论：薤白通过多成分、多靶点、多途径治疗心肌缺血再灌注损伤,其作用机制主要通过调控流体剪切应力、氧化应激及炎性反应来发挥作用。     

Multi-target mechanism of triphala in cardio-cerebral vascular diseases based on network pharmacology

OBJECTIVE Numerous references made clear that triphala is revered as a multiuse therapeutic and perhaps even panacea historically. Nevertheless, the protective mechanism of triphala on cardio-cerebral vascular diseases(CCVDs) remains not comprehensive understanding. Hence, a network pharmacology-based method was suggested in this study to address this problem. METHODS This study was based on network pharmacology and bioinformatics analysis.Information on compounds in herbal medicines of triphala formula was acquired from public databases. Oral bioavailability as well as drug-likeness were screened by using absorption, distribution, metabolism, and excretion(ADME) criteria.Then, components of triphala, candidate targets of each component and known therapeutic targets of CCVDs were collected.Compound-target gene and compounds-CCVDs target networks were created through network pharmacology data sources. In addition, key targets and pathway enrichment were analyzed by STRING database and DAVID database.Moreover, we verified three of the key targets(PTGS2, MMP9 and IL-6) predicted by using Western blotting analysis.RESULTS Network analysis determined 132 compounds in three herbal medicines that were subjected to ADME screening, and 23 compounds as well as 65 genes formed the principal pathways linked to CCVDs. And 10 compounds,which actually linked to more than three genes, are determined as crucial chemicals. Core genes in this network were IL-6,TNF, VEGFA, PTGS2, CXCL8, TP53, CCL2, IL~(-1)0, MMP9 and SERPINE1. And pathways in cancer, TNF signaling pathway, neuroactive ligand-receptor interaction, etc. related to CCVDs were identified. In vitro experiments, the results indicated that compared with the control group(no treatment), PTGS2, MMP9 and IL-6 were up-regulated by treatment of10 μg·L~(-1) TNF-α, while pretreatment with 20-80 mg·L~(-1) triphala could significantly inhibit the expression of PTGS2,MMP9 and IL-6. With increasing Triphala concentration, the expression of PTGS2, MMP9 and IL-6 decreased. CONCLUSION Complex components and pharmacological mechanism of triphala, and obtained some potential therapeutic targets of CCVDs, which could provide theoretical basis for the research and development of new drugs for treating CCVDs.     

Macrolide antibiotics broadly and distinctively inhibit cytokine and chemokine production by COPD sputum cells in vitro

Macrolide antibiotics are known to exert anti-inflammatory actions in vivo, including certain effects in COPD patients. In order to investigate the immunomodulatory profile of activity of macrolide antibiotics, we have studied the effects of azithromycin, clarithromycin, erythromycin and roxithromycin on the in vitro production of a panel of inflammatory mediators from cells isolated from human, steroid-naïve, COPD sputum samples. Macrolide effects were compared to three other commonly used anti-inflammatory compounds, the corticosteroid dexamethasone, the PDE4 inhibitor, roflumilast and the p38 kinase inhibitor, SB203580. Three of the four tested macrolides, azithromycin, clarithromycin and roxithromycin, exhibited pronounced, concentration-related reduction of IL-1β, IL-6, IL-10, TNF-α, CCL3, CCL5, CCL20, CCL22, CXCL1, CXCL5, and G-CSF release. Further slight inhibitory effects on IL-1α, CXCL8, GM-CSF, and PAI-1 production were also observed. Erythromycin was very weakly active. Qualitatively and quantitatively, macrolides exerted distinctive and, compared to other tested classes of compounds, more pronounced immunomodulatory effects, particularly in terms of chemokine (CCL3, CCL5, CCL20, CCL22, and CXCL5), IL-1β, G-CSF and PAI-1 release. The described modulation of inflammatory mediators could potentially contribute to further definition of biomarkers of macrolide anti-inflammatory activity in COPD.     

基于网络药理学探讨蒙药苏龙嘎-4颗粒抗腹泻的作用机制

目的 运用网络药理学探讨苏龙嘎-4颗粒的多成分、多靶点、多途径的抗腹泻作用机制。方法 通过TCMSP平台、BATMAN-TCM数据库及文献检索收集苏龙嘎-4颗粒中4味中药的全部化学成分和作用靶点，同时利用GeneCards数据库和OMIM数据库获取腹泻的已知治疗靶点。构建韦恩图，得到苏龙嘎-4颗粒抗腹泻的作用靶点。采用Cytoscape 3.7.1软件，将活性成分与潜在靶点构建“药物-成分-靶点”网络；通过String 10.0数据库建立PPI网络，并获得核心靶点。采用R软件对交集基因进行GO功能分析和KEGG通路分析。结果 根据数据库检索，结合所制定的筛选标准，得到苏龙嘎-4颗粒34个活性成分和110个靶点，其中74个靶点为苏龙嘎-4颗粒抗腹泻的潜在靶点。GO生物学过程分析得出87个条目，KEGG通路分析得出117条通路，主要涉及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、p53信号通路、凋亡通路等。推测苏龙嘎-4颗粒可能通过抗炎、影响细胞凋亡、修复肠粘膜损伤而起到抗腹泻的作用。结论 苏龙嘎-4颗粒的活性成分主要通过CASP-3、EGFR、IL-6、VEGFA、MAPK8等靶点抑制炎症因子的产生阻断炎症反应、影响细胞凋亡的同时对肠粘膜损伤的进行修复，最终发挥抗腹泻的作用。     

基于网络药理学、分子对接和生物信息学对中药复方抑制COVID-19“细胞因子风暴”分子机制的探索与验证

目的： 以确定临床疗效的6种推荐中药复方为研究对象,探索中药治疗COVID-19的分子机制和物质基础。方法： 利用TCMSP、IMMPORT、OMIM等数据库获得治疗COVID-19的免疫靶点。Cytoscape3.4.0用于构建"免疫靶点-中药-化合物-疾病"网络以及网络拓扑学分析,随后进行PPI、GO功能和KEGG通路富集分析。AutoDock Vina用于分子对接。SsGSEA利用转录组和microarray数据计算免疫细胞浸润程度。结果： 对"免疫靶点-中药-化合物-疾病"网络进行拓扑学分析,本研究发现28种COVID-19免疫靶点高度关联化合物,对其进行分子对接发现豆甾醇、靛玉红、黄芩素等与血管紧张素转化酶Ⅱ（ACE2,angiotensin converting enzyme Ⅱ）以及新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶具有较好的结合活性。6种复方均通过TNF、IL-17等信号通路发挥抗炎、调节细胞因子活性。IL-6是6种复方抗COVID-19的共同核心免疫靶标。肺组织表达谱生物信息学分析证实IL-6的表达与活化CD8+T细胞、调节T细胞等免疫细胞的浸润高度有关,是免疫反应的关键分子。结论： 中药复方的活性化合物豆甾醇、靛玉红、黄芩素等作用于IL-6、IL-10、IL-1B等免疫靶点调节TNF、IL-17等多条信号通路,从而发挥抑制COVID-19"细胞因子风暴"的作用。     

基于网络药理学探讨调神攻坚汤治疗肝纤维化的作用机制

目的 基于网络药理学研究方法探讨调神攻坚汤治疗肝纤维化的作用机制。方法 检索 TCMSP 和BATMAN-TCM数据库得到调神攻坚汤的有效活性成分及其相关作用靶点；并与检索OMIM和Genecards数据库得到的肝纤维化疾病作用靶点利用R语言筛选共同靶点；通过STRING数据库构建靶点间的蛋白互作PPI网络，随后利用Metascape平台进行GO功能和KEGG通路富集分析；利用 Cytoscape 3.7.2软件构建“中药-活性成分-疾病”靶点网络图，并经Cytohubba插件的MCC算法筛选出核心蛋白；再将其导入Genecards数据库中获得亚细胞分布。结果 通过筛选共计获得调神攻坚汤有效活性成分166个，作用靶点596个；经匹配后此方剂治疗肝纤维化的潜在靶点为193个；其中核心包括FN1、MMP2、TNF、IL-6、STAT3、CTNNB1等；GO以及KEGG分析显示调神攻坚汤可能通过调控炎症反应、脂质代谢、细胞凋亡等生物学过程治疗肝纤维化，并且涉及HIF-1、Foxo、PPAR等细胞信号转导通路。结论 通过网络药理学方法初步验证调神攻坚汤治疗肝纤维化是一个“多组分-多靶点-多通路”的过程，并预测其潜在作用机制，为后续临床及基础研究提供理论依据。     

Mechanism of regulating immune dysfunction of sepsis based on network pharmacology and experimental verification北大核心CSCD

目的验证升降散在脓毒症中的作用并探讨其分子机制。方法通过TCMSP、Disgenet等数据库搜索药物活性成分作用靶点与疾病相关靶点,并将二者取交集。采用DAVID数据库对交集靶点进行GO、KEGG通路富集分析,将药物活性成分与关键通路的核心基因进行分子对接。采用盲肠结扎穿刺(cecal ligation puncture,CLP)构建脓毒症小鼠模型,收集小鼠脾脏组织与血清,采用流式细胞术检测脾脏中不同T细胞亚群百分比,采用ELISA检测血清中IL-6、IL-10水平。结果网络药理学分析搜索获得升降散活性成分25个,活性成分作用靶点238个,疾病相关靶点2797个,活性成分与疾病相关靶点交集基因有90个,潜在靶标为AKT、JUN、EGFR、MMP9等;GO功能富集分析,得到条目数1021条,其中生物过程942条,细胞组成23条,分子功能55条。KEGG通路分析发现交集基因主要富集在PD-1/PD-L1信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、炎症介质信号通路等,表明其治疗效果可能和这些通路有关。分子对接结果显示,槲皮素、山奈酚、大黄素等核心化合物与关键基因都能较好的结合。流式细胞术结果显示,CLP 7 d后小鼠脾脏CD4^(+)T细胞比例减少,CD4^(+)PD-1^(+)T细胞比例增加,IL-6释放减少,IL-10含量增加,小鼠呈免疫抑制状态。给予升降散灌胃治疗后小鼠脾脏CD4^(+)T细胞百分比增加,CD4^(+)PD-1^(+)T细胞数量减少,IL-6释放增强,IL-10含量降低,小鼠免疫抑制得以改善。结论升降散能增加脓毒症晚期促炎症细胞因子IL-6释放,提高CD4^(+)T/CD8^(+)T细胞比值,降低抗炎性细胞因子IL-10表达,以改善脓毒症晚期免疫抑制,提高小鼠生存率。     

基于网络药理学的“柴胡-黄芩”药对干预足细胞病变作用机制探索

目的:预测辛通畅络法载体——复方肾苏Ⅱ之君药“柴胡-黄芩”药对干预足细胞病变的可能作用靶点与机制,为辛通畅络法防治足细胞病变序贯临床和基础研究的开展提供参考。方法:基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库,检索柴胡、黄芩化学成分及其对应靶点蛋白,借助Cytoscape 3.2.1软件绘制“中药-成分-靶点”网络图。在OMIM数据库、DrugBank数据库及DigSee在线文本中检索足细胞病变相关靶点,利用Venny 2.1.0在线作图工具获取其与“柴胡-黄芩”作用靶点的交集基因。分别应用STRING数据库及Cytoscape 3.2.1软件的“CytoNCA”插件构建交集基因蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络图并进行拓扑学分析,获取核心预测靶点。借助DAVID数据库对交集基因进行基因本体(GO)功能注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集,并通过OmicShare Tools在线作图平台实现富集结果的可视化。结果:基于TCMSP数据库检索结果,获得有对应靶点的活性成分44种,其中柴胡13种、黄芩32种,豆甾醇为两者共有成分;潜在作用靶点较多的化合物为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素等;节点度值较高靶点蛋白为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、PTGS1、核受体共激活因子2、热休克蛋白90α等,分别与37、30、25、25个活性成分相关联。获取“柴胡-黄芩”作用靶点与足细胞病变相关靶点交集基因20个,包括PTGS2、VEGFA、MMP9、TNF、IL6等。上述交集基因的PPI网络图共包含节点20个、连线110条,MMP9、VEGFA、IL6等基因处于核心位置。GO分析结果显示,共获得生物信息条目154个(P<0.05),包括生物过程条目139个、细胞组成条目8个、分子功能条目7个。其中,生物过程主要涉及一氧化氮生物合成过程的正调控、炎症反应、免疫反应等,细胞组成主要涉及细胞外间隙、胞外区、质膜外侧等,分子功能主要涉及蛋白质结合、细胞因子活性、生长因子活性等。同时,获得KEGG通路富集条目47个(P<0.05),主要涉及细胞因子-细胞因子受体相互作用、类风湿关节炎、疟疾、癌症信号通路等相关信号转导途径。结论:复方肾苏Ⅱ之“柴胡-黄芩”药对活性成分可能通过细胞因子-细胞因子受体相互作用、类风湿关节炎、疟疾、癌症信号通路等相关信号转导途径作用于MMP9、VEGFA、IL6、TNF等靶点,从而发挥对足细胞病变的干预作用。     

基于网络药理学对降脂护肝胶囊干预脂肪肝的机制研究

目的 应用网络药理学方法,探讨降脂护肝胶囊（JZHG）治疗脂肪肝（FL）的可能机制,为其临床用药提供理论指导。方法 利用TCMSP与TCMID检索JZHG的活性成分和靶点,通过GeneCard与OMIM数据库检索FL的相关靶点,并采用交集法筛选出二者的共同靶点,运用Cytoscape构建“活性成分-靶点”网络,利用STRING软件构建PPI网络。通过 Bioconductor 数据库以及R软件进行GO和KEGG富集分析。结果 根据口服生物利用度和类药性筛选出46种活性成分,从GeneCard与OMIM数据库中筛选靶点7406个。成分靶点与疾病靶点取交集,获得118个共同靶点。这些靶点主要参与氧化应激、细胞凋亡、炎症反应、激素抵抗等生物学过程。其作用机制与PI3K-Akt信号通路,人巨细胞病毒感染和癌症中的微小RNA等信号通路有关。结论 JZHG中的活性化合物干预脂肪肝的机制可能是通过抗氧化应激和抗炎等作用改善脂代谢,降低肝脏脂肪堆积实现的。     

Agents against cytokine synthesis or receptors

Various cytokines play a critical role in pathophysiology of chronic inflammatory lung diseases including asthma and chronic obstructive pulmonary disease (COPD). The increasing evidence of the involvement of these cytokines in the development of airway inflammation raises the possibility that these cytokines may become the novel promising therapeutic targets. Studies concerning the inhibition of interleukin (IL)-4 have been discontinued despite promising early results in asthma. Although blocking antibody against IL-5 markedly reduces the infiltration of eosinophils in peripheral blood and airway, it does not seem to be effective in symptomatic asthma, while blocking IL-13 might be more effective. On the contrary, anti-inflammatory cytokines themselves such as IL-10, IL-12, IL-18, IL-23 and interferon-gamma may have a therapeutic potential. Inhibition of TNF-alpha may also be useful in severe asthma or COPD. Many chemokines are also involved in the inflammatory response of asthma and COPD through the recruitment of inflammatory cells. Several small molecule inhibitors of chemokine receptors are now in development for the treatment of asthma and COPD. Antibodies that block IL-8 reduce neutrophilic inflammation. Chemokine CC3 receptor antagonists, which block eosinophil chemotaxis, are now in clinical development for asthma therapy. As many cytokines are involved in the pathophysiology of inflammatory lung diseases, inhibitory agents of the synthesis of multiple cytokines may be more useful tools. Several such agents are now in clinical development.     

基于网络药理学及分子对接验证探讨退热解毒灵清热抗炎机制

目的：运用网络药理学的方法来筛选退热解毒灵清热抗炎的作用靶点,并且探讨其作用机制。方法：使用TCMSP数据库查询到板蓝根、柴胡、连翘、甘草的主要化学成分以及作用靶点,根据ADME筛选出祛白颗粒的活性成分并且搜集其靶点,通过Genecards、OMIM、TTD、DRUGBANK、DisGeNET数据库搜集相关疾病靶点,使用STRING构建蛋白质间的相互作用网络,接着利用Metascape进行GO功能富集分析和KEGG通路分析,最后利用Cytoscape构建成分-靶点-通路网络。最后进行分子对接验证。结果：退热解毒灵清热抗炎的主要成分有67种,核心靶点有65种,包括PTGS2,HSP90AA1,NOS2,CAMKK2,PTGS1等。GO和KEGG富集结果显示,退热解毒灵清热抗炎的生物学通路主要有神经活性配体—受体相互作用、胆碱能突触、人类巨细胞病毒感染、IL-17信号通路等等。结论：本研究初步揭示了退热解毒灵清热抗炎的多成分、多靶点、多通路的作用机制,为退热解毒灵在临床上的进一步应用提供理论基础。