| 利用表达谱芯片数据筛选不同表达丰度的内参基因 |
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| 引用本文： | 胡世贤,陆佳涛,徐福意,晁天柱,周梁良,李凯,周宇荀,肖君华.利用表达谱芯片数据筛选不同表达丰度的内参基因[J].实验动物与比较医学,2017,25(1):8-13. |
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| 作者姓名： | 胡世贤 陆佳涛 徐福意 晁天柱 周梁良 李凯 周宇荀 肖君华 |
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| 作者单位： | 东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620;东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620;东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620;东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620;东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620;东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620;东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620;东华大学生物科学与技术研究所, 上海 201620 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目（编号：31371257）；上海市科委关键项目（编号：12140900404，13140900300，15140900500）。 |
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| 摘 要： | 目的 基于表达谱芯片的检测结果，筛选多个内参基因，用于小家鼠肝脏组织中具有不同表达丰度基因的定量检测。方法 应用表达谱芯片技术，完成小鼠肝脏组织的表达谱检测；依据基因表达丰度将基因分为3组，并进一步通过变异系数（coefficient of variation，CV）组内筛选候选内参基因；采用实时荧光定量PCR技术（real-time quantitative polymerase chain reaction，qPCR）和geNorm软件确定内参基因。结果 表达谱芯片成功采集超过60000个小鼠肝脏组织中转录本的表达量数据，并将之分为低、中、高3个组合。最终筛选了低表达Casp2和Lrrc14、中表达Nrd1和Trpc4ap、高表达Atp5a1和Clu，共6个内参基因。结论 基于表达谱芯片数据筛选的6个内参基因，可适用于qPCR技术准确定量小家鼠肝组织转录组中不同表达丰度基因的表达量。
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| 关 键 词： | 内参基因 表达谱芯片 实时荧光定量PCR geNorm软件 |
| 收稿时间： | 2016/6/28 0:00:00 |
Screening of reference genes of different abundance using gene expression microarrays |
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| HU Shi-xian,LU Jia-tao,XU Fu-yi,CHAO Tian-zhu,ZHOU Liang-liang,LI Kai,ZHOU Yu-xun and XIAO Jun-hua.Screening of reference genes of different abundance using gene expression microarrays[J].Laboratory Animal and Comparative Medicine,2017,25(1):8-13. |
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| Authors: | HU Shi-xian LU Jia-tao XU Fu-yi CHAO Tian-zhu ZHOU Liang-liang LI Kai ZHOU Yu-xun and XIAO Jun-hua |
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| Affiliation: | Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China;Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China;Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China;Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China;Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China;Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China;Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China;Institute of Biological Sciences and Biotechnology, Donghua University, Shanghai 201620, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Reference genes Gene expression microarrays Quantitative real-time PCR geNorm software Mouse Liver |
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