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基于转录组测序技术探讨复方蛇龙胶囊治疗膜性肾病大鼠潜在机制
引用本文:贾世艳,仲启明,司瑞花,范晓阳,严文允,刘光珍.基于转录组测序技术探讨复方蛇龙胶囊治疗膜性肾病大鼠潜在机制[J].陕西中医,2022,0(7):842-846,901.
作者姓名:贾世艳  仲启明  司瑞花  范晓阳  严文允  刘光珍
作者单位:(1.山西中医药大学,山西 晋中 030619; 2.山西省中医药研究院,山西 太原 030012)
基金项目:山西省重点研发计划重点项目(201603D3113023,201703D421024);;山西省科技攻关项目(2016ZD0307);
摘    要:目的:应用高通量转录组测序(RNA-seq)技术检测膜性肾病大鼠肾组织基因表达变化,分析复方蛇龙胶囊可能的作用机制。方法:采用改良Border法建立膜性肾病大鼠模型,设置模型组和复方蛇龙胶囊高、中、低剂量组(1.5、0.75、0.375 g/kg),每天灌胃1次,连续干预8周。采用RNA-seq技术检测复方蛇龙胶囊干预前后的差异表达基因,通过基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、蛋白质相互作用(PPI)及关键基因分析,筛选关键基因以及关键通路。结果:与模型组相比,复方蛇龙胶囊低、中、高剂量组共筛选出差异表达基因685个,其中535个上调基因,150个下调基因。GO富集分析显示差异表达基因主要涉及细胞膜结构,参与物质跨膜运输、细胞粘附与迁移,调控跨膜转运蛋白活性,KEGG富集分析显示差异表达基因主要富集在PI3K/Akt和MAPK信号通路。蛋白质相互作用网络筛选出Egfr、Fn1、Rac3、Frk、Cdh1、Agt、Hspg2、Itga8、Akt3和Fgfr2共10个关键基因,GO功能富集分析显示关键基因主要富集在细胞膜表面及间质,参与跨胞外基质组织及粘附过程,调控激酶活性,KEGG富集分析结果显示关键基因主要富集在PI3K/Akt信号通路。结论:调控肾足细胞自噬与凋亡可能是复方蛇龙胶囊作用的重要机制,与PI3K/Akt信号通路相关基因表达有关。

关 键 词:膜性肾病  复方蛇龙胶囊  转录组测序  大鼠  差异基因  关键基因  PI3K/Akt信号通路
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