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相似文献
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1.
陕西省HIV-1分子流行病学研究   总被引:8,自引:1,他引:7  
目的研究陕西HIV-1流行亚型及相互关系,分析流行时间及传播途径,为陕西省HIV的预防、控制及感染者治疗提供有力的依据。方法用PCR对15份陕西HIV-1感染者外周血单核细胞(PBMCs)样本进行扩增,获得HIV-1 env基因的核酸片段,对其C2-V3及邻区350-450个核苷酸序列进行分析,所得结果与HIV国际标准株及周边省份流行株进行比较,分析共享序列及突变序列,制作系统树,计算离散率。结果 陕西流行的B、E、C亚型内基因离散率分别为3.0%,1.7%和2.3%。10个B亚型毒株与泰国、我国云南、新疆、河南和四川流行的B亚型代表株基因序列接近;2个C亚型毒株我国新疆流行的C亚型代表株接近;3个E亚型毒株与河南流行的E亚型代表株接近。结论 陕西HIV-1流行株主要为B、E、C亚型,三亚型毒株在陕西的流行时间分别在2.5~3年、2~2.5和1.5~2年之间,传播来源可能为国外或周边省份传入。  相似文献   

2.
目的:分析青海省首次发现的HIV感染者HIV-1毒株的基因特征及亚型。方法:从2例感染者外周静脉血淋巴细胞中提取前病毒DNA,使用套式PCR方法,扩增HIV的Env基因,对其Env C2-V3及邻近序列进行分析。结果:两个毒株与国际参考序列的Coon间的基因离散率最小为4.93%,而远离其它亚型,2个毒株间的基因离散率为1.35%,进一步的系统树分析显示,2个毒株与Ccon聚集在一起。结论:2个毒株均为C亚型,而且HIV-1毒株刚进入青海省且流行的时间不长。  相似文献   

3.
20 0 10 14 0 贵州省 HIV- 1感染毒株膜蛋白基因序列测定及流行病学分析 /雷世光 (贵州省皮研所 )…∥中华皮肤科杂志 .- 2 0 0 0 ,33( 3) .- 14 9~ 151为探索贵州省 H IV - 1感染毒株亚型分布及变异情况 ,分析其流行态势。对 2 0份确诊的 HIV - 1感染者血样 ,用巢式 PCR法扩增膜蛋白基因并作测序分析。核酸分离成功有排列结果仅有 11份 ,其中云南 B亚型4份 ,欧美 B亚型 3份 ,国际 E亚型 2份 ,国际 C亚型2份。结果显示贵州 H IV毒株来源广泛 ,分布复杂 ,主要通过性接触传播。输血和静脉吸毒方式传播的 B亚型可通过政策因素在短期…  相似文献   

4.
目的研究HIV-1CRF01-AE亚型毒株与HIV传播及流行的关系,为预防控制艾滋病提供科学依据。方法分三个时段检测贵州省多地区190份HIV-1毒株样本,用套式PCR扩增其Env基因和测序分析,将实验结果与贵州省艾滋病流行现状进行相关分析。结果检出B,B',E,C亚型及CRF07-BC,CRF08-BC和CRF01-AE三种新的流行性重组亚型毒株,流行性重组亚型毒株是造成贵州省艾滋病流行的因素之一,其中CRF01-AE毒株与性传播、16~50岁年龄段高度相关。结论 CRF01-AE亚型毒株是贵州省艾滋病传播与流行的主要亚型毒株;16~50岁年龄段是CRF01-AE亚型毒株通过性传播艾滋病的主体人群;CRF01-AE亚型毒株引起的艾滋病流行,具有传播范围广、流行时间长、控制难度大等特点。  相似文献   

5.
20 0 4 2 14 6 浙江省 HIV- 1流行毒株的基因序列测定和亚型分析 /姚亚萍 (浙江省疾控中心 )… / /中国艾滋病性病 .- 2 0 0 4 ,10 (1) .- 4~ 6 ,2 2采用聚合酶链反应 (PCR)方法 ,对该省 14例 HIV抗体阳性者的全血进行 env基因 C2~ V3区的扩增与测序 ,9例测序成功者经离散率计算和系统树分析证实 :E亚型的 A / E流行重组模式 4例 ,B亚型 3例 ,C亚型的B/ C流行重组模式 1例 ,G亚型 1例。提示浙江省内存在有多种亚型的 H IV - 1毒株。图 1表 2参 5  (杨亚琴 )2 0 0 4 2 14 7 静脉吸毒人群 HIV 感染者 CD 3 、CD 4、CD 8T…  相似文献   

6.
HIV-1长期感染不进展者体内毒株env基因序列测定   总被引:1,自引:1,他引:0  
目的研究HIV-1长期感染不进展现象与HIV-1env基因变异之间关系。方法用PCR对11例感染HIV-1毒株10年以上者外周血单一核细胞样本进行扩增,获得env基因的核酸片段,对其C2~V3及邻区350~450个核苷酸序列及所属亚型进行分析,所得结果与HIV-1该亚型国际标准株进行比较,分析共享序列及突变序列,制作系统树,计算离散率。结果离散率和系统树分析11株毒株均为HIV-1B亚型,基因离散率与国际标准株相比低于以往发现的陕西省流行株和文献报道的其他省份流行毒株。11株毒株V3环顶端四肽序列特征为GPGR的2例,占18.2%;为GRGQ的9例,占81.8%。在11株样本中均出现脯氨酸向异亮氨酸的变异。结论env基因V3环顶端四肽GRGQ序列特征及脯氨酸向异亮氨酸的变异可能与HIV-1感染者长期感染而不发病的现象有关。  相似文献   

7.
目的研究HIV-1长期感染不进展现象与HIV-1 env基因变异的关系。方法用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)对21例感染HIV-1毒株7年以上者外周血单一核细胞(PBMCs)的核酸样本进行扩增,获得HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,对其C2-V3及邻区350-450个核苷酸序列进行测定和分析,所得结果与HIV-1该亚型国际标准株进行比较,分析共享序列及突变序列,制作系统树,计算离散率。结果离散率和系统树分析21个毒株均为HIV-1 B亚型,毒株间基因离散率在2%左右,高于前期研究结果;未见V3环顶端四肽特征性GPGR和GRGQ,也未见前期研究曾经发现的脯氨酸向异亮氨酸的变异现象。结论HIV-1长期感染者体内毒株env基因无规律性突变。  相似文献   

8.
20 0 0 3718 重庆市 HIV- 1样本的亚型分析及 G亚型HIV- 1毒株在我国的发现 /韩梅 (重庆市卫防站 )…∥中国性病艾滋病防治 .- 2 0 0 0 ,6( 2 ) .- 89~ 91对重庆市境内确诊的 3例 HIV抗体阳性者静脉血 ,采用提纯扩增法 ,检测核酸片段 env基因 C2 ~ V3区 ,并进行核苷酸序列分析 ,与各亚型国际共享序列比较。结果 :2例为 E亚型和 C亚型 ,1例为 G亚型毒株。G亚型 HIV- 1毒株是首次在中国发现。表明重庆市存在着 C、E、G3种 HIV亚型病毒。图 1表 2参 9  (杨亚琴 )2 0 0 0 3719 云南省 2 39例艾滋病病例分析 /张小波 (云南省卫防…  相似文献   

9.
目的了解母婴传播感染HIV-1的亚型分布和基因变异。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,逆转录后采用套式PCR扩增HIV-1gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,确定基因型并进行系统进化树分析。结果对11份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了10份样品的HIV-1基因片段。发现4种HIV-1亚型和重组型,其中B'亚型6例,CRF01_AE和CRF07_BC各1例,C亚型2例。系统进化树分析表明,3对母婴配对样品,每对各自聚在一起,处于一个分支。3对母婴配对样品的env基因组内基因离散率分别为5.9%,12.1%和3.2%,年均基因离散率分别为0.6%,1.5%和0.8%。结论母婴传播病例中存在多种HIV-1亚型和流行重组型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测。  相似文献   

10.
目的了解保定市HIV-1感染者治疗前耐药情况。方法采用In-House方法,对血浆样本进行pol基因区扩增并测序,将拼接好的序列提交至美国斯坦福大学的HIV耐药数据库,分析HIV-1毒株基因亚型和耐药突变位点。结果本研究中60例HIV-1感染者出现基因位点突变,然而只有10例出现低度以上耐药,原发耐药率为5.56%(10/180)。蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)的原发耐药率分别是0.56%(1/180)、0.56%(1/180)和4.44%(8/180)。HIV-1耐药毒株主要分布在CRF01_AE(50.00%,5/10)、B亚型(20.00%,2/10)、B+C亚型(20.00%,2/10)和A亚型(10.00%,1/10)中。结论保定市HIV感染者原发性耐药率高于WHO中等警戒线水平,应引起警惕,并制定有针对性的预防措施。  相似文献   

11.
目的调查云南省艾滋病病毒1型B(B′)、C亚型毒株在ART失败后的耐药突变特征。方法对云南省15个地州定点医院2016年随访ART失败的HIV/AIDS患者的1 591份血浆样本,采用RT-PCR扩增HIV-1 pol区蛋白酶和反转录酶基因,通过BLAST、jpHMM at GOBICS和MEGA6.06软件确证亚型,进行耐药突变位点的分析。结果共获得B(B′)、C亚型毒株分别为27例和63例,其中B(B′)、C亚型检测出发生耐药突变分别为22例和37例,耐药突变率为81.48%和58.73%。病毒载量在B(B′)、C亚型耐药突变的毒株间差异有统计学意义(P0.05),未耐药突变的毒株间差异无统计学意义(P0.05)。在所有检出耐药突变位点中,仅K103和A71突变率在两种亚型间差异有统计学意义(P0.05)。在所有治疗方案中,仅TDF/3TC/EFV方案在两种亚型间的耐药突变率和病毒载量差异有统计学意义(P0.05)。结论 B(B′)、C亚型毒株ART失败后的耐药突变特征有差异,应加强两种亚型的耐药监测。  相似文献   

12.
HIV感染流行率30年来,在少数民族中仍然很高.2003年,美国新诊断的HIV感染据CDC估计,在男男性接触者中经性传播的HIV感染约为63%,其中黑人占50%,白人占32%,西班牙人占16%。该报告初步总结国家HIV行为监测系统(NHBS)的HIV检测结果。  相似文献   

13.
20070699单平台Tru Count和PLG-CD4测定CD4T细胞绝对计数的比较;20070700中国部分地区HIV患B′和B′/C亚型毒株tat第一外显子基因变异与HIV疾病进展关系的研究;20070701 高效抗逆转录病毒疗法治疗HIV-1感染的免疫学变化;20070702 影响血样样本中HIV-1病毒载量检测值的因素分析(综述);[编按]  相似文献   

14.
HIV亚型分析基因芯片的制备及应用   总被引:8,自引:0,他引:8  
目的 建立新的HIV亚型分析方法 ,并检测其特异性及敏感性。方法 HIV 111个亚型及HIV 2的env基因C2 V3区一段核苷酸序列 ,用芯片点样机点样于经预处理的玻片 ,制备成HIV亚型分析基因芯片 ,并用其对 15份HIV阳性样本进行亚型分析 ,所得结果与目前常用HIV亚型分析方法 基因序列分析法所得结果进行比较。结果 制备的基因芯片对 15份HIV阳性样本检测结果为 :样本 0 1、0 2、0 3、0 5、0 8、0 9、11、12、13、15为HIV 1B亚型 ;0 6、0 7为HIV 1C亚型 ;0 4、10、14为HIV 1E亚型。结论 制备的基因芯片亚型分析结果与基因序列分析法所得结果完全符合 ,敏感性高、特异性好 ,并且具有操作简单、省时、价廉等特点 ,有望推广应用。  相似文献   

15.
20 0 32 596  H IV亚型分析基因芯片的制备及应用/黎志东 (四军大基础部微生物学教研室 )…∥中国皮肤性病学杂志 .- 2 0 0 3,17( 3) .- 16 4~ 16 6将 H IV - 111个亚型、 HIV - 2的 env基因 C2 -V3 区一段核苷酸序列用芯片点样机点样于经预处理的玻片 ,制备成 HIV亚型分析基因芯片 ,并用其对 2 0份血样进行分析 ,所得结果与基因序列分析法所得结果进行比较。结果 :制备的基因芯片对 15份 HIV阳性样本检测结果如下 ,HIV - 1B亚型 10份 ,HIV - 1C亚型 2份 ,H IV - 1E亚型 3份 ;对照组为 5份健康人血样 ,均阴性 ;制备的基因芯片…  相似文献   

16.
HIV-1与HIV-2交叉反应毒株的基因亚型分析;艾灵颗粒对HIV感染者外周血树突状细胞亚群的影响;HIV抗体免疫印迹试验不确定结果的特征及鉴别方法研究;9876例HIV抗体初筛试验结果分析;28例艾滋病脑部病变的CT影像学分析  相似文献   

17.
目的 探讨新疆鳞状细胞癌(简称鳞癌)患者感染人疱疹病毒8型(HHV-8) ORF26基因亚型。方法 巢式PCR扩增41例皮肤鳞癌、46例食管鳞癌石蜡包埋组织标本中HHV-8 ORF26基因,对PCR阳性产物进行双向测序,使用Dnastar软件、Clustal W软件和Phylip软件包对测序结果进行系统发生学分析,从而确定HHV-8 ORF26基因亚型。运用SPSS17.0进行统计学分析。结果 41例皮肤鳞癌组织标本9例HHV-8感染为阳性,阳性率为21.95%;46例食管鳞癌10例为阳性,阳性率为21.74%。新疆皮肤鳞癌患者感染HHV-8 ORF26亚型7例为A亚型,2例为C亚型;食管鳞癌感染HHV-8 ORF26亚型7例为A亚型,3例为C亚型。结论 新疆鳞癌患者感染HHV-8 ORF26亚型属于A亚型和C亚型,A亚型多于C亚型,亚型分布与鳞癌患者的发病部位无关。  相似文献   

18.
目的探讨张家口市HIV-1遗传基因多样性和原发耐药基因突变情况。方法使用In-house方法扩增HIV-1蛋白酶和逆转录酶编码区基因序列,通过系统进化分析和耐药数据库比对确定HIV-1基因型和基因突变情况。结果张家口市未治疗人群中共有5种HIV-1基因亚型毒株在流行,其中CRF01_AE是最主要流行毒株,占到45.00%(9/20),其次是CRF07_BC(40.00%,8/20)。其他亚型包括B(5.00%,1/20)、CRF68_01B(5.00%,1/20)和CRF65_cpx(5.00%,1/20)。CRF68_01B是河北省首次发现的基因型。HIV-1原发耐药发生率为20.00%(4/20)。没有发现NRTI耐药基因突变。结论张家口市未接受抗病毒治疗人群中HIV-1遗传基因多样化,耐药基因突变水平较高,成簇传播,加强HIV-1耐药监测和预防控制措施研究已成当务之急。  相似文献   

19.
目的 明确Kaposi肉瘤患者感染的人类疱疹病毒8型(HHV-8)ORF26基因亚型分类,初步探讨其与Kaposi肉瘤不同临床分型及侵袭性的相关性。方法 对32例Kaposi肉瘤石蜡包埋组织进行HHV-8 DNA抽提、扩增、双向测序,使用DNAStar软件、Clustal W软件和PHYLIP软件包对测序结果进行系统发生学分析,从而确定HHV-8 ORF26基因亚型,最后运用Fisher确切概率法对结果进行统计学分析。结果 32例Kaposi肉瘤中有30例HHV-8阳性,阳性率为93.75%,其中6例艾滋病相关型患者HHV-8均阳性。30例HHV-8阳性患者中,17例为HHV-8 ORF26 A亚型,13例为C亚型。不同亚型间Kaposi肉瘤患者有无黏膜损害及临床分型的分布差异均无统计学意义(P > 0.05)。结论 Kaposi肉瘤患者感染HHV-8 ORF26亚型属于A亚型和C亚型,不同亚型与黏膜损害及临床分型无关。  相似文献   

20.
20061317CRF07-DC亚型HIV的gag-pol区基因序列分析/关琪(辽宁沈阳医学院奉天医院检验科),王素芬,张卓然…∥中国艾滋病性病.-2006,12(1).-7~92株艾滋病病毒1型(HIV-1)CRF07-BC亚型病毒的完整gag基因和部分pol基因重组及耐药位点分析显示:与新疆地区流行的模式病毒毒株非常接近。未发现基因重组断点的变化,因而不存在天然耐药情况,适用于抗逆转录类药物的应用。图1表2参7(杨亚琴)20061318HIV抗体筛查实验阳性、确认实验可疑和阴性标本的对比分析/黑发欣(北京市疾控中心性病艾滋病防治所),张启云,孙伟东…∥中国艾滋病性病.-2006,12(1…  相似文献   

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