南京地区儿童人偏肺病毒感染的流行病学及临床特征分析

目的了解南京地区儿童人偏肺病毒（hMPV）感染的流行病学特点及临床特征。方法收集2009年8月至2010年7月南京医科大学附属南京儿童医院住院及门诊呼吸道感染患儿的鼻咽抽吸物（NPA）及咽拭子（NPS）共642例,采用逆转录聚合酶链反应法（RT—PCR）检测hMPVM基因,将阳性PCR扩增产物进行测序、同源性和进化分析。结果642例标本中共检出hMPV阳性扩增产物35份,检出率为5．5％。系统进化分析显示南京地区hMPVB1型占51．4％,A2b型占31．4％。hMPV的发病高峰在4月份。其致呼吸道感染以1岁以内多见（71．4％）。35例hMPV感染患儿中有15例（42．8％）存在混合感染,其中与HRV的混合感染检出率最高。临床诊断以肺炎（17例,48．6％）最为常见。结论人偏肺病毒是南京地区儿童急性呼吸道感染的重要病原之一,该年度其优势流行型别为B1型,南京地区A、B两型hMPV感染患儿临床特征无明显差异。     

人偏肺病毒感染住院儿童的临床特征及病毒基因特性分析

目的 了解急性呼吸道感染住院儿童中人偏肺病毒(hMPV)的感染情况、临床特征及人偏肺病毒基因特性.方法 对2006年2月至5月、2008年3月至4月及2008年9月至2009年2月收集的天津市儿童医院急性呼吸道感染住院儿童的310份鼻咽吸取物标本进行巢式PCR检测hMPV N基因片段,并对其中17株N基因片段进行序列测定,分析序列特征并绘制种系发生树.收集所有阳性患者的临床资料.同时采用多重PCR对N基因阳性标本进行其他常见呼吸道病毒的检测.结果 310份标本中共检出20份(6.5%)hMPV.hMPV阳性患儿的年龄中位数为15.0个月(16天～9岁),其中≤2岁患儿占90.0%(18/20).男性占60.0%(12/20).17株N基因种系发生树分析显示,11株为A2b亚型.20例hMPV阳性患儿的临床诊断均为支气管肺炎,占所有采集的肺炎患儿标本的7.1%(20/282),其临床症状以咳嗽、喘息、呼吸急促、发烧等常见.35%(7/20)需要重症监护,15%(3/20)需要吸氧治疗.平均住院时间为(11.9±4.8)d.A、B型间临床特征未见明显差别.hMPV无明显流行高峰.2例hMPV阳性患儿分别与腺病毒和鼻病毒混合感染.结论 hMPV可引起婴幼儿肺炎等严重疾病.天津地区流行的hMPV以A2b为优势流行型.     

长沙地区住院儿童人冠状病毒NL63的感染状况及临床特征

目的 了解HCOV-NL63在长沙地区急性下呼吸道感染住院儿童中的流行状况以及临床特征.方法 采集长沙地区2008年9月至2010年10月因急性下呼吸道感染住院儿童NPA样本1185份,用RT-PCR方法检测HCOV-NL63N基因,阳性扩增产物经测序确认,统计分析临床资料.结果 1185份NPA样本中,HCOV-NL63检出阳性10份,检出率为0.8％,其中春季检出1例、夏季检出6例、秋季检出2例、冬季检出1例;阳性检出病例患儿年龄最大2岁半,最小2个月,平均月龄12.5个月;男童7例,女童3例;临床诊断为支气管肺炎6例、毛细支气管炎3例、急性喉气管支气管炎1例;10例中有4例病情危重;4例有基础疾病;7例合并其他病毒混合感染;阳性扩增产物经测序分析与HCOV-NL63参考株同源性为97％～100％.结论 本资料HCOV-NL63阳性检出患儿年龄均在3岁以下;夏季检出率高;男童感染为主;单一基因型在长沙地区流行;HCOV-NL63可能也是我国儿童急性下呼吸道感染中的一种病原.     

重庆地区急性呼吸道感染患儿呼吸道合胞病毒流行特征及其G基因序列分析

目的 分析重庆地区2008-2009年度急性呼吸道感染住院患儿呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的亚型流行情况,并了解优势流行株BA株的G蛋白基因特征.方法 采集2008年4月-2009年3月全年于重庆医科大学附属儿童医院因急性呼吸道感染住院的508例患儿鼻咽深部分泌物,用RT-PCR方法检测RSV并进行亚型鉴定,选取29例B亚型和10例A亚型RSV阳性标本,用RT-PCR的方法扩增全长G蛋白并测序.结果 在508例标本中,RSV阳性126例(24.8%),其中检测出A亚型43例(34.1%),B亚型80例(63.5%),A、B亚型混合感染3例(2.4%).所测的10株A亚型的G基因与标准株A2的核苷酸同源性为91.4%～92.0%,均属GA2基因型;29株B亚型的G基因与标准株CH18537的核苷酸同源性为92.0%～93.0%,其中19株均为具有60个高度重复核苷酸插入的BA株.B亚型流行株与CH18537标准株相比,G基因有多种核苷酸变异如缺失、插入等,尤其在G蛋白近C端1/3处的高变区.结论 2008-2009年RSV仍是重庆地区儿童急性呼吸道感染的主要病原,与既往两年A亚型优势流行不同,2008-2009年度B亚型毒株流行占优;近年新发现的BA株可能已成为本地区优势流行株,BA株G基因变异是否导致G蛋白功能增强,进而促进其优势流行尚有待研究.     

长沙地区呼吸道感染儿童Saffold心肌炎病毒的调查

目的了解长沙地区Saffold病毒（以下简称为SAFV）在儿童呼吸道感染中的流行情况,探讨其与儿童呼吸道感染的相关性。方法选取湖南省人民医院儿科医学中心2007年11月至2008年10月间643名因呼吸道感染住院儿童的鼻咽抽吸物。采用实时荧光定量聚合酶链式反应（Realtime．PCR）方法扩增SAFV的5UTR的基因片段,并且统计分析临床资料。结果643份样本中共检测出SAFV阳性67份,阳性检出率为10．42％（67／643）,5岁以上未检测出该病毒。31例患迁延性肺炎和慢性肺炎的患儿标本检出SAFV8例（25．81％）,差异有统计学意义。结论本研究表明长沙地区下呼吸道感染住院儿童存在SAFV感染;SAFV可能与下呼吸道感染及病程迁延相关。     

长沙地区住院儿童冠状病毒HKU1的感染状况及临床特征

目的了解冠状病毒HKU1在长沙地区急性下呼吸道感染住院儿童中的感染状况及临床特征。方法采集2007年9月至2008年8月长沙地区因急性下呼吸道感染住院儿童鼻咽抽吸物（nasopharyngeal aspirates,NPA）样本1165份,用RT-PCR方法检测冠状病毒HKU1 pol基因,测序分析阳性扩增产物,统计分析临床资料。结果1165份NPA样本中,检测出12份冠状病毒HKU1,阳性率为1．03％（12／1165）,患儿年龄最小8天,最大3岁,临床诊断多见支气管肺炎（83．33％）,所测核苷酸序列与冠状病毒HKU1参考株同源性为98．18％～100％。结论冠状病毒HKU1阳性患儿年龄均在3岁及3岁以下;性别无差异;冬春季检出率高;单一基因型在长沙地区流行;HKU1也是我国儿童急性下呼吸道感染中的一种病原。     

兰州地区呼吸道感染患儿中人类博卡病毒1～3型检测与临床研究

目的了解兰州地区急性呼吸道感染患儿中人博卡病毒1—3型（HBoV1～3）感染的临床及分子流行病学特征。方法收集兰州大学第一医院2009年12月至2010年11月急性呼吸道感染患儿鼻咽分泌物及咽拭子标本524份,用：巢氏PCR扩增人博卡病毒（HBoV）NS1片段,检测HBoV1～3;同时PCR检测常见呼吸道病毒。结果524份标本中检出HBoV43例,检出率为8．2％,仅次于鼻病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒3型;混合感染率为69．8％。其中人博卡病毒1型（HBoV1）在下呼吸道感染中检出率显著高于上呼吸道感染的检出率;2例人博卡病毒2型（HBoV2）患儿都出现胃肠道症状,与标准株GU048662．1的核苷酸同源性分别为99％和100％;1例人博卡病毒3型（HBoV3）与标准株HM132056．1的核苷酸同源性为99％。结论本地区儿童急性呼吸道感染中博卡病毒感染以HBoV1为主,首次检出HBoV3;人博卡病毒与其他病毒有较高的合并感染。人博卡病毒是本地区儿童急性呼吸道感染的重要病原之一。     

2009甲型H1N1流感流行期间北京急性呼吸道感染儿童常见呼吸道病毒的研究

目的了解2009至2010年甲型H1N1流感大流行期间北京地区急性呼吸道感染患儿中,除流感病毒外的其他几种常见呼吸道病毒感染的流行情况。方法设计并建立检测包括呼吸道合胞病毒（RSV）A/B亚型,副流感病毒（PIV）1、2、3型,腺病毒（ADV）和人博卡病毒（HBoV）在内的多重实时荧光PCR方法,并应用该方法对2009年6月至2010年2月甲型H1N1流感大流行期间,对首都儿科研究所附属儿童医院就诊的急性呼吸道感染患儿中甲型H1N1流感病毒检测阴性的咽拭子标本进行上述呼吸道病毒的核酸检测。结果新建立的多重RT-PCR方法最低可检测的目标基因含量为10～300拷贝数,未见与其他非目标病毒的交叉反应。本研究共检测标本849份,病毒检测总阳性率为39.0%（331份）,5岁以下占87.6%（290/331份）。各病毒的检测阳性率分别为RSV-A亚型1.4%（12份）,RSV-B亚型8.4%（71份）,PIV-1型8.2%（70份）,PIV-2型0.5%（4份）,PIV-3型3.9%（33份）,ADV13.9%（118份）,HBoV2.7%（23份）。RSV检出以B亚型为主（85.5%）,流行高峰在2009年11月至2010年2月。PIV检出以PIV-1型及PIV-3型为主,PIV-1型的流行高峰在2009年7月至2009年10月,PIV-2型及PIV-3型的流行高峰在2009年6～9月。ADV病毒在研究期间均有较高检出率（平均为13.9%）,HBoV的流行高峰在2009年9～12月。结论除流感病毒外,ADV、RSV-B及PIV可能也是2009甲型H1N1流感流行期间引起儿童急性呼吸道感染的重要病原。比较以往的资料可见各病原在2009甲型H1N1流感流行期间的流行季节性及检出率基本未受到新型流感病毒的影响。     

上海地区人博卡病毒在儿童急性呼吸道感染的研究CSCD

目的了解上海地区人博卡病毒（HBoV）在儿童急性呼吸道感染中的流行情况和临床特点。方法上海地区在2012年1月至2012年12月共收集271例急性呼吸道感染患儿的鼻咽抽吸物,采用巢式聚合酶链反应（Nested PCR）方法检测人博卡病毒NS1基因、并经测序确认,对所获得的基因序列进行同源性和进化分析,博卡病毒阳性样本同时检测鼻病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒等8种呼吸道相关病毒。结果271例标本中共检出HBoV阳性31例,检出率11.4%;21例存在混合感染,全年均有检出,阳性患儿中位年龄17个月（4个月-4岁）,诊断包括上呼吸道及下呼吸道感染,临床表现包括发热、阵发性咳嗽、咳痰、腹泻、呕吐、咽充血、湿罗音等,无死亡病例,门诊患者检出率明显高于住院患者;序列分析表明其中29例为HBoV1、2例为HBoV2、与参考株的核苷酸同源性为99%-100%,氨基酸同源性96%-100%。结论HBoV1是上海地区急性呼吸道感染患儿中的重要病原,HBoV2在该地区首次检出,临床症状及诊断无特异性。     

2021—2022年桂林地区急性呼吸道感染住院儿童病毒谱与流行特征

目的了解2021—2022年间桂林市急性呼吸道感染住院儿童病例中呼吸道病毒谱的构成, 探究不同呼吸道病毒的流行特征。方法收集2021年9月至2022年10月广西桂林市14岁以下急性呼吸道感染(acute respiratory infection, ARI)住院儿童作为研究对象, 共检测638例。采集的患儿咽拭子, 采用实时荧光逆转录-聚合酶链反应的方法进行核酸检测, 对包括不同亚型在内15种常见种或型呼吸道病毒进行筛查, 分析急性呼吸道感染住院患儿病例的病毒谱特征。结果 638例标本中, 检出包括不同亚型在内的病毒12种, 有365例至少1种或型病毒检测结果为阳性, 阳性率为57.21% (365/638), 感染两种及以上病毒检出率12.85%(82/638)。不同季节的病毒检出率的差异有统计学意义(P<0.002)。不同年龄组样本的病毒阳性检出率以0～2岁组最高(40.66%), 其次为3～5岁组(34.80%)和≥6岁组(24.54%)。结论 2021年9月至2022年10月期间, 12种呼吸道病毒在桂林地区存在流行, 具有明显的夏季高峰特点, 提示当地夏季时应重点针对可...     

Co-circulating genetically divergent A2 human metapneumovirus strains among children in southern Taiwan

An outbreak of human metapneumovirus (hMPV) among children in southern Taiwan in 2004 prompted the investigation of the molecular epidemiology of hMPV from September 2003 to August 2005. Respiratory specimens that were culture negative for a panel of respiratory viruses were examined for the presence of hMPV by RT-PCR. The results indicated that 59 out of 546 (10.8%) children were hMPV-positive. The majority of these hMPV-positive children were less than 2 years old (59.4%), females (61%), and inpatients (67.8%). Infections occurred throughout the year, but peaked during the spring and/or summer months. Sequence analysis of the fusion gene from the isolates revealed two phylogenetic groups with five possible lineages (A1, A2a/A2b, B1, and B2). Among these co-circulating strains, A2 strains were most frequently observed and demonstrated the greatest divergence. Deduced amino acid sequence analysis identified several variant amino acids specific to the A2 lineage. Lineage-specific amino acid substitutions were noted at aa233, aa286, aa312, aa348, and aa296. This study indicated that genetically divergent strains of hMPV which caused respiratory disease and hospitalization were circulating among children in Taiwan.     

Prevalence of human metapneumovirus in hospitalized children with respiratory tract infections in Tianjin,China

Human metapneumovirus (hMPV) has recently been recognized as an important respiratory pathogen, especially in children. At present, our understanding of the characteristics of hMPV from China is very limited. Nasopharyngeal aspirates were taken from 310 hospitalized pediatric patients. Twenty (6.5%) of them were infected with hMPV, and they all developed pneumonia. Sixty five percent (13/20) of the cases were under 12 months. Phylogenetic analysis of F gene fragments indicated that three sub-genotypes of hMPV(A2a/A2b, B1,B2) circulated in Tianjin and A2b was the predominant subtype. The Vero-E6 cell line was better than LLC-MK2 for hMPV isolation. Three hMPV strains were successfully isolated using the Vero-E6 cell line.     

Characterization of human metapneumovirus infections in Israel

Respiratory tract infections are a leading cause of morbidity and mortality worldwide. Even with the advancement of diagnostic tools, the causative agent of 20 to 30% of upper respiratory tract infections go undiagnosed. Recently, a newly identified human respiratory virus, human metapneumovirus (hMPV), was discovered in young children in The Netherlands. To study the prevalence of hMPV infections in Israeli children, respiratory specimens from 388 hospitalized children less than 5 years of age were evaluated for the presence of hMPV RNA, which was present in 42 (10.8%) of these samples. All hMPV-positive samples were negative for respiratory syncytial virus (RSV), influenza viruses (Flu) A and B, adenovirus, and parainfluenza viruses 1, 2, and 3. Conversely, hMPV RNA was not detected in 76 RSV-positive and 38 Flu A- or B-positive samples. Most hMPV activity was between the months February and April. Sequence analysis of 20 positive samples revealed that both of the hMPV genotypes (groups 1 and 2) have circulated in central Israel during the study period. Moreover, three of the four known hMPV subgroups (1A, 1B, and 2B) were detected among the tested samples. Seroprevalence of hMPV in 204 patients from the central part of Israel revealed that 100% of the children are hMPV seropositive by the age of 5 years old. We conclude that hMPV is a common respiratory pathogen in Israel, while mixed infections of hMPV with RSV or Flu in hospitalized children are apparently rare.