山西汉族Y-STR基因座DYS510遗传多态性调查

目的调查Y染色体上的短串联重复序列DYS510基因座在山西汉族人群中的基因频率分布、多态性及群体分布情况,为法医学个体识别及亲子鉴定提供计算数据,对其在法医学上的应用进行可行性探讨。方法随机抽取102名山西汉族男性和20名女性无关个体静脉血500μL,用基因组数据库(GDB)中的引物进行聚合酶链反应(PCR)扩增,银染显色,对其选取的等位基因测序,构建等位基因分型标准物;按照ISFG原则命名各等位基因。结果102名山西汉族人群DYS510基因座共检出7种不同的等位基因,分别为DYS510*14(0.0194)、DYS510*15(0.0485)、DYS510*16(0.0291)、DYS510*17(0.3204)、DYS510*18(0.4175)、DYS510*19(0.1456)、DYS510*20(0.0194),基因多样性为0.7047,其个人识别能力(DP)和非父排出率(PE)均为0.6139。结论DYS510基因座具有较高的遗传多态性,在法医学及人类遗传学方面具有较高应用价值。     

新Y染色体DYS726在山西汉族人群中遗传多态性

目的对新的DYS726基因座的基因多态性和法医学意义进行研究。方法山西汉族人群盅随机筛选110名男性,提取静脉血DNA,用基因数据库(GDB)中的引物进行聚合酶链反应(PCR)扩增,银染显色。对其筛选的等位基因测序,构建等位基因分型标准物;按照国际法医学会(ISFG)原则命名各等位基因。结果首次选择了Y染色体基因座DYS726,该基因座为4核苷酸简单重复STR。重复单位为CTTC。在110名山西汉族男性个体血样中共检出了4个等位基因。基因频率分别为11-0.0273;12-0.5455;13-0.1818;14-0.2455。基因多样性为0.6139,在法医学应用方面,其个人识别能力(DP)和非父排出率(PE)均为0.6139。结论新Y染色体基因座DYS726具有较高的遗传多态性,在法医学及人类遗传学方面具有较高应用价值。     

新Y染色体DYS718在山西汉族人群中遗传多态性调查

目的:探讨新Y染色体DYS718基因座在山西汉族群体中遗传多态性的应用价值。方法:在Y染色体基因组DNA中查找候选的基因座,用GenBank中的引物序列进行PCR扩增,再用银染方法显带。对其筛选的等位基因测序,构建等位基因分型标准物;按照ISFG原则命名各等位基因。结果:本研究选择了Y染色体基因座DYS718。在116例山西汉族无关男性个体血样中共检出了4个等位基因。其基因多样性为0.6782,在法医学应用方面,其个人识别能力(DP)和非父排出率(PE)均为0.6782。结论:新Y染色体基因座DYS718具有较高的遗传多态性,在法医学及人类遗传学方面具有应用价值。     

X染色体STR基因座在法医鉴定中的应用

目的通过探讨太原地区汉族人群位于X染色体上的短串联重复序列DXS6804的遗传多态性,分析X染色体STR基因座在法医鉴定中的利与弊,以促进X染色体STR基因座在法医学实践中的应用。方法随机抽取太原无血缘关系汉族个体静脉血500μL,采集50例两代家系血进行突变观察;采集同一例健康男性尸体的心脏、肝脏、肌肉组织等进行同一性测定。乙二胺四乙酸抗凝,酚-氯仿法提取DNA,聚合酶链反应扩增,8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分型。基因座的等位基因频率采用直接计算法,与其他人群比较采用χ2检验。结果共检出5种不同的等位基因,基因多样性为0.7024。与不同地区及不同民族的等位基因频率分布进行了比较均有明显的差异。同一尸体血液,器官组织检测结果分型一致。50例两代家系观察未见突变。结论DXS6804基因座在太原地区汉族人群中有较好的多态性,X染色体STR基因座在法医鉴定中具有重要价值。     

山西汉族Y-STR基因座DYS552遗传多态性调查

目的:调查Y染色体上的短串联重复序列DYS552基因座在山西汉族男性人群中的基因频率分布、多态性及群体分布情况,为法医学个体识别及亲子鉴定提供计算数据,对其在法医学上的应用进行可行性探讨.方法:随机抽取102例山西汉族男性无关个体静脉血500μL,用GDB中的引物进行PCR扩增,银染显色,对其选取的等位基因测序,构建等位基因分型标准物;按照ISFG原则命名各等位基因.结果:102例山西汉族人群DYS552基因座共检出7种不同的等位基因,分别为DYS552×23(0.0194)、DYS552×24(0.1105)、DYS552×25(0.3981)、DYS552×26(0.2427)、DYS552×27(0.1262)、DYS552×28(0.0874)、DYS552×29(0.0097),基因多样性为0.7523.其个人识别能力(DP)和非父排出率(PE)均为0.7523.结论:DYS552基因座具有较高的遗传多态性.在法医学及人类遗传学方面具有较高应用价值.     

福建汉族人群6个Y染色体STR基因座遗传多态性研究

目的对福建汉族人群中DYS393、DYS19、DYA389Ⅱ、DY$390、DYS391、DYS385等6个Y-STR基因座的等位基因及单倍型的分布进行调查。方法采用多重PCR和四色荧光自动化检测技术对212例无血缘关系的福建汉族个体6个Y-STR基因座进行检测。结果DYS393、DYS19、DYA389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS385基因座分别有6、5、6、4、4、38个等位基因或等位基因组，基因多样性（GD）分别为0．6131、0．6913、0．7381、0．6459、0．3829、0．9570，共发现153种单倍型，单倍型多样性（HD）为0．9921。结论6个Y-STR基因座在福建省汉族人群中均具有较高的遗传多态性，可应用于法医学个体识别和亲子鉴定。     

常染色体及Y染色体STR在兄弟鉴定中的应用

目的研究常染色体及Y染色体STR分型技术在兄弟鉴定中的应用价值。方法采用13个常染色体和6个Y-STR基因座分别检测40对兄弟和40对无关个体,ITO法计算常染色体STR基因座的兄弟关系指数(PIFS)和兄弟关系概率(WFS),分析常染色体等位基因匹配情况及Y染色体基因座相符情况,预测判断界值。结果经χ2检验,兄弟组和无关个体组间常染色体STR基因型全相同与全不同的基因座数存在显著性差异(P<0.001),半相同的基因座数无显著差异(P>0.05)。兄弟组6个Y-STR基因座分型结果均一致,无关个体组分别为2～6个不等的Y-STR基因座不匹配。结论常染色体及Y-STR基因座分型技术在兄弟鉴定中具有一定的鉴定价值,筛选更多、更佳的常染色体及Y-STR基因座对兄弟鉴定的准确性具有重要意义。     

武汉地区汉族人群ALDH2基因多态性的分布研究

目的研究湖北武汉地区汉族人群中的乙醛脱氢酶2(ALDH2)*2等位基因及基因型的频率分布特征。方法利用基因芯片杂交技术检测样本基因型,对465名(262名男性,203名女性)湖北武汉地区汉族人群进行ALDH2*2基因多态性分析,将结果与文献报道的其他地区及不同民族进行比较,并比较本地区不同性别间基因多态性的差异。结果 465名武汉地区汉族人群中ALDH2*1和*2等位基因频率分别为80.22%和19.78%;湖北武汉地区汉族人群ALDH2基因型与洛阳、青岛、上海等城市地区的人群间差异无统计学意义(P> 0.05);不同民族间ALDH2等位基因和基因型各不相同,武汉地区汉族人群与壮族、维族、朝鲜族和鄂伦春族地区人群的差异具有统计学意义(P <0.05),与藏族、回族、蒙族和白族地区人群的差异无统计学意义(P> 0.05);不同国家之间比较,中国人群ALDH2等位基因及基因型频率与日本、印度、土耳其和美国人群的差异具有统计学意义(P <0.05);不同性别比较,男性与女性ALDH2等位基因与基因表型间差异无统计学意义(P> 0.05)。结论 ALDH2*2基因多态性分布在不同民族和国家之间差异具有统计学意义,而在不同地区和不同性别之间差异不具有统计学意义。     

武汉汉族人群DYS446基因座的遗传多态性

为研究 Y染色体上 DYS44 6基因座多态性 ,应用 PCR扩增 DYS44 6基因座、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染的方法检测了 10 7份汉族男性无关个体血样本、10份女性血样本和 2例已确认亲子关系的父子血样本。结果显示 ,10 7例男性血样本有相应的PCR产物 ,共检测到 8个等位基因 ,GD值为 0 .764 9;在 10例女性中 ,无相应的 PCR产物 ;2例已确认父子关系的基因型一致。提示DYS44 6基因座是个人识别和亲子鉴定的较好遗传标记。     

DYS593在山西汉族人群中的多态性分布

自1999年以来基因组计划的实施,大量Y染色体STR基因座得以发现,但由于Y染色体为单倍体遗传,多态性远较长染色体基因座低,因此需要寻找更多具有多态性Y—STR以满足研究的需要。DYS593在GeneBank中序列号为11503746,其多态性尚无报道。本文利用基因库（www．gdb．org）中的引物序列,建立适当的扩增条件,调查该基因座在山西汉族人群的频率分布。     

汉族人群微卫星DXS16遗传多态性

目的获得X染色体短串联重复序列DXS16遗传多态性在河南汉族人群中的分布状况。方法应用聚合酶链反应，变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（polyacrylamide gel ectrophoresis，PAGE）及银染色技术对110名无血缘关系的汉族个体DXS16基因座进行分型。结果观察到DXS16位点有14个等位基因片段，该STR位点的基因型分布符合Hardy—Weinberg平衡；杂合度为0．88，多态信息含量为0．885。结论DXS16在汉族人群中有较好的多态性分布；实验数据对X染色体特异性STR的群体遗传学研究及一些X连锁遗传病的基因诊断有重要意义。     

2个Y-STR基因座的单倍型研究

目的研究DYS716,DYS7212个Y-STR基因座在山西汉族人群中的多态性,获得其基因频率和单倍型频率,探讨其法医学应用的可行性。方法DNA来自114名山西汉族健康男性血液,进行聚合酶链反应(PCR)扩增,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)分型,银染显带后保存。按照ISFG原则命名等位基因。结果研究发现山西地区114名汉族男性DYS716,DYS721分别有5个等位基因。其等位基因频率分别是DYS716:15-0.0263,16-0.1754,17-0.5263,18-0.2456,19-0.0263;DYS721:9-0.0526,10-0.5351,11-0.2193,12-0.1842,13-0.009;DP值分别为0.6361,0.6344。在114名个体里共发现了17个单倍型,其DP值是0.8810。20名女性对照无扩增产物。     

天津汉族群体D21S11、D21S1440和Penta D STR基因座遗传多态性的研究

目的:研究天津汉族群体21号染色体上D21S11、D21S1440和Penta D 3个短串联重复序列(STR)基因座遗传多态性,为唐氏综合征(DS)基因诊断和产前基因诊断提供实验依据.方法:收集天津无亲缘关系的汉族个体332例,定量荧光PCR(QF-PCR)扩增STR基因座,ABI PRISM 377测序仪检测PCR扩增产物.根据3个STR基因座的基因型分布进行Hardy-Weinberg平衡检验.计算3个STR基因座的基因型频率、观察杂合度(Ho)、多态信息量(PIC)、个体识别率(DP)、非父排除率(PE)等群体遗传学数据.结果:D21S11、D21S1440和Penta D 3个STR基因座分别检出6、4、8个等位基因,基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律.3个基因座的Ho分别为0.617、0.705、0.867,PIC分别为0.755、0.596、0.795,DP分别为0.916、0.794、0.931,PE分别为0.312、0.436、0.730.结论:D21S11、D21S1440和Penta D STR基因座在天津汉族群体杂合度高,是21号染色体良好的遗传标记,对DS的基因诊断有指导意义.     

福建畲族人群15个短串联重复序列的遗传多态性及法医学应用

目的对福建畲族群体15个短串联重复序列等位基因遗传多态性进行分析,探讨其种族特异性及其在法医学个体识别和亲权鉴定的中的应用。方法荧光标记15个短串联重复序列(STR)位点和一个性别位点并进行PCR复合扩增,用ABI遗传分析仪以毛细管电泳技术对100例福建畲族无血缘关系健康个体PCR产物进行电泳分离基因,并以分析软件进行基因分型。结果共检出126个等位基因,基因频率范围在0.0050～0.5550。15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。15个STR位点的HET在0.6300～0.8900之间,DP在0.7680～0.9590之间,EPP在0.3280～0.7750之间,PIC在0.5200～0.8600之间。累积DP和EPP分别达到0.99999999和0.99999288。结论15个STR位点均有较高的遗传多态性,并有丰富的信息含量,适合作为福建畲族地区的遗传标记,可用于个体识别和亲权鉴定。     

江苏汉族群体15个STR基因座遗传多态性分析

目的分析15个短串联重复序列(STR)基因座在江苏汉族群体中的基因多态性和基因频率。方法取2010年-2011年来自江苏省的1000例无血缘关系的汉族个体。用Sinofiler 16荧光标记复合扩增系统15个STR位点进行扩增,自动基因分析仪片段分析并进行基因分型。结果累积STR等位基因共发现211个,其中罕见等位基因36个。基因型频率超过0.1的基因座型22个,其中D3S1358基因座的15/16等位基因型频率最高达到0.2225。杂合度达到了0.802±0.051,随机个体相同表型偶合率值为0.068±0.031,多态信息总量值为0.778±0.060,个体识别能力和非父排除率值分别为0.932±0.032和0.607±0.091。FGA、D12S391基因座在发生24次突变的11个基因座中有较高的突变率。结论通过大量的样本实验和等位基因频率总结,得到了江苏人群更多法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性的客观数据。     

短串联重复序列VWA在太原汉族人群的法医应用研究

目的　获得短串联重复序列 VWA(nt16 40 - 1794)在太原汉族人群的群体遗传学数据 ,探讨其在法医学中的应用。方法　用 TKM法对 2 14名太原地区无关汉族人群抽提血液 DNA。扩增特异性片段 ,含 7m ol/ L 尿素的聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳 ,银染显色分析其多态性。结果　该位点频率分布符合 H- W平衡定律。共检出 8个等位基因 ,长度在 134 - 16 2 bp之间 ,频率分布 ,VWA* 13- 0 .0 0 7;VWA* 14- 0 .194;VWA* 15 - 0 .0 2 8;VWA* 16 -0 .173;VWA * 17- 0 .2 78;VWA * 18- 0 .140 ;VWA * 19- 0 .10 3;VWA * 2 0 - 0 .0 14。个体识别率 :0 .932 ,杂合度0 .82 1,多态信息含量 0 .814,非父排除率 0 .6 0 3。本文调查的频率同大部分欧洲人及美国黑人分布差异有显著性。同其他中国人差异无显著性。结论　 VWA基因座在太原汉族人群中有较高的杂合度、个体识别率及非父排除率 ,是高识别能力遗传标记 ,在法医学和群体遗传学有很高的应用价值。     

Chromosome 11 loss from thymic lymphomas induced in heterozygous Trp53 mice by phenolphthalein.

C57BL/6 p53 (+/-) N5 mice heterozygous for a null p53 allele were given phenolphthalein to learn more about mechanisms of carcinogenesis and to evaluate the p53-deficient mouse as a tool for identifying potential human carcinogens. DNA samples isolated from 10 phenolphthalein-induced thymic lymphomas were analyzed for loss of heterozygosity (LOH) at the Trp53 locus and simple sequence length polymorphic (SSLP) loci. The initial screening revealed remarkable results from only chromosome 11. Allelotyping at approximately five centiMorgan intervals, we found SSLP heterozygosity for C57BL/6 and 129Sv over much of chromosome 11. In the tumors, treatment-related LOH was apparent on chromosome 11 at each of the 28 informative loci examined. The strain-specific polymorphism lost from individual tumors allowed us to deduce the distribution of alleles along the length of the maternal and paternal chromosomes 11. The allelic patterns indicate that mitotic homologous recombination occurred during embryogenesis if breeding protocols were carried out as described. The mitotic recombination observed may be attributable to p53 haploinsufficiency for normal suppression of mitotic recombination.     

中国汉族人群遗传性聋基因座位STR位点的遗传多态性研究

目的 研究中国汉族人群10个遗传性聋基因座位的短串连重复序列(STR)的遗传多态性。方法 应用PCR方法对10个位点进行扩增，变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，记录基因型。采用PPAP软件计算正常人各STR位点等位片段频率、基因型频率、预期基因型频率、多态信息量(PIC)和Hardy-Weinberg平衡吻合性检验。结果 中国汉族人群D6S287、D8S1132、D13S1275、D15S130、D1S2726、D4S3038、D2S2380、D22S282、D14S1042、D7S529各位点分别检出10个、9个、8个、7个、7个、7个、6个、6个、6个及5个等位片段，多态性分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。各位点PIC值分别为0．879、0．854、0．864、0．821、0．686、0．794、0．764、0．732、0．773、0．712；杂合度均高于0．7。结论 中国汉族人群10个位点STR均具有较高的杂合度和多态信息量，是较理想的遗传标记。