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广州管圆线虫的生物信息学分析
作者姓名:徐世三  倪芳  罗大民
作者单位:厦门大学生命科学学院, 厦门 361005
摘    要:从GenBank下载1 277条广州管圆线虫的表达序列标签(EST), 用BlastX比对分析, 并用SignalP V3.0预测潜在的抗原或过敏原相关蛋白N端是否具有分泌信号肽或信号锚定肽。结果显示, 得分值>100有614条, 其中14条与广州管圆线虫一致, 540条与其他物种的相关蛋白相匹配, 60条与数据库中序列无同源性。614条序列可分为10类, 抗原或过敏原相关蛋白有80条, 编码22种蛋白, 其中12种具有分泌信号肽, 3种具有信号锚定肽。

关 键 词:广州管圆线虫  表达序列标签  分泌-排泄蛋白  分泌信号肽  信号锚定肽
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