基于网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的应用网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法在中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索五苓散主要成分及对应靶点;检索GeneCards、TTD、DrugBank、DisGeNET数据库,筛选CHF相关靶点;取疾病与药物交集靶点,构建韦恩图;应用Cytoscape 3.8.0软件建立五苓散药物-活性成分-靶点网络及药物成分-交集靶点网络,获得关键化合物;应用STRING平台构建交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)的网络图,分析网络图得到关键靶点;应用Metascape数据库对交集基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。比较关键靶点及KEGG通路富集基因,选取主要靶点蛋白及关键化合物,应用CB-Dock平台进行分子对接验证。结果通过口服生物利用度(OB)及生物活性分子类药性(DL)筛选得到五苓散共有46个活性成分,共涉及63个作用靶点,与CHF重合的靶点有36个,得到谷甾醇、3β-乙酰氧基-白术酮、二氢槲皮素等10个关键化合物,NOS3、CASP3、PTGS2等10个关键靶点。GO分析得到与循环系统、细胞膜成分及蛋白质相关的注释条目。KEGG通路富集通路主要包括AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。分子对接结果显示,五苓散关键化合物与新型利尿剂托伐普坦,与治疗靶点均具有良好结合活性。结论五苓散包括多个活性成分,作用于多个靶点,通过抑制细胞凋亡、氧化应激、心肌重构、炎症通路等多种机制作用于CHF,体现了中药治疗疾病多成分、多靶点、多途径的特点。     

基于网络药理学探讨鸡血藤治疗再生障碍性贫血的潜在作用机制

［摘要］　目的　应用网络药理学探讨鸡血藤治疗再生障碍性贫血（AA）的潜在作用机制。方法　通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取鸡血藤的活性成分及作用靶点基因,通过GeneCards数据库检索AA的相关靶点基因,通过韦恩图分析其交集。应用R软件对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。应用Cytoscape 3.8.2软件构建药物-活性成分-关键靶点-通路-疾病网络。结果　通过TCMSP筛选获得24种活性成分,其对应的靶点基因56个。经GeneCards数据库检索,获得AA的疾病靶点基因1 665个。韦恩图分析结果显示其交集靶点基因21个。基于该21个关键靶点基因,GO功能富集分析共获得1 052个富集结果,包括生物过程（BP）1 012个、细胞组分（CC）13个、分子功能（MF）27个。KEGG通路富集分析共获得70条信号通路,主要通路包含细胞凋亡、p53信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路,以及病毒、癌症、传染病等疾病相关通路。结论　鸡血藤通过多成分、多靶点、多通路的相互作用发挥治疗AA的作用,为进一步探讨鸡血藤治疗AA的作用机制提供参考。     

苦参治疗2019新型冠状病毒感染合并心肌炎的网络药理学分析

目的采用网络药理学方法探讨苦参治疗2019新型冠状病毒(2019-nCoV)感染合并心肌炎的活性成分及作用机制。方法利用TCMSP数据库获得苦参的活性成分及其相关靶点,并在GeneCards数据库和OMIM数据库中查找2019-nCoV和心肌炎的靶点;使用R软件预测苦参作用于2019-nCoV感染合并病毒性心肌炎的作用靶点,并利用Cytoscape3.7.2软件构建"药物-活性成分-疾病-靶点"的网络;通过String数据库进行蛋白质相互作用分析,并筛选关键靶点;采用R软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果筛选得到苦参作用于2019-nCoV心肌炎的活性成分14个,作用靶点34个。富集分析显示,作用靶点主要涉及63个生物学功能和135条通路。结论苦参可能通过多成分、多靶点和多通路的共同作用发挥抗2019-nCoV心肌炎的作用。     

基于网络药理学探讨附子理中汤治疗非酒精性脂肪性肝病作用机制

目的:运用网络药理学方法分析附子理中汤(FZLZD)治疗非酒精性脂肪肝性病(NAFLD)的潜在作用机制。方法:检索TCMSP数据库筛选出FZLZD药物活性成分及作用靶点,并借助Uniprot平台进行靶点蛋白规范化处理。检索GeneCards与OMIM数据库得到NAFLD靶点基因,进一步获取药物和疾病共有靶点,即为FZLZD治疗NAFLD的潜在靶点基因。利用Cytoscape 3.7.2绘制药物活性成分-靶点-疾病网络图,利用Cytoscape 3.7.2结合String数据库构建蛋白互作(PPI)网络,利用Metascape数据库对共有靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:最终筛选出80种药物活性成分、43个潜在作用靶点;富集分析获取808个生物学过程及25条与NAFLD相关信号通路。结论:FZLZD通过多成分-多靶点-多信号通路协同调控NAFLD。     

基于网络药理学的血必清注射液治疗新型冠状病毒感染合并心肌炎的作用机制研究

目的基于网络药理学探索血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的主要活性成分及作用机制。方法利用TCMSP数据库对血必清注射液的主要活性成分及其靶点筛选,再运用GeneCards数据库和OMIM数据库筛选新型冠状病毒感染合并心肌炎的相关靶点,最后对药物靶点和疾病靶点进行Venn分析,得到血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的交集靶点。利用STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析并筛选关键靶点。采用Cytoscape 3.6.1软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,对靶点基因进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果经筛选得到血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的活性成分125个和作用靶点41个,主要涉及71个生物学过程和135条通路。结论本研究初步验证血必清注射液可通过多成分、多靶点和多通路来发挥治疗新型冠状病毒感染合并心肌炎的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术，探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制。方法 通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分，利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分，采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点，经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点，结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析。再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后，利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果 苗药黑骨藤的活性成分共24个，对应靶点574个，1 513个AD靶点，交集靶点159个；GO分析得到2 661条生物过程，587条分子功能，311条细胞成分；KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路。分子对接结...     

基于网络药理学探讨太子参、赤芍治疗糖尿病合并冠心病的作用机制

目的应用网络药理学的研究方法挖掘太子参、赤芍治疗糖尿病合并冠心病的物质基础及其作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库检索太子参、赤芍两味中药的化学活性成分,并进行靶点预测。通过TTD、DisGeNET、OMIM数据库分别检索糖尿病和冠心病的相关疾病靶点,将中药靶点与疾病靶点进行交集,筛选得到共同作用靶点。应用STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络模型。使用Cytoscape软件对该网络进行拓扑学分析得到核心靶点,并对核心靶点进行GO-BP生物功能富集分析,应用DAVID平台对其进行KEGG通路分析。结果经数据库分析共筛选出6个太子参有效活性成分、25个赤芍有效活性成分和451个潜在作用靶点,与糖尿病合并冠心病共同作用靶点173个。通过对共有靶点的拓扑分析,筛选出49个核心靶点。GO-BP生物功能富集分析发现,太子参、赤芍可通过脂多糖的调节、活性氧物质的代谢过程、血液循环的调节、血管收缩的调节等过程,从而共同发挥治疗糖尿病合并冠心病的作用。KEGG通路富集分析发现,其可通过脂肪细胞因子信号通路、ErbB信号通路、间隙连接通路、焦点黏附通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、促黄体生成素释放激素(GnRH)信号通路等代谢通路起到治疗作用。结论太子参与赤芍可通过多靶点、多通路治疗糖尿病合并冠心病。     

基于网络药理学探讨侯氏黑散治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的基于网络药理学探讨侯氏黑散治疗缺血性脑卒中的作用机制。方法采用检索中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)检索侯氏黑散的14味药(牡蛎为动物药,未纳入分析范围)中所有化学成分,筛选活性成分及作用靶点;通过GeneCards检索缺血性脑卒中疾病靶点;利用Venny工具绘制韦恩图,找出交集靶点;应用STRING构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共筛选到155个中药活性成分、164个作用靶点,缺血性脑卒中相关靶点3173个,从而得到药物-疾病的共同靶点121个。富集于分子功能、生物过程和细胞组分及47条信号通路,包括NOD样受体信号通路、胰岛素信号通路、钙信号通路等。预测侯氏黑散居前5位的主要活性成分是前列腺素内过氧化物合酶2、槲皮素、山奈酚、前列腺素内过氧化物合酶1、热休克蛋白90,主要通过调节白细胞介素6(IL-6)、血清对氧磷酶1(PON1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素2(IL-2)、趋化因子(CCL2)等靶点,调控NOD样受体信号通路、胰岛素信号通路等达到治疗缺血性脑卒中的目的。结论侯氏黑散通过多成分、多靶点、多通路治疗缺血性脑卒中。     

基于网络药理学及分子对接探讨灵芝的免疫调节机制

［摘要］　目的　通过网络药理学及分子对接探讨灵芝调控免疫功能的作用机制。方法　通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索和筛选灵芝有效成分,使用Swiss Target Prediction数据库预测其潜在作用靶点。从GeneCards、DrugBank、OMIM、PharmGKB、TDD数据库中获取免疫调控相关靶点,整合药物靶点和疾病靶点,取交集靶点。使用Cytoscape软件构建药物-活性成分-作用靶点-疾病网络图,筛选核心成分。利用String平台构建蛋白互作(PPI)网络,筛选核心蛋白。利用R软件进行GO富集分析和KEGG通路分析。通过分子对接技术进行活性成分和核心靶点的分子对接验证。结果　共获取灵芝活性成分43个,作用靶点499个,免疫相关靶点12 454个,药物与疾病的交集靶点483个。KEGG通路分析显示交集基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、蛋白多糖与癌症等信号通路。GO富集分析显示,交集基因主要参与脂质代谢过程的调节、肽基-丝氨酸磷酸化、肽基-丝氨酸修饰等过程。分子对接结果显示,主要核心成分与核心蛋白有较好的结合活性。结论　研究构建的灵芝“成分-靶点-通路-疾病”网络,一定程度上揭示了灵芝多成分、多靶点的复杂作用机制,为灵芝的临床应用和产品开发提供理论基础。     

基于网络药理学与分子对接技术探究加味泽泻汤治疗梅尼埃病的作用机制

目的:探讨加味泽泻汤治疗梅尼埃病的潜在作用机制。方法:从TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM平台中收集加味泽泻汤组方中药物的活性成分及靶点,经标准化处理后利用Cytoscape软件绘制加味泽泻汤活性成分-靶点网络图并分析其核心成分;从GeneCards、OMIM、DisGeNET及CTD疾病数据库中收集梅尼埃病相关的疾病靶点,从而得到药物-疾病共有靶点,筛选出加味泽泻汤治疗梅尼埃病的潜在作用靶点并绘制药物活性成分-疾病靶点网络图;筛选提取加味泽泻汤和梅尼埃病的交集网络制作药物-疾病互作网络,通过计算相关属性值得到核心靶点,利用Metascape数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并可视化。最后使用分子对接技术对加味泽泻汤核心活性成分与核心靶点对接并进行可视化处理。结果:经过筛选共得到加味泽泻汤药物活性成分39个,相关靶点144个;梅尼埃病疾病相关靶点1 556个,其中,有药物-疾病共同靶点44个,通过富集分析及筛选,得到排名靠前的GO功能条目及KEGG信号通路。分子对接得到4个关键化合物和3个核心靶点,具有较好的结合性,验...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙勇安汤治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙勇安汤治疗冠心病(CHD)的潜在作用机制。方法:应用中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选四妙勇安汤的药物有效活性成分及作用靶点,应用全球蛋白质资源(UniProt)数据库对基因标准化处理。通过GeneCards数据库和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库检索冠心病的有关靶点,将药物有效活性成分靶点与冠心病的相关靶点进行映射,取交集即为四妙勇安汤治疗冠心病的潜在靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建四妙勇安汤治疗冠心病的“药物-成分-疾病-靶点”网络图,运用生物分子功能注释系统(STRING)数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,并筛选核心靶点。利用DAVID数据库对得到的交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用AutoDock及PyMOL等软件进行分子对接验证及结果的可视化分析。结果:共得到四妙勇安汤治疗冠心病的活性成分127个、相关靶点137个、交集靶点120个。四妙勇安汤治疗冠心病的生物过程涉及对缺氧的反应、一氧化氮生物合成过程的...     

基于网络药理学与分子对接探讨失笑散治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨失笑散治疗冠心病的作用机制。方法:收集TCMSP及BATMAN-TCM、HERB数据库,分别检索蒲黄和五灵脂的化学成分及靶点,运用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-潜在靶点网络图。通过GeneCards、OMIM、TTD数据库筛选冠心病相关的靶点。利用Venny图获取疾病-药物交集靶点,并将其上传至STRING数据库,进一步通过Cytoscape 3.9.0软件绘制核心蛋白-蛋白互作(PPI)网络图。采用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用AutoDockTools-1.5.7软件对核心成分与核心靶点进行分子对接,采用PyMOL软件进行可视化。结果:经筛选后获得失笑散核心成分为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等;核心靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(p53)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)等。KEGG通路富集的主要通路为环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路等。分子对接验证显示：多数核心成分与核心靶点具有...     

柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症的网络药理学作用机制

目的 应用网络药理学和分子对接方法探讨柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症的作用机制。方法 利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库获得柴胡加龙骨牡蛎汤的活性成分及对应靶点,结合GeneCards数据库获取冠心病和焦虑症相关的疾病靶点;对药物与疾病靶点映射得到的柴胡加龙骨牡蛎汤治疗冠心病和焦虑症的共有靶点,通过STRING平台构建蛋白互作网络;运用R语言对共有靶点进行基因本体(GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用 Cytoscape3.7.1软件构建“活性成分-靶点-通路”网络;应用Auto Dock vina软件对PPI网络中关键靶点与主要活性成分进行分子对接。结果 网络分析结果显示,柴胡加龙骨牡蛎汤中74个有效活性成分参与调控92个共有靶点,通过调节丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、5-羟色胺能突触、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、蛋白激酶B(Akt)等121条信号通路实现对冠心病和焦虑症“异病同治”的作用。结论 现有研究初步揭示了柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症多成分、多靶点、多通路的作用机制,可能为后续深入研究提供新方向。     

基于网络药理学的赤芍治疗动脉粥样硬化作用机制研究

目的采用网络药理学方法探讨赤芍治疗动脉粥样硬化(AS)的物质基础和作用机制。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索赤芍的化学成分和作用靶点;在人类基因数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)中搜索AS靶点;使用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,并利用DisGeNET数据库对作用靶点类型进行归属;采用Cytoscape 3.7.1软件构建赤芍-活性成分-抗动脉粥样硬化靶点网络;利用Metascape平台对靶基因进行基因功能注释(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果通过口服生物利用度(OB)和生物活性分子的类药性(DL)参数筛选得到赤芍29个潜在活性成分,共涉及41个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分有12个,与疾病有关的靶点有36个。主要通过调控细胞凋亡、白介素-17(IL-17)信号通路、流体剪切应力(FSS)与AS、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、Th17细胞分化、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、甲状腺激素信号通路、p53信号通路、Toll样受体(TLR4)信号通路及磷酸肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路等多种途径发挥抗AS作用。结论网络药理学分析显示,赤芍通过多成分、多靶点、受途径共同发挥抗AS作用,有助于进一步了解赤芍的药理学作用机制,证实了网络药理学方法可以作为从整体角度揭示中医药作用机制的有效工具。     

基于网络药理学与分子对接技术探讨三参通脉合剂治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨三参通脉合剂治疗冠心病的主要化合物成分及复杂作用机制。方法:通过HERB数据库、SwissADME平台检索并筛选三参通脉合剂的潜在活性化合物,通过SwissTargetPrediction平台预测作用靶点。通过GeneCards、OMIM、DisGeNET、DrugBank及TTD数据库检索并筛选冠心病相关靶点。取药物预测靶点与疾病相关靶点的交集,将交集靶点导入Cytoscape 3.9.1构建“中药-成分-靶点”网络;导入STRING 11.5数据库构建靶点蛋白-蛋白互作(PPI)网络,并通过Cytoscape 3.9.1、CytoNCA插件进行拓扑分析。通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用AutoDock Tools 1.5.7、AutoDock Vina 1.1.2等进行分子对接分析。结果:共筛选得到三参通脉合剂365个活性成分,可能作用于320个冠心病相关靶点。根据“中药-成分-靶点”网络、PPI网络及相关文献筛选5个关键靶点与11个主要活性成分进行分...     

基于网络药理学研究小柴胡汤治疗乙型肝炎的作用机制

目的通过网络药理学研究小柴胡汤治疗乙型肝炎的作用机制。方法利用TCMSP数据库收集小柴胡汤中7味中药的主要化学成分和作用靶点;通过GeneCards和OMIM数据库获取乙型肝炎相关靶点,利用STRING在线平台构建潜在靶点PPI网络并利用R语言获取GO功能富集分析及KEGG通路分析;运用Cytoscape3.7. 2构建"活性成分-核心靶点"网络并对网络进行拓扑分析;最后利用AutoDock vina等软件对网络中度值较高的活性成分与核心靶点进行分子对接和可视化分析。结果筛选到小柴胡汤中槲皮素、山奈酚、汉黄芩素、柚皮素等193种主要化学成分和247个相关靶点,其中关键靶点有RELA、MAPK1、TP53、ESR1、EGFR、AKT1等; GO功能富集分析共得到2612条富集结果,主要涉及细胞对化学应激的反应、对药物的反应、氧化应激反应、对脂多糖的反应等生物过程的调节; KEGG通路分析共得到174条通路富集结果,主要涉及乙型肝炎、PI3K-AKT信号通路、MAPK信号通路等;分子对接结果显示主要活性成分与核心靶点的结合力均较强,蛋白结晶复合物构象稳定。结论研究初步表明了小柴胡汤通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗乙型肝炎的作用机制。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨清解化攻方治疗重症急性胰腺炎的作用机制

［摘要］　目的　基于网络药理学和分子对接技术探讨清解化攻方治疗重症急性胰腺炎（SAP）的作用机制。方法　应用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索清解化攻方的活性成分和作用靶点,通过Cytoscape构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图,借助DAVID数据库和R软件对药物疾病交集基因进行GO和KEGG富集分析,利用Autodock Vina软件进行分子对接。结果　共筛选出清解化攻方的202个药物活性成分和225个潜在靶点,其中210个靶点与SAP相关。靶点通路富集分析结果显示,清解化攻方可能作用于炎性因子、细胞凋亡等途径发挥作用。分子对接结果显示,清解化攻方的主要活性成分与关键靶点具有良好的结合活性。结论　清解化攻方可能通过P53信号通路、PI3K-AKT信号通路等多途径发挥抗炎、调控细胞凋亡、改善能量代谢等作用。     

半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制的网络药理学分析

目的为了探究半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制,应用网络药理学方法分析半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎(HAG)的主要活性化合物、潜在靶点和相关通路。方法运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对半夏泻心汤药物活性化合物及药物作用靶点基因进行筛选。通过GeneCards数据库和OMIM数据库收集HAG疾病相关靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定药物作用潜在靶点;应用Cytoscape 3.6.1软件以及String数据库分别构建"药物-化合物-潜在靶点"相互作用网络及蛋白相互作用(PPI)网络图。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能,京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果终筛选出槲皮素、山柰酚和汉黄芩素等150种药物活性化合物,涉及SATA3、TP53、MAPK1等109个潜在靶点以及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路等96条作用通路。结论半夏泻心汤治疗HAG通过多成分、多靶点、多途径发挥其抑菌、抗炎、调控癌症进展的作用。     

半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制的网络药理学分析北大核心CSCD

目的为了探究半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制,应用网络药理学方法分析半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎(HAG)的主要活性化合物、潜在靶点和相关通路。方法运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对半夏泻心汤药物活性化合物及药物作用靶点基因进行筛选。通过GeneCards数据库和OMIM数据库收集HAG疾病相关靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定药物作用潜在靶点;应用Cytoscape 3.6.1软件以及String数据库分别构建"药物-化合物-潜在靶点"相互作用网络及蛋白相互作用(PPI)网络图。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能,京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果终筛选出槲皮素、山柰酚和汉黄芩素等150种药物活性化合物,涉及SATA3、TP53、MAPK1等109个潜在靶点以及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路等96条作用通路。结论半夏泻心汤治疗HAG通过多成分、多靶点、多途径发挥其抑菌、抗炎、调控癌症进展的作用。     

基于网络药理学探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制。方法:通过TCMSP数据库和UniProt数据库校正筛选出丹参、砂仁和檀香的有效活性成分;运用GeneCards数据库、NCBI基因数据库及OMIM数据库获取心力衰竭的疾病靶点,通过STRING数据库对交集靶点构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,运用拓扑分析和MCODE聚类分析获得核心作用靶点,并对核心作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从丹参饮3味中药中筛选出78个化合物、264个靶点,心力衰竭靶点2 273个,交集靶点86个,关键靶点36个。GO功能富集分析生物学过程共1 900条,KEGG筛选出通路165条。结论:丹参饮通过多靶点、多途径、多通路干预心力衰竭,可能涉及的靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL6)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、低聚果糖(FOS)等,涉及的信号通路包括白细胞介素-17(IL17)、晚期糖基化终末产物-糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、松...