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红花黄色素治疗颅脑损伤作用机制的生物信息学分析
引用本文:谢成仁,康国钧,侯晓峰,王,丹.红花黄色素治疗颅脑损伤作用机制的生物信息学分析[J].中国临床神经外科杂志,2020,0(12):841-843.
作者姓名:谢成仁  康国钧  侯晓峰    
作者单位:733000 甘肃,武威市人民医院神经外科(谢成仁、康国钧、侯晓峰);745000 甘肃,庆阳市人民医院神经病学(王 丹)
摘    要:目的 应用生物信息学方法分析红花黄色素(YS)治疗颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法 通过GEO数据库查询检索基因表达微阵列芯片数据集GSE21854,筛选差异表达基因(DEGs), 并与YS靶点基因互相印射取交集。采用DAVID/String数据库对共同靶基因进行GO分析和KEGG通路分析,构建PPI网络。结果 筛选出140个DEGs,与YS靶点基因互相印射后得到26个共同靶基因;进一步GO分析前5个基因功能富集为信号转导、DNA 转录调节、血小板活化、信号与聚集、免疫系统及转录调控区 DNA 结合,KEGG通路途径分析筛选出前5条信号通路包括MAPK信号通路、趋化因子信号通路、PI3K/AKT信号通路、EGFR1信号通路和肿瘤信号通路。PPI分析筛选发现节点最高的中心蛋白编码基因是MAPK3。结论 应用生物信息学方法,可有效获取YS治疗TBI靶向基因的生物学功能、相关信号通路及核心关键蛋白,为后续研究和临床治疗提供了依据。

关 键 词:颅脑损伤  红花黄色素  生物信息学  作用机制

Analysis of mechanism of safflower yellow in treatment of traumatic brain injury using bioinformatics methods
XIE Cheng-ren,KANG Guo-jun,HOU Xiao-feng,WANG Dan..Analysis of mechanism of safflower yellow in treatment of traumatic brain injury using bioinformatics methods[J].Chinese Journal of Clinical Neurosurgery,2020,0(12):841-843.
Authors:XIE Cheng-ren  KANG Guo-jun  HOU Xiao-feng  WANG Dan
Affiliation:1. Department of Neurosurgery, People’s Hospital of Wuwei City, Wuwei 733000, China; 2. department of Neurology, People’s Hospital of Qingyang City, Qingyang 745000, China
Abstract:
Keywords:Traumatic brain injury  Bioinformatics method  Safflower yellow
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