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老年性白内障患者外周血环状RNA差异表达谱研究
引用本文:杜红飞,庞雪利,阳燕,周晓萍,许颖.老年性白内障患者外周血环状RNA差异表达谱研究[J].眼科新进展,2020,0(9):849-852.
作者姓名:杜红飞  庞雪利  阳燕  周晓萍  许颖
作者单位:610500 四川省成都市,成都医学院第一附属医院
摘    要:目的 利用微阵列芯片技术筛选老年性白内障患者外周血中差异性表达的环状 RNA(circular RNAs,circRNAs)进行生物信息学数据预测和分析,以探究外周血circRNAs在老年性白内障发病中的作用。方法 选取成都医学院第一附属医院已诊断为老年性白内障患者3例(试验组)和健康体检者3人(对照组)作为研究对象,运用Arraystar circRNAs基因芯片技术检测两组外周血中circRNAs表达谱及分析两组间差异表达的circRNAs。同时,运用在线生物信息学软件对差异circRNAs进行分析以及对下游相互作用的微小RNA(miRNA)进行预测。结果 与对照组比较,试验组外周血中异常表达的circRNAs共有242个(fold change绝对值≥2.0),其中上调的100个(fold change≥2.0),下调的142个 (fold change≤-2.0);生物信息分析数据提示,差异circRNAs在调节细胞代谢、发育及RNA转录等功能方面高度富集;4个circRNAs与白内障相关的miR-15a-3p、miR-34a-5p等吸附相关miRNA可能具有miRNA海绵吸附作用。结论 试验组与对照组外周血之间存在差异表达的circRNAs,这些circRNAs可能参与老年性白内障的致病调控,未来可能成为老年性白内障新型诊断和治疗的潜在生物学标志物。

关 键 词:老年性白内障  生物信息学  环状RNA  表达谱

Peripheral blood circRNAs expression profile in patients with senile cataract
DU Hongfei,PANG Xueli,YANG Yan,ZHOU Xiaoping,XU Ying.Peripheral blood circRNAs expression profile in patients with senile cataract[J].Recent Advances in Ophthalmology,2020,0(9):849-852.
Authors:DU Hongfei  PANG Xueli  YANG Yan  ZHOU Xiaoping  XU Ying
Affiliation:The First Affiliated Hospital of Chengdu Medical College,Chengdu 610000,Sichuan Province,China
Abstract:
Keywords:senile cataract  bioinformatics  circRNAs  expression profile
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